Genome editing Flashcards
Quando si parla di plasmidi, vettori virali, mRNA esogeni o miRNA si può cambiare la sequenza di un gene?
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A cosa serve il genome editing e cosa dà in più rispetto a plasmidi, vettori virali, miRNA….? Quali possono essere le macromolecole che si occupano di farlo?
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In quali cellule si trova normalmente il sistema CRISPR-cas9? Per quale meccanismo viene utilizzato?
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Quale è la prima fase del meccanismo CRISPR-cas9 nei batteri?
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Quale è la seconda fase del meccanismo CRISPR-cas9 nei batteri, dopo l’integrazione nel locus CRISPR di un pezzo del genoma fagico?
208/209
Quale è la terza fase del meccanismo CRISPR-cas9 nei batteri, dopo la trascrizione del lungo RNA contenente anche il pezzo di DNA fagico trascritto?
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Quale è la quarta fase del meccanismo CRISPR-cas9 nei batteri, dopo il processamento del lungo RNA contenente il pezzo di DNA fagico?
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Se si dovesse dividere il meccanismo CRISPR-cas9 dei batteri in tre fasi principali, quali sarebbero?
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Quali sono le tre regioni in cui si può suddividere un locus del sistema CRISPR-cas9? Cosa contiene ciascuna regione?
209/210
Perché la sequenza spacer all’ interno del CRISPR locus cambia?
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Come cresce il CRISPR locus? A cosa possiamo risalire leggendo tutte le sequenze spacer che lo costituiscono?
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Cos’ è il CRISPR Array? Da chi viene processato e in cosa viene scomposto?
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Cos’ è il complesso crRNA e da che cosa è composto? Che funzione hanno le parti che lo costituiscono?
210/211
Che formano riescono ad assumere autonomamente i repeats nel CRISPR locus e che funzione ha?
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Quale è il compito di tracrRNA nel sistema CRISPR-cas9 e che problema andrebbe a risolvere?
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Quale è il primo elemento che permette l’attivazione della proteina cas9, che ha funzione effettrice nel sistema CRISPR-cas9?
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Quale è il secondo elemento che attiva la proteina cas9 che ha funzione effettrice nel sistema CRISPR-cas9?
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A cosa serve la sequenza PAM nel sistema CRISPR-cas9? Da quanti e quali nucleotidi è costituita?
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Cosa si intende per protospacer nel sistema CRISPR-cas9?
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A che scopo posso utilizzare il metodo CRISPR-cas9 nelle cellule umane?
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Cosa devo fornire alle cellule del nostro corpo per utilizzare al loro interno il sistema CRISPR-cas9, quali elementi sono invariabili e quali devono essere modificati prima di inserirli?
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Sotto forma di che cosa possono essere internalizzati gli elementi che servono a fare CRISPR-cas9 nelle cellule e attraverso quali sistemi?
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Una volta che si è internalizzato il complesso CRISPR-cas9 in una cellula cosa accade e cosa viene prodotto in una prima fase?
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Cosa accade dopo che Cas9 ha tagliato il DNA della cellula di interesse in uno specifico punto target? Quali due situazioni si distinguono?
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