Kolokwium I - enzymy cz.1 Flashcards

1
Q

Czym są enzymy?

A

biokatalizatorami

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Jakie wyróżniamy rodzaje enzymów ze względu na strukturę jaka je tworzy?

A
  • białka (globularne)

- rybozymy (kwasy rybonukleinowe)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Czy enzymy białkowe katalizują reakcję same czy z udziałem innych czynników?

A
  • część enzymów funkcjonuje samodzielnie (bez dodatkowego udziału czynników niebiałkowych)
  • cześć enzymów wymaga udziału niebiałkowych kofaktorów
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Jak nazywamy enzym, który działa przy udziale kofaktora w stanie niezwiązanym z kofaktorem = nieaktywnym?

A

apoenzym

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Jak nazywa się apoenzym związany z kofaktorem?

A

holoenzym = aktywny

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Co to jest kofaktor?

A

niebiałkowy związek chemiczny, potrzebny danemu enzymowi do katalizowania określonej reakcji chemicznej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Jakie wyróżniamy rodzaje kofaktorów?

A
  • grupy prostetyczne
  • koenzymy
  • jony metali
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Czym charakteryzują się grupy prostetyczne?

A

są silnie, kowalencyjnie związane z enzymami

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Czym charakteryzują się koenzymy?

A
  • są luźno, niekowalencyjnie związane z enzymami

- są pochodnymi witamin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jakie jony metali mogą występować jako kofaktory?

A

Zn2+, Mg2+, Mn2+, Cu+/2+, Mo2+, Ca2+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Z ilu podjednostek składają się enzymy?

A

mogą być jedno- lub wielopodjednostkowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Co jest szczególnie ważną częścią enzymu?

A

miejsce aktywne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Jakie zadanie pełni miejsce aktywne enzymu?

A

ułatwia zajście reakcji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co ma wpływ na aktywność miejsca aktywnego enzymu?

A

kształt i środowisko chemiczne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Z czego składa się centrum aktywne enzymu?

A
  • szczelina lub zagłębienie (niedostępne dla cząsteczek wody)
  • układ przestrzenny reszt aminokwasowych z grupami polarnymi
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Jaką funkcję pełni szczelina lub zagłębienie miejsca aktywnego enzymu, które są niedostępne dla cząsteczek wody?

A

zapewnia hydrofobowe mikrośrodowisko

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Jaką funkcję pełni układ przestrzenny reszt aminokwasowych z polarnymi grupami miejsca aktywnego enzymu?

A

grupy polarne biorą udział w wiązaniu substratu i katalizie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Jaki jest stosunek wielkości enzymu do swoistych substratów?

A

enzymy są dużo większe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Jakie bariery termodynamiczne i fizykochemiczne musi pokonać enzym by utworzyć kompleks enzym-substrat?

A
  • rozproszenie i ruchliwość cząsteczek
  • uwodnienie substratu
  • stabilność utrwalonej struktury substratów
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Jakie wyróżniamy modele oddziaływania enzym-substrat?

A
  • model zamka i klucza

- model wzbudzonego dopasowania

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Jakie efekty wiążą się ze zbliżeniem i odpowiednim ustawieniem substratów względem centrum aktywnego enzymu?

A

efekty entropijne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Jakie znaczenie ma istnienie hydrofobowego mikrośrodowiska w centrum aktywnym enzymu?

A

wzmacnia oddziaływania wewnątrz centrum

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Jakie znaczenie ma wywołanie naprężeń i odkształceń w substracie podczas działania enzymu?

A

uzyskanie i stabilizacja stanu przejściowego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

O czym stanowi wejście do miejsca aktywnego enzymu?

A

o swoistości enzymu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Jak działają enzymy?

A

katalizują reakcję obniżając energię aktywacji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Czy mechanizm reakcji ma wpływ na ΔG?

A

nie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

W jaki sposób enzymy wpływają na stabilność stanu przejściowego i jaki to ma wpływ na szybkość reakcji?

A

enzymy przyspieszają reakcję przez stabilizację stanu przejściowego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Jakie cechy określają enzymy jako katalizatory?

A
  • sprawność
  • swoistość
  • funkcjonowanie w łagodnych warunkach
  • możliwość regulowania aktywności
29
Q

Względem czego może występować specyficzność enzymów?

A
  • względem substratu

- względem katalizowanej reakcji

30
Q

Co jest podstawą klasyfikacji enzymów?

A

rodzaj katalizowanej reakcji

31
Q

Jakie wyróżniamy klasy enzymów?

A
  1. oksydoreduktazy
  2. transferazy
  3. hydrolazy
  4. liazy
  5. izomerazy
  6. ligazy (syntetazy)
32
Q

Jakie wyróżniamy podklasy oksydoreduktaz?

A
  • dehydrogenazy
  • reduktazy
  • oksydazy
  • oksygenazy
  • peroksydazy
  • katalazy
33
Q

Jakie wyróżniamy podklasy transferaz?

