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Biologia Molecolare > Epigenetica e modifiche pt istoniche > Flashcards

Epigenetica e modifiche pt istoniche Flashcards

1
Q

In quale struttura risiede il primo livello di regolazione dell’espressione genica?

A

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2
Q

Cosa comprende il complesso della cromatina e quale è il suo ruolo?

A

95

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3
Q

Su cosa si basano i meccanismi epigenetici? Quali sono i substrati per le modificazioni epigenetiche?

A

95

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4
Q

Quali sono i tre aggettivi per descrivere le modificazioni epigenetiche?

A

95

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5
Q

Quali sono i due principali meccanismi epigenetici?

A

96

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6
Q

Cosa sono i nucleosomi e da cosa sono composti?

A

96

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7
Q

Quale sono le proteine istoniche che formano il core del nucleosoma e in quante unità?

A

96

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8
Q

In quali domini si divide una proteina istonica?

A

96

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9
Q

Che tipo di proteine sono gli istoni e che funzione conferisce la loro caratteristica?

A

96

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10
Q

Quanti e quali sono i dimeri di istoni che costituiscono la struttura finale di un nucleosoma? Quali sono le fasi per la formazione del complesso nucleosoma?

A

96

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11
Q

Che tipo di legame si instaura tra istoni e DNA e perché è definito sequenza indipendente? Dove avviene l’ interazione?

A

96

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12
Q

Quale tipo di DNA è presente tra un nucleosoma e un altro e che ruolo ha? Tramite quale altro tipo di istoni quel tratto di DNA si lega maggiormente al nucleosoma?

A

96/97

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13
Q

Quali strutture forma il DNA avvolto ai nucleosomi in gradi di compattamento maggiori? E come è coinvolto l’istone H1?

A

97

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14
Q

Cosa rende un gene attivo o inattivo in relazione al grado di compattamento della cromatina? Si può passare da uno stato all’ altro e come?

A

97

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15
Q

Data la stabilità di una modificazione epigenetica, cosa è necessario per rompere i legami formati, e quali complessi svolgono questa funzione e cosa possiedono per farlo?

A

97

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16
Q

Quali sono le possibili azioni dei complessi di rimodellamento della cromatina?

A

98

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17
Q

Quali sono le possibili azioni dei complessi di rimodellamento della cromatina?

A

98

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18
Q

Grazie a cosa i complessi di rimodellamento sono in grado di riconoscere il DNA, non essendo possibile farlo in modo autonomo?

A

98

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19
Q

Quali sono gli eventi che vanno dal riconoscimento del DNA dai fattori pionieri all’ attivazione della trascrizione?

A

98

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20
Q

Quali sono le regioni più accessibili ai complessi di rimodellamento della cromatina, e cosa determina in ciascuna cellula la differente espressione di geni a questo livello iniziale?

A

98

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21
Q

Quale è una delle possibili tecniche per determinare le regioni del DNA accessibili al rimodellamento della cromatina?

A

99

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22
Q

Quale è la funzione delle varianti istoniche nei nucleosomi e quali complessi si occupano di sostituirle al posto degli istoni normali? Farne un esempio

A

99

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23
Q

In cosa consistono le modifiche post tradizionali degli istoni, dove vengono effettuate negli istoni e quali sono le principali?

A

99

24
Q

Che cosa si intende per codice istonico? Da chi viene scritto, letto e cancellato?

A

99

25
Q

Da cosa dipende l’effetto delle modificazioni post traduzionali sugli istoni? E nello specifico da cosa dipende rispetto al residuo istonico modificato?

A

100

26
Q

Cosa prevede la nomenclatura per le modifiche post traduzionali sugli istoni?

A

100

27
Q

Da quali enzimi il codice istonico viene scritto, letto e cancellato?

A

100

28
Q

Quali sono i writers, erasers e readers per l’acetilazione?

A

100

29
Q

Quali sono i writers, erasers e readers per la metilazione?

A

100

30
Q

In che modo spesso i writers sono considerati anche readers nelle modifiche post traduzionali? Per quali due motivi questo aspetto è rilevante?

