Cours 14 - Génétique bactérienne Flashcards

Question

Les Ab sont spécifiques à quoi?

Answer 1

* Bien qu'il existe des Ab à large spectre, la majorité ciblent un élément (ex. protéine, structure, etc.) qui est présent que dans une partie des bactéries * Et donc les Ab sont spécifiques aux bactéries qui possèdent cette étape * Même à l'intérieur des sous-divisions des bactéries Gram + et Gram -, les Ab sont spécifiques

Answer 2

* années 50-60

Answer 3

années 90

Answer 4

Un plus petit génome oblige les bactéries à dépendre plus des facteurs de l’hôte pour leur reproduction.

Answer 5

1. Types de gènes dans les **_chromosomes_** vs plasmide 1. chromosome: **_essentiel,_** virulence, résistance 2. plasmide: virulence et résistance 2. Les plasmides sont plus petits que le chromosome bactérien et leur taille peut varier entre 1 et 1 000 kilo paires de bases. 3. La plupart des bactéries ont un seul chromosome et en général celui-ci est circulaire. 4. Les plasmides peuvent encoder de l'information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie hôte.

Answer 6

* La plupart des bactéries ont un seul chromosome et en général celui-ci est circulaire. * Types de gène * **_essentiel_** * virulence * résistance

Answer 7

* Les plasmides sont plus petits que le chromosome bactérien et leur taille peut varier entre 1 et 1 000 kilo paires de bases. * Les plasmides peuvent encoder de l'information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie hôte. * Types de gènes * virulence * résistance

Answer 8

* génome plus gros: * infos supplémentaire, et donc souvent processus infectieux plus complexe * besoin de moins de facteurs de l'hôte pour vivre (plus de potentiel) * souvent possède des plasmides en plus des chromosomes

Answer 9

* Processus qui prend 20 min * Répartition égale des copies du chromosome entre les cellules filles mais pas toujours équitable pour le ou les plasmides. 1. Réplication de l'ADN (chromosome + plasmides) 2. Élongation de la cellule 3. Formation d'un septum (septum = invaginaton) 4. Compléter le septum en formation des parois distinctes 5. Séparation de la cellule 6. Formation de 2 cellules filles

Answer 10

* Objectif : Minimiser ses dépenses énergétiques. * Moyen: Activer seulement au besoin. * Mais toujours être prêts à produire ce qu’il faut pour répondre rapidement. * bactérie active ce qu'elle a besoin au bon moment

Answer 11

1. **_Changements dans le nombre de transcrits (régulation transcriptionnelle) - MOYEN #1 CHEZ LES BACTÉRIES_** 1. Activateurs 2. Répresseurs 2. Changement dans la séquence d'ADN 1. Amplification d'un gène 2. Réarrangement de gènes (mutations) 3. Changement dans la qualité de produit de gène actif 1. Ajout de cofacteur ou groupe prostétique 2. Clivage protéique 3. Interactions avec d'autres macromolécules

Answer 12

1. Changements dans le nombre de transcrits (régulation transcriptionnelle) * Activateurs * Répresseurs

Answer 13

1. Changement dans la qualité de produit de gène actif * Ajout de cofacteur ou groupe prostétique * Clivage protéique * Interactions avec d'autres macromolécules * cofacteur = ion actif * protéine est seulement activée au bon moment * clivage de protéines: protéines ne sont pas activées directement après leur synthèse – proenzyme * couper une enzyme pour qu'elle devienne active * ex. pepsinogène en pepsine * interactions avec d'autres macromolécules: assemblage avec d'autres protéines

Answer 14

* type de régulation de l'expression des gènes * plus pour les champignons que pour les bactéries 1. Changement dans la séquence d'ADN 1. Amplification d'un gène 2. Réarrangement de gènes (mutations)

Answer 15

1. Promoteur 2. Opérateur 3. Répresseur 4. Activateur 5. Contrôle négatif 6. Contrôle positif

Answer 16

* éléments de la régulation transcriptionnelle * **_Promoteur_**: Séquence d’ADN située en _amont_ d’un gène ou groupe de gènes * Permet la _transcription_ de ce gène en ARNm. * Séquence _reconnue par l'ARN polymérase_ * Séquence _requise_ pour _amorcer la transcription_ du gène (ou d'un groupe de gènes consécutifs). * **_Opérateur_**: Séquence d'ADN **adjacente** à un gène ou groupe de gènes * Séquence **reconnue par une protéine régulatrice** (qui agit comme répresseur ou activateur) * Contrôle la **transcription** de ce gène ou groupe de gènes Pour simplifier : promoteur + opérateur = P

