Virus biologie et classification Flashcards

1
Q

Nomme 5 caractéristiques principales des virus

A
  • pas vivant
  • parasites intracellulaire obligatoire
  • produisent protéines et énergie (même en dehors de cell)
  • bcp plus petit que bactéries (grossissement 100 000x)
  • peuvent infecter insecte, poisson, plante, reptile, mammifères, bactéries (bacétériophage)
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2
Q

Décris la structure d’un virus

A
  • particule virale: virion
  • vision composé d’un génome entouré dune capside avec ou non enveloppe
  • génome composé d’ADN ou ARN, mais pas les 2
  • capside peut être entouré d’une enveloppe
    1. composante interne: protéines virales
    2. composantes externe: composante lipidique
    3. +/- spike: glycoprotéines
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3
Q

Quelle est la différence entre la structure des virus nu et enveloppé

A

virus enveloppé possède une enveloppe autour de la capsule
- composante interne: prpétine virale
- composante externe lipidique
- spikes: glycoprotéine

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4
Q

Quelles sont les deux types de classification des virus

A

selon génome
- adn ou arn
- linéaire, circulaire, segmenté
- simple brin ou double brin

forme
- icosaèdre
- sphérique
- filamenteux
- balle de fusil

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5
Q

Décris les étapes de la réplication virale

A
  1. reconnaissance protéine virale et récepteur
  2. attachement protéine virale sur la capside (clé) et récepteur cellulaire (serrure)
  3. pénétration virus dans l’hôte
  4. décaspidation: perte capside
  5. transcription en protéine et réplication du génome
  6. assemblage protéine et génome pour former nouveau virus
  7. libération hors de l’hôte
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6
Q

Où a lieu la réplication virale

A

virus ARN: dans le cytoplasme
virus ADN: dans le noyau

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7
Q

Définis un rétrovirus

A
  • virus ARN
  • contient une transcriptase inverse qui permet de transformer ARN viral en ADN viral
  • ADN viral va être intégré à l’ADN de l’hôte et met le virus à l’abri du SI de l’hôte
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8
Q

Quelles sont les deux façon de classifier les virus

A

selon l’hote
- plante
- animaux
- bactérie

selon leur structure
- morphologie/forme
- génome: ADN ou ARN
- taille
- nu ou enveloppé

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9
Q

Quels sont les virus ARN et ADN nu et enveloppé

A

ADN enveloppé
- herpesviridae
- hépatite b

ADN nu
- VPH
- adénovirus
- parvovirus b19

ARN enveloppé
- virus influenza
- virus covid
- virus respiratoire syncytial
- rougeole
- rubéole
- oreillon
- VIH
- hépatite C

ARN nu
- hépatite A
- entérovirus
- rhinovirus
- rotavirus
- calicivirus
- astrovirus

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10
Q

Quelles sont les caractéristiques des virus nu et enveloppés
- résistance
- résistance tractus gi
- libération de l’hote
- transmission

A

virus nus
- résistance température, sécheresse, acidité, détergents
- bonne survie environnement et acidité gastrique (tractus gi)
- libéré de l’hote par lyse cell
- transmission
1. fécale orale: virus causant gastro-entérite, hépatite a
2. gouttelettes: adénovirus, parvovirus, rhinovirus
3. contact direct: vph

virus enveloppés
- mauvaise résistance aux conditions adverses de l’environnement
- résiste pas à l’acidité gastrique
- libération de l’hote par bourgeonnement ou lyse cell
- transmission
1. gouttelettes: virus respiratoires, RRO
2. contact direct: herpesviridae, EBV
3. exposition liquide biologique: VIH, hépatite B et C

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11
Q

Quels virus peuvent être classifier selon le tropisme

A

tropisme : croit dans des conditions spécifiques comme tissus

adénovirus: adénoïdes
entérovirus: tractus gi
hépatite a,b,c,d,e: foie

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12
Q

Comment les virus peuvent ils être classé selon leur capacités à être cultivable en labo

