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Biochimie > Cours 1: Les acides aminés > Flashcards

Cours 1: Les acides aminés Flashcards

1
Q

Comment sont définis les acides aminés

A

Acides aminés sont les unités de base formant les protéines

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Q

Quelle est la structure des a.a.

A

comportent une fonction acide (COOH) et une fonction amine (NH2)
+ une chaine latéral ( R)

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3
Q

Base + Acide =

A

Amphotérique

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4
Q

L’asymétrie du carbone alpha en fait quoi

A

Un centre chiral

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5
Q

Dans les protéines on retrouve quelle configuration autour du carbone alpha

A

Seulement la forme L

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5
Q

Quelle sont les deux configuration d’une acide aminés

A

L et D ( mis dans le préfixe )

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6
Q

Combien y’a t’il d’acides aminés

A

20

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7
Q

Est ce que tous les acides aminés ont des propriété identiques

A

Non , varient en taille, forme, charge, hydrophobicité et réactivité

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8
Q

Propriété d’un acide aminé est défini par quoi

A

La chaine latérale R

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9
Q

Quel sont les a.a. hydrophobe ( non-polaire ) et nommé les particularité

A
  • Glycine ( non-chiral )
  • Alanine
  • Valine
  • Leucine
  • Isoleucine
  • Méthionine ( possède un souffre )
  • Proline ( à un cycle dans lequel est l’amine )
  • Phenylalanine ( cycle et résonance )
  • Tryptophan ( 2 cyle )
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10
Q

Quel sont les a.a. avec les chaines latérales polaires non-chargées

A
  • Asparagine ( 2e NH2 )
  • Glutamine ( 2e NH2 )
  • Tyrosine ( alcool et cycle )
  • Cystéine ( SH )
  • Sérine ( alcool )
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11
Q

Quels sont les a.a. avec les chaines latérales polaires basique ( chargée + )

A
  • Lysine ( Un NH3)
  • Arginine ( R composé de CN3H5)
  • Histidine ( cycle avec deux N )
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12
Q

Quels sont les a.a. avec les chaines latérales polaires acide ( chargée -)

A
  • Acide aspartique ( acide carboxylique )
  • Acide glutamique ( acide carboxylique )
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13
Q

Quels sont les propriétés des a.a. hydrophobe

A
  • Non-polaires;
  • Interaction faible ou nulle avec l’eau;
  • les acides aminés hydrophobes sont retrouvés à l’intérieur de la molécule;
  • Ne participent pas directement aux réactions chimiques ( pcq les rct se font majoritairement avec l’eau )
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14
Q

Quels sont les propriétés des a.a. polaires non-chargés

A
  • Polaires;
  • Interaction des groupements fonctionnels avec l’eau;
  • Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
  • Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
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15
Q

Quelle est la particularité de l’histidine

A
  • Le groupement imidazole de l’histidine peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH.
  • Dans une protéine, permet de moduler l’activité en fonction du pH.
  • Peut être polaire chargés et non-chargés
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16
Q

Quelle est la particularité de la Glycine

A
  • Petit, seul acide aminé non-chiral
  • non-hydrophobe et non-chargé, on le classe parfois parmi les a.a. polaires
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17
Q

Quelles sont les particularités des a.a. polaires chargées

A
  • Chaîne latérale chargée à pH physiologique;
  • Polaire;
  • Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
  • Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
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18
Q

Le pKa indique quoi dans la courbe de titrage

A

point d’inflexion de la courbe de titrage du groupe ionisable

19
Q

Qu’est ce que le point isoélectrique

A

(zwitterion):
pH où l’acide aminé est électriquement neutre (100% des molécules sont sous leur forme électroniquement neutre )

20
Q

Comment on définis le points isoélectrique

A
  • pI = (pKa1 +pKa2)/2
    (si 2 fonctions ionisables)
  • pI = (pKa1 + pKa2)/2 (si diacide)
  • pI = (pKa2 + pKa3)/2 (si dibasique)
21
Q

Qu’est ce que le pH physiologique

A

pH normal à l’intérieur de la cellule environ 7 - 7.4

22
Q

Le pKa de la sln indique quoi dans la quantité d’acide et de base

A

Au pKa la moitie est sous la forme de la base conj. et l’autre encore en acide

23
Q

Pourquoi autour du pKa on a un pH de la sln qui change peut ( tampon )

A

Au début la sln possède deja des h+ quand on rajoute l’acide le OH- de la base prends quand meme des H+ de la sln mais au pka on va prendre les H+ de l’acide pcq l’acide est plus reactif ainsi la quantité de H+ de la sln ne change pas alors le pH ne change pas

24
Q

V/F : la chaine latéral n’est pas ionisable

A

Vrai juste l’acide et l’amine

25
Q

Qui est ce qui donne sont proton en premier dans le a.a.

A
  • L’acide a tendance à relacher son proton plus facilement ( pKa plus petit )
  • Amine ne donne pas facilement son H alors on attends qu’il n’y aie plus d’autres proton à donner
26
Q

Qu’est ce que le point d’inflection

A

point d’inflection ou le pH varie énormément pcq toutes les carboxyle on relacher leur proton

27
Q

Combien d’acide aminés ont une chaine ionisable

A

7

28
Q

Quels sont les acides aminés avec des chaines ionisable et nommé les protons

A
  • Asparagine ( asp ) ( H de l’alcool )
  • Glutamine ( glu ) ( H de l’alcool )
  • Histidine ( his ) ( H du NH+ du cycle )
  • Cystéine ( cys ) ( H de SH )
  • Tyrosine ( tyr) ( H de l’alcool )
  • Lysine ( lys ) (H du NH3+ )
  • Arginine ( arg) ( H Du NH2+
29
Q

Quel est le pKa du carboxyle du carbone alpha et le pKa de l’amine du carbone alpha

A

2 et 9,3

30
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de la cystéine

A

8,4

31
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de la tyrosine

A

10,5

32
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de l’acide aspartique

A

3,9

33
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de l’acide glutamique

A

4.1

34
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de la Lysine

A

10,5

35
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de l’arginine

A

12

36
Q

Quel est le pKa de la chaine latéral de l’histidine

A

6,0

37
Q

Qu’est ce qu’un polymère

A

Molécule à laquelle on peut ajouter plusieurs d’unités à la suite de l’autre pas mal infiniement

38
Q

Condensation de deux acides aminés forme quoi

A

Un dipeptide

39
Q

Quelle est la liaison chimique entre deux a.a.

A

Lien peptidique

40
Q

Où est situé le lien peptidique entre deux a.a.

A

Le lien peptidique est situé entre le C=O et le N-H

41
Q

Quelles sont les deux extrémités des peptides

A

une extrémité N-terminale (NH3+) et C-terminale (COO-)

42
Q

Qu’est ce qu’un polypeptide

A

Courte chaine de a.a. <50

43
Q

Comment on appelle les a.a. dans les chaines

A

Résidus

44
Q

Quelle est la nomenclature des chaines

A

N-terminale=>C-terminale

45
Q

Qu’est ce qu’une protéines

A

polypeptides longs ayant une structure tridimensionnelle définie

46
Q

Pour chaque position dans une chaîne d’acides aminés constituant une protéine, il y a combien de possibilités

A

20

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