Bactério : Métabolisme des bactéries Flashcards
Caractéristiques du métabolisme ?
- Essentiel à la vie
- Sert à la reproduction, survie, prise de nourriture
- Vaste répertoire de réaction chimique → synthèse d’NRJ
- Plusieurs aspect commun à ts les organismes
Quels sont les points communs entre le métabolisme des bactéries et celui des autres organismes ?
- NRJ → stockée +++ sous ATP
- Réaction d’oxydo-red → conservation + passage de l’NRJ
- Possède des chaines de transport d’e-
- Réactions chimiques organisées en voies biochimiques
- Régulation des voies biochimiques
- Catalyse des réactions par enzymes ou ribosomes
Quels sont les types trophiques des organismes vivants?
8 définit par rapport à :
* Nature des aliment utilisables
* Condition de la production de l’énergie
Quels sont les types trophiques existants ?
- Autotrophe
- Hétérotrophe
- Prototrophe
- Auxotrophe
- Lithotrophe
- Organotrophe
- Phototrophe
- Chimiotrophe
Quel est le type nutritionnel des bactérie pathogènes et du microbiote ?
Chimio-organo-hétérotrophe
Schéma des différentes sources du métabolisme bactérien →
Cours métabolisme page 2
Caractéristiques des bactéries chimiotrophes ?
- Majorité du monde bactérien
- Source d’NRJ chimique
Que signifie des bactéries ayant une source d’NRJ chimique ?
Capable de récupérer l’NRJ libérée dans certaines réaction d’oxydation → stockage sous forme d’ATP
Caractéristiques des bactéries chimiolithotrophe ?
- Tropisme propre au monde bactérien
- Bactéries à rôle écologique
Quels sont les rôles écologiques des bactéries chimiolithotrophes ?
- Réoxydation de certains composés minéraux
- Oxydation de l’oxygène
- Oxydation de l’ammoniaque en nitrate
- Oxydation de divers composés : fer, méthane, oxyde de carbone
Caractéristique de métabolisme des bactéries chimioorganotrophes ?
- Peu différentes des euka
- Existe réaction propres aux bactéries
- Métabolisme bactérien + diversifié que euka
Intérêt de l’étude du métabolisme bactérien ?
→ Indication sur le type de bactérie et des méthode de riposte
* Mode de vie et habitat → probabilité de rencontre avec l’Ho
* Condition optimales de culture
* Caractéristiques physiologique importante → diagnostic
* Aspect physiopathologiques de l’infection
Quelles sont les voies métabolique bactérienne d’utilisation du glucose ?
3 →
* Glycolyse / Voie d’Embden Meyerhof
* Pentose phosphate
* Cycle de Krebs / Cycle des Acides tricarboxyliques
Comment se fait la réoxydation des coenzymes réduits ?
Par la réaction de respiration ou la réaction de fermentation
Localisation de la chaine respiratoire bactérienne ?
Membrane cytoplasmique
Définition de la respiration ?
Ensemble des réaction biochimiques d’oxydation procurant à l’organisme l’NRJ nécessaire à ses biosynthèse essentiellement grâce à des phosphorylation oxydatives membranaires
Quels sont les types de respiration existant chez les bactéries ?
2 →
* Aérobie → accepteur = O2
* Anaérobie → accepteur ≠ O2
Schéma de la respiration aérobie et anaérobie ?
Cours métabolisme page 5
Avec O2 comme accepteur :
Quels sont : le produit final réduit, le nom du processus, les bactéries réalisant ce métabolisme ?
Produit : H2O
Nom : Respiration aérobie
Exemple de bactéries : Escherichia coli, Streptomyces, pseudomonas
Avec NO3- comme accepteur :
Quels sont : le produit final réduit, le nom du processus, les bactéries réalisant ce métabolisme ?
Produit : NO2-, NH3, N2
Nom : Respiration anaérobie => dénitrification
Exemple de bactéries : Bacillus, Pseudomonas
Avec SO4- comme accepteur :
Quels sont : le produit final réduit, le nom du processus, les bactéries réalisant ce métabolisme ?
Produits : S ou H2S
Nom : Respiration anaérobie => réduction des sulfates
Exemple de bactérie : Desulfovibrio
Avec Fumarate comme accepteur :
Quels sont : le produit final réduit, le nom du processus, les bactéries réalisant ce métabolisme ?
Produit : Succinate
Nom : Respiration anaérobie => accepteurs organique
Exemple de bactérie : Escherichia colis
Avec CO2 comme accepteur :
Quels sont : le produit final réduit, le nom du processus, les bactéries réalisant ce métabolisme ?
Produit : CH4
Nom : Méthanogénèse
Exemple de bactérie : Methanococcus
Caractéristiques de la respiration aérobie ?
Consomme l’O2 et produit de l’ATP par chaine d’e- → associée à des phosphorylation oxydatives
Objectif des test oxydase ?
