Caractéristiques des bactéries Flashcards
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Campylobacter jejuni?
BGN incurvé/hélicoïdal “en vol de mouette”. Flagelle polaire, capsulé non sporulé
Quelles sont les caractéristiques culturales de Campylobacter jejuni?
Prelevements : selles, hemocultures , aliments incriminés Examen microscopique : Bacille incurvé mobile en vol de mouette. Bacterie exigeante, micro-aerophile, capnophile, thermotolerante. Culture sur milieu enrichi et sélectif : gélose selective au charbon de Karmali, gelose Campylosel. Atmosphère 5 % O2, 10% et 85% azote à 37C ou 42C Colonies non hémolytiques,d’aspect grisâtres, tête d’epingle sur gelose au charbon ou rosée sur gelose au sang oxydase +, urease - , catalase + , hippurate +++++ Hydrolyse de l’hippurate PCR directement dans les aliments Serologie pour confirmer syndrome de Guillain Barré
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Chlamydia trachomatis?
Apparenté BGN, parasite intracellulaire obligatoire
Quelles sont les caractéristiques culturales de Chlamydia trachomatis?
Milieu de transport adapté, 4°C, ensemencement dans les 24h sur cellules MacCoy en présence de cycloheximide Incubation 36°C 48-72h puis mise en évidence par IFI La PCR est très sensible
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Clostridium difficile?
BGP fin et droit anaérobie strict, sporulé, capsulé, mobile (ciliature péritriche)
Quelles sont les caractéristiques culturales de Clostridium difficille et strategies de diagnostic ?
Prélevement - selles liquides, examen direct et mise en evidence d’un déséquilibre de la flore avec des bacilles G+ avec présence des formes sporulées. Diagnostic rapide par mise en evidence du glutamate deshydrogenase dans les selles par technique d’agglutination ou methode immuno-enzymologique. Detection directe des toxines : ELISA detectant toxine A ou toxine A + B , test immunochromatographique , PCR avec recherche des genes tcdA et tcdB codant pour les toxines A et B directement sur les selles. Sur milieu spécifique et sélectif CCFA(gelose coeur-cervelle + 5%sang de cheval + cycloserine + cefoxitine) Colonies obtenues en 48h,grisâtres à bords irreguliers , non hemolytiques , en aspect de verre fritté , fluorescentes verte-jaune sous UV 360nm . Odeur caractéristique de crottin de cheval Bioch : oxydase - , catalase - , indole - , lecithinase - , nitrate reductase - , urease - Identificatin colonies par spectrometrie de masse
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Escherichia coli ?
BGN parfois mobile ,non capsulé non sporulé, enterobacterie, commensale
Quelles sont les caractéristiques culturales de Escherichia coli?
Bacterie non exigeante, AAF Culture sur gélose ordinaire , milieux lactosés non selectifs (BCP, CLED) ou selectifs Gram - + sels biliaires (Hektoen, MacConkey) Gélose Mac conkey + sorbitol - souche O157:H7 (sorbitol -) Biochimie : Oxydase -, Nitrate reductase +, glucose + , Lactose++++, H2S ——-, indole++++++ Spectrometrie de masse (non differencié de shigella dans ce cas - attention)
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Haemophilus influenzae?
Cocobacilles Gram- capsulés ou non capsulés
Quelles sont les caractéristiques culturales de Haeomophilus influenzae?
Bacterie exigeante - facteur X et V dépendante, AAF , culture favorisée par 5% CO2. Culture sur gélose au sang de mouton + facteur V ou gélose au sang cuit. Satéllitisme dans la zone de B hémolyse des S.aureus. Colonies grisâtres, translucides, convexes. Caract. Bioch: oxydase + , catalase + , saccharose -.
Quels sont les moyens non bactériologiques de diagnostiquer la présence de Helicobacter pylori?
Sérologie ELISA, immunoblot, Wester-Blot, test respiratoire à l’urée marquée au carbone 13, recherche d’Ag dans les selles, PCR
Quelles sont les caractéristique culturale de Helicobacter pylori?
Culture sur gélose sélective en micro-aérophilie (en 2 à 5j) : oxydase +, uréase +, catalase +
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Legionella pneumophila?
Bacille GN mobile (ciliature monotriche) non capsulé non sporulé
Quelles sont les caractéristiques culturales de Legionella pneumophila?
Aerobie strict, thermophile culture 25-40 C , gélose nutritive BCYE (charbon,cysteine,fer) +/- Vancomycine ou collistine pour éliminer la flore oropharyngé. Lecture : 3-10 jours : colonies en verre fritté à reflets roses Bioch : oxydase + faible, catalase +
Quelles sont les moyens non bactériologiques de diagnostiquer la présence de Legionella pneumophila?
Recherche des Ag urinaires solubles (positifs dès l’apparition des symptomes, mais limité au sérogroupe 1) par immunochromatographie et ELISA . Immunofluorescence directe sur prélevements réspiratoires pour rechercher les antigenes de toutes les serogroupes. PCR directement sur l’échantillon. Diagnostic indirect - IFI IgG ou IgA anti- LPS de la mb externe - seroconversion lente (15j)
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Listeria monocytogenes?
