Genómica funcional y RNAs no codificantes Flashcards

1
Q

La información genética común a todas las células del organismo

A

Genoma

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2
Q

Parte del genoma que se transcribe en una célula en un momento específico

A

Transcriptoma

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3
Q

Proteínas en la célula que le dan su carácter individual

A

Proteoma

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4
Q

Suma total de los sustratos, metabolitos y moléculas pequeñas presentes en una población de células

A

Metaboloma

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5
Q

Se ha desarrollado como consecuencia de los avances en biología molecular e informática

A

Genómica

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6
Q

Genómica

A
  • Planteamiento clásico
  • Planteamiento genómico
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7
Q
  • Dirigido por una hipótesis
  • Limitado número de genes estudiados
A

Planteamiento clásico

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8
Q
  • No hay hipótesis de partida
  • Información sobre miles de genes contenidos en el genoma completo
A

Planteamiento genómico

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9
Q

Determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación descubrimiento de genes

A

Genómica funcional

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10
Q

Identificación y estudio de la estructura de la secuencia en el genoma. Polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones. Localización y construcción de mapas

A

Genómica estructural

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11
Q

Estudio comparativo de los genomas estructural y funcionalmente para explicar las relaciones funcionales y evolutivas

A

Genómica comparativa

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12
Q

Aspectos dinámicos de la información biológica:

A
  • Transcriptoma
  • Proteoma
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13
Q

Comparación de los niveles de proteínas

A

proteómica cuantitativa

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14
Q

Segmento de DNA con una ubicación física conocida en un cromosoma

A

Marcador genético

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14
Q

microarreglos de DNA (de expresión)

A

-Niveles del mRNA
-perfiles de expresión génica
-redes de regulación génica

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14
Q

Silenciamiento de genes

A

Knockdown (RNA de interferencia-RNAi)

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15
Q

Aplicaciones de las herramientas moleculares

A
  • Descubrimiento de genes
  • Identificación de marcadores genéticos
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16
Q

Pueden ayudar a vincular una enfermedad hereditaria con el gen responsable

A

marcadores geneticos

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17
Q

Los segmentos de DNA que se encuentran cerca en un cromosoma tienden:

A

A heredarse juntos

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18
Q

Los marcadores genéticos se utilizan para rastrear la herencia de un gen cercano que aún no ha sido identificado (V/F)

A

VERDADERO

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19
Q

Puede ser parte de un gen o puede no tener ninguna función conocida

A

Marcador genético

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20
Q

Molécula biológica que se encuentra en la sangre, otros líquidos o tejidos del cuerpo y es un signo de un proceso normal o anormal, o de una afección o enfermedad

A

Biomarcador

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21
Q

Determina la respuesta del cuerpo a un tratamiento para una enfermedad o afección

A

Biomarcadores

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22
Q

La regulación positiva o negativa de la expresión de un gen puede ser por causa de:

A

la enfermedad

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23
Q

Genes regulados pueden ser utilizados como:

A

biomarcadores

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24
Q

En los años ochenta se observó en bacterias que moléculas pequeñas de RNA pueden aparearse con secuencias complementarias e inhibir la síntesis de proteínas

A

RNAi en procariotas

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25
Q

Se descubrió en 1990 intentando aumentar el color púrpura de petunias por introducción de un gen clonado que producía un pigmento

A

RNAi en plantas

26
Q

En el proceso de silenciamiento génico post-transcripcional (PTGS), tanto el gen introducido como el homólogo endógeno son:

A

suprimidos

27
Q

En neuroespora crassa insertaron copias adicionales del gen que codifica para el pigmento naranja que sintetiza el hongo
Producían hongos blanquecinos, fenómeno llamado quelling o supresión

A

RNAi en hongos

28
Q

Descubierto en 1993 en el gusano C.elegans

A

RNAi en eucariotas

29
Q

-Modelo de regulación no era común
-Gran número de moléculas pequeñas de RNA
-Transcritos sin una señal de lectura ORF
-RNAs no codificantes (ncRNAs)
-Variantes que pueden regular o silenciar a los genes codificantes

A

RNAi en eucariotas

30
Q

Posiblemente un tipo de…………. para proteger al organismo de la presencia de material genético extraño

A

Sistema inmunitario genético

31
Q

El mecanismo para bloquear la replicación de virus reconoce al dsRNA como:

A

una molécula “indeseable”

