Epigenetica e modifiche pt istoniche

Question 1

In quale struttura risiede il primo livello di regolazione dell’espressione genica?

Answer 1

95

Question 2

Cosa comprende il complesso della cromatina e quale è il suo ruolo?

Answer 2

95

Question 3

Su cosa si basano i meccanismi epigenetici? Quali sono i substrati per le modificazioni epigenetiche?

Answer 3

95

Question 4

Quali sono i tre aggettivi per descrivere le modificazioni epigenetiche?

Answer 4

95

Question 5

Quali sono i due principali meccanismi epigenetici?

Answer 5

96

Question 6

Cosa sono i nucleosomi e da cosa sono composti?

Answer 6

96

Question 7

Quale sono le proteine istoniche che formano il core del nucleosoma e in quante unità?

Answer 7

96

Question 8

In quali domini si divide una proteina istonica?

Answer 8

96

Question 9

Che tipo di proteine sono gli istoni e che funzione conferisce la loro caratteristica?

Answer 9

96

Question 10

Quanti e quali sono i dimeri di istoni che costituiscono la struttura finale di un nucleosoma? Quali sono le fasi per la formazione del complesso nucleosoma?

Answer 10

96

Question 11

Che tipo di legame si instaura tra istoni e DNA e perché è definito sequenza indipendente? Dove avviene l’ interazione?

Answer 11

96

Question 12

Quale tipo di DNA è presente tra un nucleosoma e un altro e che ruolo ha? Tramite quale altro tipo di istoni quel tratto di DNA si lega maggiormente al nucleosoma?

Answer 12

96/97

Question 13

Quali strutture forma il DNA avvolto ai nucleosomi in gradi di compattamento maggiori? E come è coinvolto l’istone H1?

Answer 13

97

Question 14

Cosa rende un gene attivo o inattivo in relazione al grado di compattamento della cromatina? Si può passare da uno stato all’ altro e come?

Answer 14

97

Question 15

Data la stabilità di una modificazione epigenetica, cosa è necessario per rompere i legami formati, e quali complessi svolgono questa funzione e cosa possiedono per farlo?

Answer 15

97

Question 16

Quali sono le possibili azioni dei complessi di rimodellamento della cromatina?

Answer 16

98

Question 17

Grazie a cosa i complessi di rimodellamento sono in grado di riconoscere il DNA, non essendo possibile farlo in modo autonomo?

Answer 17

98

Question 18

Quali sono gli eventi che vanno dal riconoscimento del DNA dai fattori pionieri all’ attivazione della trascrizione?

Answer 18

98

Question 19

Quali sono le regioni più accessibili ai complessi di rimodellamento della cromatina, e cosa determina in ciascuna cellula la differente espressione di geni a questo livello iniziale?

Answer 19

98

Question 20

Quale è una delle possibili tecniche per determinare le regioni del DNA accessibili al rimodellamento della cromatina?

Answer 20

99

Question 21

Quale è la funzione delle varianti istoniche nei nucleosomi e quali complessi si occupano di sostituirle al posto degli istoni normali? Farne un esempio

Answer 21

99

Question 22

In cosa consistono le modifiche post tradizionali degli istoni, dove vengono effettuate negli istoni e quali sono le principali?

Answer 22

99

Question 23

Che cosa si intende per codice istonico? Da chi viene scritto, letto e cancellato?

Answer 23

99

Question 24

Da cosa dipende l’effetto delle modificazioni post traduzionali sugli istoni? E nello specifico da cosa dipende rispetto al residuo istonico modificato?

Answer 24

100

Question 25

Cosa prevede la nomenclatura per le modifiche post traduzionali sugli istoni?

Answer 25

100

Question 26

Da quali enzimi il codice istonico viene scritto, letto e cancellato?

Answer 26

100

Question 27

Quali sono i writers, erasers e readers per l'acetilazione?

Answer 27

100

Question 28

Quali sono i writers, erasers e readers per la metilazione?

Answer 28

100

Question 29

In che modo spesso i writers sono considerati anche readers nelle modifiche post traduzionali? Per quali due motivi questo aspetto è rilevante?

Answer 29

101

Question 30

Su cosa si basa il significato strutturale delle modificazioni istoniche post traduzionali? Quali sono esempi di modificazioni che fanno riferimento a ciò?