Petit bacile Gram + , non capsulé, non sporulé, immobile à 37C et mobile à 22C
Quelles sont les caractéristiques culturales de Listera monocytogenes?
Anaérobie-aérobie facultatif. Gélose au sang Columbia + ANC (beta-hémolyse) de 4°C à 42°C. Lecture en 24H : zone etroite B-hemolyse (camp test - majoration B hemolyse par S.aureus) Caractetes biochimiques : Catalase + , oxydase - , esculine + rapide, glucose +
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Mycobacterium tuberculosis?
Baciles alcolo-acido-résistants (acides mycoliques ne prenant pas le Gram) : coloration de Ziehl-Neelsen( rouges sur fond bleu) ou auramine( jaunes sur fond rouge) (observation fluo) Non capsulé non sporulé immobile
Quelles sont les caractéristiques culturales de Mycobacterium tuberculosis
Aérobie strict, cultive en 3 à 8 semaines sur milieu solide à l’oeuf (Lowenstein-Jensen, colestos) colonies rugueuses en chou fleur, Middlebrook solide : colonies plates, sèches, rugueuses. Middlebrook liquide : qqs jours. Bioch : oxydase - , catalase + , acide nicotinique + , uréase + , nitrate reductase +
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Nesseria gonorrhoeae?
Diplocoques Gram négatif en grain de café, non sporulé, non capsulé immobile Présence de bactéries intracellulaires possible
Quelles sont les caractéristiques culturales de Nesseria gonorrhoeae?
Cuture sur gélose chocolat (avec ou sans inhibiteurs) en milieu aérobie avec 10% de CO2 + polyvitex + VCN ou VCAT - selectif au G- Lecture dans 2-5 jours : petites colonies arrondies , grisâtres - brillantes ou mates Bioch : catalase + , oxydase + , glucose + , maltose —— , gammagt ——, DnAse —– On peut effectuer un PCR sur le premier jet d’urine.
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Nesseria meningitidis?
Diplocoque Gram négatif en grains de café avec capsule polysaccharidique (A, B, C, Y, W135) ou non capsulé , immobile
Quelles sont les caractéristiques culturales de Nesseria meningitidis?
Aerobie stricte, exigeante et fragile - culture favorisée par 5% CO2 Culture sur milieu riche : Gélose au sang cuit (chocolat) + polyvitex + VCN (vancomycine , collistine, nystatine) pour rendre la gélose selective aux cocci Gram - Lecture 24-48 h : colonies grisâtres à bords irreguliers Bioch : Catalase + , Oxydase + , glucose + , maltose + , yGT +
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Pseudomonas aeruginosa?
Bacille fin GN mobile (cliature monotriche) parfois capsulé non sporulé
Quelles sont les caractéristiques culturales de Pseudomonas aeruginosa?
Aérobie strict, non fermentante et non exigeante. Cultive sur milieux usuels et produit un pigment bleu (pyocyanine) ou vert (pyoverdine) Milieu sélectif Gram - ex : Drigalski, Milieu King A - pyocianine spécifique du P.aeruginosa ; King B pour pyoverdine commune aux pseudomonas. Culture : colonies plates qux bords irréguliers à reflets métalliques et odeur de fleur de Seringa avec production de pigments. Bioch : oxydase + , catalase + , nitrate et nitrite reductase +
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Salmonella spp. ?
k
BGN mobiles , parfois capsulé , non sporulé (sérotypes = classification de Kauffman-White)
Quelle est la stratégie diagnostique pour mettre en évidence une salmonelle?
Hémocultures essentielles , coprocultures peuvent être utiles. Bacterie non exigeante AAF - culture sur geloses ordinaires, milieux lactosés non selectifs (BCP, CLED) ou selectifs des Gram - : Hektoen, Mac Conkey ou selectifs des salmonelles, shigelles - milieu SS Milieux minimisant la croissance d’autres bacteries : bouillon selenite-cysteine Bioch : oxydase - , Nitrate reductase + , glucose + , lactose - , H2S + , uréase - Identification colonies par spectrometrie de masse. Recherche des Ag : O, H, Vi par agglutination PCR- dans les selles.
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Shigella spp?
BGN immobiles, non capsulés , non sporulés.
Quelle est la stratégie diagnostique pour mettre en évidence une shigelle?
Selles, hémocultures en cas de bacteriemie Aliment incriminé en cas de suspicion de TIAC Culture : geloses ordinaires (BCP, CLED) ou selectifs gram négatif ( Hektoen, Mac Conkey, Drigalski ) ou selectif salmonelles et shigelles (SS) Biochimie : oxydase - , nitrate reductase + , glucose + , lactose - , H2S - , uréase - Identification colonies par spectrometrie de masse. PCR : genes plasmidede virulence- lpa et detection shiga toxines dans les selles.
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Staphylococcus aureus?
CGP en grappes de raisin, cocci en amas
Quelles sont les caractéristiques culturales de Staphylococcus aureus?
Anaérobie-aéro tolérante. Cultive sur milieux ordinaires et sur Chapman (germe halophile) mannitol + . Catalase +, coagulase +, bêta-hémolyse sur gélose au sang Colonies rondes, jaunes dorées.
