Topi transgenici, topi knock in, topi knock out

Question 1

Quale è il vantaggio di utilizzare organismi interi animali per esperimenti di loss o gain of function rispetto a farli in vitro nelle cellule coltivate? Fare un esempio di gene che è meglio studiare con organismi interi

Answer 1

217

Question 2

Quale è la condizione necessaria per prendere per buono un esperimento fatto con organismi animali interi? Come sono quindi gli organismi in questione?

Answer 2

217

Question 3

Quale è il dato più forte che ci fa capire la funzione di un gene e quale tipo di esperimento in particolare?

Answer 3

217

Question 4

Perché si prediligono i topi come modelli animali per fare esperimenti?

Answer 4

217/218

Question 5

Quale è il fine ultimo degli esperimenti effettuati con organismi animali in ambito diagnostico e terapeutico?

Answer 5

218

Question 6

Quali sono i tre tipi di modelli murini geneticamente modificati che vengono utilizzati in laboratorio?

Answer 6

218

Question 7

Quand’è che un topo può essere definito transgenico?

Answer 7

218

Question 8

In che punto si va a integrare nelle cellule dei topi transgenici un transgene? In quali cellule avviene inizialmente questa integrazione

Answer 8

218

Question 9

Quale è lo scopo di esperimenti fatti con topi transgenici?

Answer 9

218

Question 10

Come viene costruito un transgene prima di inserirlo nelle cellule del topo, cosa deve contenere al suo interno? È possibile guidarlo verso un punto specifico del genoma?

Answer 10

218

Question 11

Di che tipo può essere il promotore associato al transgene integrato nelle cellule del topo?

Answer 11

218

Question 12

Che elemento serve a rendere funzionale un mRNA trascritto da un transgene inserito nelle cellule di un topo?

Answer 12

218

Question 13

Nell’ integrazione del transgene della beta globina in un topo, come si può verificare che l’inserimento sia andato a buon fine? Quale è il rischio potenziale

Answer 13

219

Question 14

Nel caso del transgene WAP-p53R172H, cosa stanno ad indicare WAP, p53 e R172H? Dove viene espresso questo gene e in quali periodi? Se si ha una versione mutante di p53, quali sono le conseguenze a livello molecolare e tissutale?

Answer 14

219

Question 15

Dato che è difficile introdurre un intero gene con introni ed esoni all’ interno di un plasmide prima di introdurlo come transgene in un topo, cosa si può usare alternativamente nella struttura del transgene?

Answer 15

220

Question 16

Nei topi transgenici, nell’ esperimento riguardante WAP-p53R172H, una volta integrato un transgene con p53 mutato, quale è la prima cosa che si deve verificare e tramite quale strumento? Cosa ne emerge?

Answer 16

220

Question 17

Nei topi transgenici, nell’ esperimento riguardante WAP-p53R172H, una volta verificato che il transgene con p53 mutato, viene espresso ad alto livello solo in alcuni topi, cosa va verificato?

Answer 17

220

Question 18

Nei topi transgenici, nell’ esperimento riguardante WAP-p53R172H, cosa emerge da una prima analisi sull’espressione del gene e sullo sviluppo della ghiandola mammaria, inserendo un transgene con p53 mutato?

Answer 18

220

Question 19

Nei topi transgenici, nell’ esperimento riguardante WAP-p53R172H, cosa bisogna fare per avere un rapido sviluppo di tumori dopo l’ inserimento del transgene con p53 mutato?

Answer 19

220

Question 20

Com’ è il promotore che guida l’ espressione della sequenza codificante per GFP? Cosa succede quindi se il gene è inserito come transgene in un topo?

Answer 20

220

Question 21

Per quale tipo di studi è sfruttato l’ esperimento di tipo transgenici con la proteina GFP e a che scopo? Quale è un altro esempio di utilità di questi esperimenti?

Answer 21

220/221

Question 22

Cosa contengono i transgeni utilizzati per fare lo studio sulla neurogenina? Cosa c’è bisogno di visualizzare?

Answer 22

221

Question 23

Quali sono le mutazioni utilizzate in tre diversi transgeni per la neurogenina, cosa si osserva con una di esse e cosa se ne deduce?

Answer 23

222

Question 24

Quali sono riassuntivamente gli studi che si possono fare utilizzando dei transgeni?

Answer 24

222

Question 25

Come si potrebbe fare loss of function con un modello transgenico?

Answer 25

222

Question 26

Alla base di cosa vi è il problema di fare LOF con un modello transgenico e con quali altri modelli non si ha questo tipo di problema, cosa viene sfruttato infatti al loro interno?

Answer 26

222/223

Question 27

Cosa si può fare per inattivare un gene endogeno nei modelli knock out?

