Virologie : Origine de la microbiologie Flashcards
Que sont les microbes ?
µorganismes non visibles à l’oeil nu
Comment est classé le monde microbien ?
EN 2 groupes
Quels sont les groupes que comporte le monde microbien ?
- Organismes vivants
- Organismes inertes
Caractéristiques des organismes vivants ?
Se multiplient par eux-mêmes → autonome
Caractéristiques des organismes inertes ?
Ont besoin d’un hôte pour se multiplier → dépendant
Quels sont les organismes compris dans les organismes inertes ?
Prions, Viroïdes, et Virus
A quelle famille appartiennent les prions et viroïdes ?
ATNC → Agent transmissible non conventionnels
Caractéristiques des viroïdes ?
- ARN →246 à 375 nucléotides
- Sans structure protéique
- Uniquement chez les plantes
Caractéristiques des prions ?
Formes mal repliées des protéines
Maladie issues de prions ?
- Maladies de Kuru
- Creutzfelsd-Jacob
- Gertsmann-Sträusseler
- Tremblante du mouton
- Maladie de la vache folle
Comment se fait la contamination par un prion ?
- Production par les cellules de forme normale (PrPC) et de protéines prions infectieuses (PrPSC)
- PrPSC convertit son mauvaise repliement à PrPC
→ Induction de pathologies
Propriétés du prion ?
PrPSC =
- Résistant :
* aux protéases
* à la chaleur
* aux traitements chimiques
- Insoluble
- S’agrège
Que sont les encéphalopathies spongiformes ?
Accumulation de prions dans le tissus neural
→ trous dans le tissu en tuant les neurones
→ détériorassions de la fonction cérébrale
Que signifie le mot virus ?
Poison en latin
Rôle d’Edward Jenner dans la mise en évidence des virus ?
Vaccination : il la met en place avant même de connaitre la nature des virus
Rôle de Jacob Hence dans la mise en évidence des virus ?
Postulat :
Un agent infectieux est trop petit pour être vu à l’oeil nu → besoin d’un microscope
Que sont les postulats de Koch ?
Ils ont permit la définition d’un agent pathogène
Quels sont les Postulats de Koch ?
- µorganisme présent dans chaque cas de maladie. Absent sain → association agent/syndrome
- µorganisme doit pouvoir être isolé et cultivé à partir d’un hôte malade
- µorganisme doit pouvoir être réinoculé à un hôte sain et entrainer l’apparition de symptômes identiques à ceux observés sur l’hôte de départ
Rôle de Dimitri Ivanosky dans la mise en évidence du virus ?
Grâce à un ultra filtra met en évidence un agent ultrafiltrable pathogène différent des bactéries
Quel est le premier scientifique à montrer l’existence des Virus ?
Martinus Willem Biejerinck
→ A l’aide de filtrat
Que se passe-t-il dans le monde du virus en 1911 ?
Découverte d’une nouvelle propriété du virus :
Capacité à induire des cancers
Que se passe-t-il dans le monde du virus en 1915 ?
Découverte des bactériophage (virus infectant des bactéries)
Que se passe-t-il dans le monde du virus en 1933 ?
Découverte du papillomavirus → capable d’induire des cancer chez l’Ho
Que se passe-t-il en 1984 dans le monde du virus ?
Découverte du VIH
Quels sont les progrès technique qui ont permis l’avancé sur la découverte des virus ?
Création de la microscopie électronique à transmission
Comment se sont faites les cultures de virus ?
- Chez les animaux
- Sur des cellules embryonnaires humaines
Qu’à démontrer l’expérience d’Alfred Hershey et Martha Chase ?
L’ADN des virus est infectieux
Comment a-t-il été prouvé que l’ADN des virus est infectieux ?
- Utilisation de bactériophages marqués par radioactivité sur protéines OU ADN
- Après infection (protéines) : radioactivité à l’extérieure de la bactérie → Prot non transmises
- Après infection (ADN) : radioactivité absente du milieu de culture et bactérie radioactive → ADN est transmis
=> ADN = caractère infectieux
Qu’à mis en évidence l’expérience de Heinz Fraenkel-Conrat et Bea Singer ?