Answer 17

* éléments de la régulation transcriptionnelle * **_Répresseur_** : protéine _inhibant_ la _transcription_ d'un gène (ou de plusieurs gènes) en _se liant à une séquence spécifique de nucléotides_ de l'ADN (à un _opérateur_, par exemple). * **_Activateur_** : protéine qui **stimule la transcription** d'un gène ou d'un ensemble de gènes. Ces protéines **reconnaissent généralement une séquence spécifique sur l'ADN** située à **proximité d'un promoteur.**

Answer 18

* Contrôle négatif (répresseur; inductible ou répressible). * Contrôle positif (activateur; inductible ou répressible). * inductible ou répressible: veut dire que sa présence pour être favorisée ou bien diminuée selon le contexte

Answer 19

* Dans cet exemple, la **tétracycline** agit comme **inducteur** puisqu'en se **complexant avec le répresseur**, elle **empêche ce dernier de bloquer le** **promoteur.** * Le promoteur, n’étant plus obstrué par le répresseur, la **polymérase à ARN peut donc produire l’ARNm**.

Answer 20

* À retenir: * En général, les bactéries ne produisent certaines **protéines** que lorsqu'elles en ont **besoin** (**économie d'énergie**). * La **régulation** (et l'autorégulation) de l’expression des gènes est ordinairement un **processus actif** qui exige que la cellule soit dans un **état métabolique actif**. * Ainsi, la **régulation sera plus rapide durant la phase de croissance exponentielle** des bactéries que durant les phases de latence et de plateau ou de décroissance. * La régulation est souvent un processus comprenant des **boucles de contrôle** comme dans le cas de **l'autorégulation**.

Answer 21

1. **Régulation simple**: Un promoteur pour contrôler un gène. 2. **Régulation dans un opéron**: Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents. 3. **Régulation par un régulon:** Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome. 4. **Régulation par un stimulon**: Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus.

Answer 22

Un promoteur pour contrôler un gène.

Answer 23

Un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents.

Answer 24

Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome.

Answer 25

Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus.

Answer 26

* **Modification de la séquence des nucléotides de l'ADN** 1. Substitution 2. Délétion 3. Insertion 4. Réarrangement 5. *Transmises à la cellule fille* 6. *Peuvent être spontanées ou induites* 1. **Mutations spontanées** 1. Erreurs lors de la réplication (ADN Polymérase) 2. Erreurs aléatoires 3. *Peu fréquentes; 10-7 à 10-11 par paire de base /ronde de réplication bactérienne* 2. **Mutations Induites** 1. *Fréquences beaucoup plus élevées* 2. *Agents mutagènes* 3. Physiques; Chimiques; Biologiques

Answer 27

1. Substitution 2. Délétion 3. Insertion 4. Réarrangement * *Transmises à la cellule fille* * *Peuvent être spontanées ou induites*

Answer 28

1. **Mutations spontanées** 1. Erreurs lors de la réplication (ADN Polymérase) 2. Erreurs aléatoires 3. *Peu fréquentes; 10-7 à 10-11 par paire de base /ronde de réplication bactérienne*

Answer 29

1. **Mutations Induites** 1. *Fréquences beaucoup plus élevées* 2. *Agents mutagènes* 3. Physiques; Chimiques; Biologiques

Answer 30

1. Mauvais sens 2. Non sens 3. Silencieuse 4. Sauvage

Answer 31

* mauvais acide aminé * diminution de la performance de la protéines dans la majorité des cas * mais il peut arriver que ça procure un avantage aux bactéries (ex. résistance à un Ab)

Answer 32

* codon stop à la place d'un acide aminé * protéines tronquée * souvent inactive * TRUC: ce que codon n'a aucun sens…

Answer 33

* pas bonne série de nucléotide (la séquence génétique est différente), mais l'acide aminé est le même au final * et donc pas de différence dans la protéine au final * protéine fonctionne convenablement

Answer 34

* protéine normale, sans mutation

Answer 35

* ligne de bactéries au milieu: bactéries normales * points plus blanchâtres au-dessus: mutans qui ne peuvent utiliser le glucose

Answer 36

TOUTES les populations bactériennes ont des mutans

Answer 37

* bactéries plus longues: peut être avantageux ou problématique

Answer 38

* pas de zone grise autour de la bactérie: pas produire de capsule * et donc plus facile pour le système immunitaire de s'en débarrasser

Answer 39

désavantageuses

Answer 40

* individus des bactéries mutans sont capables de se développer malgré la présence d'Ab * état donné que ce trait est avantageux dans ce cas-ci ces quelques bactéries vont prendre le dessus

