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Cours A2020 > Bio mol - Cours 5 Maladie infectieuse/BPL > Flashcards

Bio mol - Cours 5 Maladie infectieuse/BPL Flashcards

1
Q

Quelle est la cause d’una maladie infectieuse?

A

Causée par la transmission d’agents pathogènes entre les individus d’une population

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Q

Nommer des agents pathogènes pouvant causer des maladies infectieuses

A
  • Virus
  • bactéries
  • parasites
  • champignons
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3
Q

Nommer 2 modes de transmission des maladies infectieuses et donner des exemples pour chacuns

A

Direct :

  • Contact peau à peau
  • Contact des muqueuses
  • Contact avec du sang

Indirect

  • Aérosols
  • Goutellettes
  • Surfaes ou aliments contaminés
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4
Q

Pourquoi monitorer les maladies infectieuses?

A
  • Pour anticiper les problèmes et les maladies en émergence
  • Pour soutenir les interventions de santé publique visant à protéger la population de la propagation d’infections et d’éventuelles épidémies
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5
Q

Quel organisme coordonne l’étude des maladies infectieuses au Québec?

A

L’INSPQ/LSPQ

Laboratoire de santé publique du Québec qui fait parti de l’Institut national de santé publique du Québec

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6
Q

Quels sont les 4 domaines d’expertise de l’INSPQ/LSPQ?

A
  • Immunisation
  • ITSS (infections transmises sexuellement et par le sang) et biovigilance
  • Infections nosocomiales et risques infectieux en milieu de soin
  • Surveillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses
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7
Q

Nommer des champ d’expertise du LSPQ dans le domaine de l’immunisation

A
  • Évaluation des programmes d’immunisation
  • Promotion de la vaccination et organisation des services
  • Surveillance des couvertures vaccinales et des manifestations post-vaccination
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8
Q

Nommer des champ d’expertise du LSPQ dans le domaine des ITSS et biovigilance

A
  • Développement et coordination des programmes nationaux de formation en ITSS
  • Analyse des données de surveillance des ITSS (dont le VIH)
  • Soutien d’expertise pour la réalisation et l’évaluation des programmes de prévention
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9
Q

Nommer des champ d’expertise du LSPQ dans le domaine des infections nosocomiales et risques infectieux en milieu de soin

A
  • Surveillance et élaboration de lignes directrices en prévention des infections nosocomiales
  • Évaluer le risque pour les travailleurs de la santé
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10
Q

Nommer des champ d’expertise du LSPQ dans le domaine de la survaillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses

A
  • Surveillance et prévention des maladies vectorielles, zoonotiques, entériques, alimentaires et hydriques
  • Surveillance de la résistance aux antimicrobiens
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11
Q

Qu’est ce que le TAAN?

A

Technologie d’amplification d’acides nucléiques

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12
Q

***Nommer des avantages des méthodes TAAN en infectiologie

A

Méthode de choix en identification de microorganismes

  • Méthode la plus sensible
  • Rapidité d’exécution par rapport à la culture
  • Permet l’ID de pathogènes difficiles/impossibles à faire croitre en culture
  • Capacité analytique élevée (plaque 96 puits)
  • Potentiel de détection en simultané (multiplex)
  • Appareillage relativement simple
  • Application de méthodes commerciales et potentiel de développement interne selon les besoins
  • Applications diverses
    • Dx/dépistage/surveillance (qualitatif)
    • Détermination de la charge virale (quantitatif)
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13
Q

***Nommer des désavantages des méthodes TAAN en infectiologie

A

Contexte et intention clinique

  • Que veut dire un résultat + et quoi faire avec?
    • Rémanance cellulaire post-traitement
    • ID microorgansime n’identifie pas nécessairement la cause de la pathologie
      • Concordance clinique
      • Flore endogène du patient
  • Que veut dire un résultat - ?
    • Faux négatifs possibles :
      • Matrice
      • Qualité du prélèvement
      • Timing du prélèvement p/r à apparition Sx
      • Milieu de transport
      • Technique manuelle
  • Qu’est-ce qu’on cherche à identifier?
    • Très très spécifique donc très ciblé
    • Ne permet pas de recherche à large spectre
    • Contrôler l’utilisation du multiplex : Rechercher des pathogènes qu’on peut traiter
  • Aspect de laboratoire
    • Requiert des espaces physiques adéquats (pré-post PCR)
    • Attention aux contaminations
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14
Q

