Kolokwium II - replikacja DNA Flashcards

1
Q

Jakie jest podstawowe zadanie replikacji?

A

dostarczenie potomstwu informacji genetycznej zawartej w cząsteczce macierzystej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Czym musi cechować się replikacja by utrzymać stabilność genetyczną w obrębie gatunków i organizmów?

A

musi być kompletna i wierna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Z jakich faz składa się cykl komórkowy?

A

M, G0, G1, S, G2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Które fazy cyklu komórkowego określane są jako interfaza?

A

G1, S i G2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Co się dzieje w fazie M cyklu komórkowego?

A

mitoza i początek cytokinezy

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Co się dzieje w fazie G0 cyklu komórkowego?

A

faza “spoczynku” komórek zróżnicowanych

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Co się dzieje w fazie G1 cyklu komórkowego?

A

zakończenie cytokinezy, wzrost, biosynteza RNA i białk

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Co się dzieje w fazie S cyklu komórkowego?

A

replikacja DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Co się dzieje w fazie G2?

A

wzmożona synteza białek i przygotowanie się do poziału

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jaką funkcję pełnią topoizomerazy?

A

katalizują topologiczne zmiany DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Co się tworzy przed widełkami replikacyjnymi?

A

superzwoje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Jakie wyróżniamy typy topoizomeraz?

A

topoizomerazę I i topoizomerazę II

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Jak działają topoizomerazy I?

A

przecinają jedną nić DNA i rozluźniają superzwinięty DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Jak działają topoizomerazy II?

A

przecinają obie nici DNA i tworzą w cząsteczce dwa ujemne superskręty czerpiąc energię z ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Ile opleceń nici niwelują topoizomerazy I?

A

1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Ile opleceń nici niwelują topoizomerazy II?

A

2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Jakie znamy inhibitory bakteryjnej gyrazy?

A
  • nowobiocyna
  • kwas nalidikowy
  • cyprofloksacyna
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Kiedy są stosowane inhibitory bakteryjnej gyrazy?

A

w leczeniu infekcji układu moczowego i innych infekcji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Jakie wyróżniamy inhibitory eukariotycznych topoizomeraz?

A
  • doksorubicyna
  • etopozyd
  • chemoterapeutyki
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

W jakie pary nukleotydów są bogate sekwencje DNA w miejscach inicjacji replikacji?

A

A-T

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Jakie białka uczestniczą w inicjacji replikacji?

A

DnaA, DnaB (helikaza), DnaG (prymaza), SSB

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Jaką funkcję pełni SSB?

A

stabilizuje strukturę jednoniciową i zapobiega ponownemu łączeniu nici pojedynczych-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Jaką funkcję pełni prymaza?

A

rozpoczyna syntezę

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Z jakich nici składają się widełki replikacyjne?

A

z nici wiodącej i opóźnionej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Jaka synteza zachodzi na nici wiodącej?

A

ciągła

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Jaka synteza zachodzi na nici opóźnionej?

A

nieciągła

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Czym są fragmenty Okazaki?

A

małe kawałki DNA na nici opóźnionej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Z ilu par zasad składają się fragmenty Okazaki?

A

100-1000 pz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

W jakim kierunku nici DNA są wydłużane?

A

5’→3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Co jest niezbędne do procesu replikacji DNA?

A
  • matryca
  • starter (primer)
  • prekursory
  • enzymy
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Jaką funkcję pełni matryca w procesie replikacji DNA?

A

dostarcza informacji odnośnie sekwencji nukleotydów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Jaką funkcję pełni starter w procesie replikacji DNA?

A

dostarcza wolny koniec 3’-OH do którego dołączane są nukleotydy

33
Q

Jakie enzymy są głównymi enzymami replikacji DNA?

A

polimerazy DNA

34
Q

Czy do końca 5’ nici polinukleotydowej można dołączyć nowe nukleotydy?

A

NIE! nie da rady nie ma szans nawet nie próbuj nigdy w życiu

35
Q

Jaką funkcję pełnią helikazy?

A

rozdzielają nici DNA

36
Q

Jaką funkcję pełnią ligazy w procesie replikacji DNA

A

łączą fragmenty Okazaki

37
Q

Co może być prekursorem do replikacji DNA?

A

dNTPs (5’-deoksynukleozydotrifosforan)

38
Q

Czym jest i jaką funkcję pełni prymaza?

A

polimeraza RNA zależna od DNA syntetyzująca primer

39
Q

Czym chemicznie jest primer?

A

oligorybonukleotyd

40
Q

Jaką długość mają primery w komórkach eukariotycznych?

A

8-10 nukleotydów

41
Q

Czego wymagają wszystkie polimerazy DNA?

A

matrycy i startera

42
Q

Jaki enzym pełni funkcję korektorską dla polimerazy DNA?

A

3’→5’ egzonukleaza

43
Q

Co to jest procesywność polimeraz DNA?