Answer 41

Phénotype: effet observable d’une mutation

Answer 42

Phénotype (**observable**) + **sélectionable** = effet sur une population

Answer 43

* elle devient maître du monde

Answer 44

* La concentration des antibiotiques va affecter la croissance des bactéries susceptibles dans une population ainsi que celle des bactéries résistantes retrouvées dans cette population. * La sélection des mutants résistants peut survenir sous la Concentration Minimale Inhibitrice (CMI en français; MIC in english) de la fraction susceptible (à partir de la concentration minimale sélective; MSC) et aussi au dessus de la CMI de la population susceptible, tant que la CMI des bactéries résistantes (MICres) ne sera pas atteinte. * La concentration suboptimale des antibiotiques durant le traitement (pensez pharmacocinétique/pharmacodynamique) peut sélectionner les mutants résistants. * MICsusc: minimal inhibiting concentration of susceptible bacteria * concentration minimale pour inhiber la majorité de la population * MICres: minimal inhibiting concentration of resistant bacteria * concentration minimale pour les bactéries résistantes * et donc toujours devoir donner plus d'Ab pour tuer les bactéries résistantes également

Answer 45

* La concentration des antibiotiques va affecter la croissance des bactéries susceptibles dans une population ainsi que celle des bactéries résistantes retrouvées dans cette population. La sélection des mutants résistants peut survenir sous la Concentration Minimale Inhibitrice (CMI en français; MIC in english) de la fraction susceptible (à partir de la concentration minimale sélective; MSC) et aussi au dessus de la CMI de la population susceptible, tant que la CMI des bactéries résistantes (MICres) ne sera pas atteinte. * La concentration suboptimale des antibiotiques durant le traitement (pensez pharmacocinétique/pharmacodynamique) peut sélectionner les mutants résistants * Bref: * traitez vite (population, biofilm) * traitez efficacement (antibiotique, dose, durée)

Answer 46

* principe de la fenêtre de sélection par Ab 1. Traitez vite 1. population 2. biofilm 2. Traitez efficacement 1. Ab 2. dose 3. durée

Answer 47

1. Actions chirurgicales (ex. si biofilm) 2. Actions immunologiques (ex. si abcès)

Answer 48

* pourrait diminuer * pour l'instant: Trop peu d’études pour conclure sur la réduction de la durée de l’antibiothérapie...à suivre

Answer 49

1. La réparation directe de l'ADN 2. La réparation par excision 3. La réparation par recombinaison 4. La réponse SOS (peut stimuler le transfert horizontal de gènes) 1. utilisée lorsque la bactérie est en train de mourir (en urgence!) 5. La réparation sujette à erreur (peut entraîner des mutations)

Answer 50

* L'action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation * ex. Bêta-lactamines et quinolones à faible concentration

Answer 51

* L'action de certains antibiotiques peut activer les systèmes re réparation * ex. Bêta-lactamines et quinolones à faible concentration

Answer 52

1. Transformation 2. Conjugaison 3. Transduction 4. (Transposition)

Answer 53

La transformation se fait par absorption d'ADN libre à partir de cellules lysées dans l'environnement

Answer 54

Au cours de la transduction, le matériel génétique est introduit à partir d'un **phage** dans les génomes bactériens.

Answer 55

La conjugaison implique le **transfert** d'ADN à travers des **pili conjugatifs** et constitue le mécanisme **prédominant** de transfert d'ADN entre bactéries.

Answer 56

La **_conjugaison_** implique le **transfert** d'ADN à travers des **pili conjugatifs** et constitue le mécanisme **prédominant** de transfert d'ADN entre bactéries.

Answer 57

* Cette capacité qu'ont certaines cellules d'être transformées (**modifiées génétiquement) par de l'ADN externe libre** est appelée **compétence**. * La compétence est naturelle chez certaines espèces bactériennes telles: - Bacillus sp. - Haemophilus influenzae - Neisseria sp. - Streptococcus pneumoniae * La bactérie réceptrice est compétente grâce à une **machinerie protéique lui permettant de faire entrer l’ADN externe** dans sa cellule et de l’**intégrer dans son génome** par recombinaison homologue. * **Simple contact** avec des fragments d'ADN provenant d’autres **bactéries (mortes).** * Nouvelles propriétés telles que: * **Résistance** à un antibiotique * Facteur de **virulence** * Beaucoup **plus efficace entre bactéries d’une même espèce**. * Très peu efficace entre bactéries d’espèces différentes.