A
  • transaldolazy i transketolazy
  • metylo-, acylo-, glukozylo-, amino-, i fosfotransferazy
  • kinazy
  • fosfomutazy
  • syntazy
34
Q

Jakie wyróżniamy podklasy hydrolaz?

A
  • esterazy
  • fosfatazy
  • glikozydazy
  • peptydazy
  • tiolazy
  • fosfolipazy
  • nukleazy
  • lipazy
35
Q

Jakie wyróżniamy podklasy liaz?

A
  • dekarboksylazy
  • aldolazy
  • hydratazy
  • dehydratazy
  • syntazy
36
Q

Jakie wyróżniamy podklasy izomeraz?

A
  • racemazy
  • epimerazy
  • mutazy
37
Q

Jakie wyróżniamy podklasy ligaz?

A
  • karboksylazy
  • ligazy
  • syntetazy
38
Q

Jakie reakcje katalizują oksydoreduktazy?

A

utleniania i redukcji

39
Q

Jakie koenzymy są związane z podklasą dehydrogenaz?

A
NAD+
NADP+
FAD
FMN
DPT
liponian
40
Q

Jakie koenzymy związane są z podklasą oksydaz?

A

FAD i FMN

41
Q

Jakie reakcje katalizują dehydrogenazy?

A

utleniania i redukcji z odczepieniem atomu wodoru

42
Q

Jakie reakcje katalizują oksydazy?

A

przenoszenie wodoru na tlen w wyniku czego powstaje woda lub nadtlenek wodoru

43
Q

Jakie reakcje katalizują oksygenazy?

A

wbudowania tlenu w cząsteczkę

44
Q

Jakie wyróżniamy rodzaje oksygenaz?

A

monooksygenazy i dioksygenazy

45
Q

Jakie koenzymy związane są z monooksygenazami?

A

NADP+
hem (cyt P450)
witamina C

46
Q

Jakie reakcje katalizują monooksygenazy?

A

włączenie jednego atomu tlenu do hydroksylowanego substratu, podczas gdy drugi atom tlenu wiązany jest w cząsteczkę wody z udziałem NAD(P)H

47
Q

Jakie reakcje katalizują dioksygenazy?

A

włączają dwa atomy tlenu do substratu

48
Q

Jak inaczej nazywamy monooksygenazy?

A

hydroksylazy

49
Q

Jaki specyficzny aminokwas zawiera peroksydaza glutationowa?

A

selenocysteinę

50
Q

Jaką reakcję katalizuje katalaza?

A

2H2O2 → 2H2O + O2

51
Q

Jakie reakcje katalizują peroksydazy?

A

utlenianie nadtlenkiem wodoru różnych substratów

52
Q

Jakie reakcje katalizują transferazy?

A

reakcje przenoszenia fragmentów substratów

53
Q

Jakie koenzymy są związane z aminotrasferazami?

A

fosforan pirydoksalu (PLP)

54
Q

Jakie reakcje katalizują aminotransferazy?

A

transaminację grup α-aminowych z α-aminokwasów na α-ketokwasy

55
Q

Jakie reakcje katalizują kinazy?

A

reakcję przeniesienia grupy fosforanowej ze związku wysokoenergetycznego (np. ATP) na właściwą cząsteczkę docelową

56
Q

Jak nazywamy reakcję, którą katalizują kinazy?

A

fosforylacja

57
Q

Jakie reakcje katalizują hydrolazy?

A

reakcje hydrolitycznego rozszczepienia substratów (= z udziałem cząsteczki wody)

58
Q

Jakie koenzymy związane są z hydrolazami?

A

hydrolazy nie wiążą się z koenzymami

59
Q

Jakie reakcje katalizują liazy?

A

odłączanie grup bez udziału cząsteczki wody lub dołączanie grup do wiązań podwójnych

60
Q

Co jest koenzymem dekarboksylazy pirogronianowej?

A

DPT

61
Q

Jakie reakcje katalizują izomerazy?

A

przekształcania substratu w jego izomer

62
Q

Jakie reakcje katalizują racemerazy?

A

zmieniają położenie podstawników przy atomie węgla decydującym o przynależności do szeregu D lub L

63
Q

Jakie reakcje katalizują epimerazy?

A

zmieniające położenie podstawników przy asymetrycznym atomie węgla

64
Q

Jakie reakcje katalizują mutazy?

A

zmieniające położenie reszty fosforylowej

65
Q

Jakie reakcje katalizują dekarboksylazy?

A

odłączenie dwutlenku węgla od grupy karboksylowej kwasów organicznych

66
Q

Jakie reakcje katalizują ligazy?

A

reakcje łączenia substratów w sprzężeniu z hydrolizą związku wysokoenergetycznego

67
Q

Jakie reakcje katalizują karboksylazy?

A

powstawanie wiązań chemicznych węgiel-węgiel (C-C) pomiędzy cząsteczkami (przy użyciu energii w postaci ATP)

68
Q

Jaki koenzym jest związany z karboksylazą pirogronianu?

A

biotyna