Answer 27

223

Question 28

Di cosa vi è bisogno per poter sostituire nei modelli knock out una sequenza codificante per una proteina funzionale e come viene inserito? Su quali cellule viene fatto questo processo per via dell' efficienza?

Answer 28

223

Question 29

A cosa serve il marker di selezione positiva nei modelli knock out?

Answer 29

223

Question 30

Cosa avremmo genotipicamente e fenotipicamente nei topi omozigoti wyld type, in relazione agli esperimenti di kock out?

Answer 30

223

Question 31

Cosa avremmo genotipicamente e fenotipicamente nei topi eterozigoti wild type-knock out, in relazione agli esperimenti di kock out?

Answer 31

224

Question 32

Cosa avremmo genotipicamente e fenotipicamente nei topi omozigoti knock out, in relazione agli esperimenti di kock out?

Answer 32

224

Question 33

Come si fa un esperimento di knock out con il gene per Tcf-4? Quali sono le conseguenza a livello molecolare?

Answer 33

225

Question 34

In un organismo knock out -/- per il gene di Tcf-4, cosa cambia nel suo colore e perché non sopravvive per più di 24 ore?

Answer 34

225

Question 35

Negli esperimenti di knock out di Dicer, quale esone viene eliminato e con cosa è sostituito? Quale è la conseguenza e cosa si deduce da questo esperimento?

Answer 35

225

Question 36

Quali possono essere le ragioni per cui in un omozigote knock out -/-, può comunque presentarsi in alcuni casi un fenotipo sano?

Answer 36

226

Question 37

Che cosa osserviamo in modelli knock out costituitivi, e perché spesso a scopo della ricerca è meglio utilizzare modelli knock out condizionali?

Answer 37

226

Question 38

Quale è il vantaggio del conditional knock out rispetto al costitutive knock out? Che sistema viene sfruttato?

Answer 38

226

Question 39

Nel sistema Loxp-Cre, nel knock out condizionale, quale tipo di enzima viene utilizzato e quali sono le fasi della sua azione? Come viene sfruttato nell' esperimento vero e proprio?

Answer 39

226/227

Question 40

Che vantaggio da il sistema Loxp-Cre nel knock out condizionale rispetti al knock out costitutivo?

Answer 40

227

Question 41

Quali sono i 3 alleli modificati che in tipo KO condizionale deve necessariamente avere? Che elemento serve inoltre per garantire una tessuto specificità del processo?

Answer 41

227

Question 42

Come si ottiene tessuto specificità nel KO condizionale nel caso del promotore epatico per l'albumina?

Answer 42

227

Question 43

Quali sono le fasi previste dal knock out condizional di Dicer nei precursori cardiaci del topo? Cosa si ottiene e per quale motivo?

Answer 43

227

Question 44

Come si può aggiungere un sistema di controllo temporale del knock out condizionale di Dicer nei precursori cardiaci del topo?

Answer 44

228

Question 45

In quali situazioni si può trovare la Cre ricombinasi e che effetto determina nel knock out condizionale, se sottoposta sia a controllo spaziale che temporale (e che elementi vengono usati per farlo)?

Answer 45

228

Question 46

Come si può scegliere in quale tessuto e quando fare knock out nel knock out condizionale?

Answer 46

228

Question 47

Cosa vuol dire fare knock in con un modello di topo? Quali sono le due principali conseguenze che voglio avere come risultato?

Answer 47

228

Question 48

Cosa è necessario inserire in una cellula di un modello di topo knock in per fare esperimenti di knock in?

Answer 48

228

Question 49

Da cosa è causata la progeria o sindrome di Hutchinson Gilford a livello molecolare, e che conseguenze ha a livello fenotipico, in eterozigosi e in omozigosi? Come si può fare knock in con modelli di topo?

Answer 49

229

Question 50

Quali sono i tre elementi fondamentali per realizzare un esperimento di knock in condizionale nei modelli di topo?

Answer 50

229

Question 51

Cosa è necessario che ci sia nella cassetta LoxP-STOP-LoxP nel knock in condizionale?

Answer 51

228

Question 52

Quale è la prima cosa che accade nel knock in condizionale qual'ora la sequenza mutante del gene è inserita downstream rispetto alla cassetta LoxP-STOP-LoxP?

Answer 52

229

Question 53

Cosa è necessario per "sbloccare" l'RNA polimerasi e quindi la trascrizione del gene mutante nel knock in condizionale?

Answer 53

229

Question 54

Come funziona il sistema LoxP-STOP-LoxP per knock in condizionale nel caso del gene Kras? Cosa garantisce una tessuto specificità in questo caso?

Answer 54

230

Question 55

Quale è la conseguenza tissutale di knock in per il gene Kras e su cosa viene fatto contemporaneamente knock out?

Answer 55

230