Answer 58

* Cette capacité qu'ont certaines cellules d'être **transformées** (modifiées génétiquement) par de l'ADN externe libre est appelée compétence. * Section: échange de gènes - **transformation** par de l'ADN libre

Answer 59

La compétence est naturelle chez certaines espèces bactériennes telles: - Bacillus sp. - Haemophilus influenzae - Neisseria sp. - Streptococcus pneumoniae

Answer 60

* Les antibiotiques peuvent favoriser la transformation : • En imposant une **pression sélective** aux bactéries transformées par des gènes de résistance. • En agissant comme **stimulus externe induisant ou augmentant la compétence.** • En favorisant la **lyse de cellules**, libérant ainsi l’ADN servant à la transformation. * Des travaux récents suggèrent que la **transformation peut être stimulée chez certaines bactéries exposées à des médicaments non-antibiotiques** dans des concentrations observées en **clinique** et dans **l’environnement**.

Answer 61

1. Création d'un pili sexuel 2. Échange de plasmide unidirectionnel de la cellule donatrice à la cellule réceptrice

Answer 62

1. Origine de réplication 2. Fonctions de transfert 3. Gènes de résistance

Answer 63

* Bactériophages ou phages : Virus qui parasitent uniquement les bactéries * Transduction: Transfert de gènes médié par les bactériophages. * Capside: Enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique (ADN ou ARN du phage). * Les cycles de vie des bactériophages peuvent prendre plusieurs formes : • lytiques • lysogéniques • chroniques

Answer 64

* Virus qui parasitent uniquement les bactéries * Section transduction de l'échange de gènes

Answer 65

* Enveloppe protéique des bactériophages qui renferme leur matériel génétique * section transduction (échange de gènes)

Answer 66

Les cycles de vie des bactériophages peuvent prendre plusieurs formes : • **lytiques**: une fois la bactérie infectée, le phage se fait multiplier, puis lyse la bactérée • **lysogéniques**: potentiel de lyser la bactérie • **chroniques**: pas tuer la bactérie

Answer 67

1. Bactériophage en mode lytique 2. Transfert d'ADN ou d'ARN à la bactérie 3. Le génome du phage s'intègre dans le matériel génétique de la bactérie 4. La cellule produit les protéines du code génétique du phage 5. Tellement de production de phages que la bactérie explose * Lors de la lysogénisation, le matériel génétique du phage (trait plein) s’intègre dans le chromosome (trait ouvert) de la bactérie et y est répliqué en même temps que le chromosome sans affecter l’hôte qui contribue ainsi à propager l’ADN du phage. * En A, un événement vient rompre le cycle lysogénique en permettant à l’ADN du phage de s’exciser du chromosome de l’hôte. * Par la suite en B, de nouvelles particules de phage sont produites et sont libérées entrainant la lyse cellulaire et la mort de la bactérie dans le cadre du cycle lytique.

Answer 68

* transduction 1. **Spécialisé**: Rare mais peut se propager par la suite 1. génome du phage: une partie de son génome + du génome de l'hôte (hôte = bactérie) 2. **Généralisé**: Plus fréquente mais ne peut se propager 1. génome du phage: juste le génome de l'hôte (hôte = bactérie)

Answer 69

* dans l'échange de gènes chez les bactéries, plus précisément la transduction * Dans la transduction spécialisée un génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du prophage (trait rouge) est improprement excisé du génome de l’hôte (trait ouvert) puis empaqueté à l’intérieur du phage * Rare mais peut se propager par la suite * Plus d'impact a long terme puisque peut se propage

Answer 70

* dans l'échange de gènes chez les bactéries, plus précisément la transduction * La transduction généralisée est le résultat de l’empaquetage accidentel uniquement de fragments de l’ADN de l’hôte (trait ouvert) à l’intérieur d’une capside de phage. * Plus fréquente mais ne peut se propager * Moins d'impacts à long terme puisque peut pas se propager

Answer 71

- la toxine de Corynebacterium diphteriae - l'entérotoxine de certaines souches de E. coli - la toxine du streptocoque responsable de la scarlatine - certaines toxines de Clostridium botulinum - certains gènes de résistance aux bêta-lactamines chez les Pseudomonas

Answer 72

* type d'échange de gènes chez les bactéries * Mouvement de segments d'ADN **_à l'intérieur_** d'une même cellule * Requière une **_proximité**_ _**intracellulaire_** entre les endroits où le transfert a lieu