***Nommer des avantages des méthodes de culture et antibiogramme en infectiologie (test de susceptibilité)

A
  • Technique traditionnelle (souvent encore gold Std)
  • Très bonne spécificité
  • Identification large de l’agent infectieux (pan-domaine)
  • Différents milieux possibles pour une bonne sélectivité
  • Peu coûteux
  • Permet d’orienter le Tx
  • Permet de distinguer les souches susceptibles vs les souches résistantes (Ex : staph aureus vs SARM)
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15
Q

***Nommer des désavantages des méthodes de culture et antibiogramme en infectiologie (test de susceptibilité)

A
  • Certains microorganismes croissent mal en culture
  • Sensibilité variable selon les organismes
  • Délai de croissance
  • Nécessite des cultures diverses (aérobie, anaérobie, milieu sélectif…)
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16
Q

***Nommer des avantages des tests antigéniques en infectiologie

A
  • Rapide
  • Automatisable
  • Faible coût
  • Très grande capacité analytique
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17
Q

***Nommer des désavantages des tests antigéniques en infectiologie

A
  • Sensibilité et spécificité variable et majoritairement moins bonnes que TAAN et culture
  • Cible un nombre limité de pathogènes

“On ne sait pas quoi faire avec??”

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18
Q

***Nommer des avantages de la sérologie en infectiologie

A
  • Disponible dans presque tous les laboratoires
  • Utile pour évaluer la séroprévalence et études épidémiologiques (suivi)
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19
Q

***Nommer des désavantages de la sérologie en infectiologie

A
  • Peu ou pas utilisé en diagnostic
  • Performance variable selon les tests (IgA, IgM, IgG, Ig totaux)
20
Q

***Nommer des avantages de la spectrométrie de masse (MALDI-TOF) en infectiologie

A
  • Permet ID les microorganismes sur la base de leur signature protéique
  • Potentiel de passer la barrière pan-domaine (culture préalable)
21
Q

***Nommer des désavantages de la spectrométrie de masse (MALDI-TOF) en infectiologie

A
  • Très $$$
  • Requiert une expertise
  • Requiert quand même un antibiogramme
  • Pas parfait : certaines bactéries ont des signatures protéiques semblables (E. coli et Shigella)
22
Q

Nommer des caractéristiques des infections respiratoires

A
  • Courantes
  • Caractères souvent saisonniers
  • Responsables d’infections nosocomiales et communautaires
  • Présentation variable inter-individus
23
Q

Qu’est ce que le SAG? À quoi fait-il référence?

A

Syndrome d’Allure Grippale (SAG)

  • Fièvre
  • Toux
  • Douleurs articulaire et musculaires
  • Fatigue extrême
24
Q

Discuter de la présentation clinique des infections respiratoires

A
  • Présentation variable
  • Peut aller d’une présentaiton asymptomatique à une détresse respiratoire
  • Symptômes et complications tendent à être plus imporantes chez les personnes à risque
    • NN
    • Immunosupprimés
    • Facteurs de risques
    • Femmes enceintes
    • Personnes âgées
25
Q

Quel groupe d’âge est le plus affecté par l’influenza?

A

> 75 ans

26
Q

Nommer quelques infections respiratoires

A
  • Influenza A/B
  • Adénovirus
  • SRAS-CoV
  • SRAS-CoV 2
  • MERS-CoV
  • RSV (Virus respiratoire syncytial)
  • Staphylococcus aureus
  • Chlamydia pneumoniae
27
Q

Que signifie SRAS-CoV-2?

A

Syndrome respiratoire aigu sévère - Coronavirus 2

28
Q

Discuter du mode de transmission du SRAS-CoV-2

A
  • Compréhension encore incomplète
  • Principalement une transmission personne à personne par gouttelettes-contact
29
Q

Discuter de l’infectiosité du SRAS-CoV-2

A
  • Plus la charge virale est élevée, plus la probabilité de transmission est grande
  • Infectiosité débute environ 2.3 jours avant le début des Sx
  • Pic d’infectiosité = 0,7 jours avant le début des Sx
  • Infectiosité quasi-nulle 7-10 jours après le début des Sx
  • Médiane de la clairance virale = 30 jours!
30
Q

Quelle valeur de Ct est utilisée par le LSPQ pour juger que le potentiel infectieux est bas?

