Cours 2.3 : Structure tertiaire des protéines Flashcards
Qu’est ce que la structure tertiaire
- Repliement du polypeptide en entier , en 3 dimensions dans l’espace.
- Conformation native = biologiquement active;
- Assemblage de plusieurs motifs;
Qu’est ce que les motifs
- assemblage de plusieurs structures secondaires;
- Associé à une fonction spécifique de la protéine
Le repliement de structure tertiaire dépend de quoi
- Liaisons H;
- Liaisons électrostatiques;
- Effet hydrophobe;
- Liaisons covalentes S-S (ponts disulfures).
Ex d’une structure tertiaire : Des feuillets b et des hélices a sont assemblés dans une seule masse …
Globulaire
Donnez des exemples de motifs protéique
Hélice-tour-hélice
Coiled-coil
Helix bundle
Épingle à cheveu
Tonneau b (feuillet plisé beta antiparrallèle relier par des boucles )
Clef grecque
=> Diapo 3
Donnez un exemple de Tonneau a/B
Ex: Triosephosphate isomérase
- Assemblage de 8 feuillets b et de 8 hélices a
Le motif protéique à doigt de zinc (zinc finger)sont caractéristique de quelles protéines
Caractéristique des protéines de liaison à l’ADN ou l’ARN
Quel sont trois domaines protéiques distincts
- Un domaine de liaison à l’ATP (feuillets b).
- Un domaine de liaison au substrat (hélices a et feuillets b) ;
- Un domaine régulateur de l’activité (hélices a et feuillets b);
Les domaines hydrophobe sont maintenus où
à l’intérieur de la protéine
Décrivez énergiquement le dépliement de la protéine
Énergiquement défavorable parce qu’il expose les domaines hydrophobes au milieu aqueux
Expliquer les caractéristiques des liens entre des cystéine dans un polypeptides
- Liaison covalente entre résidus cystéine à l’intérieur d’un même polypeptide ou entre différentspolypeptides
- Oxydation des groupes SH des cystéines
- Réaction réversible, les liaisons peuvent être réarrangées après la synthèse protéique
L’effet hydrophobe est responsable de quelle force dans la protéine
principale force de stabilisation de la structure protéique
Les résidus cystéine peuvent former quoi
Des ponts disulfure
Les pont disulfure sont nécessaire à quoi
À la formation et/ou stabilisation de la structure 3D de certaines protéines
La formation des structure 3D est catalysée par quoi
La disulfide isomérase présente dans le réticulum endoplasmique
