Investigación en la regulación de la expresión génica Flashcards
1
Q
Herramientas moleculares en genómica funcional
A
- Transcriptoma
- Proteoma
2
Q
Transcriptoma
A
- Knockdown (RNAi)
- Microarreglos de DNA (de expresión)
3
Q
Knockdown (RNAi)
A
silenciamiento de genes
4
Q
Microarreglos de DNA:
A
- Niveles de mRNA
- Perfiles de expresión génica
- Redes de regulación génica
5
Q
Comparación de los niveles de proteínas
A
Proteómica cuantitativa
6
Q
- Permite identificar redes complejas de regulación génica
- Comprensión de la biología del organismo a nivel de su genoma
A
Microarreglos de DNA
7
Q
Microarreglos de expresión:
A
- Laminilla en donde se inmovilizan las sondas que reconocerán cada uno de los transcritos
- Sondas isotérmicas de hasta 60nt
8
Q
Específicas para cada uno de los transcritos
A
Sondas
9
Q
Bases de datos para el diseño de las sondas del microarreglo de expresión
A
- Secuencia completa del genoma del organismo
- Librerías de cDNA normalizadas (EST)
10
Q
Pretende ser la representación de todos los posibles transcritos que se generan en cualquier momento en dicho organismo bajo diferentes condiciones y etapas de vida:
A
Librerías de cDNA normalizadas (EST)
11
Q
- Representación de todo el conjunto de DNA complementario al mRNA
- Cuando no se cuenta con la secuenciación completa del genoma
A
Librerías de cDNA normalizadas (EST)
12
Q
Procesamiento del microarreglo:
A
- Extracción de RNA de alta calidad
- Preparación y marcaje de la muestra
- Hibridación
- Escaneo
13
Q
Tipos de muestras para preparación y marcaje:
A
- Muestras amplificadas
- Muestras no amplificadas. Síntesis de cDNA
14
Q
Muestras amplificadas:
A
Amplificación del cRNA
15
Q
Muestras no amplificadas:
A
- Oligo dT
- Random primer
