Cours 3 - NDC Flashcards

Question

L'organisation cellulaire des microorganismes présente deux degrés de \_\_\_\_\_\_\_, elle peut être ______ ou \_\_\_\_\_\_\_. C'est ce critère qui conduit à distinguer les microorganismes dits _____ de ceux dits \_\_\_\_\_\_\_.

Answer 1

* L'organisation cellulaire des microorganismes présente deux degrés de **complexité**, elle peut être **simple** ou **complexe** * C'est ce critère qui conduit à distinguer les microorganismes dits **procaryotes** de ceux dits **eucaryotes**.

Answer 2

Alors que les **eucaryotes** sont parfois **unicellulaires** et parfois **pluricellulaires**, les _procaryotes_ sont toujours _unicellulaires_

Answer 3

* Selon les espèces, ils peuvent **se développer sur** des matières minérales ou à partir d'une très grande variété de substrats organiques présents dans la nature. * Par ailleurs, et contrairement aux autres groupes d'êtres vivants, les microorganismes disposent de **plusieurs moyens de se procurer l'énergie** nécessaire à leurs activités vitales, que ce soit par respiration ou par fermentation, par photosynthèse ou en dégradant des produits organiques comme substrat énergétique et source de carbone, en présence ou absence d’oxygène. * Certains peuvent vivre dans des **conditions extrêmes** (pH très acide, température approximant 100°C, salinité élevée).

Answer 4

* Les bactéries possèdent de **l’ADN et de l’ARN** et se répliquent de façon autonome, par **division binaire**. * Elles ont un **diamètre** moyen de **1 micromètre**, une **longueur** d’environ **5 micromètre** et sont visibles en **microscopie optique** (grossissement 400-1000X). * Elles peuvent vivre à l’**extérieur ou à l’intérieur des cellules de l’hôte** qu’elles infectent.

Answer 5

* La majorité peuvent se développer de façon autonome et sont cultivables sur des milieux de culture artificiels préparés en laboratoire. * **Certaines** manquent toutefois de **métabolites essentiels** qu’elles n’arrivent pas à synthétiser, en sorte qu’elles agissent comme des **parasites intracellulaires obligatoires.** * Ces dernières sont étudiées sur des cultures de **cellules eucaryotes infectées.**

Answer 6

* Les virus sont trop petits (**0.1 micromètre**) pour être visualisés en microscopie optique et nécessitent l’utilisation d’un **microscope électronique.** * Ils sont considérés non-vivants et classés ni comme procaryotes ni comme eucaryotes. * Ils ne peuvent se répliquer de façon autonome, ce sont des **parasites obligatoires** ne pouvant se développer qu’au moment où il existe une cellule-hôte qu’ils peuvent infecter. * Leur génome n’est composé **que d’ADN ou d’ARN, jamais les deux en même temps**. * Ils possèdent une structure protéique, nommée **capside**, qui entoure le matériel génétique.

Answer 7

Les virus possèdent une structure protéique, nommée capside, qui entoure le matériel génétique.

Answer 8

* Les mycètes (ou champignons) sont de **plus grande taille que les bactéries** et ils possèdent une **structure cellulaire plus complexe**. * Ce sont des organismes **eucaryotes**.

Answer 9

* Ce sont des organismes eucaryotes existant dans la nature en tant que saprophytes environnementaux, c’est-à-dire, ils tirent les substances qui leur sont nécessaires de matières organiques en décomposition, sans nécessairement être pathogènes en soi pour l’homme. * Toutefois, ils peuvent causer des infections entre autres chez les personnes souffrant d’un déficit immunitaire.

Answer 10

* les levures sont des mycètes **unicellulaires** se reproduisant par **bourgeonnement**. * Elles occupent une place essentielle dans **l'industrie alimentaire** (la bière, le vin et le pain sont fermentés par Saccharomyces cerevisiae) et contribuent à la **revalorisation des déchets agricoles et industriels**. * Certaines levures peuvent toutefois causer des **infections chez l’humain** (ex. vaginite à Candida albicans).