32
Q

Mecanismo de regulación de la expresión génica

A

miRNA

33
Q

Demostraron el efecto fenotípico de RNA inyectando unc-22 que codifica para la proteína del músculo estriado, que es abundante pero no esencial

A

Fire-Mello

34
Q

Una disminución en los niveles de expresión de este gen producía un aumento en la curvatura del gusano y la supresión del gen resultaba en mayores defectos estructurales y perdida de motilidad

A

unc-22

35
Q

RNA de interferencia corto de 21 a 25 nucleótidos

A

siRNA

36
Q

RNA de interferencia de doble cadena largo

A

dsRNAi

37
Q

RNA de interferencia de horquilla corto, se puede clonar en un plásmido

A

shRNA

38
Q

Los mamíferos no lo poseen y es responsable de la amplificación del RNA

A

la RdRp

39
Q

microRNA de 18 a 25 nucleótidos

A

miRNA

40
Q

El efecto en plantas y ciertos animales como el gusano C.elegans va pasando por varias generaciones sin:

A

alterar la secuencia genómica de DNA

41
Q

Cantidad de moléculas que pueden silenciar un mRNA blanco que esté presente en miles de copias por célula

A

Menos de 50 moléculas

42
Q

Capaz de actuar a distancias considerables en el organismo

A

dsRNA/siRNA

43
Q

Amplificación mediante la síntesis de más copias de siRNA por la vía:

A

De la RNA polimerasa RNA dependiente (RdRp)

44
Q

Se introduce mediante técnicas de transfección un plásmido que trascriba una horquilla que semeje el pri-miRNA

A

shRNA

45
Q

Fácil de sintetizar y de usar
Poco tiempo de silenciamiento

A

siRNA

45
Q

Son procesados por…………….. y…………………. para generar siRNAs funcionales

A

Drosha y Dicer

46
Q

Estable expresión del siRNA con mayor tiempo de duración del silenciamiento, difíciles de usar en células difíciles de trasnfectar

A

shRNA vector plásmido

47
Q

Son introducidos a prácticamente cualquier tipo de célula mediante infección, mayor tiempo para obtener las células de interés

A

shRNA vector lentiviral o retroviral

48
Q

Pequeñas moléculas capaces de regular negativamente la expresión de un gen diana y tienen patrones de expresión independientes tiempo-tejido específicos

A

miRNAs

49
Q

Función de regulación génica post-transcripcional

A

–Proliferación y diferenciación celular
–Desarrollo embrionario, morfogénesis
–Apoptosis
–Iniciación tumoral
–Promoción de metástasis

50
Q

Cromosómicos, endógenos, no codificantes, diversos en secuencia, intergénicos, exóticos, intrónicos, evolutivamente conservados

A

miRNAs

51
Q

Son enzimas RNAsas III que procesan los pri-miRNA y pre-miRNA, respectivamente

A

Drosha y Dicer

51
Q

Se carga en el complejo RISC induciendo el silenciamiento del mRNA mediante su degradación o inhibición de la traducción

A

El resultante miRNA-Duplex

52
Q

Los miRNAs son transcritos por:

A

la ARNpol II

52
Q

Endonucleasa específica para RNA de doble hebra, posee un dominio amino terminal RNA helicasa, dos dominios RNAsa III y un carboxilo terminal de unión a dsRNA

A

Drosha

53
Q

70-100 nt

A

pre-microRNA

54
Q

En la represión de la traducción, la complementariedad con el mRNA es:

A

menor al 100 %

55
Q

Se estima que el 50% de los genes de miRNAs son controlados directamente por la metilación del ADN (F/V)

A

Verdadero

56
Q

La expresión de alrededor del 30 % de todos los genes se cree que puede ser regulada mediante:

A

miRNAs

57
Q

miRNAs regulan la expresión de componentes importantes de los mecanismos epigenéticos atacando:

A

las enzimas modificadoras de la cromatina, cambiando sutilmente el epigenoma

58
Q

Su especificidad sobre la expresión génica hace de este mecanismo una valiosa herramienta en investigación, ya que pueden introducirse en las células para inducir el silenciamiento selectivo de genes específicos

A

RNAi

59
Q

El RNAi puede no bloquear completamente la expresión del gen de interés, normalmente suele referirse a esta técnica como:

A

knockdown

60
Q

Aplicaciones del RNAi

A
  • Estudiar la función de los genes en cultivos celulares e in vivo en organismos modelo
  • Terapia mediada genéticamente