Cours 2 - Les maladies infectieuses d'hier à aujourd'hui Flashcards
Définition infection
Une maladie causée par un déséquilibre entre les défenses naturelles de l’hôte et la capacité invasive des microorganismes
Qu’est-ce qui détermine si le micro-organisme qui habite l’hôte sera un commensal ou un pathogène?
L’équilibre qui existe entre l’hôte et le pathogène
Que veut dire commensal?
Commensal: Micro-organisme qui est l’hôte habituel d’un organisme sans lui causer de dommage.
(Larousse)
Quelle était l’utilité première des postulats de Koch? En quelle année?
Ces postulats ont été établis pour expliquer l’étiologie de la tuberculose (1890)
Quels sont les 4 postulats de Koch?
- Le micro-organisme doit être associés à ceux qui souffrent de la maladie, mais absent des organismes sains.
- Ce micro-organisme doit pouvoir être isolé et cultivé.
- Le micro-organisme cultivé doit déclencher la même maladie chez un animal de laboratoire sensible.
- Le micro-organisme doit être à nouveau isolé du nouvel organisme hôte rendu malade puis identifié comme étant identique à l’agent infectieux original.
Quelles sont les 3 formes que sous lesquelles peut se présenter une maladie infectieuse?
- endémie
- épidémie
- pandémie
Définition endémie
Forme de maladie infectieuse qui sévit de façon continue dans une population. Elle peut donner des bouffées épidémiques mais le taux d’infection par an reste relativement constant.
Définition épidémie
Infection qui se développe dans un endroit donné et touche un grand nombre de personnes.
Cette augmentation est souvent soudaine.
Définition pandémie
Épidémie qui touche plusieurs continents et qui a un développement au niveau mondial.
Quels sont les types d’infections? (5)
- Infections à transmission directe
- Infections à transmission vectorielle (e.g. Zika)
- Infections nosocomiales (acquises à l’hôpital)
- Infections opportunistes (patient immunodéficient)
- Zoonoses : Groupe d’infections qui se transmettent de l’animal à l’homme
Quels sont les 3 moyens de transmission d’infection à transmission directe?
- Par contact (contact physique ou objet inanimé)
- Par gouttelettes et voies aériennes (e.g. varicelle)
- Par un véhicule commun (e.g. eau contaminée)
Qu’est-ce que des zoonoses?
Groupe d’infections qui se transmettent de l’animal à l’homme
Expliquez l’expression “un monde, une santé”
- Lien entre les animaux, les humains dans leur milieu urbain et l’environnement
- Les insectes permettent de faire le lien entre les animaux et les humains dans leur milieu urbain
À quel rang se situe les infections dans les causes de mortalité à l’échelle mondiale en 2000? En 2016? En 2016 dans les pays à faible revenu?
Bref:
2000
- 3ème: IVRB
- 5ème: maladies diarrhéiques
- 6ème: tuberculose
- 7ème: VIH/SIDA
2016
- 4ème: IVRB
- 9ème: maladies diarrhéiques
- 10ème tuberculose
- pas VIH/SIDA
- diminution des infections…
- Pays faible revenu 2016
- 1ère: IVRB
- 2ème: maladies diarrhéiques
- 4ème: VIH/SIDA
- 6ème: tuberculose
- 7ème: prématurité
- 10ème: malnutrition protéino-énergétique
- AMÉLIORTION 2000 VS 2016
- MAIS DANS LES PAYS À FAIBLE REVENU REPRÉSENTE LA CAUSE DE MORTALITÉ #1
- AUGMENTATION EN 2020, 2021, ETC. À CAUSE DE LA COVID
Causes de mortalités 2000 vs 2019 - mondial vs pays à faible revenu
Mondial
- diminution des IVRB
- augmentation maladies chroniques
- diminution des conditions néonatales
Pays à faible revenu
- diminution IVRB
- diminution VIH/SIDA +++
- diminution malaria
- augmentation maladies chroniques
- diminution conditions néonatales
Principales causes de mortalité au Canada: 2016 vs 2019
Quel est le rang de la mortalité des infections respiratoires?
