Virus biologie et classification Flashcards
Nomme 5 caractéristiques principales des virus
- pas vivant
- parasites intracellulaire obligatoire
- produisent protéines et énergie (même en dehors de cell)
- bcp plus petit que bactéries (grossissement 100 000x)
- peuvent infecter insecte, poisson, plante, reptile, mammifères, bactéries (bacétériophage)
Décris la structure d’un virus
- particule virale: virion
- vision composé d’un génome entouré dune capside avec ou non enveloppe
- génome composé d’ADN ou ARN, mais pas les 2
- capside peut être entouré d’une enveloppe
1. composante interne: protéines virales
2. composantes externe: composante lipidique
3. +/- spike: glycoprotéines
Quelle est la différence entre la structure des virus nu et enveloppé
virus enveloppé possède une enveloppe autour de la capsule
- composante interne: prpétine virale
- composante externe lipidique
- spikes: glycoprotéine
Quelles sont les deux types de classification des virus
selon génome
- adn ou arn
- linéaire, circulaire, segmenté
- simple brin ou double brin
forme
- icosaèdre
- sphérique
- filamenteux
- balle de fusil
Décris les étapes de la réplication virale
- reconnaissance protéine virale et récepteur
- attachement protéine virale sur la capside (clé) et récepteur cellulaire (serrure)
- pénétration virus dans l’hôte
- décaspidation: perte capside
- transcription en protéine et réplication du génome
- assemblage protéine et génome pour former nouveau virus
- libération hors de l’hôte
Où a lieu la réplication virale
virus ARN: dans le cytoplasme
virus ADN: dans le noyau
Définis un rétrovirus
- virus ARN
- contient une transcriptase inverse qui permet de transformer ARN viral en ADN viral
- ADN viral va être intégré à l’ADN de l’hôte et met le virus à l’abri du SI de l’hôte
Quelles sont les deux façon de classifier les virus
selon l’hote
- plante
- animaux
- bactérie
selon leur structure
- morphologie/forme
- génome: ADN ou ARN
- taille
- nu ou enveloppé
Quels sont les virus ARN et ADN nu et enveloppé
ADN enveloppé
- herpesviridae
- hépatite b
ADN nu
- VPH
- adénovirus
- parvovirus b19
ARN enveloppé
- virus influenza
- virus covid
- virus respiratoire syncytial
- rougeole
- rubéole
- oreillon
- VIH
- hépatite C
ARN nu
- hépatite A
- entérovirus
- rhinovirus
- rotavirus
- calicivirus
- astrovirus
Quelles sont les caractéristiques des virus nu et enveloppés
- résistance
- résistance tractus gi
- libération de l’hote
- transmission
virus nus
- résistance température, sécheresse, acidité, détergents
- bonne survie environnement et acidité gastrique (tractus gi)
- libéré de l’hote par lyse cell
- transmission
1. fécale orale: virus causant gastro-entérite, hépatite a
2. gouttelettes: adénovirus, parvovirus, rhinovirus
3. contact direct: vph
virus enveloppés
- mauvaise résistance aux conditions adverses de l’environnement
- résiste pas à l’acidité gastrique
- libération de l’hote par bourgeonnement ou lyse cell
- transmission
1. gouttelettes: virus respiratoires, RRO
2. contact direct: herpesviridae, EBV
3. exposition liquide biologique: VIH, hépatite B et C
Quels virus peuvent être classifier selon le tropisme
tropisme : croit dans des conditions spécifiques comme tissus
adénovirus: adénoïdes
entérovirus: tractus gi
hépatite a,b,c,d,e: foie
Comment les virus peuvent ils être classé selon leur capacités à être cultivable en labo
- virus cultivable
- virus non cultivable
Qu’est-ce qu’un arbovirus et donne des exemples
virus transmis par la piqûre d’un insecte
- arthropod born virus
ex
- virus du nil occidental
- virus zika
- virus fièvre jaune
- virus de la dengue
- virus chikungunya
Quelle est la classification des virus selon leurs manifestations cliniques
- jaunisse/ictère
- hépatites
- fièvre jaune - encéphalite
- gastro-entérite
- virus exanthémateux (éruption cutanée)
- érythème ou macule (rougeur)
- érythèmo-papulaire ou maculo-papulaire (rougeur + lésion surélevée)
Quelles sont les virus qui donne des éruption rougeurs vs vésicule
éruption type rougeur
- rougeole
- rubéole
- virus herpès humaine 6 (roséole)
- parvovirus
- EBV
- entérovirus
- VIH
éruption type vésicule
- virus varicella-zoster
- virus herpès simplex
- entérovirus
Quels sont les outils diagnostiques disponibles pour les infections virales
- culture virale (on ne la fait plus dans les hopitaux depuis covid)
- détection antigène viraux
- TAAN
- test sérologie virale (détection Ac) –> bcp utilisé
quels sont les prélèvements quon peut faire pour une culture virale
prélèvement de
- lésion cutanée
- muquesue: vulve, col, gorge
- tissu/biopsie: poumons, rein foie
- liquide normalement stérile: LCR, urine
Pour quel virus faisons nous le prélèvement du nasopharynx pour la détection d’antigène et décris ce test
covide et influenza –> prélèvement nasopharynx
- déposer échantillon sur la cupule du bas
- mettre réactif A à g qui contient des Ac anti-influence A couplé à une enzyme
- mettre réactif B à d qui contient Ac anti-influenza B couplé à une enzyme
- mettre réactif C qui contient substrat de l’enzyme
- observer réaction/résultats
Pour quels virus faisons nous la recherche d’antigène et via quel type d’échantillon
hépatite B: sérum
VIH (Ag p24 VIH) : sérum
covid: gorge, nez, nasopharynx
Pourquoi la recherche d’antigène viraux sur le nasopharynx n’est pas recommandé et quels sont ces application pour la covid
- moins sensible que TAAN
- applicable à peu de virus
covid
- moins sensible que TAAN (faux négatif)
- moins spécifique que TAAN (faux positif)
- utilisé au qc pour les personnes symptomatique slm
Quels sont les avantages et les inconvénients du TAAN
- en + utilisé
- applicable à plusieurs virus
- $$$$
- résultat rapide (moins de 24h)
- personnel spécialisé: technicien, biologiste moléculaire
- pas dispo dans tous les hopitaux
à quoi servent les test de sérologie et comment se font ils
détection d’anticorps (ou d’antigène) dans le sérum du patient
prise de sang
centrifugation pour coagulation
décante le sérum(surnageant)
À quels moment les TAAN sur le sang sont ils applicables
pas applicables
- virus respiratoire
applicable pour
- VIH
- hépatite c
- hépatite b
Décris la cinétique de la production d’Ac
IgM produit en premier lors nouvelles infection et reste qlq sem après infection
IgG produit un peu plus tard mais reste toute la vie
IgM indique infection récente
Pour quel virus peut on détecter la présence d’IgM dans les labo hospitalier
- cytomégalovirus
- EBV
- rougeole
- rubéole
- oreillons
- parvovirus b19
- hépatite a
- hépatite b
