Extracción y cuantificación de proteínas Flashcards

1
Q

¿Para qué nos sirve extraer proteínas?

A
  • Purificación
  • Secuenciación
  • Expresión de una proteína recombinante
  • Inmunoensayos
  • Análisis estructurales
  • Estudiar su función y regulación
  • Estudiar sus interacciones con otras moléculas
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2
Q

Pasos para la extracción de proteínas:

A
  • Disrupción mecánica
  • Lisis celular
  • Separación de las membranas y restos celulares
  • Precipitación de proteínas solubles
  • Centrifugación
  • Resuspensión de proteínas
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3
Q

La disrupción mecánica se lleva a cabo en:

A

Tejidos principalmente, no es necesaria si la muestra proviene de cultivo celular.

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4
Q

Disrupciones mecánicas de muestras:

A
  • Licuadora
  • Homogeneizador Dounce
  • Homogeneizador de ultrasonido
  • Pulverización en Nitrógeno líquido
  • Perlas de vidrio
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5
Q

La muestra se tritura mediante cuchillas rotatorias

A

Licuadora

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6
Q

En el método de licuadora, ¿qué tipo de muestra se utiliza?

A

Gran cantidad de tejido

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7
Q

Tubo de vidrio con pistón ajustado, maja las células por acción de corte:

A

Homogeneizador Dounce

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8
Q

Tipo de muestra para el homogeneizador Dounce

A

Células tisulares, útil para protocolos de enriquecimiento de proteínas mitocondriales o nucleares

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9
Q

Tipo de muestras utilizadas en el homogeneizador de ultrasonidos:

A

Células, tejidos, bacterias

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10
Q

Ondas de sonido emitidas por una sonda para romper las membranas celulares

A

Homogeneizador de ultrasonidos

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11
Q

La muestra se pulveriza utilizando un mortero y un almirez refrigerados

A

Pulverización en Nitrógeno líquido

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12
Q

Tipos de muestras utilizadas para la pulverización en Nitrógeno líquido

A

Tejido animal o vegetal

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13
Q

La ruptura de la célula se produce por agitación de las perlas de vidrio

A

Perlas de vidrio

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14
Q

Tipo de muestra para el método de perlas de vidrio

A

Levaduras

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15
Q

El buffer de lisis contiene:

A
  • Inhibidores de proteasas
  • Detergente
  • Algunos agentes estabilizadores
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16
Q

Qué contiene el detergente para lisis celular?

A
  • SDS, desnaturalizante
  • Tritón X-100 no desnaturalizante
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17
Q

Reduce el daño por oxidación, quela iones metálicos:

A

EDTA 10 mM

18
Q

Estabiliza las membranas lisosómicas, reduce la liberación de proteasas

A

Sacarosa o glucosa 25 mM

19
Q
  • Reduce la pérdida debida a la asociación con componentes celulares o a la autoagregación.
  • Extracción y purificación de las proteinas integrales de membrana.
  • Solubilización de proteínas poco solubles
A

Detergentes, 0.01% - 1%

20
Q

Para estabilización, se puede utilizar hasta un 50% si es necesario

A

Glicerol 5% - 10%

21
Q

Para estabilización

A

Sacarosa al 10%

22
Q

Degradación de ácidos nucleicos, reduce la viscosidad de la solución

A

Nucleasas (DNAasa y RNAasa)

23
Q

Coctel de diferentes inhibidores cada uno con especificidad para diferentes proteasas en particular, evitando la degradación global de las proteínas en el extracto.

A

Inhibidores de proteasas

24
Q

Inhibidores de proteasas:

A
  • Aprotinina
  • EDTA
  • EGTA
  • Leupeptin
  • Pepstatina A
  • PMSF
25
Q

EDTA.

A

Ácido etilendiaminotetraacético

26
Q

EGTA

A

Ácido etilenglicol tetraacético

27
Q

PMSF

A

Fluoruro de fenilmetilsulfonilo

28
Q

Enzima diana de la aprotinina

A

Proteasas de Serina

29
Q

Enzima diana del EDTA

A

Mg/Mn Metaloproteasas

30
Q

Enzima diana del EGTA

A

Ca+ Metaloproteasas

31
Q

Enzimas diana del Leupeptin

A

Proteasas de Serinas, Cisteinas

32
Q

Enzima diana de la Pepstatina A

A

Proteasas de Aspártico

33
Q

Enzimas diana del PMSF

A

Proteasas de Serina

34
Q

Al centrifugar, en el sobrenadante se encuentran:

A

todas las proteínas solubles de la célula

35
Q

Al centrifugar, en el pellet se encuentran:

A

las membranas y proteínas hidrofóbicas de membrana

36
Q

Las membranas y proteínas hidrofóbicas de membrana pueden ser de interés, V/F

A

Verdadero

37
Q

Para precipitar las proteínas solubles del sobrenadante se utiliza:

A
  • Sulfato de amonio (NH4)2SO4 No desnaturalizante
  • Etanol y acetona
38
Q

Es el más ampliamente utilizado para la cuantificación de proteínas

A

Ensayo de Bradford

39
Q

El ensayo de Bradford se basa en:

A

el colorante azul de Coomassie G-250 en una solución ácida

40
Q

El colorante azul de Coomassie G-250 en una solución ácida, conforme reacciona con las proteínas se torna:

A

Café-rojizo

41
Q

En el ensayo de Bradford se realiza una curva patrón con concentraciones desconocidas, V/F

A

Falso, la curva patrón se realiza con concentraciones conocidas

42
Q

La curva patrón se lee a cuántos nanómetros y a qué sensibilidad?

A

a 595nm y a una sensibilidad de 1 μg/ ml.