A

101

31
Q

Su cosa si basa il significato strutturale delle modificazioni istoniche post traduzionali? Quali sono esempi di modificazioni che fanno riferimento a ciò?

A

101

32
Q

Su cosa si basa la creazione di siti di legami per fattori regolatori, riguardo le modifiche istoniche post traduzionali? Quale tipo di modificazione adopera solo secondo questa definizione?

A

101

33
Q

Descrivere l’acetilazione riguardo target, significato, writer, erasers e reader

A

102

34
Q

In che modo può essere spiegato il recettore nucleare per gli ormoni tiroidei riguardo le modificazioni epigenetiche?

A

103

35
Q

Spiegare la fosforilazione in termini di target, effetto, writer, eraser, meccanismo di attivazione nelle modifiche istoniche post traduzionali

A

103

36
Q

Quali sono le lisine che subiscono metilazione per avere attivazione trascrizionale?

A

104

37
Q

Che tipo di effetto ha una metilazione di una coda istonica? Quale subunitá deve possedere affinché possa avvenire?

A

104

38
Q

Quale è l’ enzima che si occupa di metilare la lisina 4 e quale per la lisina 36 nelle modifiche istoniche?

A

104

39
Q

A quali regioni del DNA è associata la monometilazione della lisina 4, la trimetilazione della lisina 4, la trimetilazione della lisina 36?

A

105

40
Q

Quali lisine nelle code istoniche subiscono metilazione per la repressione trascrizionale?

A

105

41
Q

Quale è il writer che si occupa della metilazione della lisina 27? Perchè questo processo è importante nello sviluppo embrionale?

A

105

42
Q

Cosa impedisce il complesso Polycomb dopo aver metilato la lisina 27?

A

105

43
Q

Quali sono i writer per la metilazione della lisina 9, dove si trovano le regioni metilate da questi enzimi?

A

105

44
Q

Quali sono i due meccanismi secondo i quali la metilazione delle code istoniche impedisce la trascrizione?

A

106

45
Q

Cosa si intende per eterocromatina costitutiva ed eterocromatina facoltativa e come questo è connesso al concetto di modificazioni epigenetiche?

A

105

46
Q

Cosa si intende per non contemporaneità e coerenza nelle modificazioni istoniche sugli aminoacidi?

A

106

47
Q

Quali sono le tre regole generali del codice istonico?

A

106

48
Q

Come vengono mantenute le modifiche istoniche nel processo di replicazione? Illustrare le fasi e gli enzimi che entrano in gioco

A

106

49
Q

Come si provvede, dopo il processo di replicazione e l’assemblaggio di nucleosomi sui neofilamenti, a risolvere la mancanza di metà dei nucleosomi necessari, e dopo aver fatto ciò come si instaura nei neofilamenti di DNA lo stesso pattern del filamento madre?

A

107

50
Q

Una volta che la modifica istonica è mantenuta nella replicazione, come questa può essere trasmessa da un singolo nucleosoma ai nucleosomi circostanti?

A

107

51
Q

Grazie a cosa si ferma il processo di espansione delle modifiche istoniche nei nucleosomi vicini?

A

107

52
Q

Alla base di cosa è presente un sistema a feedback positivi e negativi nelle modificazioni istoniche?

A

108

53
Q

Cosa si può capire dai patterns di attivazione e repressione legati ai promotori enhancers e corpo del gene? Quali modificazioni si osservano?

A

108

54
Q

Quale è il punto iniziale e il punto finale dell’ attivazione della trascrizione nelle modificazioni epigenetiche? Una volta reclutato l’attivatore (punto iniziale) quali passaggi possono verificarsi?

A

108/109

55
Q

Come viene spenta l’espressione di un gene a livello epigenetico a partire da un repressore?

A

109

56
Q

Quali tipi di modifiche epigenetiche e proteine associate alla cromatina si trovano nelle regioni di eterocromatina?

A

109

57
Q

Nella repressione della trascrizione di un gene a livello epigenetico, quali sono i passaggi che vedono coinvolte le proteine SUVAR e HP1?

A

109/110

Biologia Molecolare (23 decks)

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