Le microbiote Flashcards
Quelles sont les deux grands projets génétiques historiques
Human Genome Project
- sur 13ans
- séquençage du génome humain (3 millards pb)
Human Microbiome Project
- analyser la composition génétique de la population microbienne qui vit sur et dans un adulte en santé (microbiome)
- ration bactéries:cellules = 10:1
Comment évolue le microbiome des êtres humains
- foetus: vit dans un milieu stérile
- naissance: premier contact avec la flore normale de sa mère (vaginale ou peau) = début de la colonisation de la peau et du tube digestif du bébé par une flore normale
- enfant entre en contact avec d’autres personnes, animaux et bactéries de l’environnement ce qui développement son microbiome
Quelle est la différence entre microbiote et microbiome
microbiote: ensemble des micro-organismes qui vivent sur un site donné (peau, narines, tractus génito-urianaire, tractus gastro-intestinal, etc.)
microbiome: ensemble des micro-organismes et de leur gènes qui vivent sur un site donné
Quelle est la différence entre un microbiome central et secondaire
microbiome central
- espèces bactériennes qui se retrouvent chez plus de 95% des individus humains à un site donné
- majorité des bactéries présentes à un site donné
- moins grandes variété que microbiome secondaire
microbiome secondaire
- espèces bactériennes qui varient d’une personne à l’autre
- très grandes variétés d’espèces
- chaque espèce se retrouve en plus petite qté à un site donné comparé au microbiome central
Quelles sont les bactéries qui font partie de la flore normale du microbiome central pour la peau, la bouche, le colon et le vagin
Peau
- staphylococcus epidermis
- corynebacterium
- propionibacterium
Bouche
- streptococcus viridian
- corynebacterium
- neisseria
Colon
- escherichia coli
- klebsiella
- proteus
- enterococcus
- bacteroides
Vagin
- lactobacillus
Quels sont les 3 facteurs qui font varier le microbiote cutané (de la peau)
- varie selon le site de la peau
- influencé par la présence ou non de glande sébacée et d’humidité
- varie selon le sexe
Quelles sont les différentes qté de bactéries selon les sites suivants: bouches, estomac, intestin grêle, colon, vagin
bouche: 10^9 organismes/ml
estomac: 10^3 organismes/ml (à cause acidité)
intestin: 10^4 organismes/g
colon: 10^11organismes/g
vagin: 10^9 organismes/ml
Comment varie le microbiote du tractus digestif, combien de bactéries dans le colon, quelles bactéries dominent dans le colon, combien d’espèces dans le colon et comment fait on pour les identifier
varie en diversité et qté selon le segment du tube
10^11 bactéries/g
bactéries anaérobie stricte (odeur qui pue) plus nombreuses que aérobie
plus de 200 espèces
- non cultivables
- identifier par séquençage moléculaire
Pourquoi la technique par coloration de gram ne permet pas d’identifier les bactéries dans le colon
parce qu’il y en a trop
Comment varie le microbiote humain sain et qu’est-ce qui peut contribuer à le diversifier
Varie grandement
- dune personne à l’autre
- d’une région géographique à l’autre
- en fonction de l’âge
alimentation variée = microbiote diversifié = bon pour la santé
est-ce que l’analyse du microbiote permet de prédire le développement éventuel de maladies
Non
Comment évolue le microbiote avec l’âge
Naissance
- qualité du microbiote dépend du type de naissance
- par voies vaginales: microbiote formé à partir des bactéries du vagin de la mère (lactobacillus)
- par césarienne: microbiote formé à partir des bactéries de la peau (staphylococcus épidermis, corynebacterium, propionibacterium)
- césarienne: plus susceptible aux pathogènes et aux maladies d’hypersensibilité (eczéma)
enfance
- développement microbiote et diversité
- varie selon alimentation, maladies, prises antibio
adulte
- modification du microbiote selon alimentation
- changement plus lent qu’en enfance
vieux
- modification du microbiote: très différent qu’à l’âge de jeune adulte
Quels sont les rôles du microbiotes intestinal
- fonction métabolique
- métaboliser les nutriments pour faciliter l’absorption par les cellules de l’hôtes
- transformer les grosses molécules d’hydrates de carbone (cellulose) en petites molécules pour favoriser absorption par enterocytes
- acide (acétate, propionate, butyrate) empêche croissance de bactérie indésirables - fonction immunitaire innée
- prévient colonisation de bactéries pathogènes
- protège contre infections entériques
De quelles façons le microbiote intestinal protège contre les infections entériques
- tapisse la muqueuse (sert de rempart/obstacle mécanique) et consomment les nutriments (affament les pathogènes)
- stimule production de mucines, immunoglobuline IgA, peptides antimicrobiens –> fonction de protection
- stimule la production des cytokines IL-22 (augmente résistance cell épithéliales) et IL-Ibeta (augmente recrutement cell inflammatoire)
Quels sont les facteurs externes qui influencent le microbiotes
- hygiène personnel: savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale
- diète (riche en fibres, sucres, lipides) + diversifiée ou non
- eau (chlore vs puit)
- prise antibio