Le microbiote Flashcards

1
Q

Quelles sont les deux grands projets génétiques historiques

A

Human Genome Project
- sur 13ans
- séquençage du génome humain (3 millards pb)

Human Microbiome Project
- analyser la composition génétique de la population microbienne qui vit sur et dans un adulte en santé (microbiome)
- ration bactéries:cellules = 10:1

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2
Q

Comment évolue le microbiome des êtres humains

A
  1. foetus: vit dans un milieu stérile
  2. naissance: premier contact avec la flore normale de sa mère (vaginale ou peau) = début de la colonisation de la peau et du tube digestif du bébé par une flore normale
  3. enfant entre en contact avec d’autres personnes, animaux et bactéries de l’environnement ce qui développement son microbiome
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3
Q

Quelle est la différence entre microbiote et microbiome

A

microbiote: ensemble des micro-organismes qui vivent sur un site donné (peau, narines, tractus génito-urianaire, tractus gastro-intestinal, etc.)

microbiome: ensemble des micro-organismes et de leur gènes qui vivent sur un site donné

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4
Q

Quelle est la différence entre un microbiome central et secondaire

A

microbiome central
- espèces bactériennes qui se retrouvent chez plus de 95% des individus humains à un site donné
- majorité des bactéries présentes à un site donné
- moins grandes variété que microbiome secondaire

microbiome secondaire
- espèces bactériennes qui varient d’une personne à l’autre
- très grandes variétés d’espèces
- chaque espèce se retrouve en plus petite qté à un site donné comparé au microbiome central

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5
Q

Quelles sont les bactéries qui font partie de la flore normale du microbiome central pour la peau, la bouche, le colon et le vagin

A

Peau
- staphylococcus epidermis
- corynebacterium
- propionibacterium

Bouche
- streptococcus viridian
- corynebacterium
- neisseria

Colon
- escherichia coli
- klebsiella
- proteus
- enterococcus
- bacteroides

Vagin
- lactobacillus

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6
Q

Quels sont les 3 facteurs qui font varier le microbiote cutané (de la peau)

A
  1. varie selon le site de la peau
  2. influencé par la présence ou non de glande sébacée et d’humidité
  3. varie selon le sexe
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7
Q

Quelles sont les différentes qté de bactéries selon les sites suivants: bouches, estomac, intestin grêle, colon, vagin

A

bouche: 10^9 organismes/ml
estomac: 10^3 organismes/ml (à cause acidité)
intestin: 10^4 organismes/g
colon: 10^11organismes/g
vagin: 10^9 organismes/ml

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8
Q

Comment varie le microbiote du tractus digestif, combien de bactéries dans le colon, quelles bactéries dominent dans le colon, combien d’espèces dans le colon et comment fait on pour les identifier

A

varie en diversité et qté selon le segment du tube

10^11 bactéries/g

bactéries anaérobie stricte (odeur qui pue) plus nombreuses que aérobie

plus de 200 espèces
- non cultivables
- identifier par séquençage moléculaire

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9
Q

Pourquoi la technique par coloration de gram ne permet pas d’identifier les bactéries dans le colon

A

parce qu’il y en a trop

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10
Q

Comment varie le microbiote humain sain et qu’est-ce qui peut contribuer à le diversifier

A

Varie grandement
- dune personne à l’autre
- d’une région géographique à l’autre
- en fonction de l’âge

alimentation variée = microbiote diversifié = bon pour la santé

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11
Q

est-ce que l’analyse du microbiote permet de prédire le développement éventuel de maladies

A

Non

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12
Q

Comment évolue le microbiote avec l’âge

A

Naissance
- qualité du microbiote dépend du type de naissance
- par voies vaginales: microbiote formé à partir des bactéries du vagin de la mère (lactobacillus)
- par césarienne: microbiote formé à partir des bactéries de la peau (staphylococcus épidermis, corynebacterium, propionibacterium)
- césarienne: plus susceptible aux pathogènes et aux maladies d’hypersensibilité (eczéma)

enfance
- développement microbiote et diversité
- varie selon alimentation, maladies, prises antibio

adulte
- modification du microbiote selon alimentation
- changement plus lent qu’en enfance

vieux
- modification du microbiote: très différent qu’à l’âge de jeune adulte

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13
Q

Quels sont les rôles du microbiotes intestinal

A
  1. fonction métabolique
    - métaboliser les nutriments pour faciliter l’absorption par les cellules de l’hôtes
    - transformer les grosses molécules d’hydrates de carbone (cellulose) en petites molécules pour favoriser absorption par enterocytes
    - acide (acétate, propionate, butyrate) empêche croissance de bactérie indésirables
  2. fonction immunitaire innée
  3. prévient colonisation de bactéries pathogènes
    - protège contre infections entériques
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14
Q

