Virologie : Partie 7 Flashcards
Pourquoi en cas d’infection virale les C meurent ?
Par accumulation de matériel viral qui désorganise la structure et les fonction cellulaire
Quelles sont les morts possibles pour les C infectée par les virus ?
- Apoptose
- Nécrose
Caractéristique de la mort par apoptose ?
→ Programmée
Sécrétion de prot qui entrainent la mort de la cellule
Caractéristiques de la mort par nécrose ?
→ Accidentelle
Détournement du métabolisme cellulaire pour le virus
Qu’est-ce que la tolérance de l’infection ?
Génome viral et cellulaire se partage le potentiel de la C et les métabolismes viraux coexistent sans conséquence négative pour la cellule → Virus latent (VIH, Herpès)
Qu’est-ce que la transformation cellulaire maligne ?
Acquisition par la C infectée des caractères attribués aux C cancéreuses
Les virus ne touent pas les C, au contraire → Augmentation de leur capacité de multiplication
Quels sont les différents types d’infections virale ?
- Aigue : syst immunitaire élimine le virus
- Persistante : Rep immunitaire insuffisante pour éliminer les C infectées et bloquer la réplication virale
Quels sont les possibles scénarios en cas d’infection virale persistante ?
- Infection latente
- Infection chronique
Qu’est-ce qu’une infection latente ?
Virus capable d’intégrer leur génome viral au génome cellulaire → présent sous forme inactive dans le corps
Qu’est-ce qu’une infection chronique ?
Virus persiste et la réplication virale se poursuit malgré la réponse immunitaire insuffisante → dégradation de l’organisme
Définition d’une infection localisée ?
Virus extracellulaire infecte les C voisine : infection de proche en proche
Définition d’une infection généralisée ?
Virus contaminent + loin dans l’organisme → migration vers des organes secondaires via :
* Voie sanguine +++
* Voie nerveuse
* Voie lymphatique
* le syst réticulo-histiocytaire
Le virus grippal provoque une infection localisée ou généralisée ?
Localisée : infection de l’arbre respiratoire supérieur et inférieur
Le poliovirus provoque une infection localisée ou généralisée ?
Généralisée : utilisation du syst rétiulo-histiocytaire puis passage dans le sang
Qu’est-ce qu’une virémie ?
Passage du virus dans le sang
Comment les virus diffusent dans l’organisme grâce au syst réticulo-histiocytaire au niveau des tissus et des muqueuses ?
Virus capturés par les macrophage + polynucléaires →
* Destruction du virus
ou
* Résistance du virus : reste dans la C, véhiculé dans l’organisme
Comment les virus diffusent dans l’organisme via la voie lymphatique ?
Pénétration du virus dans les capillaires lymphatiques → véhiculées par les CPA jusqu’aux organes lymphoïdes périphériques → Possibilité de multiplication → repasse dans le sang → circulent vers d’autres organes
Comment les virus circulent dans le sang ?
→ Librement : entérovirus, parvovirus, HBV, HBC
→ Sous forme intra leucocytaire : VIH, Virus leucémique humain, virus d’Epstein Barr
Quels sont les virus concernée par leur dissémination dans l’organisme via la voie nerveuse ?
Les virus latents +++ → ils peuvent se propager le long des nerfs périphériques
Quels sont les facteurs qui activent les virus latent ?
Stress, fatigue, maladie…
Quels sont les organes cibles des virus ?
- La peau
- Les voies respiratoires
- Tube digestif
- Système nerveux
Quelles parties de la peau peuvent être ciblées par les virus ?
- Le derme
- Épiderme
Signe de la présence d’un virus dans le derme ?
Très vascularisé => virus dans les cellules endothéliales = induction réponse immunitaire :
- inflammation : macule
ou
- infiltration cellulaire : papule
Caractéristiques d’une macule ?
Tache rouge ou brune sans relief
Caractéristiques d’une papule ?
- Tâche rouge présentant un relief = mise en place d’une réponse immunitaire = éruption maculo-papuleuse
- Caractéristique de la rougeole, rubéole
Signe de la présence d’un virus dans l’épiderme ?
Infiltration des C du syst immunitaire => entraîne le décollement de la couche cornée et la formation de vésicules
Virus/maladie caractéristiques de la formation des vésicules ?
- Virus VZV => varicelle/zona
- Formation vésicule avec du liquide à l’intérieur
- L’enfant peut présenter 3 formes de boutons : sec, avec du liquide ou avec des rougeurs => fini en croûte
Conséquence d’une infection par le virus Eblola/Marburg ?