2016: 8ème rang
2019: 7ème rang
*Augmentera certainement avec la COVID-19…
Nombre total de cas et nombre de décès COVID-19 Canada (2020-2021)
Cas: 2,38 M
Décès: 30 510 décès
Nommez 5 impacts financiers des zoonoses au-delà du secteur économique.
- Tourisme
- Agriculture
- Gouvernement
- Financier
- Voyage
Quel sera le coût de la résistance aux antibiotiques d’ici 2050 si rien est fait?
100,2 trillions $
Comment a changé le PIB au Canada lorsque la COVID-19 est arrivée en mars 2020?
Diminution d’environ 10%
Quel est le micro-organisme causant la peste? (type + nom)
Bactérie
Yersinia pestis
Comment est-ce que la peste est devenue épidémique / pandémique?
À cause de la transmission interhumaine
Qui est le découvreur de la bactérie responsable de la peste?
Alexandre Yersin
Comment est-ce que la peste est passé d’un animal à l’autre? (vecteur)
la puce
Quel animal est un important vecteur de la peste noire?
Le rat, c’est donc une zoonose
Nommez les 3 pandémies de peste. Laquelle a été la plus mortelle?
Quels sont été les impacts de la peste sur les connaissances actuelles? (2)
- Déclin du sevrage: La mortalité (30-50% de la population européenne) a entraîné une forte pénurie et demande en main-d’œuvre ce qui a augmenté le pouvoir de négociations des travailleurs, une meilleure rémunération et à l’émergence de nouvelles classes sociales.
- Apparition des premières ébauches de santé publique: Gestion des cadavres, apprivoisement en eau et nourriture, développement d’un système de quarantaine
Décrivez le virus responsable de la variole
- famille
- mortalité
- symptômes
- réservoir ou vecteur
- dernière infection naturelle
- contagiosité
- origine
- début des épidémies
- Orthopoxvirus; virus à ADN 130-375 Kb
- Mortalité 30%
- Syndrome grippal suivi éruption cutanée suivi de pustules
- Aucun réservoir animal ou vecteur connu
- Dernière infection naturelle en 1977 En Somalie
- Très contagieuse mais immunité collective
- Origine 4e millénaire avant J.C
- Début des épidémies vers le 5e siècle
Que s’est-il passé lorsque les Européens ont découvert l’Amérique? Quelle année?
(Racontez la petite histoire)
Découverte de l’Amérique 16e siècle par les Européens - > 90 % de la population autochtone décède des suites de la variole en Amérique du Sud
- Introduction en Amérique du Sud par les Espagnols a causé la mort de plus de 20 millions d’Autochtones .
- Elle a causé la perte des empires Aztèques et Incas.
- L’absence d’activité humaine et la reforestation des terres cultivés a entraîné une baisse de CO2 qui a contribué à un ‘petit âge glacial’ et famine….en Europe.
Qu’est-ce que la variolisation? Efficacité? Origine?
- Début avec la VARIOLE
- Inoculation avec le contenu des pustules d’un malade.
- Résultat aléatoire et risqué.
- Commencé en Chine, la stratégie a été établie en Europe au 18e siècle mais pas généralisée.
Racontez la petite histoire du vaccin. Quelle épidémie?
- Début avec la VARIOLE
- Jenner en 1796 (virus de la vaccine- cowpox) inocule à un enfant le contenu des pustules prélevé de la main d’une fermière qui a contracté la vaccine par contact avec le pis d’une vache infectée.
- Trois mois plus tard il démontrait que cet enfant était protégé suite à la variolisation.
- Au 20e siècle conservation du virus de la vaccine dans la glycérine (plus besoin de vache à proximité!) et dessiccation sous vide permet une vaccination plus massive.
Comment a-t-on réussi à éradiquer la variole?
- Quoique éradiquée en Amérique dans les années 50 la variole tuait encore 2M personnes/an.
- Plusieurs stratégies de vaccination (de masse, en cercle) ont été déployées .
- En 1980 l’OMS déclara officiellement cette maladie éradiquée.
Quels sont les impacts de la variole sur les connaissances actuelles? (3)
- variolisation
- vaccination
- éradication d’une maladie infectieuse
À quel moment a été le pire épisode de variole au Québec? Nombre de morts?