A

Ct >= 33

31
Q

Nommer quelques indications de dépistage pour le SRAS-CoV-2

A
  • Patient avec Sx COVID
  • Contexte d’éclosion
  • Contact avec une personne positive
  • Patient ASx admis dans une unité de soin ou qui recevront différents traitements
  • Travailleur de la santé
  • Patient ASx soumis à admission dans un milieu de vie (CHSLD)
32
Q

Nommer des S/Sx de la COVID

A
  • Toux
  • dyspnée
  • fièvre
  • maux de tête
  • diarrhée
  • mal de gorge
  • Anosmie
33
Q

Quelle est l’évolution clinique la plus fréquente de la COVID?

A

Développement d’une pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan

34
Q

Quelle est la proportion d’infection COVID ASx ?

A

Environ 30-40%, mais attention au timing du répistage (pré-Sx, post-Sx)

35
Q

Chez les patients symptomatiques atteints de la COVID, quelle est la force des atteintes?

A
  • Atteinte légère (81%)
  • Atteinte sévère (14%)
  • Atteinte critique (5%)
    • Dysfonction multi-organes
    • Choc
    • Insuffisance respiratoire
  • Mortalité : 2,3%
36
Q

Nommer des complications connues de la COVID

A
  • Insuffisance respiratoire
    • Ventillation assistée chez 12,3% des patients
  • Complications cardiovasculaires (AMI)
  • Complications thromboemboliques (ACV)
  • Complications inflammatoires (Kawasaki, Guillain-Barré)
  • Séquelles à long terme (fatigue, faiblesse, détérioration respiratoire)
37
Q

Quel est le processus analytique d’un échantillon COVID?

A
  • Inactivation
  • Extraction
  • Amplification
  • Interprétation
  • Rapport
38
Q

Discuter des avantages et des désavantages d’une stratégie de pooling en TAAN

A

Avantages :

  • Augmente la capacité analytique
  • Diminue le besoin de réactifs d’extraction

Désavantages :

  • Besoin de temps technique pour pooler
  • Quelle population? (comment pooler pour que ce soit efficace)
  • L’utilité du pooling dépend de l’incidence
39
Q

Expliquer pourquoi l’utilité du pooling dépend de l’incidence

A
  • Lorsque l’incidence est élevée, si on pool, on a plus de chances de devoir dépooler et retester les échantillons
  • Indication de pooler lorsque l’incidence est faible
40
Q

Quelle autre méthode peut être utilisée au lieu de l’extraction (kit)?

A

Lyse thermique

41
Q

Discuter des avantages et des inconvénients de la lyse thermique comme technique d’extraction

A

Avantages :

  • Permet de ne plus avoir besoin de stock de réactifs d’extraction
  • Inactivation et extraction réalisés en une seule étape

Désavantages :

  • Ne permet pas de pooler
  • Nécessite l’ajout d’un contrôle interne
    • Validation requise
    • Possibilités d’inhibiteurs réactionnels (débris cellulaires)
42
Q

Quelles CLSI sont spécifiques au développement PCR?

A
  • MM03-2015
  • MM17-2018
43
Q

Vrai ou faux : Les méthodes sérologiques et antigéniques ont une excellente capacité de multiplexage comparativement au TAAN

A

FAUX

TAAN nettement meilleur que sérologie et antigènes pour le potentiel de muxiplexage

44
Q

Parmis les différentes méthodes disponibles pour identifier le SRAS-CoV-2, laquelle est la plus sensible?

A

TAAN (95,2%)

45
Q

Quels sont les avantages et les désavantages de la méthode TAAN pour les tests de COVID?

A

Avantages :

  • Test le plus sensible
  • Automatisable (Cobas, BDMax)
  • Haute cadence
  • Rapidité

Désavantages :

  • Technique manuelle
  • Rémanance (détecte encore du virus non actif)
  • Risque de FP/FN
  • Performance variable selon matrice
46
Q

Quels sont les avantages et les désavantages de la méthode sérologique pour les tests de COVID?

A

Avantages :

  • Détection des infections passées

Désavantages :

  • Ne permet pas le Dx
  • Performance variable (IgG, IgM, IgA, Ab totaux)
  • Peu d’application

Matrice = sérum

47
Q

Quels sont les avantages et les désavantages de les méthodes antigéniques pour les tests de COVID?

A

Avantages :

  • Rapidité
  • Cadence
  • Automatisable

Désavantages :

  • Moins performant que TAAN

Cours A2020 (27 decks)

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