Cours 3 - Les grands groupes des microorganismes (monde microbien) Flashcards

Question

Quelle est la définition de l'enveloppe d'une bactérie? Quels sont les 3 “niveaux”? (extérieur à intérieur de la cellule)

Answer 1

* Définition: Les enveloppes sont les différentes structures qui entourent les bactéries 1. MATÉRIEL EXTRACELLULAIRE (CAPSULE; GLYCOCALYX; COUCHE-S ) 2. PAROI CELLULAIRE 3. MEMBRANE CYTOPLASMIQUE

Answer 2

* Certaines bactéries seulement en possèdent une * Procure un pouvoir pathogène en empêchant la phagocytose * Capsule constituée de polysaccharides = Antigène K * 83 variantes capsulaires (‘sérotypes’) de pneumocoques

Answer 3

* Sorte de ‘capsule’ intercellulaire formant des biofilms agglutinants * résistent donc aux antibiotiques: besoin d'une chirurgie * Favorise l’adhésion aux matériaux (ex. prothèses, tuyaux) * Exemple: Streptococcus mutans --\> carie dentaire * besoin de fluore + action mécanique pour décoller des bactéries qui, lorsqu'en contact avec des sucres, produisent des acides qui détruisent les dents * moins structuré et moins antigénique que la capsule

Answer 4

* Enveloppe rigide qui assure la forme de la bactérie * Il en existe deux structures très différentes: GRAM +/- * Peptidoglycan: épais (Gram +) ou mince (Gram -) * Gram - : enveloppe supplémentaire, endotoxine = LPS = Antigène O

Answer 5

_Gram +_ * cellule plus simple * retient le colorant de Gram * une seule couche (paroi cellulaire) _Gram -_ * pas retenir le colorant de Gram * possède une 2ème couche de lipopolysaccharides en plus de la paroi cellulaire * facteur de virulence: peut déclencher la fièvre NOTE: les antibiotiques ne sont pas les mêmes pour les 2 types de bactéries, puisque la constitution de leur paroi est différente

Answer 6

* Bicouche de phospholipides avec protéines transmembranaires * Barrière osmotique: contrôle les taux ioniques * Transport: régulation des échanges interne/externe * Enzymes: métabolisme énergétique

Answer 7

1. **CYTOPLASME**: Contient l’appareil nucléaire et les ribosomes 2. **APPAREIL NUCLÉAIRE**: ADN double brin _sans_ membrane nucléaire 3. **PLASMIDES**: ADN extra-chromosomique, circulaire, réplication autonome Codent pour des propriétés facilitant la survie, incluant des gènes de résistance

Answer 8

* Assurent la mobilité = Antigène H * Nombre et disposition varient selon les genres

Answer 9

1. Monotriche: 1 seule 2. Lophotriche: plusieurs à une seule extrémité 3. Péritriche: plusieurs partout 4. Amphitriche: juste aux 2 extrémités

Answer 10

1. Pilus sexuel * Transfert de plasmide entre bactérie de manière unidirectionnelle, * ADN * Phénomène de conjugaison 2. Pili, fimbriae (attachement)

Answer 11

* Genres **Bacillus** et **Clostridium** * Survivre dans des **conditions défavorables** * ex. lorsque que la bactérie manque de nutriments, d'humidité, qu'un système immunitaire est dirigé contre elle, elle produit des spores * (Fonction très différente des spores des mycètes) * Volume et position = caractères constants pour une espèce * Maladies par bactéries sporulées: gangrène, tétanos, botulisme, anthrax

Answer 12

* Dans des conditions difficiles, la bactérie met du matériel génétique dans un pré-spore pour protéger ce matériel génétique * Puis, il y a destruction de la cellule et libération du spore contenant du matériel génétique

Answer 13

* les spores sont conçus pour survivre à des conditions difficiles, il est donc difficile de les faire partir * il faut faire usage de produits chimiques et d'une action mécanique (ex. frotter) pour les faire disparaître * ex. C. difficile

Answer 14

1. H = flagelle 2. K = capsule 3. O = endotoxine (paroi Gram -)

Answer 15

_Obligatoires_ * Paroi cellulaire * Membrane plasmique * Cytoplasme * Chromosome * Ribosomes _Facultatives_ * Capsule (et autres matériaux extracellulaires) * Endotoxine * Plasmide * Flagelle * Pil * Spore * Corps d’inclusion/granule

Answer 16

* Coloration simple (Coloration hémalogique de Wright sur LCR, Bacillus anthracis) * Les bactéries sont pas visibles facilement au microscope puisqu'elles sont transparentes. En utilisant le colorant permet aux bactéries de devenir visibles.

