Neuro Genética

Question 1

Análise do Material Genético

Answer 1

• cariótipo
• array: ver duplicações e deleções
• sequenciamento: atualmente é um short reads - ruim para expansões e deleções
  Painel
  Exoma
  Genoma: aumenta somente 5-10% em relação ao exoma. Bom para genes poucos cobertos pelo exoma (ex SELENON)

Question 2

Variantes

Answer 2

• comum ou raras
• concorda com o quadro clínico
• mecanismo de doença que faz sentido para o quadro clínico
• está em um local de conservação entre as espécies
• herança genética concordante
• variantes em cis (as duas vem do mesmo alelo - não justifica quadros recessivos) ou trans (cada variante veio em um dos pais)

Question 3

Conceitos Básicos

Answer 3

• AUG = códon iniciação
  UAA, UAG, UGA = códons de parada

Tipos de mutação:
- De ponto - pode ser silent (mesmo aminoácido), nonsense (stop códon - proteínas peq são eliminadas por RNA decay), missense (conservativa = AA diferente, mas com estrutura similar - ou não conservativa)
- Inserção/deleção - Frameshift = número diferente de 3 vs non-frameshift
- Mutações no sítio de splicing (intron - de -4 a +4)

Question 4

Browsers

Answer 4

• OMIM -> fenótipo e zigosidade
• a variedade já foi previamente publicada? Clinvar (mostra quais labs publicaram a variante; a partir de uma estrela já é bom), mastermind (mostra todos os papers que descreveram), varsome (tem que saber se o lab usa hg38 ou 19)
• Gnomad - posição genômica e frequência populacional (escrever o número do cromossomo, traço, posição da variante que ve pelo varsome, traço e posição final - pode ser a mesma se for de ponto - ex. ver a foto)
• clicar no UCSC browser -> ver conservação entre as espécies (linha rosa = 100% conservação, logo variante deve ser patogênica mas não é um critério)
• Mastermind

Question 5

Mecanismos de Terapias Gênicas

Answer 5

• oligonucleotídeo antissense (ASO): pode degradar o RNAm mediada por RNAse H, pode gerar um bloqueio da ligação com ribossomo impedindo a transcrição ou modulando o splicing (ex. exon skipping)
• RNA interferência: silencia a expressão do gene, não é degradado diferentemente do ASO (ex givosirana)
• terapias de read-through (ver melhor) - inibe um stop codon
• terapias para DNA