Answer 73

* séquences d'insertion (IS) * enzyme transposase: coupe un morceau d'ADN d'un endroit de la cellule * enzyme ADN polymérase et ligase permettent de remplir les espaces * section transposition, échange de gènes chez les bactéries 1. Insertion de l'élément IS (séquences d'insertion) au site cible de l'ADN receveur 2. Les espaces sont remplis avec de l'ADN par l'ADN polymérase et l'ADN ligase

Answer 74

* Composites avec IS + autres gènes * IS = séquences d'insertion * Les transposons complexes ont une **importance médicale considérable** car ils peuvent **encoder** à l'intérieur de leur **région centrale**, des **gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques.**

Answer 75

- Séquences d'insertion (IS), les transposons les plus simples - Transposons complexes (composites avec IS + autres gènes) - Phages transposables - Rétrotransposons (intermédiaire ARN impliqué dans la transposition) - Etc. NOTE: Les transposons complexes ont une importance médicale considérable car ils peuvent encoder à l'intérieur de leur région centrale, des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques.

Answer 76

* Éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément * on peut en intégrer jusqu'à 17 = 1 promotteur permet de résister à 17 Ab différents! * La bactérie “collectionne” ces gènes de résistance

Answer 77

Ensemble des **microbes**, **bactéries**, **archées, fungi, protistes, virus** vivant dans un **environnement spécifique** comme par exemple chez un hôte comme l’humain (notre **microflore**).

Answer 78

Ensemble des microbes, bactéries, archées, fungi, protistes, virus vivant dans un environnement spécifique comme par exemple chez un hôte comme l’humain (notre **microflore**).

Answer 79

Ensemble des **génomes** **microbiens** colonisant un **environnement /composition** et **théâtre d’activité** de ces micro-organismes dans leur écosystème particulier.

Answer 80

* **500 à plus de 1000 espèces bactériennes** différentes vivent dans/sur le corps humain. * **10 fois plus de cellules bactériennes** que de cellules humaines nuclées (10¹⁴ vs 10¹³). * Nb total de gènes du microbiome **\>150X le nb de gènes humain.**

Answer 81

Notre corps est un écosystème et notre microbiote est une partie essentielle de notre système immunitaire.

Answer 82

* Bébé in utero: pas de microbes (stérile) * Les premiers bons microbes du bébé lui sont transmis lors de **l’accouchement**

Answer 83

* Les premiers bons microbes du bébé lui sont transmis lors de **l’accouchement** * La naissance par **voie** **vaginale** ou par **césarienne** **affecte la flore du bébé** * pas la même flore selon le mode d'accouchement * Des recherches sont en cours pour « renaturaliser » le microbiote des bébés nés par césarienne * On ne connait pas encore bien l’impact de ces flores distinctes sur la santé des bébés * Mais on sait que le bébé acquiert bcp de sa flore avec l'intégration de son environnement et lors de l'allaitement

Answer 84

* Par des effets sur la colonisation précoce, le développement immunitaire et le développement neurologique, le microbiote maternel régule la sensibilité à un certain nombre de maladies infantiles et peut transmettre verticalement des agents pathogènes liés à la dysbiose. 1. Microbiote maternel (vaginal, intestinal/ fécal, allaitement, microbes de la peau) 1. Allaitement: microbes maternels, nutriments, peptides antimicrobiens 2. Signaux transplacentaires depuis le microbiote maternel 2. Développement de la muqueuse intestinal et de l'immunité foetale 3. Ensemencement du microbiote précoce 4. Développement immunitaire et développement neurologique précoces 1. Sensibilité aux maladies infantiles, y compris les infestations, l'asthme, l'obésité et les troubles du développement neurologique

Answer 85

Acquisition/évolution importante du microbiote dans les premiers mois du bébé

Answer 86

* Effets immunologiques * Altérations transitoires ou persistantes de l'immunité * Tolérance altérée au microiote commensal * Défauts immunologiques et contrôle microbien altéré * Résistance à la colonisation altérée et pathobiontes et agents pathogènes émergents * Conséquences cliniques * Maladie inflammatoire de l'intestin (IBD) * asthme * Obésité * Diabète de type 1 * Dermatite atopique * Sclérose en plage * Cancer? * Autisme?

