11.3 : La chromatine Flashcards
Pourquoi la transcription ne peut pas commencer directement avec l’ADN polymérase chez les eucaryotes
1 ) L’ADN est beaucoup plus abondant. Avec l’évolution, la taille du génome codant augmente en fonction du nombre de types cellulaires. La taille du génome non codant augmente encore plus , ce qui indique encore une fois l’importance de la partie non codante, nommée la matière noire du génome et
2) l’ADN est condensé dans la chromatine. En effet l’ADN, faisant presque 2 m de longueur, est replié dans la chromatine et il n’est pas très accessible. .Alors, la chromatine est une barrière formidable pour l’ARN polymérase.Il est évident qu’avant de reconnaitre le promoteur, il faudra exposer la chromatine où ces promoteurs sontlocalisés.
Donnes les trois étapes de la transcription chez les eucaryotes
1) Remodelage de la chromatine,
2) Recrutement du Médiateur
3) Recrutement de l’ARN polymérase et les facteurs généraux de la transcription
Donnez les deux sous étapes de l’étapes 1 de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes
- Facteurs de transcription spécifiques: ne lient pas le promoteur
- Complexes de remodelage: ouvrent la chromatine
Qu’est ce que le remodelage de la chromatine
rendre des séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription
Les complexes de remodelage de la chromatine sont recrutés par quoi
les facteurs de transcription/ pionniers ( sous-étape 1 )
Que font les facteurs de transcription avant la transcription
- reconnaissent un site de liaison spécifique autour de la région promotrice du gène qui sera activé
- recrutent des complexes de remodelage de la chromatine qui vont ouvrir la chromatine et exposer la région du promoteur
V/F : les facteurs de liaison peuvent reconnaitre leur site de liaison même dans le contexte de nucléosomes
Vrai
Que sont les complexes de remodelage et quel sont leur fonction
Les complexes de remodelage de la chromatine contiennent une ATPase de la superfamille SNF2
=> catalyse le glissement ou le déroulement de nucléosomes, l’éviction des histones ou l’échange des histones
Les complexes de remodelage de la chromatine contiennent aussi des enzymes qui catalysent quelles modifications
des modifications post-transcriptionnelles des histones
=> modification des queues N-terminales des histones
Quel sont les modification apporté au histone ( queue N-terminal ) par les complexe de remodelage
La queue N-terminale avec des lysines peut être modifiées par acétylation et méthylation
Qu’est ce que le code des histones
- code qui est composé des différentes modification des différent histone
Le code des histones détermine quoi
détermine la liaison des différents facteurs à la chromatine et sa conformation ouverte ou fermée
Quelle modification ( dans le code des histone ) ferment la chromatine ( servent à la répression des gène )
méthylation des lysines 9 et 27 de la H3
Quelle modification ( dans le code des histone ) active la chromatine
- : méthylation de la lysine 4 de la H3,
- acétylation des lysines 9 de H3
- acétylation de la lysine 16 de H4
Que font les histone acétyltransférases (HAT) , qu’est ce qui annule cette modification
catalyse la décondensation de la chromatine en ajoutant des groupement acétyles sur la chaîne latérale des Lys.
=>Des histones désacétylases (HDAC) annulent cette modification.
Qu’est ce qu’un médiateur
un complexe-multi protéique qui est recruté au promoteur
=> une fois que la chromatine est décompactée et modifiée
Quel est le rôle du médiateur
- responsable du recrutement de la Pol II en réponse aux facteurs de transcription
- En conjonction avec les facteurs généraux de la transcription, il est responsable de l’assemblage des complexes de préinitiation
Comment on reconnait les facteurs généraux de la pol II et donnez des exemple
portent tous le chiffre romain II.
- TFIID
- TFIIH
- TFIIB
Quel est le rôle de TFIIB et TFIID
- TFIIB est similaire aux facteurs sigma bactériens.
- TFIIB et TFIID lient plusieurs éléments du promoteur.
Nommez deux des nombreuses sous-unité de TFIID
- TBP ou TATA binding protéine ( lie le TATA box )
- TAF1
Pourquoi avons-nous besoin d’autant d’éléments pour reconnaître le promoteur
un gène donné peut contenir plusieurs éléments mais pas tous. La composition de TFIID change entre les différentes types cellulaires ce qui aide a choisir le bon programme de transcription.
V/F : TBP est la protéine la plus grande chez TFIID
FAUX , c’est TAF1
TAF 1 est composé de plusieurs quoi qui lui permettent de quoi
TAF1 a plusieurs motifs qui lui permettent de:
1- lier TBP,
2- activité HAT,
3- Bromodomaine qui peut lier les lysines acétylées,
4- activité kinase
5- Activité mono-ubiquitine ligase de l’histone H1.
TAF1 est quoi et est recruté par quoi
Un facteur général qui est recruté par les facteurs de transcription spécifiques ou activateurs et médiateurs