A
  • virus cultivable
  • virus non cultivable
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13
Q

Qu’est-ce qu’un arbovirus et donne des exemples

A

virus transmis par la piqûre d’un insecte
- arthropod born virus

ex
- virus du nil occidental
- virus zika
- virus fièvre jaune
- virus de la dengue
- virus chikungunya

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14
Q

Quelle est la classification des virus selon leurs manifestations cliniques

A
  1. jaunisse/ictère
    - hépatites
    - fièvre jaune
  2. encéphalite
  3. gastro-entérite
  4. virus exanthémateux (éruption cutanée)
    - érythème ou macule (rougeur)
    - érythèmo-papulaire ou maculo-papulaire (rougeur + lésion surélevée)
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15
Q

Quelles sont les virus qui donne des éruption rougeurs vs vésicule

A

éruption type rougeur
- rougeole
- rubéole
- virus herpès humaine 6 (roséole)
- parvovirus
- EBV
- entérovirus
- VIH

éruption type vésicule
- virus varicella-zoster
- virus herpès simplex
- entérovirus

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16
Q

Quels sont les outils diagnostiques disponibles pour les infections virales

A
  • culture virale (on ne la fait plus dans les hopitaux depuis covid)
  • détection antigène viraux
  • TAAN
  • test sérologie virale (détection Ac) –> bcp utilisé
17
Q

quels sont les prélèvements quon peut faire pour une culture virale

A

prélèvement de
- lésion cutanée
- muquesue: vulve, col, gorge
- tissu/biopsie: poumons, rein foie
- liquide normalement stérile: LCR, urine

18
Q

Pour quel virus faisons nous le prélèvement du nasopharynx pour la détection d’antigène et décris ce test

A

covide et influenza –> prélèvement nasopharynx

  1. déposer échantillon sur la cupule du bas
  2. mettre réactif A à g qui contient des Ac anti-influence A couplé à une enzyme
  3. mettre réactif B à d qui contient Ac anti-influenza B couplé à une enzyme
  4. mettre réactif C qui contient substrat de l’enzyme
  5. observer réaction/résultats
19
Q

Pour quels virus faisons nous la recherche d’antigène et via quel type d’échantillon

A

hépatite B: sérum
VIH (Ag p24 VIH) : sérum
covid: gorge, nez, nasopharynx

20
Q

Pourquoi la recherche d’antigène viraux sur le nasopharynx n’est pas recommandé et quels sont ces application pour la covid

A
  • moins sensible que TAAN
  • applicable à peu de virus

covid
- moins sensible que TAAN (faux négatif)
- moins spécifique que TAAN (faux positif)
- utilisé au qc pour les personnes symptomatique slm

21
Q

Quels sont les avantages et les inconvénients du TAAN

A
    • en + utilisé
  • applicable à plusieurs virus
  • $$$$
  • résultat rapide (moins de 24h)
  • personnel spécialisé: technicien, biologiste moléculaire
  • pas dispo dans tous les hopitaux
22
Q

à quoi servent les test de sérologie et comment se font ils

A

détection d’anticorps (ou d’antigène) dans le sérum du patient

prise de sang
centrifugation pour coagulation
décante le sérum(surnageant)

22
Q

À quels moment les TAAN sur le sang sont ils applicables

A

pas applicables
- virus respiratoire

applicable pour
- VIH
- hépatite c
- hépatite b

23
Q

Décris la cinétique de la production d’Ac

A

IgM produit en premier lors nouvelles infection et reste qlq sem après infection

IgG produit un peu plus tard mais reste toute la vie

IgM indique infection récente

24
Q

Pour quel virus peut on détecter la présence d’IgM dans les labo hospitalier

A
  • cytomégalovirus
  • EBV
  • rougeole
  • rubéole
  • oreillons
  • parvovirus b19
  • hépatite a
  • hépatite b