Cours 1.1 : Biomolécules Flashcards
Qu’est ce que le métabolisme
ensemble de rct chimique qui se produisent ds un organisme vivant ( permet de convertir les nutriment en énergie
Expliquer une rct anabolique vs catabolique
- RCT catabolique ( dégradation ) permet de créer des molécules riche en énergie ex. ATP, NADH, FADH2
- RCT anabolique ( synthèse ) ( opposer à catabolique ) consomme de l’énergie ( ATP )
Donnez un exemple de voie catabolique
Ex. Glycolise ( glucose => pyruvate produise éaglement de l’ATP)
Donnez les macromolécule et leurs composantes
Protéines< => acide aminés
Glucides <=> monosaccharides
Lipides <=> Acide gras
Qu’est ce que la signalisation cellulaire
système de communication complexe entre les cellule et entre les cellule et leur environnement ( message chimique )
Donnez un exemple de signalisation cellulaire
apres un gros repas le pancréas anonce la présence nouvelle du glucose grace à l’insuline au cellule qui ont des récepteur d’insuline. La liaison de l’insuline au récepteur crée une chaine d’évènement pour une réponse attendue. La tranmission du message dans la cellule fait intervenir les enzymes ( ici transfert d’un groupement phosphate ( cascade de phosphorylation ) envoyé des transporteur de glucose.
Pour la signalisation cellulaire on utilise quoi
- On utilise des signaux chimiques, des récepteurs et des messagers intracellulaire
Quelles sont les 4 familles de biomolécules
Lipides, Sucres , Acide Aminés ( protéine) , et nucléotide
La plupart des biomolécule sont à base de quoi
- La plupart des biomolécules sont à base de carbone, hydrogène, oxygène et nitrogène ( il y a également du Ca, P, K S, Cl, Na, Mg )
- La grande majorité des molécules d’un organisme vivant contiennent du carbone
Donnez des exemples d’acides aminés et leurs fonctions
- Ex. Asparagine, Cystéine
- Fonctions :
- Structure
- Catalyseur
- Transport
- Signalisation
Donnez des exemples de glucides et leurs fonctions
- Ex. Glucose
- Fonctions :
- Structure
- Énergie
Donnez des exemples de Lipides et leurs fonctions
- Ex. Cholestérol
- Fonctions :
- Structure
- Énergie
- Signalisation
Donnez des exemples de nucléotides et leurs fonctions
- Ex.ATP
- Fonctions
- Structure de l’ADN et l’ARN
- Information génétique
- Énergie
Nommer les polymère que les biomolécules peuvent former et les liaisons former
- Acide aminée => polypeptide ( grace à liaison peptidique ) =>
*Le pont disulfure est un exemple de lien covalent très important pour la structure des protéines. - Nucléotides => acide nucléique ( grace à liaison phosphodiester )
- Monosaccharide=> polysacchharide ( grace à la liaison glicosidique )
Quelle sont les propriété macroscopique et la structure de l’eau
- Propriété macroscopiques : Solvant, abondance
- Structure de l’Eau : Déséquilibre dans la répartition des charges sur liaison O-H ( dipole permanent => liaison polaire )
Nommez les intéractions dans l’eau
- Ionique
- Hydrogène
- Van der Waals
- Effet hydrophobe
Qu’est ce que les intéractions ioniques
- Interaction électrostatique entre deux groupement de charges opposées ( ions )
- Force de liaison : + petite qu’une liaison covalente plus grande qu’une liaison polaire
- H2O affaibli ces rcts
Qu’est ce que les interactions hydrogène
- Intra ou inter moléculaire
- Conséquence de la polarité => attraction des molécules H2O
- 20 kJ/mol , soit 1/20 d’un lien covalent
- Ex, Structure cristalline ( Glace ) => dans la glace , orientation tétraédrique de H et O
Qu’est ce que le rayon de Van der Waals
la distance entre son noyau et sa surface électronique réelle
La polarité de l’eau permet quoi , donnez des exemples
excellent solvant pour molécule ionisable et polaires
- Ex.ionisable : NaCl, Cristal<=> soluté, Formation d’une sphère d’hydratation
- Ex. polaire Glucose et saccharose: formation de pont H intermoléculaires
Qu’est ce que les interactions de van der Waals
