Metilazione del DNA e Imprinting Flashcards
In cosa consiste la metilazione del DNA e quale è l’enzima che si occupa di questa reazione?
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La metilazione del DNA sulla citosina, cambia in qualche modo la sua capacità di formare legami a idrogeno con la guanina?
110
Può essere metilata qualsiasi citosina o solo un tipo in particolare nel processo di metilazione del DNA?
110
Come sono distribuiti nel genoma i dinucleotidi CpG?
111
Dove si trovano le isole CpG?
111
Cosa determina la presenza di isole CpG metilate nel promotore di un gene, e quali sono i geni che contengono queste isole, ma non metilate?
111
Quali sono le quattro modalità secondo le quali la metilazione del DNA può influenzare l’espressione di un gene?
111/112
Quali sono le due famiglie di DNA metiltransferasi e come agisce ciascuna di esse?
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Quando si formano i siti emimetilati nel DNA, come vengono metilati completamente e a che scopo viene fatto ciò?
113
Dato che la metilazione del DNA è un processo reversibile, quali sono i due possibili meccanismi per demetilare il DNA?
114
Da cosa differisce l’espressione dei geni soggetti ad imprinting rispetto alla normale espressione genica?
115
Quali alleli vengono silenziati e quali attivati nell’ imprinting di tipo materno e paterno?
115/116
In quale fase il DNA è metilato e quindi reso non esprimibile nel caso dell’ imprinting materno o paterno?
116
Una volta imposti dei pattern di metilazione nella gametogenesi, durante le prime fasi dello sviluppo embrionale, quali cellule li mantengono per tutta la vita e quali invece non li mantengono (e per quale motivo)?
116
Dove si possono trovare i geni soggetti ad imprinting? Come avviene la regolazione nei due casi?
116
Cosa è possibile trovare nel locus IgF2 e H19? Quale dei due geni è soggetto a imprinting materno e quale paterno?
116/117
Nel locus genico IgF2/H19 a seconda del fatto che ci si trovi su gene materno o paterno, in che modo viene attivato un gene e represso l’altro e viceversa?
117
Perché nell’ imprinting genico è importante che sia espresso soltanto uno dei due alleli dello stesso gene?
117
Se abbiamo un gene 1 soggetto ad imprinting materno e un gene 2 soggetto ad imprinting paterno, cosa accade se:
* delezione che porta alla perdita di entrambi i geni in cromosoma materno
* delezione che porta alla perdita di entrambi i geni in cromosoma paterno
117
Cosa si intende per geni emizigoti?
117
Quali sono due esempi di delezione in una regione genica soggetta ad imprinting materno e paterno ?
118
Come cambia la metilazione del DNA nelle varie fasi dello sviluppo embrionale a partire da spermatozoo/ cellula uovo fino a blastocisti?
118
Se si traccia un grafico che ha negli assi lo stadio dell’ embrione e il livello di citosina (DNA) metilata, a che stadio si osserva:
-livelli di metilazione massimi
-decrescita della metilazione
-livelli di metilazione minimi
-crescita dei livelli di metilazione
119/120
Per quale motivo dallo stadio di zigote le cinetiche legate alla decrescita dei livelli di metilazione del DNA sono diversi nel pronucleo maschile e nel pronucleo femminile?
119
Quando durante lo sviluppo embrionale il DNA viene completamente demetilato e in quale tipo di geni questo non avviene? In che tipo di cellule viene cancellata la metilazione per questo tipo di geni e riscritti e per quale motivo?
120