Cours 1: Les acides aminés Flashcards
Comment sont définis les acides aminés
Acides aminés sont les unités de base formant les protéines
Quelle est la structure des a.a.
comportent une fonction acide (COOH) et une fonction amine (NH2)
+ une chaine latéral ( R)
Base + Acide =
Amphotérique
L’asymétrie du carbone alpha en fait quoi
Un centre chiral
Dans les protéines on retrouve quelle configuration autour du carbone alpha
Seulement la forme L
Quelle sont les deux configuration d’une acide aminés
L et D ( mis dans le préfixe )
Combien y’a t’il d’acides aminés
20
Est ce que tous les acides aminés ont des propriété identiques
Non , varient en taille, forme, charge, hydrophobicité et réactivité
Propriété d’un acide aminé est défini par quoi
La chaine latérale R
Quel sont les a.a. hydrophobe ( non-polaire ) et nommé les particularité
- Glycine ( non-chiral )
- Alanine
- Valine
- Leucine
- Isoleucine
- Méthionine ( possède un souffre )
- Proline ( à un cycle dans lequel est l’amine )
- Phenylalanine ( cycle et résonance )
- Tryptophan ( 2 cyle )
Quel sont les a.a. avec les chaines latérales polaires non-chargées
- Asparagine ( 2e NH2 )
- Glutamine ( 2e NH2 )
- Tyrosine ( alcool et cycle )
- Cystéine ( SH )
- Sérine ( alcool )
Quels sont les a.a. avec les chaines latérales polaires basique ( chargée + )
- Lysine ( Un NH3)
- Arginine ( R composé de CN3H5)
- Histidine ( cycle avec deux N )
Quels sont les a.a. avec les chaines latérales polaires acide ( chargée -)
- Acide aspartique ( acide carboxylique )
- Acide glutamique ( acide carboxylique )
Quels sont les propriétés des a.a. hydrophobe
- Non-polaires;
- Interaction faible ou nulle avec l’eau;
- les acides aminés hydrophobes sont retrouvés à l’intérieur de la molécule;
- Ne participent pas directement aux réactions chimiques ( pcq les rct se font majoritairement avec l’eau )
Quels sont les propriétés des a.a. polaires non-chargés
- Polaires;
- Interaction des groupements fonctionnels avec l’eau;
- Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
- Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
Quelle est la particularité de l’histidine
- Le groupement imidazole de l’histidine peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH.
- Dans une protéine, permet de moduler l’activité en fonction du pH.
- Peut être polaire chargés et non-chargés
Quelle est la particularité de la Glycine
- Petit, seul acide aminé non-chiral
- non-hydrophobe et non-chargé, on le classe parfois parmi les a.a. polaires
Quelles sont les particularités des a.a. polaires chargées
- Chaîne latérale chargée à pH physiologique;
- Polaire;
- Dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant;
- Peuvent également se retrouver à l’intérieur, si pont H possible.
Le pKa indique quoi dans la courbe de titrage
point d’inflexion de la courbe de titrage du groupe ionisable
Qu’est ce que le point isoélectrique
(zwitterion):
pH où l’acide aminé est électriquement neutre (100% des molécules sont sous leur forme électroniquement neutre )
Comment on définis le points isoélectrique
- pI = (pKa1 +pKa2)/2
(si 2 fonctions ionisables) - pI = (pKa1 + pKa2)/2 (si diacide)
- pI = (pKa2 + pKa3)/2 (si dibasique)
Qu’est ce que le pH physiologique
pH normal à l’intérieur de la cellule environ 7 - 7.4
Le pKa de la sln indique quoi dans la quantité d’acide et de base
Au pKa la moitie est sous la forme de la base conj. et l’autre encore en acide
Pourquoi autour du pKa on a un pH de la sln qui change peut ( tampon )
Au début la sln possède deja des h+ quand on rajoute l’acide le OH- de la base prends quand meme des H+ de la sln mais au pka on va prendre les H+ de l’acide pcq l’acide est plus reactif ainsi la quantité de H+ de la sln ne change pas alors le pH ne change pas