De quelles façons le microbiote intestinal protège contre les infections entériques

A
  1. tapisse la muqueuse (sert de rempart/obstacle mécanique) et consomment les nutriments (affament les pathogènes)
  2. stimule production de mucines, immunoglobuline IgA, peptides antimicrobiens –> fonction de protection
  3. stimule la production des cytokines IL-22 (augmente résistance cell épithéliales) et IL-Ibeta (augmente recrutement cell inflammatoire)
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15
Q

Quels sont les facteurs externes qui influencent le microbiotes

A
  • hygiène personnel: savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale
  • diète (riche en fibres, sucres, lipides) + diversifiée ou non
  • eau (chlore vs puit)
  • prise antibio
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16
Q

Définis la dysbiose

A

Altération de la flore normale

17
Q

Donne 5 exemples de dysbiose et ce qui les cause

A
  1. diarrhée à clostridioides difficile
    - prise antibio altère la flore normale du colon
    - favorise prolifération de c. difficile (absence de compétition alimentaire)
    - c. difficile produit toxines qui causent diarrhée
  2. colite ulcéreuse
    - augmentation de la bactérie Akkermansia munciniphila qui produit sulfatase (Enzyme) qui dégrade la couche de mucine
    - prolifération de la bactérie Prévotellaceae qui produit chemokine qui induit inflammation
    (maux ventre et diarrhée)
  3. maladie céliaque : entéropathie au glutent
  4. vagininte à candida
  5. obésité: homme/femme ont des bactéries qui dégradent plus facilement et rapidement les grosses molécules d’hydrate de carbone en petites molécules faciles à absorber
18
Q

Quel genre de manipulation peut on faire avec le microbiome humain à des fins thérapeutiques

A

transplantation du microbiome dans des cas de c. difficile où les gens sont réfractaires au traitement standant
- transplantation efficace à 40-96%
- nécessite un donneur

19
Q
  1. Qu’est-ce qu’un probiotique,
  2. quelles sont les microorganismes qui s’y trouvent généralement
  3. de quoi dépend l’efficacité des probiotiques
  4. quel est le problème majeur des probiotiques par rapport aux médicaments
A
  1. mélange de bactéries et/ou de levures dans le but de coloniser (même temporairement) l’intestin
  2. majoritairement des bactéries gram + comme lactobacillus et bifidobacterium et levures comme les saccharomyces
  3. efficacité dépend du types de microorganismes, de la dose et de al capacité de survie des microorganismes à acidité de l’estomac
  4. contrairement au médicament, moins bon controle de la composition exacte et de la concentration résiduelle des microorganismes après passage dans estomac
20
Q

Qu’est-ce qu’un pouchite et quel est le lien avec les probiotiques

A

pouchite = inflammation du réservoir iléale suite à une colectomie totale avec anastomose iléorectale
- probiotiques permettent de protéger contre inflammation

21
Q

Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante du nouveau né (symptome, causes, mortalité) et quel est le lien avec les probiotiques

A
  • maladie qui touche intestin chez enfant né prématurément (< 37sem)
  • symptomes: gonflement abdomen, sang dans les selles, air dans la paroi intestin
  • causes: prédisposition génétique + intestin immunoréactif + réponse inflammatoire immature
  • dysbiose tube digestif
  • moralité 20-30%
  • probiotiques pour prévenir cette maladie
22
Q

Quelles sont les conseils de l’INESS sur les probiotiques

A
  • recommande pas administration dans prévention et traitement de c. difficile
  • contre-indiqué chez les immunosupprimés car si lésion intestin –> entre dans le sang –> conséquence graves
  • peu d’études scientifique qui démontrent efficacité de probiotiques spécifique

on recommande plutot d’avoir une alimentation riches et diversifiées et manger du yogourt

23
Q

Qu’est-ce qu’un prébiotique

A

produits alimentaires administrés qui favorisent la croissance de microorganismes endogènes désirables