Answer 17

* coloration différentielle basée sur la paroi * étant donné que les bactéries a gram - perdent le complexe cristal violet-iode, lors de la décoloration, lorsque la safranine (coloration rouge) est ajoutée, elles deviennent rouges * identification: bactérie gram + vs - * 5 étapes 1. fixation 2. crystal violet (colorant) 3. iode 4. décoloration 5. safranine

Answer 18

1. Capsule 2. Flagelles 3. Endospores

Answer 19

* Pas de colorations impliquées * Changer le contraste, la couleur du fond * Champ clair = observation régulière

Answer 20

* lasers qui excitent de **molécules fluorescentes qui sont couplées à un anticorps** * Lasers - immunofluorescence - reconstruction 3D par ordinateur * Phénomènes d’interactions **vivantes** peuvent être filmés

Answer 21

* Ce qui varie, c'est que le microscope électronique est doté de **lentilles électromagnétiques** et d'un **faisceau d'électrons**, alors qu'un microscope optique utilise un faisceau de lumière et des lentilles en verre. * La **résolution** des microscopes électroniques est beaucoup plus grande (le grossissement atteint 2 millions de fois, contre 2.000 fois avec un microscope optique). Source: Futura Santé

Answer 22

NOTES DE COURS * Les épreuves biochimiques sont utilisées pour identifier les bactéries **une fois leur croissance obtenue en culture pure**. * Elles exploitent une panoplie de **propriétés bactériennes**, incluant la capacité pour certaines de croître en absence d’oxygène, ou en présence d’antibiotiques ou de fortes concentrations de sel, ou encore de métaboliser par voie de fermentation une vaste gamme de glucides. * A titre d’exemple, certaines bactéries entériques ont la capacité de fermenter le lactose, avec production de gaz et d’acide lactique détectable par un indicateur colorimétrique de pH, tandis que d’autres ne fermentent pas ce sucre. On trouve sur le marché des outils miniaturisés capables d’effectuer plusieurs tests biochimique simultanément. * Ex. **système API** et **technologie Micro-Scan**

Answer 23

* Test biochimique * Les laboratoires de bactériologie clinique utilisent maintenant la technologie Micro-Scan qui effectue les tests dans des **microplaques de 96 puits** contenant divers **réactifs colorimétriques** dont l’analyse automatisée est accomplie par ordinateur. * Pour chaque rangée de tests, un pointage est attribué selon que la **réponse est positive ou négative**. * Le **_cumul du pointage donne un résultat final à 8 chiffres_** qui correspond à **une seule espèce bactérienne possible**. * L’appareil Micro-Scan possède également l’avantage de vérifier le **degré de sensibilité d’une souche envers différents antibiotiques** incorporés dans certains puits de la plaque.

Answer 24

* **Test biochimique** * Mentionnons le système API, appelé aussi galeries API, consistant en **languettes multi-puits** dans lesquels des substrats déshydratés sont déjà incorporés. * L’addition de gouttes d’échantillon bactérien dans les puits, suivie d’une **incubation de 4 à 24 heures**, permet aux **enzymes** **bactériens** de réagir, en sorte de produire des **couleurs finales caractéristiques d’une espèce particulière.** * La première galerie API apparue dans le monde de la microbiologie a été la galerie API 20E destinée à l'identification des b. Puis toute une gamme est apparue. * Par la suite, les systèmes d’identification ont été réduits en taille et accrus en capacité, donnant naissance à des **systèmes robotisés performants.**

Answer 25

* Technologies phénotypiques * Tubes éprouvettes, Plaquettes de cupules, Plaque 96 puits (Micro-Scan), Micropuits, etc. * Sources de carbone * Aérobiose, anaérobiose * Potentiel de fermentation * Produits terminaux du métabolisme * Tolérance aux inhibiteurs métaboliques et antibiotiques

Answer 26

* tests biochimiques * Pointage selon les réactions positives: rangée 1: 4, rangée 2: 2, rangée 3: 1 * Le nombre final correspond à une genre et espèce de bactérie * Certaines rangées permettent de vérifier la résistance aux antibiotiques

Answer 27

* détection immunologie par antigènes microbiens * double reconnaissance de l'antigène (utiliser 2 anticorps) * augmente la sensibilité du test de détection * réactif coloré fluorescent ou enzymatique: augmente coloration (en augmentant la production de molécules rouges, grâce à utilisation d'une enzyme) * “ELISA sandwich”

Answer 28

* test de détection immunologique par anticorps (réponse sérologique) * comme les tests rapides pour la COVID

Answer 29

Trousses de détection d’un seul microbe spécifique soupçonné présent dans un échantillon clinique • S. aureus résistants à la méticilline • Staphylocoques sensibles ou résistants • Entérocoques résistants à vancomycine • Clostridium difficile • Streptocoques B lors de l’accouchement Détection simultanée potentielle de plusieurs espèces de microbes (Appareil Revogene de GenePOC)

Answer 30

Ont tous besoin de: base de données fiables et exhaustives!

