W2 HC.2 DNA schade en reparatie: deel 2 Flashcards
Wanneer kun je de complementaire DNA streng gebruiken als template voor DNA schadeherstel?
Geschikt voor het herstel van DNA schade waarbij alleen één van beide DNA strengen is beschadigd
- Mismatched baseparen
- Intrastreng DNA crosslinks
- Enkelstrengs DNA breuken
Wanneer gebruiken we zusterchromatide/ homologe chromosoom als template voor DNA schadeherstel?
Geschikt voor het herstel van DNA schade waarbij beide DNA strengen zijn beschadigd
- Interstrengs DNA crosslinks
- Dubbelstrengs DNA breuken
Voorbeelden van DNA schade reparatiemechanismen:
- Base excisie reparatie (BER): herstel kleine adducten (oxidatieve DNA schade)
- Nucleotide excisie reparatie (NER): herstel grote adducten (UV licht geïnduceerde DNA schade)
- Niet-homologe DNA eind verbinding + homologe recombinatie (herstel van dubbelstrengs DNA breuken)
Verschil niet-homologe DNA eindverbinding en homologe recombinatie?
Niet homologe DNA eindverbinding (NHEJ)
-> direct aan elkaar ligeren van de twee uiteinden van een DNA breuk
-> gebruikt geen template
-> onnauwkeurig herstel
Homologe recombinatie (HR)
-> uitwisseling van DNA strengen tussen DNA moleculen
-> gebruikt vnml het zusterchromatide
-> nauwkeurig herstel
-> mbv RAD51 (oiv BRCA-1/2)
Verschil homologe chromosomen en zusterchromatiden?
Homologe chromosomen: twee vergelijkbare maar niet identieke kopieën van elk chromosoom
Na replica (onderdeel celcyclys) per chromosoom twee identieke zusterchromatiden.
Stappen herstel dubbelstrengs DNA breuk door homologe recombinatie?
- Breuk herkenning en verwerking tot enkelstrengs ‘staart’
- Base pairing tussen gebroken en identieke intacte zusterchromatide
- Synthese ontbrekend DNA en ligatie van gebroken strengen
Waarom is RAD51 belangrijk voor dubbelstrengs DNA breukherstel door homologe recombinatie?
- RAD51 eiwitmoleculen vormen een filament op de enkelstrengs ‘staart’
- Het RAD51 eiwitfilament bevordert baseparing tussen het gebroken en intacte zusterchromatide
-> Het gedrag van RAD51 na ontstaan van DNA schade wordt beïnvloed door de BRCA1 en BRCA2 eiwitten.
Functie BRCA1 en BRCA2?
Deze eiwitten zorgen dat RAD51 naar de plek van de schade gaat.
Wat is een gevolg van mutatie BRCA1 en BRCA2?
RAD51 kan niet meer naar de DNA-breuken toe gaan. Hierdoor worden de DNA-breuken verkeerd aan elkaar gezet, waardoor genomische instabiliteit ontstaat.
-> BRCA is van belang voor genomische stabiliteit
Wat voor fouten kunnen er ontstaan bij homologe recombinatie?
- Bij zusterchromatide als template: nauwkeurig herstel
- Bij homologe chromosoom als template: mogelijk verlies van heterozygositeit (‘LOH’)
Wat voor fouten kunnen er ontstaan bij NHEJ dubbelstrengs DNA breuken?
- Binnen een homoloog chromosoom: Interne chromosomale deletie
-> mogelijk verlies van heterozygositeit - Tussen verschillende chromosomen: translocatie (bv bij CML)