Cours 18 - Les mycoses Flashcards
1
Q
Infos générales: règne des champignons
A
- Le règne des champignons est très diversifié
- ~ 150,000 espèces
- 1-5 millions estimées (> 5 % caractérisées )
2
Q
2 types généraux de champignons
A
- Micromycètes: Levures et moisissures (microscopiques)
- Macromycètes: Champignons macroscopiques Sporophores/Condiophores (visibles)
3
Q
Décrire: caractéristiques des champignons/mycètes/fungi
A
- Organismes eucaryotes
- ressemblent à humains: facteur limitant pour la médication
- Sans chlorophylle
- Porteurs de spores
- Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
- Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
- Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
- Elles sont pour la plupart saprophytiques; moins de 0.5 % sont reconnus pathogènes
- saprophytiques: se nourrissent de matière organique en décomposition
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Q
Définir: Mycoses
A
des infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme.
5
Q
Mycoses: infectent quoi?
A
Les mycoses peuvent être superficielles ou profondes et même systémiques
6
Q
Définir: mycologie médicale
A
- une discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie.
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Q
Histoire de la mycologie médicale (ordre)
A
- Hippocrates (460–377 b.c.e. )
- Moyen Âge en Europe
- 20ème siècle
- 21ème siècle: l’âge d’or de la mycologie médicale
8
Q
Mycobiologie médicale et Hippocrates
A
- 460–377 b.c.e.
- le père de la médecine, avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans).
9
Q
Moyen Âge en Europe et mycobiologie médicale
A
des enfants infectés par Trichophyton schoenleinii (dermatophyte-Tinea)- Champignon attaquant le cuir chevelu, la peau lisse et les ongles.
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Q
20ème siècle et mycobiologie médicale
A
- Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-1944).
- 2ème guère mondiale: apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose).
- Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses):
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
11
Q
21ème siècle et mycobiologie médicale
A
- l’âge d’or de la mycologie médicale
- Développement des tests diagnostiques: tests de mise en culture spécifiques, tests de susceptibilités aux agents antimicrobiens, identification moléculaires (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
- Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
- Avancées dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique:
- Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes de l’Homme.
- Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
- etc.
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Q
Classifications possibles des pathogènes fongiques
A
- Critères morphologiques
- Taxonomie et phylogénie
- Manifestations cliniques (sites d’infection)
13
Q
Mycètes: classification morphologique
A
- Basée sur la forme de la croissance végétative.
- On distingue trois types de
morphologies :- Levures (forme levuriforme)
- Moisissures (champignons filamenteux)
-
Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
- transitent entre les 2 premières formes
14
Q
Classification morphologique des mycètes: décrire les levures
A
- La forme la plus simple des champignons
- Se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae et C. albicans -A) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe- B)
- Les levures pathogènes humains sont désignées par Blastoconidies (C. albicans)
15
Q
Classification morphologique des mycètes: décrire les moisissures
A
- Cellules filamenteuses et cylindriques souvent branchées nommées hyphes
- filament multicellulaire
- Une masse d’hyphes = Mycélium
- ensemble de filaments
- Hyphes avec (Aspergillus) ou sans septum (Mucor)
- septum: séparation entre les cellules
16
Q
Mycètes: qu’est-ce qu’un septum?
A
- seulement chez les moisissures
- septum: séparation claire entre les cellules
- mais encore des échanges possibles entre les cellules
- vrai hyphe: avec septum
- pas de septum: plusieurs noyaux baignent dans le cytoplasme
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Q
Classification morphologique: formes possibles
A
- Levures
- Moisissures
- Champignons dimorphiques (levures et champignons à la fois)
- Pseudohyphes
18
Q
Classification morphologique des mycètes: décrire pseudohyphes
A
- Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale.
- Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
- Forme s’apparente à filament, mais pas de septum
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Q
Classification morphologique des mycètes: décrire les champignons dimorphiques
A
- Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes endémiques comme Blastomyces et Histoplasm
- Filamenteux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol)
- Levures à 37°C température corporelle.
- Ce changement morphologique (morphogenèse) est une caractéristique d’identification de ces champignons au laboratoire.
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Q
Classification taxonomique des mycètes: se base sur quoi? + importance
A
- Classification actuelle dépend de la présence/absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
- Phylogénie moléculaire/génétique (basée sur la ressemblance des séquences d’ADN)
- Pourquoi est-ce important pour un clinicien microbiologiste ?
- Susceptibilité aux agents antifongiques
- Pouvoir pathogène et transmissibilité
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Q
Classification taxonomique des mycètes: exemples de règnes, divisions, ordres et genres associés
A
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Q
Classification taxonomique des mycètes: où se situent la plupart des mycètes pathogènes?