Answer 87

* Sélection de bactéries résistantes aux antibiotiques??? * 835 médicaments non-antibiotiques ciblant l’humain * 40 bactéries retrouvées dans notre intestin * 27% de ces médicaments inhibaient la croissance d’au moins une bactérie * Dans toutes les classes thérapeutiques * Surreprésentation des antipsychotiques * Ex. certains médicaments ne sont pas assimilés de la même manière d'une journée à une autre (même si la dose reste la même) étant donné le changement du microbiote, ce qui change la quantité de médic qui est assimilée et biodsiponible

Answer 88

1. Il y a toujours des bactéries résistantes dans une population 2. En présence d’un antibiotique, les bactéries résistantes vont être sélectionnées et donc survivre pour éventuellement dominer dans la population, rendant ainsi l’antibiotique inefficace

Answer 89

* **Transmission verticale** * mutation * **Transmission horizontale** * conjugaison * transformation

Answer 90

* La résistance aux antimicrobiens peut se répandre par de **multiples voies** * *directes et indirectes** entre les **humains**, les **animaux** et leur **environnement** * La majorité des antibiotiques utilisés dans le monde le sont pour les **animaux** produits pour notre **alimentation**

Answer 91

1. (a) Un individu (humain ou animal) sous thérapie aux antibiotiques est un foyer où il y a une haute concentration d’antibiotiques (ombre rouge) et bactéries résistantes (points noirs) 2. (b) Dispersion de l’antibiotique et des résistants dans l’environnement 3. (c) Plusieurs individus traités en même temps 4. (d) Sélection continue des bactéries résistantes pendant et après la thérapie

Answer 92

* Dans le sol: * moins de mobilité * moins de sélection * Chez l'humain * plus de mobilité * plus de sélection * Moins de 0.1% des gènes de résistances retrouvés dans les bactéries du sol se retrouvent dans les bactéries isolées chez l’humain

Answer 93

* une protection contre les gènes étrangers 1. (a) Dans le génome de la bactérie, de courtes séquences d’ADN (4-8 nucléotides en palindromes) peuvent être reconnues et coupées par des enzymes de restriction 2. (b) À chaque enzyme de restriction, correspond aussi une enzyme de modification qui ajoute un groupement méthyle à la séquence palindromique, la protégeant ainsi de la coupure par l’enzyme de restriction. La bactérie peut donc protéger son génome tout en pouvant détruire les génomes envahissants tels ceux des phages, plasmides et bouts de chromosomes étrangers qui ne sont pas méthylés au niveau des séquences palindromiques

Answer 94

* une sorte de système de mémoire immunitaire pour bactéries * Dans le génome de la bactérie, les régions CRISPR sont composées de courtes répétitions d'ADN (diamants noirs) et d'espaceurs (boîtes de couleurs). * Lorsqu'un nouveau phage infecte la bactérie, un nouvel espaceur dérivé du génome du phage est incorporé parmi les espaceurs existants. * La séquence CRISPR est transcrite et traitée pour générer de courtes molécules d'ARN CRISPR. * L'ARN CRISPR associe et guide la protéine de coupe de l'ADN bactérien (Ciseaux: protéine Cas9) à une séquence cible correspondante dans le phage envahissant. * La protéine Cas9 coupe et détruit le génome viral envahissant. * Mes notes: * collection de bactériopahes * si ADN que l'on a déjà vu, on fait le ménage; CISP/Cas coupe et se débarrasse de ce segment

Answer 95

* Il y a actuellement sur le marché plusieurs produits pharmaceutiques synthétisés par les bactéries et d'autres types de cellules: * l'hormone de croissance humaine * l'insuline humaine * l'alpha-1-antitrypsine humaine * l'érythropoïétine humaine (EPO) * la DNase humaine * l'activateur du plasminogène humain * le vaccin contre l'hépatite B * des anticorps monoclonaux humanisés * etc.

Answer 96

une technique pour recopier un brin d’ADN

Answer 97

utilisation pour le diagnostic rapide

Answer 98

* Production rapide de milliards de copies de molécules d’ADN et ainsi pouvoir les détecter 1. Dénaturation (1er cycle) - à 95 degrés Celsius 2. Appariement des amorces (1er cycle) - à 55 degrés Celsius 3. Élongation (1er cycle) - à 72 degrés Celsius 4. Fin du 1er cycle: **2 copies** 5. Dénaturation (2ème cycle) - à 95 degrés Celsius 6. Appariement des amorces (2ème cycle) - à 55 degrés Celsius 7. Élongation (2ème cycle) - à 72 degrés Celsius 8. Fin du 2ème cycle: **4 copies** 9. Fin du 3ème cycle: **8 copies** 10. Fin du 30ème cycle: 2³⁰ = 10⁹ copies 11. Fin du 40ème cycle: 24⁰ = 10¹² copies

Answer 99

1. Extension d’amorce par la polymérase à ADN: une technique pour recopier un brin d’ADN 2. Réaction d’amplification d’ADN par la polymérase: utilisation pour le diagnostic rapide

Answer 100

* Les antibiotiques sont des médicaments utilisés pour **traiter** et **prévenir** les **infections bactériennes.** * La résistance survient lorsque les **bactéries évoluent en réponse à l’utilisation de ces médicaments.**

Answer 101

* Ce sont les bactéries, et non les êtres humains ou les animaux, qui deviennent résistantes.