A

zdolność do katalizowania wielu kolejnych reakcji bez odłączania

44
Q

Co jest podstawą wysokiej wierności procesu replikacji?

A

aktywność korektorska

45
Q

Co to jest ligacja

A

spajanie pęknięć jednej nici w dwuniciowym DNA

46
Q

Jaką funkcję pełni polimeraza I?

A

usuwa primery i uzupełnia fragmenty Okazaki, naprawia

47
Q

Jaką funkcję pełni polimeraza III?

A

jest głównym enzymem relikacyjnym wydłużającym łańcuch

48
Q

Jakie wyróżniamy eukariotyczne polimerazy DNA?

A

α, β, γ, δ i ε

49
Q

Jaką funkcję pełni α polimeraza DNA?

A

udział w syntezie krótkich primerów (zawierających RNA i DNA) dla fragmentów Okazaki

50
Q

Czy polimeraza α DNA wykazuje aktywność 3’egzonukleazową?

A

nie

51
Q

Jaką funkcję pełni β polimeraza DNA?

A

naprawa przez wycinanie zasad

52
Q

Jaką funkcję pełni γ polimeraza DNA?

A

replikacja mitochondrialnego DNA

53
Q

Jaką funkcję pełni δ polimeraza DNA?

A

główna polimeraza replikująca wykazująca aktywność korektorską

54
Q

Analogiem jakiej polimerazy prokariotycznej jest polimeraza δ DNA?

A

polimerazy III

55
Q

Jaką funkcję pełni polimeraza ε DNA?

A

usuwa primery i bierze udział w naprawie

56
Q

Analogiem jakiej polimerazy peokariotycznej jest ε polimeraza DNA?

A

polimerazy I

57
Q

Jaką funkcje pełnią “klamry” w procesie replikacji DNA?

A

utrzymują białka na matrycach

58
Q

Co to jest telomerowy DNA?

A

1000 lub więcej tandemowych powtórzeń krótkich bogatych w G sekwencji na 3’końcu każdego chromosomu

59
Q

Do czego prowadzi spadek aktywności telomeraz w komórkach somatycznych organizmów wielokomórkowych?

A

do starzenia

60
Q

Co się dzieje z telomerami przy każdorazowym podziale komórki?

A

skracają się

61
Q

Jaki wpływ ma telomeraza na nieśmiertelność komórek nowotworowych?

A

zachowuje swoją aktywność

62
Q

Co się dzieje z nukleotydami na końcu 5’ w każdej replikacji?

A

są tracone

63
Q

Jakie wyróżniamy fazy replikacji DNA w komórkach eukariotycznych?

A
  1. identyfikacja miejsca początku replikacji
  2. rozplecenie (denaturacja) dsDNA w celu utworzenia matrycy ssDNA
  3. utworzenie widełek replikacyjnych
  4. inicjacja syntezy DNA i elongacja
  5. utworzenie “banieczek” replikacyjnych i ligacja zsyntetyzowanych fragmentów DNA
  6. odtworzenie struktury chromatynowej
64
Q

Co to jest miejsce ori?

A

origin of replication = miejsce rozpoczęcia replikacji

65
Q

Jakie komponenty procesu replikacji zbiegają się w miejscu powstania widełek replikacyjnych?

A
  1. helikaza DNA
  2. primaza
  3. polimeraza DNA
  4. SSB
66
Q

Czy polimerazy DNA mogą inicjować syntezę DNA de novo?

A

nie, potrzebują startera

67
Q

Co to jest primosom?

A

ruchliwy kompleks złożony z primazy i helikazy

68
Q

Co określa procesywność polimerazy?

A

liczbę nukleotydów dodawanych do powstającego łańcucha przed odłączeniem polimerazy odmatrycy

69
Q

Ile polimeraz jest potrzebnych do syntezy nowego DNA na nici wiodącej i opóźnionej w jednym czasie?

A

jeden

70
Q

W której fazie cyklu komórkowego zachodzi biosynteza DNA?

A

faza S

71
Q

W jaki sposób i ile razy jądrowy DNA jest replikowany w czasie fazy S cyklu komórkowego?

A

tylko raz i w całości

72
Q

Jakie działanie ma kompleks kinaz CDK4 i CDK6?

A

przejście poza punkt restrykcyjny na granicy G1/S

73
Q

Jakie działanie ma CDK2?

A

inicjuje biosyntezę DNA we wczesnej fazie S

74
Q

Jakie działanie ma CDK1?

A

przejście z fazy G2 do M

75
Q

Jaka cyklina aktywuje CDK4 i CDK6?

A

cyklina D

76
Q

Jaka cyklina aktywuje CDK2?

A

cylklina E lub A

77
Q

Jaka cyklina aktywuje CDK1?

A

cyklina B

78
Q

Na przejście między którymi fazami cyklu komórkowego mogą wpływać onkowirusy i onkogeny?

A

z fazy G1 do S