Answer 30

101

Question 31

Su cosa si basa la creazione di siti di legami per fattori regolatori, riguardo le modifiche istoniche post traduzionali? Quale tipo di modificazione adopera solo secondo questa definizione?

Answer 31

101

Question 32

Descrivere l'acetilazione riguardo target, significato, writer, erasers e reader

Answer 32

102

Question 33

In che modo può essere spiegato il recettore nucleare per gli ormoni tiroidei riguardo le modificazioni epigenetiche?

Answer 33

103

Question 34

Spiegare la fosforilazione in termini di target, effetto, writer, eraser, meccanismo di attivazione nelle modifiche istoniche post traduzionali

Answer 34

103

Question 35

Quali sono le lisine che subiscono metilazione per avere attivazione trascrizionale?

Answer 35

104

Question 36

Che tipo di effetto ha una metilazione di una coda istonica? Quale subunitá deve possedere affinché possa avvenire?

Answer 36

104

Question 37

Quale è l' enzima che si occupa di metilare la lisina 4 e quale per la lisina 36 nelle modifiche istoniche?

Answer 37

104

Question 38

A quali regioni del DNA è associata la monometilazione della lisina 4, la trimetilazione della lisina 4, la trimetilazione della lisina 36?

Answer 38

105

Question 39

Quali lisine nelle code istoniche subiscono metilazione per la repressione trascrizionale?

Answer 39

105

Question 40

Quale è il writer che si occupa della metilazione della lisina 27? Perchè questo processo è importante nello sviluppo embrionale?

Answer 40

105

Question 41

Cosa impedisce il complesso Polycomb dopo aver metilato la lisina 27?

Answer 41

105

Question 42

Quali sono i writer per la metilazione della lisina 9, dove si trovano le regioni metilate da questi enzimi?

Answer 42

105

Question 43

Quali sono i due meccanismi secondo i quali la metilazione delle code istoniche impedisce la trascrizione?

Answer 43

106

Question 44

Cosa si intende per eterocromatina costitutiva ed eterocromatina facoltativa e come questo è connesso al concetto di modificazioni epigenetiche?

Answer 44

105

Question 45

Cosa si intende per non contemporaneità e coerenza nelle modificazioni istoniche sugli aminoacidi?

Answer 45

106

Question 46

Quali sono le tre regole generali del codice istonico?

Answer 46

106

Question 47

Come vengono mantenute le modifiche istoniche nel processo di replicazione? Illustrare le fasi e gli enzimi che entrano in gioco

Answer 47

106

Question 48

Come si provvede, dopo il processo di replicazione e l'assemblaggio di nucleosomi sui neofilamenti, a risolvere la mancanza di metà dei nucleosomi necessari, e dopo aver fatto ciò come si instaura nei neofilamenti di DNA lo stesso pattern del filamento madre?

Answer 48

107

Question 49

Una volta che la modifica istonica è mantenuta nella replicazione, come questa può essere trasmessa da un singolo nucleosoma ai nucleosomi circostanti?

Answer 49

107

Question 50

Grazie a cosa si ferma il processo di espansione delle modifiche istoniche nei nucleosomi vicini? Come sono sparsi nel genoma i siti isolatori?

Answer 50

107

Question 51

Alla base di cosa è presente un sistema a feedback positivi e negativi nelle modificazioni istoniche?

Answer 51

108

Question 52

Cosa si può capire dai patterns di attivazione e repressione legati ai promotori enhancers e corpo del gene? Quali modificazioni si osservano?

Answer 52

108

Question 53

Quale è il punto iniziale e il punto finale dell' attivazione della trascrizione nelle modificazioni epigenetiche? Una volta reclutato l'attivatore (punto iniziale) quali passaggi possono verificarsi?

Answer 53

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Question 54

Come viene spenta l'espressione di un gene a livello epigenetico a partire da un repressore?

Answer 54

109

Question 55

Quali tipi di modifiche epigenetiche e proteine associate alla cromatina si trovano nelle regioni di eterocromatina?

Answer 55

109

Question 56

Nella repressione della trascrizione di un gene a livello epigenetico, quali sono i passaggi che vedono coinvolte le proteine SUVAR e HP1?

Answer 56

109/110