Answer 102

* Les bactéries résistantes peuvent provoquer chez l’homme ou l’animal des infections plus difficiles à traiter que celles dues à des bactéries non résistantes. * La résistance aux antibiotiques entraîne une augmentation des dépenses médicales, une prolongation des hospitalisations et une hausse de la mortalité.

Answer 103

* Il faut d’urgence changer dans le monde entier la façon dont nous prescrivons et utilisons ces médicaments. * **Même si l’on met au point de nouveaux antibiotiques, la résistance demeurera une grave menace sans une modification des comportements.** * Cette évolution doit comporter des mesures pour _réduire la propagation des infections_, notamment par la vaccination, le lavage des mains, les rapports sexuels à moindre risque et une bonne hygiène alimentaire.

Answer 104

* La résistance aux antibiotiques atteint désormais des niveaux **dangereusement élevés dans toutes les régions** **du monde.** * De nouveaux mécanismes de résistance apparaissent et se propagent dans le monde entier, compromettant notre capacité à traiter les maladies infectieuses courantes. * Pour un nombre croissant d’infections, comme la pneumonie, la tuberculose, la septicémie et la gonorrhée et les maladies d'origine alimentaire, le traitement devient plus difficile, voire impossible parfois, du fait de la perte d’efficacité des antibiotiques. * Dans les pays où ils sont délivrés sans ordonnance pour l’homme ou l’animal, le problème de l’émergence et de la propagation des résistances est encore pire. * De même, dans les pays dépourvus de guides thérapeutiques normalisés, les antibiotiques sont prescrits de manière excessive par les agents de santé et les vétérinaires et surconsommés par le grand public. * Si nous ne prenons pas des mesures d’urgence, nous entrerons bientôt dans une ère postantibiotique dans laquelle des infections courantes et de petites blessures seront à nouveau mortelles.

Answer 105

* L’usage abusif ou excessif des antibiotiques accélère le phénomène de la résistance, de même que de mauvaises pratiques de prévention et de lutte contre l’infection. * On peut prendre des mesures à tous les niveaux de la société pour réduire l’impact et limiter la propagation des résistances.

Answer 106

• n’utiliser ces médicaments que s’ils sont prescrits par un professionnel de santé qualifié; • ne jamais exiger d’antibiotiques si votre agent de santé vous dit que vous n’en avez pas besoin; • toujours respecter les conseils du soignant lorsque vous utilisez des antibiotiques; • ne jamais partager vos antibiotiques avec d’autres personnes ou utiliser les médicaments qui vous restent; • prévenir les infections en vous lavant régulièrement les mains, en suivant les règles d’hygiène pour la préparation de la nourriture, en évitant les contacts proches avec des malades, en ayant des rapports sexuels protégés et en tenant vos vaccinations à jour; • préparer les aliments de façon hygiénique en respectant les Cinq clés pour des aliments plus sains (les garder propres, séparer les aliments crus et cuits, bien les cuire, les conserver aliments à une température adaptée) et choisir des aliments, notamment les produits d’élevage sans antibiotiques.

Answer 107

* veiller à mettre en place un plan d’action national robuste pour endiguer la résistance aux antibiotiques; * améliorer la surveillance des infections résistantes aux antibiotiques; * renforcer les politiques, les programmes et la mise en œuvre des mesures de prévention et de lutte contre les infections; * réglementer et favoriser l’usage rationnel et la mise à disposition de médicaments de qualité; * diffuser les informations sur l’impact de la résistance aux antibiotiques.

Answer 108

* faire de la prévention en veillant à la propreté des mains, des instruments et de leur environnement; * ne prescrire et délivrer des antibiotiques que quand ils sont nécessaires, en application des directives en vigueur; * signaler les infections résistantes aux antibiotiques aux équipes de surveillance; * parler à leurs patients de la prise correcte des antibiotiques, des résistances et des dangers d’un usage abusif; * parler à leurs patients de la prévention des infections (par exemple, par la vaccination, le lavage des mains, les rapports sexuels à moindre risque ou en se couvrant la bouche et le nez pour éternuer).

Answer 109

investir dans la recherche et le développement de nouveaux antibiotiques, vaccins, produits de diagnostic et autres outils.