Pouvoir discriminer les bactéries selon le type de chaine respiratoire et les identifier → présence ou non de cytochrome C
Que signifie un test oxydase positif ?
Observe un disque avec point bleu immédiatement
→ Bactérie oxydase positive : chaine respi avec cytochrome C
Que signifie un test oxydase négatif ?
Pas de coloration observée → Bactérie oxydase négative : chaine respi sans cytochrome C
Exemple de bactérie oxydase + ?
Pseudomonas
Exemple de bactérie oxydase - ?
Escherichia coli
Caractéristiques/définition de la respiration anaérobie
- Respiration dont l’accepteur d’e- n’est pas l’O2
- Substrat organique
- Accepteur final minéral ou organique
Chaine de réaction de la respiration anaérobie ?
Cours métabolisme page 6
Comment se fait le test des nitrates ?
Utilisation d’un bouillon nitraté mis en contact avec 2 réactif → NIT1 + NIT2
Observation réalisée après 24h de culture
Que cherche à mettre en évidence le test des nitrates ?
La nitrate réductase → voie dissimilatrice de l’azote
Quelle sont les voies qui utilisent les nitrates comme accepteurs chez les bactéries ?
- Voie assimilatrice de l’azote
- Voie dissimilatrice
Caractéristiques de la voie assimilatrice de l’azote ?
Nitrate réduit en ammoniac → azote converti en forme organique
→ Réduction assimilatrice
Caractéristiques de la voie dissimilatrice de l’azote ?
Conduit à la formation de N2
Qu’est ce que la dissimilation ?
Dinitrification → perte d’azote → pas d’assimilation de l’azote
Que signifie un milieu jaune après le test de l’urée ?
Pas de changement de pH → la bactérie n’a pas utilisée l’urée → absence d’uréase
Que signifie un milieu rose après le test de l’urée ?
Changement de pH → Présence d’uréase
Pourquoi la bactérie nécessite des catalase ?
L’oxydation peut avoir lieu directement dans le cytoplasme → conduit à la formation d’H2O2
Quelles sont les bactéries possédant la catalase ?
Les bactérie aérobie stricte et les bactérie aérobie/anaérobies facultative
Méthode de test à la catalase (TP) ?
H2O2 sur une lame → dépôt des bactéries → effervescence si présence de catalase
Quelles sont les bactéries que l’on peut discriminer grâce au test à la catalase ?
Streptococcus et Staphylocoques
Rôle de la peroxydase ?
Donne le caractère d’aérotolérance chez les bactérie anaérobie aérotolérante en détoxifiant l’H2O2
Définition de la fermentation ?
Ensemble de réaction biochimique cytoplasmique d’oxydation qui fournissent à l’organisme de l’NRJ par des phosphorylation non couplées au processus membranaire
Quelles sont les bactéries qui ne peuvent PAS réaliser la fermentation ?
Les bactéries aérobie strictes → non fermentaire
Quand à lieu la fermentation ?
Seulement en anaérobiose → réprimée en aérobiose car moins efficace que la respiration
Rôle de la fermentation ?
Réoxyde les coenzymes ayant été réduits pour l’oxydation de substrat + produit de l’NRJ en absence d’oxygène
Quel est accepteur final de la fermentation ?
Composé organique endogène
Quelle est la nature des substrat de la fermentation ?
- Glucides
- Ac Organique
- Alcools
- AA
- Amine
- Purine
- Pyrimidine
Comment peut on chercher s’il y a ou non une fermentation / oxydation du glucose chez une bactérie ?
Ensemencement de bactérie dans 2 tube, un tube mis en condition anaérobie → observation d’un changement de couleur (vert au jaune)
Voie de fermentation du glucose chez les bactéries ?
Voie d’Hugh et Leifson
Que met en évidence le test VP ?
De l’acétoïne produit suite à la fermentation du glucose
Déroulement du test VP ?
- Ajout de VP1 et VP2 dans des tubes ensemencés
- Si rouge → présence d’acétoine
Milieu de culture utilisé pour le test VP ?
Clark et Lubs + beaucoup d’O2
Quelles sont les molécules que peuvent cataboliser les molécules ?
- Glucose
- Hydrate de carbone
- Lipides
- AA
- ATB
Quels sont les hydrates de carbones utilisés par les bactérie ?
- Glucose
- Fructose
- Mannose
- Galactose
Action de la voie de beta-oxydation bactérienne ?
Oxydation des AG, triglycérols et lipides
Caractéristiques du catabolisme des protéines et AA des bactéries ?
- Protéase hydrolyse protéines en AA
- AA forme pyruvate et acétylCoA par transamination et désamination
Test de mise en évidence des gélatinase ?
Morceau de gélatine contenant du charbon dans un milieu avec des bactéries → si milieu noir = présence de gélatinase
Résultat test de la tryptophane désaminase ?
- Milieu noir : TDA+
- Milieu jaune : TDA-
Rôle du test de la LPG ?
Si la bactérie est capable d’utiliser le lactose