- Interaction électrostatique entre molécules polaire non chargée, formation de dipole temporaire
- Force de liaison plus faible que les ponts H
- Attraction électrostatique dipole produit dans les atomes par le mouvement des électrons autour du noyau
- Ex: La structure linéaire des lipides saturés de même que les nombreuses liaisons C-H qu’ils possèdent permettent autant d’interactions de Van der Waals
Quelle est la distance idéale entre deux dipole , pourquoi
La distance idéales est de 4 entre deux dipole si la distance est en dessous de 3 les nuages électronique vont rentrer en collision et y avoir une certaine répulsion si les distance sont trop grande et ne permettront par l’attraction
Qu’est ce que l’effet hydrophobe
- Non polaire => interaction hydrophobe
- Regroupement afin de minimiser l’interactions avec l’eau
- Phénomène d’exclusion de la solution ex: rassemblement des gouttes d’huile pour diminuer la surface de contact avec H2O
=> Effet hydrophobe : important pour le repliement des protéines et pour la formation de membranes
Qu’est ce qu’une molécule amphiphile
- possédant deux portion polaire-apolaire ( hydrophile et hydrophobe )
- Ex: Acide gras Palmitate
Comment les molécule amphiphile s’organisent dans l’eau
- Ces molécule se dépose à la surface de l’eau ( monocouche ) , tête polaire vont former des interactions
- Dispersion dans la face aqueuse peu également laisse place à des gouelette ou la tete polaire fait la circonference de la goutellette face à l’eau avec les queu apolaire au centre ( dispersion appelé micelle )
Quelles sont les caractéristiques des structure formé par des liaisons non covalentes
Liaison facile à formé et à défaire ce qui donne des structures dynamiques
Nommé et expliquer les structures formées par des liaisons non-covalentes
- Filament d’actine
- Microtubule
- Membranes lipidique (cytoplasme ; formés majoritaire de phosphoglycéride ( qui on une tête polaire et une queue apolaire ) , tete intéragi avec le solvant , dans al membrane il y a une bicouche ( deux phosphoglycéride ou les tet s’opposse et les queue se touche
Qu’est ce que l’osmose
Diffusion du solvant à travers une membrane semi -perméable vers un millieu moins concentré vers un milieu plus concentré en SOLUTÉ
Qu’est ce que la pression osmotique
pression nécessaire pour empêcher le flux du solvant ( eau )
Qu’est ce qu’une sln hypertonique, isotonique et hypotonique
- Hypertonique ( concentration de soluté à l’extérieur est plus élevée que celle à l’intérieur => l’eau va sortir de la cellule
- Isotonique : ^m concentration ; équilibre osmotique
- Hypotonique : concentration de soluté à l’intérieur est plus élevée que celle à l’extérieur=> l’eau va rentrer de la cellule ( peut mener à l’éclatement de la cellule, lyse cellulaire, s’il y a trop d’eau qui entre )
Expliquez l’ionisation de l,eau
- l’eau s’ionise pour former des ions H+( proton ) et OH- ( hydroxyde )
*EN fait les sln ne contiennent pas vrm de H+ mais des ions hydronium ( H3O+) - Dans l’eau pure les concentration de H+ et OH- sont égales
- K= cste de dissociation
- pH de l’eau pure = 7
Qu’est ce que le K et le pH
- K= cste de dissociation
- pH ( potentiel hydrogène ) = - log ( concentration de H+)
Quel est l’approche de l’acide / base avec un proton
- L’acide se transforme en base conjugué par perte d’un proton
- La base se transforme en acide conjugué par fixation d’un proton
Quel est la relation pKa-pH
- Le pKa est pas le pH mais plutôt le pH avec le quel on retrouve 50 % de la quantité de l’Acide ioniser et l’autre 50% intacte
- Quand le pKa est = pH => la concentration de la base conjugué et de l’Avcide faible sont égales
Qu’est ce que l’effet tampon lors du titrage
Variation faible du pH autour du pKa de l’acide faible malgré l’ajout assez important de base
Quelle est la particularité du pKa de l’acide polyprorique
Capable de relacher plusierus proton ( possède trois pKa)
- Ex: acide aminé libre
