Balteerien luokittelu ja tunnistaminen

Question 1

Taksonomian hyödyt maailmassa

Answer 1

Taksonomian avulla eliöt voidaan jakaa luokkiin yhtäläisyyksien ja sukulaisuuden perusteella.

Joukkojen kuvaaminen nimellä, yhtenäisen ja kansainvälisen nimistön luominen.

Ryhmän ominaispiirteiden yksilöinti tunnistusta varten.

Question 2

Miksi mikrobien laijinmääritys on vaikeaa?

Answer 2

Genomien rekombinaatiovauhti nopeampaa kuin aitotumallisilla, joilla seksuaalinen lisääntyminen ja pidempi sukupolvenväli.

Question 3

Mitä on polyfaasinen taksonomia? (muuta kuin kakkaa)

Answer 3

Polyfaasinen taksonomia yhdistää feno- ja genotyyppisiä tietoja.

Question 4

Lajin määritelmä aitotumallisilla

Answer 4

Taksonomian perusyksikkö: saman lajin yksilöt, jotka tuottavat keskenään lisääntymiskykyisiä jälkeläisiä.

Question 5

Bakteerin lajinmääritelmä

Answer 5

Bakteerin lajinmääritelmä: perustuu DNAn samankaltaisuuteen (vähintään 70% pariutuminen) tai yli 97% 16S RNAn geenin samankaltaisuus (bakteerien evoluution mitta).

Question 6

Mikä on pienin lajin sisäinen yksikkö

Answer 6

Kanta on pienin lajin sisäinen yksikkö. Tietystä kohteesta eristetty joukko klonaalisia, ominaisuuksiltaan identtisiä bakteereita, jotka eroavat muista. Sama bakteerikanta voi olla 2 paikassa, jos välillä on ollut siirtymisen mahdollistanut yhteys.

Question 7

Mikrobien genomit eivät ole stabiileja, vaan muuttuvat miten

Answer 7

horisontaaliset geeninsiirrot, rekombinaatio jne perimänvaihto hämärtävät laji- ja sukurajoja.

Question 8

Mitä on feneettinen samankaltaisuus

Answer 8

ilmiasun samankaltaisuutta

Question 9

Miten bakteerin nimi kirjoitetaan

Answer 9

kursiivilla

Question 10

Miten spesifinen entiteetti raapustetaan

Answer 10

pienellä alkukirjaimella

Question 11

Onko laji uusi? Taksonomisen tutkimuksen vaiheet:

Answer 11

Polyfaasisella taksonomialla osoitetaan, ettei laji kuulu aiemmin kuvattuun lajiin

Tuotetaan genomisekvenssidataa julkiseen tietokantaan. Bakteerikannat tallennetaan 2 julkiseen kantakokoelmaan

Ehdotetaan uutta taxaa ja kuvataan tyyppikanta

Question 12

Isolaatti

Answer 12

Puhdasviljelmä, joka on peräisin heterogeenisestä bakteeriyhteisöstä

Question 13

Kanta 2. määritelmä

Answer 13

Saman solulinjan edustajat, eroavat muista lajin edustajista vähäisesti, mutta tunnistettavasti

Question 14

Kantakokoelma

Answer 14

kokoelma hyvin tunnettuja ja kuvailtuja kantoja. Kansainvälisesti hyväksytty palvelukokoelma, jolla on kantanumero.

Question 15

Tyyppikanta

Answer 15

Jokaiselle lajille nimetään tyyppikanta. Laji määritellään tyyppikannan ominaisuuksien perusteella.

Question 16

Vertailukanta

Answer 16

Ominaisuuksiltaan tunnettu kanta, joka on peräisin kantakokoelmasta/muutoin varmennettu. Vertailukantojen avulla varmistetaan menetelmien toimivuus ja tulosten toistettavuuus.

Question 17

Miksi epätyypilliset kannat aiheuttavat ongelmia

Answer 17

ei tiedetä, onko kyseessä toinen kanta vai saman kannan sisäistä normaalia biologista vaihtelua

Question 18

Mitä varmistustesteillä tutkitaan

Answer 18

Kanta vahvistetaan kohderyhmän edustajaksi morfologian, biokemiallisten rektioiden, aineenvaihdunnan, fysiologian ja makromolekyylien avulla.

Question 19

Tyypittämismenetelmät

Answer 19

Biotyypitys, serotyypitys, faagityypitys, molekyylityypitys

Question 20

Biotyyppi ja biotyypitys

Answer 20

Testit ja lkm lajikohtaisia, patteri biokemiallisia reaktioita

Question 21

Serotyypitys ja serotyypit (serovarit)

Answer 21

Antigeenejä (vasta-aineiden muodostumisen aiheuttava rakenne). Esim O, H, Vi

Spesifisyyttä kuvataan numerolla O:5

Question 22

Faagityypitys

Answer 22

Testaa bakteriofaagien kykyä infektoida ja hajottaa bakteereja

Faagityyppi on faagisarjan testien tulos

Question 23

Sekvenssipohjainen tyypitys

Answer 23

MLST, ANI

Question 24

Sekvenssipohjainen tyypitys

Answer 24

plasmidien virulenssigeenien suhteen