Answer 31

NON! * sensibilité et spécificité du test (possibles faux + ou faux - * marge d'erreur * mauvais prélèvement * mauvaise technique * environnement dans lequel le test a été fait * contamination Bref, tous les tests ont leurs limites, d'où l'importance de faire usage de son raisonnement clinique. Le test est qu'un élément parmi d'autres à prendre en considération.

Answer 32

**1. Très petits** (microscope électronique) Acellulaires (non vivants) Structure simple (Acide nucléique + emballage) **2.** **ARN ou ADN seulement** Métabolisme, énergie (absents) **3. Parasites obligatoires** Pas de reproduction autonome **4. Cycle de réplication dans l’hôte** Culture sur cellule hôte seulement Traitement par antiviral Antibiotiques inefficaces (Antibiotique = agent antibactérien)

Answer 33

1. Nature du génome 2. Configuration du génome 3. Taille du génome (kbp ou kb) 4. Enveloppe? 5. Morphologie 6. Taille du virion 7. Hôte

Answer 34

* Un virus porte soit de l’ADN, soit de l’ARN, mais **jamais les deux à la fois** * Il injecte son matériel génétique dans la cellule hôte pour se faire répliquer

Answer 35

* le virus utilise la cellule de l'hôte pour se répliquer: et donc lorsque les symptômes apparaissent, le virus est déjà répand (maladie déjà avancée) – importance de la distanciation sociale * moins de cibles que la bactérie

Answer 36

* Avec ou sans enveloppe lipidique * Les virus enveloppés sont entourés d’une bicouche lipidique acquise lors de leur sortie des cellules de l’hôte par bourgeonnement: leur bicouche est donc en réalité une partie de la membrane de la cellule hôte qu'ils s'approprient * Possèdent des spicules d’attachement Ex. Gp120 VIH Hémagglutinine * Les virus sans enveloppe sont dits ‘nus’. * Les virus nus sont plus difficiles à venir à bout de. En effet, pour ceux avec une bicouche, on utilise de l'alcool ou bien de l'eau avec du savon et le tour est joué.

Answer 37

* Nucléocapside = Capside (assemblage de capsomères protéiques) + Acide nucléique * Il y a symétrie des capsides pour donner les formes hélicoïdale ou icosaédrique

Answer 38

* injectent du matériel génétique dans les cellules de l'hôte

Answer 39

* Transcriptase inverse : rétro-transcrit l’ARN viral en ADN * Intégrase : intègre l’ADN viral au chromosome de l’hôte * Protéase : favorise la maturation des protéines virales Application: cible de la trithérapie

Answer 40

* Neuraminidase : contribue au relargage des virus hors des cellules * Ex. Grippe H1N1 : Hémagglutinine-1 Neuraminidase-1 * H1-16, N1-9 Application: peut être inhibée par certains médicaments, mais étant donné que le virus est déjà dans les cellules, ce n'est pas super efficace

Answer 41

1. levures (unicellulaire) 2. moisissures (pluricellulaires)

Answer 42

* mycètes / fungi * unicellulaires * Peuvent produire des pseudohyphes (reproduction par bourgeonnement)

Answer 43

* mycètes / fungi * pluricellulaires * Se reproduisent le plus souvent par spores asexuées volatiles

Answer 44

1. Saccharomyces cerevisiae 2. Candida albicans

Answer 45

1. Certains fromages ensemencés avec Penicillium roqueforti ou Penicillium camemberti 2. Pénicilline découverte par Alexander Fleming produite par Penicillium notatum NOTE: pénicilline est une moisissure (et non une levure)

Answer 46

Protistes unicellulaires ayant des cycles de vie complexes pouvant affecter plusieurs espèces d’hôtes différents dans leur développement

Answer 47

* antigène H = flagelle * antigène K = capsule * antigène O = endotoxine / paroi gram -

Answer 48

* Environ 5 à 10 % des patients hospitalisés contractent des infections acquises en milieux de soins. * L'utilisation correcte de l'hygiène des mains est essentielle à la prévention de ces infections. * Malheureusement le taux d'observance parmi les travailleurs de la santé est souvent inférieur à 40 %.