W3ZO's Flashcards
Immunoblot
- bestuderen eiwit in een weefsel- of celextract
- eiwitten worden gedenatureerd en op grootte van elkaar gescheiden mbv SDS-elektroforese in gels
- het te onderzoeken eiwit wordt op de gel zichtbaar gemaakt met het antilichaam
Aflezen op de blot
- positie eiwitband: het MW (grootte) van het eiwit
- intensiteit vd band: de hoeveelheid vh eiwit
- het aantal verschillende banden: of er meerdere vormen van een eiwit voorkomen of meerdere soorten eiwitten die met het antilichaam kunnen reageren
Immuunprecipitatie
Het extract wordt behandeld met het antilichaam, de eiwit-antilichaam complexen slaan neer (precipiteren) en kunnen worden geïsoleerd en geanalyseerd
Moleculaire hybridisatie
Vorming van een dubbele helix uit 2 enkelstrengige nucleïnezuren met een homologe nucleotidenvolgorde
-> om stecifieke mRNAs te bekijken
Probe
Een bekend stuk enkelstrengig DNA dat kan hybridiseren met een specifiek enkelstrengig DNA of RNA molecuul
RNA-blot
ipv het antilichaam wordt nu een probe gebruikt die fluorescerend of radioactief is gemarkeerd, zodat hij zichtbaar gemaakt kan worden
Colchicine
Gebruikt om de cellen in de prometafase te stoppen door remming vd microtubuli en er geen spoelfiguur wordt gevormd
Chromosome painting
Mengsel gebruiken van een groot aantal probes die specifiek zijn voor eenzelfde chromosoom
Aneuploïdie
Abnormale hoeveelheid DNA in een cel
Microsatelliet analyse (MA)
- verlies van chromosoom fragmenten opsporen
- microsatellieten bestaan uit korte repeterende sequenties, en worden geanalyseerd door DNA te amplificeren met PCR
APC-eiwit en bèta catenine
- APC bindt aan bèta catenine en zorgt dat het afgebroken wordt -> transcriptiefactor TCF4 kan niet worden gestimuleerd -> cycline D niet geactiveerd
- bij niet functioneel APC eiwit wordt bèta-catenine niet meer afgebroken -> meer celcyclus
Functies telomeer onderdelen
- herhaalde TTAGGG sequentie: buffer tegen beperkt verlies
- T-loop: bijdragen aan verbergen vh open uiteinde voor verschillende enzymen
- telomeer-specifieke eiwitten: maken en stabiliseren telomeer structuur, aantrekken telomerase
MicroRNA
- 21 nucleotiden lang
- bindtaan mRNA moleculen waarvan ze de stabiliteit of mate van translatie kunnen regelen
- zijn gedeeltelijk complementair met het te reguleren mRNA
- kunnen bijdragen aan tumorgroei door vermindering genproducten tumorsuppressorgenen
siRNAs
kunnen afbraak mRNA veroorzaken