Que l’ARN donne le caractère infectieux du virus
Comment a-t-il été prouvé que l’ARN des virus est infectieux ?
- Utilisation de 2 souche (A +B) de virus mosaïque du tabac
- Dénaturation de L’ARN par urée : isolation des ARN et structure protéique
- Création d’hybrides ne donnant les caractéristiques que de l’ARN de la souche
Définition moderne des virus ?
Entités :
* Possédant un unique type d’acide nucléique
* Se reproduisant uniquement à partir de matériel génétique
* Parasite intracellulaire obligatoire
Qu’est-ce que le virus ?
Forme extra ET intracellulaire
Qu’est-ce que le virion ?
Virus nouvellement produit → uniquement forme extracellulaire
Quels sont les théories d’origine du virus ?
3 :
* Hypothèse régressive
* Hypothèse progressive
* Hypothèse du virus premier
Qu’est-ce que l’hypothèse régressive ?
Virus = cellules qui ont évoluées puis régressées pour ne garder qu’une structure géomique
Qu’est-ce que l’hypothèse progressive ?
Virus = éléments génétiques d’une cellule de départ qui ont évolués et acquis la capacité de se déplacer entre les cellules
Qu’est-ce que l’hypothèse du virus premier ?
Virus et cell euca ont été générée en même temps et ont co évolués parallèlement
Taille des virus ?
Ordre du nanomètre (10^-9)
Microscope utilisé pour observer les virus ?
Microscope électronique
Est-ce que la taille des virus est variable ?
OUI
De quoi dépend la taille d’un virus ?
De son patrimoine génétique :
Gros virus → génome important → code beaucoup de protéines → structure plus complexe
Que sont les mimivirus ?
Virus géant non pathogène pour l’Ho en Sibérie
Anatomie général des virus nu ?
Acide nucléique + Capside
Anatomie générale des virus enveloppés ?
Acide nucléique + Capside + Enveloppe
Qu’est-ce que l’acide nucléique pour le virus ?
La structure la plus importante
Qu’est-ce qu’une capside virale ?
Structure protéique à l’intérieur de laquelle se trouve le génome
Qu’est-ce que l’enveloppe d’un virus ?
Peplos : protection supplémentaire facultative issue d’une membrane de l’hôte
Quelles peuvent être les membranes d’origines de l’enveloppe des virus ?
- Membrane nucléaire (Herpes virus)
- Membrane des organelles (virus fièvre jaune)
- Membrane plasmique (virus grippe)
Composition de l’enveloppe des virus ?
Lipido-glucido-protéique
Qu’engendre la composition complexe de l’enveloppe d’un virus ?
Un fragilisation du virus vis à vis de la chaleur et des solvants
Quel type de virus est le plus résistant ?
Un virus nu
Quels virus sont enveloppés ?
- ARN +++
orthomyxovirus
paramyxovirus
rhadbovirus
coronavirus - ADN
Herpes virus
Qu’est-ce que l’orthomyxovirus ?
Virus de la grippe
Qu’est-ce que le paramyxovirus ?
Virus de la rougeole
Qu’est-ce que le rhabdovirus ?
Virus de la rage
Caractéristiques du virus de l’influenza ?
- ARN négatif
- Capside ET enveloppe
- Génome segmenté
- Enveloppe avec 2 glycoprotéines
Que signifie un ARN négatif ?
Non reconnue par la cellule hôte
Quelles sont les glycoprotéines qui composent l’enveloppe du virus de la grippe ?
- Hémagglutinine H
- Neuraminidase N
Que signifie un génome segmenté ?
Chaque protéine est codée par un brin différent
Quelles sont les glycoprotéines qui constituent l’enveloppe du VIH ?
gp120 et gp41 → reconnaissent le CD4
Quelle est la glycoprotéine principale retrouvée sur l’enveloppe du coronavirus ?
Protéine Spike ou protéine S
Caractéristique du matériel génétique porté par le coronavirus ?
- ARN positif
- ARN protégé par des nucléocapsides
Que signifie un ARN positif ?
La cellule hôte le considère comme un ARNm
Rôle de la capside ?
Protection du génome viral
Composition de la capside ?