Answer 11

* Les moisissures sont des **champignons multicellulaires** pouvant se présenter **sous forme filamenteuse** (des hyphes formant un mycélium visible, avec production de spores reproductives volatiles) **ou parfois dimorphe** (filamenteux dans la nature mais ayant une forme ressemblant aux levures dans l’hôte infecté). * Elles **détériorent les aliments**, sans pour autant être toxiques, bien que certains mycètes puissent libérer des toxines dangereuses ou s’avérer invasifs en cas de blessures. * En général, les mycètes sont largement utiles dans **l'industrie alimentaire et pharmaceutique** (ex. : fromages, pénicilline).

Answer 12

* Le terme ‘parasite’ est souvent utilisé au sens large pour décrire une variété d’organismes macroscopiques ou microscopiques pouvant induire des maladies. Ceci inclut de petits arthropodes porteurs de microbes impliqués dans les infections contractées au contact des animaux (zoonoses), des helminthes (ex. vers intestinaux) et des protozoaires * Les protozoaires sont des eucaryotes unicellulaires (des protistes) causant des infections. Ils vivent dans l’eau, les sols humides ou à l’intérieur d’un organisme, ont des formes variées et peuvent agir comme entités autonomes ou parasitaires. * Ils sont connus pour causer des maladies telles que la toxoplasmose, la malaria ou la dysenterie. * Les infections parasitaires demeurent un problème sanitaire et économique majeur dans les pays en voie de développement. * Par ailleurs, la plupart des parasites ont des cycles de vie complexes impliquant plus d’une espèce dans leur développement, pouvant par exemple passer d’un insecte à l’humain sous formes différentes selon l’hôte.

Answer 13

En fait, le terme infestation se réfère aux parasites macroscopiques (vers, poux), tandis que le terme infection est utilisé pour décrire les pathologies induites par des microorganismes invisibles à l’œil.

Answer 14

* La capsule est une enveloppe **visqueuse** **d’épaisseur variable** produite à la surface de certaines bactéries. * C'est le constituant le **plus externe**. * Elle n'est pas visible en microscopie optique par les techniques de coloration usuelles. * On la met en évidence en mélangeant la suspension bactérienne avec de l'**encre de chine**; la capsule forme alors un halo clair détectable autour de la bactérie. * La capsule n'existe que chez certaines bactéries et n'est **pas indispensable** à leur survie. * Elle joue un rôle essentiel dans la **virulence**, en empêchant la **phagocytose** par les cellules immunitaires et en favorisant **l'adhérence** des bactéries aux cellules épithéliales de l’hôte. * Elle confère à la bactérie qui en est dotée un **pouvoir pathogène** que la bactérie non capsulée ne possède pas. * Elle est en général composée de **polysaccharides** variés permettant la classification par **sérotypes**. * La capsule est appelée ‘**Antigène K**’ et on utilise le terme ‘**sérotype**’ pour désigner les diverses souches selon les caractéristiques capsulaires. * Par exemple, il existe environ **83 sérotypes de S. pneumoniae**

Answer 15

* Le glycocalyx est un feutrage extracellulaire de fibres **polysaccharidiques** présentes à la surface de **certaines** bactéries dans leur milieu naturel. * Elle est l’équivalent de la capsule mais elle établit des **interconnections entre bactéries.** * Chez certaines espèces, des quantités importantes de glycocalyx sont synthétisées (ex. Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus mutans). * On parle **d’exopolymère**, de ‘**biofilm**’, de ‘**slime**’ (**visqueux et gluant**). * La production de glycocalyx favorise l'**adhésion de la bactérie à des matériaux** comme les prothèses, les tuyaux, etc. * Compte-tenu que la composition du glycocalyx est pratiquement la même que celle de la capsule, on utilise le terme **glycocalyx lorsque les bactéries sont reliées entre elles** dans cette matrice extracellulaire, et le terme _capsule lorsque les polysaccharides demeurent confinés à des bactéries individuelles_