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Streptococcus agalactiae?
CGP capsulé en chainettes
Quelles sont les caractéristiques culturales de Streptococcus agalactiae?
Anaérobie aéro-tolérant, cultive sur gélose au sang (bêta-hémolyse). Sérogroupe B de Lancefield. Résistant à l’optochine
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Streptococcus pneumoniae?
Diplocoque lancéolé ou en courtes chaînettes Gram + capsulé, non sporulé, immobile. Coloration à l’encre de Chine pour mettre en evidence la capsule.
Quelles sont les caractéristiques culturales de Streptococcus pneumoniae?
Bacterie exigeante, Cultive sur gélose au sang Columbia + ANC , AAF culture sous atmosphère enrichie en CO2 ou anaerobien Aspect ombiliquée, rond en gouttelettes de rosée, d’aspect muqueux entourés d’une zone verdâtre d’alpha hémolyse (pneumolysine++++) Alpha-hémolytique, sensible à l’optochine, lyse par les sels biliaires Bioch : Catalase - , oxydase - fermente le glucose sans produire du gaz.
Quels sont les moyens non bactériologiques de diagnostiquer la présence de Streptococcus pneumoniae?
Immunochromatographie sur les urines,LCR : recherche antigene, capsule polyasidique C Recherche des genes codant pour la pneumolysine par PCR sur LCR
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Streptococcus pyogenes?
CGP en chainettes, capsulé non sporulé , immobile
Quelles sont les caractéristiques culturales de Streptococcus pyogenes?
Cultive sur gélose au sang Columbia + ANC (anaerobie aero-tolerante) => culture sous atmosphère enrichie en CO2 ou anaérobie. Petites colonies grisâtres ou translucides, hémolyse B complete (streptllysines+++), résistantes à l’optochine et sensibles à la bacitracine. Bioch : catalase - , oxydase - , fermente le glucose sans production de gaz. Sérogroupe A de Lancefield (permet la détection sur prélèvement de gorge = TDR)
Quelles sont les caractéristiques morphologiques de Treponema pallidum?
Sprochète hélicoïdal mobile. Examen direct au microscope à fond noir. IFI
Quelles sont les caractéristiques culturales de Treponema pallidum?
Il ne se cultive pas
Qu’est ce que le VDRL? Comment est-il détecté et que marque-t-il?
Antigène non tréponémique. L’anticorps anti-VDRL agglutine avec un Ag cardiolipidique. Il marque le suivi de l’efficacité thérapeutique (se positive en dernier)
Dans quel cas l’anticorps anti-VDRL peut-il être faussement négatif?
En cas d’excès d’anticorps (phénomène de zone)
Dans quel cas l’anticorps anti-VDRL peut-il être faussement positif?
Maladies auto-immunes, grossesse
Qu’est ce que le TPHA? Comment est-il détecté et que marque-t-il?
C’est un antigène tréponémique. L’Ac anti-TPHA se positive 3 à 4 semaine après le début de l’infection (soit 1 semaine après le chancre). Il est positif chez le malade guéri (technique par hémagglutination passive)
Qu’est ce que le FTA? Comment est-il détecté et que marque-t-il?
C’est un antigène tréponémique. Sa cinétique est la même que le TPHA, l’Ac est détecté par IFI, c’est un test de confirmation
Interprétation d’une sérologie de syphilis : VDRL - et TPHA -
Syphilis exclue ou contamination récente
Interprétation d’une sérologie de syphilis : VDRL + et TPHA +
Syphilis
Interprétation d’une sérologie de syphilis : VDRL + et TPHA -
Faux positif probable : confirmer le TPHA - par le FTA (qui doit être négatif)
Interprétation d’une sérologie de syphilis : VDRL - et TPHA +
Syphilis débutante ou cicatrice sérologique
Autres moyens de diagnostiquer H.influenzae ?
Recherche de Ag capsulaires par agglutination.
Examens non bactério S.pyogenes ?
TDR : mise en évidence du polyoside C : par immunochromatographie sur ecouvillon de gorge. Serologie : anticorps streptolysine O si inf pharyngée et streptodornase B si inf pharyngée et cutanée.
Examens non bacteriologiques pour identifier Mycobacterium tuberculosis ?
PCR sur prélevement, Sondes moleculaires par hybridation avec l’ARN bactérien. Test à la niacine - détecter l’acide nicotinique Nitrate reductase test - réaction colorimetrique
Examens biologiques pour E coli ?
Serotypage Recherche ag O,K, H par agglutination Recherchecag K1 chez la femme enceinte PCR Genes codant pour le pathovar suspecté (Stx1, Stx2, eae, enterotoxines…) Indirect : Av anti-O157 pour diagnostiquer SHU (faible sensibilité)
Autres moyens de diagnostiquer Listeria monocytogenes ?
Recherche d’anticorps anti-listeriolysine O
Autre moyens pour diagnostiquer N.meningitidis ?
Serogroupage par tests d’agglutination - obligatoire pour la vaccination. PCR - permet egalement le serogroupage
