Kolokwium I - enzymy cz. 3 Flashcards
Jakie wyróżniamy podstawowe strategie katalityczne?
- kataliza kowalencyjna
- ogólna kataliza kwasowo-zasadowa
- kataliza z udziałem jonów metali
Co zawiera miejsce aktywne enzymów wykorzystujących katalizę kowalencyjną jako strategie katalityczna?
grupę reaktywna (zwykle nukleofil)
Co się dzieje z reaktywna grupa miejsca aktywnego w kowalencyjnej strategii katalitycznej?
podlega tymczasowej modyfikacji kowalencyjnej
Jaki enzym jest przykładem wykorzystywania katalizy kowalencyjnej jako strategii katalitycznej?
chymotrypsyna (enzym proteolityczny)
Co wykorzystuje chymotrypsyna aby wzmocnić nukleofilowość seryny?
histydynę jaki katalizator zasadowy
Jakie reakcje katalizuje chymotrypsyna?
hydrolizę wiązań peptydowych
Czy chymotrypsyna wymaga obecności koenzymu?
nie
Jakim białkiem jest chymotrypsyna jeżeli nie wymaga obecności koenzymu?
białkiem prostym
Czego wynikiem jest to co się dzieje w miejscu aktywnym enzymu?
reakcji między polarnymi grupami reszt aminokwasowych a specyficznymi ugrupowaniami substratu
Jaka katalityczna triada występuje w chymotrypsynie?
His 57, Asp 102, Ser 195
Co to jest deacylacja?
odwrócenie acylacji z podstawieniem cząsteczki wody w miejsce aminowej części substratu
Jakie wiązania i pomiędzy jakimi resztami aminokwasowymi występują w miejscu aktywnym enzymu bez obecności substratu?
His 57 tworzy wiązanie wodorowe z grupą -OH Ser 195
Jaki produkt przejściowy powstaje podczas reakcji katalizowanej przez chymotrypsynę?
acylo-enzym
Co jest najważniejszym nukleofilem kwaśnej fosfatazy prostatowej?
His 12
Jaki produkt przejściowy powstaje podczas reakcji katalizowanej przez kwaśną fosfatazę prostatową?
fosfohistydyna (kowalencyjny pośrednik)
Dehydratyza weglanowa (CA) jest metaloenzymem. Jakiego jonu potrzebuje do prawidłowego działania?
Zn2+
W jaki sposób możemy modelować aktywność enzymu?
- pH
- temperatura
- inhibitory
Jaka jednostka aktywności enzymów jest częściej używana: katal czy jednostka standardowa?
jednostka standardowa
W jaki sposób działa wiele leków (penicylina, aspiryna) i czynników toksycznych (jony metali ciężkich)?
przez hamowanie aktywności enzymów
Jakie wyróżniamy typy inhibicji?
odwracalna i nieodwracalna
Czym charakteryzuje się inhibicja odwracalna?
szybka dysocjacja kompleksu enzym-inhibitor
Jakie wyróżniamy typy inhibicji odwracalnej?
- hamowanie kompetycyjne
- hamowania niekompetycyjne
- hamowanie akompetycyjne
Czym charakteryzuje się Inhibicja nieodwracalna?
inhibitor pozostaje silnie związany z enzymem (kowalencyjnie i niekowalencyjnie)
Do czego prowadzi inhibicja nieodwracalna?
ze zużyciem energii (degradacja enzymu niespełniającego funkcji - kosztowne, synteza nowego białka - kosztowne)
Na czym polega inhibicja kompetycyjna?
na konkurencji inhibitora i substratu o miejsce aktywne
Jak działa inhibitor w hamowaniu kompetycyjnym?
uniemożliwia wiązanie substratu do centrum aktywnego
W jaki sposób uniemożliwienie wiązania substratu do centrum aktywnego w inhibicji kompetycyjnej zmniejsza szybkość reakcji?
inhibitor zmniejsza liczbę cząsteczek enzymu wiążących substrat
Podaj przykłady inhibitorów kompetycyjnych:
- sulfanilamid
- ibuprofen
- statyny
Jaką reakcje hamują sulfanilamidy?
syntezę kwasu foliowego w komórkach bakterii
Jaka reakcje hamuje ibuprofen?
działanie cyklooksygenazy (stan zapalny)
Jaka reakcje hamują statyny?
syntezę cholesterolu
Co się dzieje z Km i Vmax podczas działania inhibitora kompetycyjnego?
Vmax pozostaje takie samo
Km rośnie
Co jest substratem dla dehydrogenazy bursztynianowej?
bursztynian
Co jest inhibitorem dehydrogenazy bursztynianowej?
malonian
Jakim typem inhibitora jest malonian dla dehydrogenazy bursztynianowej?
inhibitorem kompetycyjnym
Gdzie jest wykorzystywany 5-fluorodeoksyurydylan?
w terapii nowotworowej
Inhibitorem jakiego enzymu jest 5-fluorodeoksyurydylan?
syntazy tymidylanowej
Do czego prowadzi inhibicja syntazy tymidylanowej?
do spowolnienia syntezy dTMP = upośledzenie replikacji DNA
Jakim typem inhibicji jest inhibicja samobójcza?
inhibicja nieodwracalna
Co to jest DHFR?
reduktaza dihydrofolianowa