Structure polymérisé à base de sous unités protéiques → capsomères
Composition de la capside du papillomavirus ?
- Protéine L1 se regroupe par 5 pour former un pentamère
- Agencement des pentamères entre eux pour former la capside
- Une capside L1 = 71 pentamère
Comment peut on nommer la formation de la capside ?
- Formation séquentielle
- Formation non aléatoire → selon une symétrie
Comment sont classés les nucléocapsides ?
Rapport des capsomère entre eux et le génome et leur géométrie d’agencement
Quels sont les différents types de nucléocapsides ?
3 :
Nucléocapside à symétrie :
* Icosaédrique
* Hélicoïdale
* Complexe
Caractéristique des nucléocapsides à symétrie hélicoïdale ?
Assemblage des sous unité protéiques en un ruban autour de l’acide nucléique → spirale autour du génome
Forme d’un virus avec une capside à symétrie hélicoïdale ?
- Tube (Ebola, mosaïque du tabac)
- Polymorphe (grippe)
Forme d’un virus avec une capside à symétrie icosaédrique ?
Icosaèdre → Adénovirus
Exemple de virus à symétrie complexe ?
Bactériophage, virus de la variole
Que sont les virus à symétrie complexe ?
Lorsqu’ils associent une structure hélicoïdale et icosaédrique
Quelles peuvent être les formes du matériel génétique des virus ?
- ARN/ADN
- Simple/double brin
- Molécule linéaire/circulaire
Quelle peut être la nature d’un ARN viral ?
- Positif ou négatif
- Segmenté ou non segmenté
Qu’est-ce qu’un ARN segementé ?
Chaque information génétiques est portée par un brin d’ARN (plusieurs brins)
Sur quels plan se fait la diversité des virus ?
Tailles, formes et ARN/ADN
Fonction du génome ?
Production des protéines de structure du virus
Qu’est-ce qui est codé par le génome viral ?
- Protéines structurales (virion)
- Protéines non structurales (pas virion)
Quelles sont les protéines comprise dans les protéines structurales ?
- De la capside
- De l’enveloppe
Rôle des protéines de la capside ?
- Protection et compaction du génome
- Attachement à la cellule cible des virus nus
Rôles des protéines de l’enveloppe ?
- Attachement des virus à la cellule cible
- Délivrance de nucléocapside
- Reconnaissance de la cellule hôte
Rôle des protéines non structurales ?
- Importante dans la survie du virus
- Initient la réplication et ka régulation du virus
- Bloquent la cellule eucaryote
Quel est le génome le plus important pour le virus ?
Celui qui code pour les protéines non structurales
Où sont exprimée les protéines non structurales ?
Uniquement au sein de la cellule infectée
Quelles sont les natures des protéines non structurales ?
- Enzymes
- Protéines de régulation de l’expression des génomes viraux
- Protéines d’interaction avec la machinerie de l’hôte
Quels étaient les critères de classification des virus “avant” ?
- Nature de l’hôte
- Tropisme tissulaire
- Pouvoir pathogène
- Mode de transmission
Quels sont les critères de classification des virus aujourd’hui ?
Critères physico-chimique
* Nature de l’acide nucléique
* Symétrie de la nucléocapside
* Présence ou absence d’une enveloppe
Comment se fait la classification de Baltimore ?
7 groupes en fonction de la nature et la conformation du matériel génétique
Groupe I classification de Baltimore ?
ADN double brin (enveloppés ou non)
Groupe II de la classification de Baltimore ?
ADN simple brin
Groupe III de la classification de Baltimore ?
ARN simple brin
Groupe IV de la classification de Baltimore ?
ARN positif simple brin
Groupe V de la classification de Baltimore ?
ARN négatif
Groupe VI de la classification de Baltimore ?
ARN positif qui nécessitent la conversion en ADN par rétrotranscription
Groupe VII de la classification de Baltimore ?
ADN partiellement double brin → Hépatite B
Classification utilisée par le comité international de taxonomie virale (ICTV) ?
Classification de Baltimore + sous classification
Nomenclature selon ICTV ?
- Ordre (-virales)
- Famille (-viridea)
- Sous-famille (-virinae)
- Genre (-virus)