A
- La grande majorité des champignons pathogènes appartiennent au Dicarya (Ascomycètes & Basidiomycètes) et la division des Glomeromycota (Mucorales & Entomophtorales)
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Q
Décrire les ascomycètes
A
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
-
Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
- ascospores: origine de leur nom!
- peut avoir les 2 modes de reproduction
- chaque ascoque contient des ascospores
- Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs propagules ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
- Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma,
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Q
Décrire les basidiomycètes
A
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
- basidium: sorte de socle où on voit 4 spores appelés basidispores
- Apparences: levures, filaments, capsules.
- Exemples : Cryptococcus neoformans, C. gattii, Schisophyllum commune, Trichosporon, Malassezia pachydermatis
25
Q
Décrire les mucorales
A
- aka zygomycètes
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques
- plusieurs noyaux au sein du même cytoplasmae
- Formation de zygospores
- 2 filaments se rencontrent et forment un zygospore
- Exemples : Mucor spp, Rhizopus, Lichtheimia, Apophysomyce
26
Q
Classification basée sur la pathogenèse: quelles sont les classes possibles?
A
Classification basée sur les sites d’infections primaires :
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
27
Q
Décrire: mycoses superficielles
A
- Tinea versicolor : Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
- Infections causées par Malassezia
- Problèmes majoritairement cosmétiques.
28
Q
Décrire: mycoses cutanées
A
- Aussi appelés dermatophytes
- Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
- Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale > Microsporum canis
- Ex. pied d’athlète
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Q
Facteurs de risques des mycoses invasives
A
- Mortality rates, by high-risk condition, of patients with (shaded bars) and without (open bars) invasive fungal infections.
- HSCT/BMT = Hematopoietic Stem Cell Transplantation or Bone Marrow Transplantation
- Solid cancer
- Blood cancer
- SOT = Solid-Organ Transplantation
- COPD = Chronic Obstructive Pulmonary Disease
- Mutiple complications
- All other patients
- Diabetes
- HIV
HSCT/BMT = Hematopoietic Stem Cell Transplantation or Bone Marrow Transplantation SOT = Solid-Organ Transplantation COPD = Chronic Obstructive Pulmonary Disease
33
Q
Composantes de la cellule fongique: Levure
A
- Noyau avec membrane nucléaire (cellule eucaryote)
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
- pas présent chez Humain!
34
Q
Composantes de la cellule fongique: Hyphe
A
- on voit le cône du filament: où se passe la croissance de se filament (partie apicale)
- le filament a donc une polarité
- Corps de Voronine (Woronin body): boucher le pore
- Spitzenkorper: spécificité de la moisissure, permet de tirer physiquement le filament et ainsi d’avoir une polarité
- Septum avec le pore septal
- Corps de Voronine (Woronin body)
- Noyau avec nucléole
- Réticulum endoplasmique
- Mitochondrie
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire avec 3 couches:
- Interne (chitine),
- Intermédiaire (glucane)
- Externe (mannane)
- Vacuole
- Golgi
- Spitzenkorper
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Q
Décrire: paroi cellulaire d’un mycète (en général)
A
Intérieur à extérieur
- Couche interne: chitine
- Couche intermédiaire: glucane
- Couche externe: mannanes et protéines pariétales
- AUSSI: Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
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Q
Décrire: protéines pariétales
A
- couche externe de la paroi cellulaire des mycètes
- Protéines GPI ( glycosyl–phosphatidylinositol-Protéines) associées à la chitine et au ß-1→ 6-glucane:
- Fonctions: Adhésines (attachement à l’hôte), Biogenèse de la paroi.
42
Q
Mélanine chez les mycètes
A
- Présence de mélanine chez certains champignons filamenteux (Aspergillus, Alternaria)
- dans la paroi cellulaire: couche externe, près des mannanes
- hydrophobe: protection contre conditions hostiles de l’envrionnement
43
Q
Capsule chez les mycètes
A
- polymère
- épaississement de la paroi: épais
- en externe de la paroi cellulaire
44
Q
Les superstars des mycoses
A
- candidiasis
- multiple mycoses
- zygomycosis
- aspergilliosis
- cryptococcosis
- histoplasmosis
- coccidiocomycosis
- other mycoses
45
Q
Décrire: Aspergillus sp
A
- Aspergillomes pulmonaires et cérébrales
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
46
Q
Décrire: Cryptococcus
A
- Cryptococcus gattii
- Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
- Sujets sains et immunosupprimés
- Présence d’une capsule
54
Q
Morphologie de C. albicans
A
- C. albicans, Un champignon, plusieurs morphologies
-
POLYmorphique
- et non dimorphique
- et donc rend son identification difficile juste en regardant la morphologie