=> Phénomènes hémorragiques
Virus infecte les cellules épithéliales et les tue, avec création de médiateurs qui augmentent la perméabilité vasculaire
Comment varie la sévérité d’une infection des voies pulmonaires ?
● Infections bénignes => sphère ORL et voies respiratoires supérieures
● Sévérité clinique plus marquée lors d’infections des voies respiratoires inférieures
Quel(le)s sont les maladies et virus provoquant des infection des voies respiratoires supérieure ?
- rhinites
- rhino-pharyngites
- otites
- bronchite => rhinovirus, coronavirus
- grippe
Quel(le)s sont les maladies et virus provoquant des infection des voies respiratoires inférieures ?
=> inflammation des bronchioles :
* pneumonie => virus syncytial respiratoire
* bronchiolite
/!\ Risques + élevés car détresse respiratoire
Signe de la présence d’un virus dans le tube digestif ?
→ Gastro-entérites :
* Infection des cellules épithéliales (entérocytes)
* Destruction de l’épithélium
* Atrophie des µvillosités
* Diminution de la sécrétion enzymatique
* Syndrome de la malabsorption => vomissement + diarrhées
Signe de la présence d’un virus dans le SNC ?
- Effet cytopathogène du virus qui se multiplie dans le SNC
- Mécanisme immunopathologique déclenché par le virus => réaction inflammatoire au niveau du cerveau
Maladie virale ayant lieu au niveau du système nerveux ?
- Méningites
- Encéphalites
- Poliomyélites
- Dans des cas rares la rougeole
Quels sont les modes de transmission des infections virales ?
● Horizontale
● Verticale : Systématiquement transmission mère-enfant
Quels sont les modes de transmission horizontale des infections virales ?
- Directe : aérienne, orau-fécale, sexuelle
- Indirecte : aliments, eau, seringues, produits biologiques, vecteurs, animaux, insectes…
Pourquoi faire du diagnostic en virologie ?
- Lors de dons de sang, d’organes et de tissus
- Pour le suivi biologique des infections (VIH, hépatite B et C)
- Diagnostic virologique => développer des mesures prophylactiques + contrôler des
épidémies - Lors d’études épidémiologique
- Preuve de l’origine virale d’une infection
- Développement des antiviraux
- Décision thérapeutique
Quelles sont les phase de l’analyse du diagnostic virologique ?
● Phase préanalytique : définir le type de prélèvement => guidée par l’examen clinique
● Phase analytique : Choix de la méthode d’analyse utilisée pour révéler la présence du virus.
● Validation et interprétation des résultats : On réalise l’examen et on interprète le résultat
Quels sont les types de méthodes lors de l’analyse du prélèvement en virologie ?
- Diagnostic direct : visualise directement le virus ou les structures du virus (Ag)
- Diagnostic indirect : on met en évidence la réponse immunitaire de l’hôte (Ac)
Quels sont les différents produits pathologiques pour l’isolement du virus ?
→ Selles
→ Liquide céphalo-rachidien
→ Sécrétion de l’appareil respiratoire
→ Urines
→ Vésicules et ulcérations cutanéo-muqueuses
→ Sang
→ Fragments de Tissus
Virus et condition de maintient associée aux selles ?
=> adénovirus, entérovirus
* Recueil dans un récipient stérile
Virus et condition de maintient associée au liquide céphalo-rachidien ?
=> poliovirus
* Recueil dans tube sec et temps de transport court (1 h)
Virus et condition de maintient associée aux sécrétions de l’appareil respiratoire ?
=> influenza virus
* Recueil par écouvillonnage ou rinçage du rhinopharynx dans récipient stérile et conservation à 4 °C
Virus et condition de maintient associée aux Urines ?
=> cytomégalovirus
* Recueil dans récipient stérile et temps de transport court (2-3h)
Virus et condition de maintient associée aux vésicules et ulcérations cutanéo-muqueuses ?
=> herpès simplex
* Recueil à la base de la lésion à l’aide d’un écouvillon
Virus et condition de maintient associée au sang ?
=> virus de l’hépatite B, HIV
* Recueil dans un tube anticoagulant
* Tps de transport court (5-6h)
* 1-5 ml enfant et 5-10 ml pour des adultes
Virus et condition de maintient associée aux fragments de Tissus ?
=> Virus de l’hépatite C → foie
* Pièce de biopsie, récipient stérile
Condition de transport des échantillons pour l’isolement d’un virus ?