Answer 16

* La paroi est une enveloppe **semi-rigide** donnant sa **forme** à la bactérie (sphère, bâtonnet, spirale). * Deux structures de paroi très différentes sont observées, lesquelles ont servi à élaborer le **test de Gram**. * Chez les Gram+ et les Gram- on trouve un c**onstituant commun appelé peptidoglycan**, mais celui-ci varie grandement en **épaisseur** dans l’un et l’autre cas. * Il s’agit d’un polymère qu’on ne retrouve pas dans les cellules humaines et c’est pourquoi il peut servir de cible aux **antibiotiques**. * La **pénicilline** interfère avec la **synthèse du peptidoglycan** en se liant à des protéines nommées ‘protéines liant la pénicilline’ (Penicillin Binding Proteins, PBP). * La paroi des bactéries à **Gram positif** est constituée en majeure partie d’un **épais** peptidoglycan. * La paroi des bactéries à _Gram négatif_ est plus complexe : la couche de peptidoglycan est _très mince_ mais recouverte d'une seconde couche appelée enveloppe externe, laquelle contient des _lipopolysaccharides (LPS) appelés endotoxine (Antigène O)_ ainsi que des canaux appelés _porines_ par lesquels des substances nutritives peuvent pénétrer la cellule. * On comprend que la présence de cette enveloppe supplémentaire chez les Gram- rend _difficile l’accès au peptidoglycan par la pénicilline_, qui s’avère donc plus efficace contre les Gram+.

Answer 17

* La membrane cytoplasmique est une **structure mince, à la fois souple et résistante**, qui s'étend sous la paroi cellulaire et qui enveloppe et r**etient le cytoplasme** de la cellule. * Elle est faite de **protéines mobiles** au-milieu d’une **bicouche de phospholipides**, laquelle forme une **barrière osmotique** régulant les concentrations **d’ions** et de **substances nutritives** intracellulaires versus extracellulaires. * La membrane cytoplasmique contient des **systèmes de transport** (les **perméases**) qui assurent la **pénétration sélective** de certaines substances (sucres, acides aminés, ions minéraux), même contre un gradient de densité qui **ne favorise pas l’accumulation intracellulaire** de ces substances.

Answer 18

* Le cytoplasme est un fluide qui contient plus de **95% d’eau** et dans lequel on retrouve un grand nombre de **substances dissoutes**. * Il contient de nombreux **ribosomes** responsables de la traduction des ARNm en protéines.

Answer 19

* Le **cytoplasme** contient de nombreux ribosomes responsables de la **traduction des ARNm en protéines**. * Les ribosomes bactériens possèdent les **sous-unités 50S et 30S** (indice de sédimentation), une **divergence** d’avec les **ribosomes humains**, constituant ainsi une caractéristique exploitable par **l’antibiothérapie**

Answer 20

* On peut mettre en évidence le chromosome bactérien par microscopie optique ou électronique, l’**ADN** apparaissant comme une **forme pelotonnée** compte-tenu qu’il est **1000 fois plus long** que la bactérie. * Plusieurs bactéries possèdent, en addition de leur chromosome, de petites **molécules d’ADN circulaire** douées de **réplication autonome, transférables d’un microbe à l’autre**, appelées **plasmides**.

Answer 21

* Plusieurs bactéries possèdent, en addition de leur chromosome, de petites **molécules d’ADN circulaire douées de réplication autonome, transférables** d’un microbe à l’autre, appelées plasmides. * Les plasmides sont médiateurs de nombreuses propriétés, incluant le fait de porter des **gènes de résistance aux antibiotiques**. * Le nombre d'espèces bactériennes hébergeant des plasmides de résistance est considérable et constitue un **problème médical réel**. * Les plasmides sont également porteurs de gènes conférant des **propriétés pathogènes** aux bactéries les possédant. * Entre autres, plusieurs **entérotoxines** irritantes pour l’intestin sont d’origine plasmidique.