Answer 110

* ne donner des antibiotiques aux animaux que sous contrôle vétérinaire; * ne pas utiliser les antibiotiques comme facteurs de croissance ou pour prévenir les maladies chez les animaux; * vacciner les animaux pour réduire le besoin d’antibiotiques et utiliser des solutions de remplacement à ces médicaments s’il en existe; * promouvoir et appliquer les bonnes pratiques à chaque étape de la production et de la transformation des aliments d’origine animale et végétale; * augmenter la sécurité biologique dans les exploitations agricoles pour éviter les infections en améliorant l’hygiène et le bien-être des animaux.

Answer 111

* Bien que de nouveaux antibiotiques soient en cours de développement, aucun d’entre eux ne sera sans doute efficace contre les formes les plus dangereuses de bactéries résistantes aux antibiotiques. * Compte tenu de la facilité et de la fréquence des déplacements dans le monde actuel, la résistance aux antibiotiques est un problème mondial, qui exigera des efforts de la part de tous les États et de nombreux secteurs.

Answer 112

* Lorsqu’une infection ne peut plus être traitée par un antibiotique de première intention, on doit recourir à des médicaments plus coûteux. De plus, la prolongation de la maladie et du traitement, souvent dans le cadre d’une hospitalisation, accroît les dépenses de santé, ainsi que la charge financière pesant sur les familles et la société. * La résistance aux antibiotiques compromet les acquis de la médecine moderne. En l’absence d’antibiotiques efficaces pour prévenir et traiter les infections, les transplantations d’organes, la chimiothérapie et certaines interventions chirurgicales telles que les césariennes deviendront beaucoup plus dangereuses.

Answer 113

* L’OMS accorde une grande priorité à la lutte contre la résistance aux antibiotiques. Un Plan d’action mondial pour combattre la résistance aux antimicrobiens, qui inclut la résistance aux antibiotiques, a été approuvé par l’Assemblée mondiale de la Santé en mai 2015. Il vise à préserver notre capacité de prévenir et traiter les maladies infectieuses à l’aide de médicaments sûrs et efficaces. * Ce plan d’action mondial définit 5 objectifs stratégiques: 1. améliorer la sensibilisation et la compréhension du phénomène de résistance aux antimicrobiens; 2. renforcer la surveillance et la recherche; 3. réduire l’incidence des infections; 4. optimiser l’usage des agents antimicrobiens; 5. consentir des investissements durables pour combattre la résistance aux antimicrobiens. * En septembre 2016, les Chefs d’État réunis lors de l’Assemblée générale des Nations Unies se sont engagés à adopter une approche coordonnée pour s’attaquer aux causes fondamentales de la résistance aux antimicrobiens dans plusieurs secteurs, en particulier la santé humaine, la santé animale et l’agriculture. L’OMS aide ses États Membres à élaborer leurs propres plans d’action nationaux pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens.

Answer 114

1. **Semaine mondiale pour un bon usage des antibiotiques** Cette semaine est organisée en novembre de chaque année, depuis 2015, sur le thème «Antibiotiques : à manipuler avec précaution». Cette campagne mondiale pluriannuelle est l’occasion d’organiser des activités chaque année plus nombreuses. 2. **Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (GLASS)** Ce système soutenu par l’OMS facilite l’application d’une approche standardisée de la collecte, de l’analyse et de la communication des données sur la résistance aux antimicrobiens au niveau mondial, afin de soutenir la prise de décisions et de motiver les actions locales, nationales et régionales. 3. **Partenariat mondial pour la recherche-développement d’antibiotiques (GARDP)** Le GARDP est une initiative commune de l’OMS et de l’Initiative sur les médicaments pour les maladies négligées (DNDi) destinée à favoriser la recherche-développement dans le cadre de partenariats public-privé. D’ici à 2023, ce partenariat vise à mettre au point et à proposer jusqu’à 4 nouveaux traitements grâce à l’amélioration des antibiotiques existants et à la mise plus rapide sur le marché d’antibiotiques nouveaux. 4. **Groupe de coordination interorganisations sur la résistance aux antimicrobiens (IACG)** Le Secrétaire général de l’Organisation des Nations Unies a créé l’IACG en vue d’améliorer la coordination entre les organisations internationales et de garantir une action mondiale efficace pour contrer cette menace à la sécurité sanitaire. L’IACG, coprésidé par le Vice-Secrétaire général de l’ONU et par le Directeur général de l’OMS, est composée de représentants de haut niveau des institutions des Nations Unies concernées, d’autres organisations internationales et d’experts de différentes domaines.