→ Sans précautions de T° : virus éliminées dans les selles, contenus dans les croûtes
==> Virus nus
→ Avec précautions de T° et de durée de transport
==> Virus enveloppés
Quelles sont les différentes méthodes de diagnostic direct (virus) ?
- Culture classique
- Techniques de détection des virus non cultivables
- Détection directe du génome viral
Quelles snt les sources de C utilisées pour la culture classique pour le diagnostic direct des virus ?
- Les animaux vivants : peu/plus utilisés, mais indispensable pour certains virus
- Œufs embryonnés : utilisé en dans le cas des virus de la grippe + production de vaccins
- C en culture ; base du diagnostic viral, chaque virus a une C spécifique => permet de voir l’effet cytopathique
Principe de la culture en laboratoire des cellules pour le diagnostique des virus ?
On introduit le virus dans le
milieu => si les C sont tuées alors le virus se multiplie
Quels sont les types de cellules utilisée pour la mise en culture ?
- C primaires
- C en lignées continues
Que sont les C primaires et quel sont leurs avantage et inconvénient ?
- C obtenues à partir d’organes (reins de singes ++) ou des
C sanguines : - croissance de nombreux virus
- durée de vie limitée à quelques passages
- contamination par des virus simiens
Que sont les C en lignées continues et quels sont leurs avantages ?
- C transformées, immortalisées, obtenues à partir de tissus
cancéreux - Croissance est très rapide,
- Facile à cultiver
- Nombre de passages illimité
Intérêt de la culture virale avec immunofluorescence ?
µscopie optique n’est pas la meilleure technique => intéressant de la coupler avec l’immunofluorescence
Principe de la culture virale à coloration rapide ?
Couplage avec une enzyme => va cliver le substrat => donne une coloration marron au prélèvement
Quelles sont les techniques de détection des virus non cultivables ?
a. Microscopie électronique
b. Détection des constituants antigéniques
Intérêt de l’utilisation de la µscopie électronique pour détecter les virus ?
- Visualisation directe des virus
- Quantification des virus
- Vérification de la pureté et de la qualité
- Utilisée pour détecter les virus
cultivables ou non
Quelles sont les techniques de détection des constituants antigéniques viraux ?
- Immunofluorescence
- Immunoperoxydase pas fluorescence, mais coloration de la cellule
- Test ELISA : (Enzymes Linked Immuno Serbant Assay)
- Technique d’agglutination
Principe de la technique d’agglutination pour la détectin des Ag viraux ?
Particules de latex couplées à un AC spécifique d’un Ag viral => lorsqu’elles sont en présence du virus => forme un agrégat avec ce dernier
Quelles sont les méthodes de détection directe du génome viral ?
a. Hybridation sans amplification génique
b. Amplification génique
Principe de l’hybridation sans amplification génique ?
Synthétiser une sonde radioactive spécifique d’une séquence génétique du virus => hybridation spécifique entre la séquence cible et la sonde radiomarquée
Quelles sont les méthodes d’amplification génique ?
PCR et RT-PCR : Amplification exponentielle du génome viral à
partir d’un faible échantillon
Quelles sont les principales étapes des PCR et RT-PCR ?
1 : Dénaturation : ADN matrice est séparé en 2 brins différents
2 : Hybridation des amorces spécifiques à un gène : Insertion d’amorces => donnent la spécificité
3 : Élongation : Utilisation d’une TAG polymérase => enzyme permettant de synthétiser le brin
complémentaire dans les 2 sens
Comment vérifier que nous avons une amplification du gène d’intérêt lors d’une PCR/RT-PCR ?
Utilisation d’un gel d’agarose sur
lequel on fait migrer notre PCR et on effectue une électrophorèse
Principe de la RT-PCR ?
Pour les virus à ARN négatif => soumet ARNm- à l’action d’une reverse transcriptase => obtient de l’ADN => soumis à une PCR
Caractéristiques de la PCR en temps réel ?
- Quantitative
- Permet de suivre en tps réel la formation des produits amplifiés
- Quantité d’ADN total ou d’amplicon => mesurée grâce à un marqueur fluorescent
- Reflète le niveau de réplication virale, réplication active
Quelles sont les sondes utilisées pour la PCR en temps réel ?
Le SYBRGreen ⇒ se lie à l’ADN double brin
Finalité de la PCR en temps réel ?
Permet d’estimer la charge virale du patient
