Cours 3 : Enzymologie Flashcards
Quelle est la demi-vie d’une liaison peptidoglycane
20 ans
Nommer 3 manières d’augmenter la vitesse de réaction
- Augmenter la température : impossible pour la plupart des organismes
- Augmenter la concentration des réactifs : certaines réactions sont si lentes spontanément qu’il faudrait des concentrations impossible à atteindre en réalité
- Utiliser un catalyseur
Quel est le rôle premier des enzymes
Agir comme un catalysateur biologique
La formation de l’intermédiaire de réaction (état de transition) ABC demande quoi
Une certain quantité d’énergie libre
Pourquoi on a besoin de l’énergie d’activation
L’énergie “d’activation” requise provient du fait que les molécules doivent s’orienter correctement pour former l’intermédiaire (∆S négatif) et que pour favoriser les contacts entre molécules, il faut favoriser leur mouvement (donner de la chaleur, donc ∆H positif)
Mais si on nécessite de l’énergie pour faire une réaction pourquoi est ce que c’est payant énergétiquement
puisque les produits ont une énergie libre plus basse que les substrats, la réaction est globalement favorable thermodynamiquement
Que font les catalyseurs dans une rct chimique
Le catalyseur réduit la barrière énergétique de la réaction chimique (énergie d’activation) en interagissant avec les substrats de la réaction et en augmentant la probabilité de formation de l’état de transition
V/F : le catalyseur change la diff. d’énergie entre les produit et les réactifs
Faux
en absence de catalyseur, il faudrait augmenter quels facteurs ( même si c’est bcp plus couteux énergiquement )
La T et la P
Les enzyme sont des catalyseurs de quelles natures
protéique ou ribonucléique (ARN; ribozyme)
* nous on se concentre + sur protéique
Expliquer le la catalyse chimique d’hydrogénation de l’éthylène avec la surface de métal
1) La surface métallique interagit avec les carbones de l’éthylène et avec l’hydrogène
2)Ces interactions favorisent grandement les contacts productifs entre les substrats, ce qui diminue de façon importante la quantité d’énergie requise pour que la réaction se produise
Les enzymes ont besoin de quelles conditions
Douces ( pH, T , temps )
Dans une réaction que fait habituellement l’enzyme
Forment un complexe avec leur substrat par liaisons habituellement non covalentes entre le site actif de l’enzyme et le substrat
Qu’est ce qui permet une grande spécificité à l’enzyme
la structure 3D de l’enzyme
à quel point les enzymes accélèrent les réactions
Accélèrent les réactions par 108 à 1017 fois
Dans une rct chimique : + la c des produits augmente…
Plus la C des substrats diminue
Que veut dire une rct à l’équilibre
Lorsque production de produits et de réactifs sont égales:
=>Lorsque V1 = V-1, le système est à l’équilibre
=>. Ça ne veut pas dire qu’autant de produits que de réactifs sont présents
Qu’est ce que la vitesse d’une rct
La vitesse décrit la diminution des réactifs ou l’apparition des produits dans le temps
Quelles est la particularité des vitesse initiales
Les vitesses initiales de la réaction dépendent uniquement de la c des réactifs à moment précis
Qu’est ce que les constanttes de rct K1 et K-1 ( décrivent quoi )
décrivent les proportions des produits et des réactifs à l’équilibre, et donc la tendance qu’à la réaction à se produire.
Donnez l’évolutions des vitesse d’une rct réversibles au fur et à mesure que le temps avance
v1 ↓ parce que [S] ↓
v-1 ↑ parce que [P] ↑
à l’équilibre la constante d’équilibre est quo
K1/k-1
Décrivez les graphiques de concentration et de vitesse en fct du temps
À l’équilibre
=> le graphique de vitesse montre deux courbe qui se fusionnent
=> concentration se croise mais ont leur plateau séparer
La vitesse de réaction est proportionnelle à quoi
à la fréquence avec laquelle les molécules réagissantes se rencontrent;
=>donc au produit des concentrations des substrats
Qu’est ce que l’ordre de réaction
la somme des exposants de l’équation de vitesse, donc à la molécularité (# de molécules qui doivent entrer en collision simultanément dans la réaction)
l’ordre 0 indique quoi
- v = cste
=>les collisions ne sont pas limitantes
Qu’est ce que le pseudo ordre 1
Si [A]»_space;>[B] v = k[A] 0[B] 1 = pseudo-ordre 1 , en fonction de [B] seulement ([A] inclus dans la constante)
Quelle est l’équation de la constante d’équilibre
Ke = [C]l [D]m /[A]j [B]k
Qu’est ce que le complexe enzyme-substrat
Le(s) substrat(s) se fixe(nt) de façon non-covalente à l’endroit approprié du site actif
Comment le complexe enzyme substrat catalyse la rct
rapproche les réactifs et les positionne favorablement
Favorise la formation d’intermédiaires métastables (diminue E d’activation)
Stabilise les états transitionnels intermédiaires
Quel est le problème avec un intermédiaire avec petite barrière énergétique pour donner P ou S
etirement des liens => fragilisation