Answer 22

* Les flagelles assurent la **mobilité** de la bactérie. * Ils ne sont visibles qu'en utilisant une **coloration spéciale**. * Ils sont antigéniques et appelés **Antigène H**. * Leur nombre et leur disposition varient selon les espèces : * **Monotriche** : un seul flagelle à une extrémité de la cellule * **Lophotriche** : plusieurs flagelles à une extrémité de la cellule * **Amphitriche** : un ou plusieurs flagelles aux deux extrémités de la cellule * **Péritriche** : des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule

Answer 23

* Beaucoup de bactéries à Gram- possèdent des genres de poils nommés pili (pilus au singulier), plus courts que les flagelles, servant à les **fixer** plutôt qu’à les faire avancer. * Par ailleurs, certains pili, dits **sexuels**, servent au **transfert unilatéral de matériel génétique** d’une bactérie à l’autre, phénomène appelé **conjugaison**, qui contribue à la dissémination de gènes de résistance par le transfert de plasmides. * Les pili sexuels sont peu nombreux, et les **pili réguliers** sont aussi appelés **fimbriae**.

Answer 24

* Certaines bactéries ont la capacité de former des **spores intracellulaires** (endospores) dans lesquelles elles **stockent leurs éléments vitaux** dans les **situations de survie**, en se débarrassant du reste. * Sous cette forme, elles peuvent **résister de longues années sans eau ni nourriture, aux températures extrêmes**, et deviennent **insensibles** à l'action de composés chimiques tels les **antibiotiques**. * Lorsque les conditions environnementales deviennent défavorables, le processus de sporulation s’enclenche; lorsqu’elles redeviennent favorables, la bactérie reprend sa **forme ‘végétative’ active** par un processus appelé **germination**. * **_Seule la forme active peut être pathogène, mais c’est souvent sous sa forme sporulée que la bactérie est contractée dans l’environnement._**

Answer 25

Seule la forme active peut être pathogène, mais c’est souvent sous sa forme sporulée que la bactérie est contractée dans l’environnement.

Answer 26

Les ‘spores’ bactériennes ne doivent toutefois pas être confondues avec les ‘spores’ des mycètes, les premières constituant un mode de survie, tandis que les secondes jouent un rôle de reproduction par leur dissémination.

Answer 27

Les bacilles à **Gram +** des genres **Bacillus** et **Clostridium** ont cette capacité de former des endospores.

Answer 28

* Le volume, la forme, la localisation de la spore bactérienne à l’intérieur de la bactérie sont des caractéristiques constantes pour une espèce donnée et servent donc à l’identification des espèces.

Answer 29

Les spores sont importantes dans la dissémination de la **gangrène gazeuse** (Clostridium perfringens), du **tétanos** (C. tetani), du **botulisme** (C. botulinum) et de **l'anthrax** (Bacillus anthracis)

Answer 30

Le génotype est le contenu en matériel génétique d’un microbe.

Answer 31

Le phénotype est l’ensemble des caractéristiques découlant du génotype, comme par exemple la morphologie et les fonctions cellulaires.

Answer 32

* La taille des bactéries est d’environ 0.5-1.0 m de diamètre et 2.0-5.0 m de longueur. * Leur forme peut être celle de bâtonnets (ex. bacilles), de sphères (cocci), un entre-deux (coccobacilles), des virgules (vibrio) ou spirales (spirochètes) ou de forme variable (pléïomorphes). * Leur arrangement spatial est soit celui de bactéries isolées, de paires (ex. diplocoques), de chaînettes (ex. streptocoques), de paquets organisés en cubes (ex. Sarcina) ou d’amas désorganisés (ex. staphylocoques). * Certaines composantes structurales servent également à les classifier, que ce soit la présence de flagelles locomoteurs, d’endospore, de capsule ou autres composantes.

