Esempio pratico di esercizio Flashcards

1
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, quale è la prima cosa da fare per comprendere se la mutazione è patogenica?

A

231

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2
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, quali sono le due modalità per studiare le mutazioni sulle cellule?

A

231

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3
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nel gain of function con un plasmide, quale tipologia di promotori si può utilizzare in base allo scopo?

A

231

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4
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nel gain of function con un plasmide, quali sono le opzioni per introdurre il plasmide nelle cellule?

A

231

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5
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nel gain of function con un plasmide, una volta introdotto nella cellula, che risultato ci si aspetta di vedere?

A

231

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6
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nel gain of function con un plasmide, quali sono le strategie che si usano per verificare l’incorporazione della sequenza nel DNA della cellula?

A

231

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7
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nel gain of function con un plasmide, una volta noto che il target è espresso cosa si deve fare in ultima fase?

A

232

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8
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nella CRISPR-cas9 quali sono le tre componenti necessarie e cosa fanno?

A

232

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9
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, nella CRISPR-cas9 cosa bisogna ricercare se si vuole utilizzare Cas9?

A

232

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10
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, con CRISPR-cas9, che differenza c’è fra l’ esone modificato e l’ esone wild type?

A

232

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11
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con cellule in coltura, con CRISPR-cas9 cosa bisogna fare per verificare che la mutazione è stata integrata e cosa bisogna fare per verificare se la mutazione è presente in omozigosi o in eterozigosi?

A

232

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12
Q

Esempio pratico: Perché spesso non basta fare un esperimento con cellule in vitro e si ricorre anche ad esperimenti fatti con organismi interi?

A

232

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13
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con organismi interi, quali sono i topi modelli utilizzati?

A

232

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14
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con organismi interi, Cosa bisogna determinare relativamente alla proteina di interesse? Per quale passaggio è importante saperlo?

A

232/233

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15
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento fatto con organismi interi, quali sono i tipi di promotori che si possono utilizzare e in quali situazioni?

A

233

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16
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento di knock out/in fatto con organismi interi, nel caso di pazienti eterozigoti che modello bisogna scegliere qual’ora il gene di interesse sia dominante o recessivo?

A

233

17
Q

Esempio pratico: Se consideriamo un esperimento di knock out/in fatto con organismi interi, cosa bisogna fare alla fine dell’ esperimento? Che strumenti si possono usare?

A

233

18
Q

Esempio pratico: Nel confronto tra gain e loss of function, di cosa c’è bisogno innanzitutto per capire se c’ è stato un effettivo cambiamento negli organismi modificati?

A

233

19
Q

Esempio pratico: Nel confronto tra gain e loss of function, come si fa a discriminare se una mutazione è loss o gain of function?

A

234

20
Q

Esempio pratico: Nel confronto tra gain e loss of function, è un’informazione utile sapere se vi è una condizione di eterozigosi o omozigosi negli individui malati?

A

234

21
Q

Esempio pratico: Nel confronto tra gain e loss of function, nelle cellule coltivate in coltura, quali sono i tre modi per fare loss of function? Perché non si può usare un dominante negativo? Cosa verifico alla fine

A

234/235

22
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, che tipo di topo modello bisogna scegliere e che cosa si può fare?

A

235

23
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, se si ha un topo con genotipo X fl/fl (omozigote negli alleli floxati), com’è fenotipicamente e perché?

A

235

24
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, in che modo si può fornire al topo la cre ricombinasi? Nel caso in cui si voglia fare knock out tessuto specifico, cosa bisogna fornire insieme ad essa?

A

235

25
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, se la tessuto specificità riguarda i neuroni, una volta fornite alle cellule i siti LoxP, la Cre, il suo promotore specifico, cosa accade nelle cellule muscolari e cosa invece nei neuroni? In quale delle due cellule quindi non si vedrà l’mRNA della proteina di interesse?

A

235/236

26
Q

Esempio pratico: se si effettua un esperimento di knock out cosa ci si aspetta sul fenotipo del topo mutante, nel caso in cui la mutazione sia loss of function e nel caso in cui sia gain of function?

A

236

27
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, come posso studiare come la mutazione diventa problematica per le cellule?

A

236

28
Q

Esempio pratico: nel loss of function in vivo, per capire cosa sia successo alle cellule durante l’ esperimento, quali indagini molecolari si possono fare? Cosa si intende per meccanismo adattativo e meccanismo primario?

A

236/237

29
Q

Esempio pratico: Come si può vedere dopo un esperimento di loss of function o gain of function, come cambia il profilo trascrizionale delle cellule mutanti?

A

237