Answer 33

* Lorsque les bactéries croissent sur gélose nutritive en boîte de Pétri, leur apparence coloniale est typique de l’espèce. * la morphologie des colonies qu’elles produisent est classée selon * la **forme** (circulaire, irrégulière, filamenteuse, rhizoïde), * **l’élévation** (élevée, convexe, plate, pointue, cratériforme), * la **bordure** (entière, ondulée, filiforme, frisée, lobée), * la **surface** (lisse, luisante, crémeuse, rugueuse, mate), * **l’opacité** (transparente, opaque, translucide, iridescente), * la **pigmentation** (diverses couleurs).

Answer 34

* pour identification / classification bactérienne * Diverses colorations mettent à profit les caractéristiques structurales et biochimiques des bactéries. * Une fixation préalable du spécimen sur lame est nécessaire. * Des colorants basiques ou acides sont ensuite appliqués. * On peut procéder à une coloration simple, une coloration différentielle, ou une coloration de structures spécifiques.

Answer 35

* En coloration simple, on emploie une solution aqueuse ou alcoolisée d’un seul colorant basique, le but étant de faire ressortir les cellules en entier. * On ajoute parfois un agent chimique, appelé mordant, pour intensifier la coloration. * Les colorants simples le plus souvent utilisés sont le bleu de méthylène, la fuchsine basique, le violet de cristal et la safranine

Answer 36

* la coloration de Gram a été mise au point en 1884 par Christian Gram. * Cette technique permet de diviser les bactéries en deux grands groupes : les bactéries à Gram positif et les bactéries à Gram négatif. On fait une coloration primaire d’un frottis avec du cristal-violet, que toutes les bactéries absorbent, surtout en y ajoutant de l’iode comme mordant. Toutes les bactéries apparaissent alors violettes. On lave ensuite avec une solution d’éthanol ou d’acétone, ce qui 11 décolore certaines espèces seulement, alors que d’autres conservent le cristal-violet. Les bactéries ayant perdu le cristal violet deviennent transparentes. On soumet ensuite le frottis à un second colorant (dit ‘contre-colorant’) qui est la safranine, de couleur rosée. Seules les bactéries qui s’étaient décolorées à l’éthanol absorbent le contre-colorant. Le résultat final est la visualisation de bactéries violettes (Gram +) ou de bactéries roses (Gram -). En fait, les bactéries réagissent différemment pour des raisons liées à la structure de leur paroi cellulaire. Selon sa composition, cette dernière retient ou laisse échapper le mélange de cristal-violet et d’iode. La coloration de Gram a une grande utilité en microbiologie médicale pour la sélection des antibiotiques à administrer, car ceux-ci dépendent en partie de la composition de la paroi bactérienne pour leur efficacité. Certaines bactéries réagissent mal à la coloration de Gram, du fait de la composition cireuse de leur paroi : ce sont les mycobactéries, responsables entre autres de la tuberculose et de la lèpre. On utilise donc à la place une coloration dite de Ziehl-Neelsen, faisant usage d’un colorant primaire rouge (la fuchsine basique) et d’un contre-colorant bleu (bleu de méthylène). Les Mycobacterium (acido-alcoolo-résistants) ne se décolorent pas et demeurent rouges, car la fuchsine s’intègre aux lipides de leur paroi.

Answer 37

* une façon de mettre la capsule en évidence consiste à mélanger les bactéries qui en produisent à une suspension colloïdale d’**encre de Chine**. * La capsule apparaît **translucide** autour de bactéries noires, d’où l’expression de coloration négative de la capsule.

Answer 38

* il n’existe que quelques genres de bactéries à **Gram positif** qui sporulent, soit les **Bacillus** et les **Clostridium**. * Le vert de malachite est utilisé pour les colorer, et la safranine contre-colore le reste de la bactérie, en sorte que les bactéries sporulées apparaissent **roses** avec une **spore** **verte**.

Answer 39

* les flagelles bactériens sont des structures de locomotion trop fines pour être vues sans coloration, en sorte que la **fuchsine** est utilisée, dans un procédé fastidieux, pour les rendre visibles