- 1885
- 5800 morts
- Contexte social complexe
- franco vs anglo
- catholique vs protestant
- riche vs pauvre
- émeute à cause de la vaccination obligatoire (ressemble à la COVID-19)
Décrivez le choléra
- microorganisme en cause
- transmission
- symptômes
- Causé par la bactérie Vibrio cholerae
- Transmission fécale-orale (eau aliments contaminés)
- Déshydratation (1 litre/h)
Nommez les différentes pandémies de choléra
- nombre
- origine
- dates
- plus mortelle
- qui a touché le Québec
- qui sévit encore
- Nombre: 7
- toutes de l’Inde, sauf la 7ème (Indonésie)
- 2ème (1826-1842) a touché le Québec
- qui sévit encore: 7ème (1961-?)
Qui a découvert le micro-organisme responsable du choléra?
Koch
Pacini
Qui a découvert le micro-organisme responsable de la tuberculose?
Koch
Quels sont été les impacts du choléra sur les connaissances actuelles? (2)
- Base de l’épidémiologie
- Quarantaine à Québec (La Grosse-île)
Racontez la petite histoire de la base de l’épidémiologie.
Quelle épidémie?
- John Snow, médecin Londonien fait enquête dans un quartier de Soho lors de la 3ième pandémie.
- établit que la source du choléra était l’eau provenant de la même pompe.
- La condamnation de la pompe a mis fin à l’épidémie.
- Choléra
Racontez la petite histoire de la quarantaine à Québec
Quelle pandémie?
- Quarantaine à Québec lors de la deuxième pandémie.
- Tous les navires doivent s’arrêter à La Grosse-Île près de Québec pour inspection.
- choléra
Depuis le début du XXème siècle, le monde a été marqué par ? de taille et de répercutions variables
9 pandémies
Nommez les réservoirs principaux de la grippe
- Aviaire
- Porcin
- Autres
Quelles sont été les 9 pandémies depuis le début du 20ème siècle?
- Influenza
- Grippe espagnole (1918-1920)
- Grippe asiatique (1957-1958)
- Grippe de Hong-Kong (1968-1970)
- Grippe A (H1N1) (2009-2010) - VIH-1 (SIDA) (1981-?)
- Coronavirus
- SRAS (2002-2003)
- MERS (2012-?)
- Covid-19 (2019-?) - Ebola (2014-2016)
Décrivez la grippe (influenza)
- micro-organisme responsable
- types
- sous-types
- réservoirs / vecteurs
- type de transmission
- Causée par un virus à ARN de la famille des Orthomyxoviridés
- 4 types d’ influenza: A, B, C et D; seul A peut être pandémique
- Plusieurs sous-types du type A: H hémagglutinine (18); N, neuraminidase (11)
- Plusieurs réservoirs
- Transmission via gouttelettes
Quel est le seul type d’influenza qui peut être pandémique? Pourquoi?
Type A, puisque c’est le seul qui touche l’humain et les animaux
Quels sont les impacts de la grippe sur les connaissances actuelles?
- Sanatorium (stratégie d’isolement)
- Port du masque
- Premier vaccin antigrippe: 1944 Jonathan Salk; pour les soldats lors de la 2ème Guerre mondiale
Décrivez l’évolution / découvertes en lien avec le VIH-1 et SIDA de 1981 à 2017.
Qu’est-ce que l’objectif 90-90-90 en lien avec le VIH-1 et SIDA?
90% savent qu’ils sont le virus
90% prennent leur médicament
90% sont indétectables
Qu’est-ce qui a permis que le VIH-1 et SIDA passe d’une maladie mortelle à chronique au Canada?
la trithérapie
Quels sont été les impacts sur les connaissances actuelles en lien avec le VIH-1 et SIDA? (4) (ou du moins les répercussions en général…)
- Discrimination envers les minorités qui, avec les décennies, a reculé grâce aux efforts de plusieurs mouvements activistes.
- Implication des patients dans la recherche et dans le développement de médicaments. Grâce à ces campagnes l’on prend maintenant les besoins des patients en considération dans le développement et la règlementation de nouveaux médicaments, du moins en Occident
- En 40 ans nous sommes passés d’une maladie mortelle à une maladie chronique (au Canada)
- L’efficacité de la bi-trithérapie comme modèle pour d’autres maladies
Entre quelle et quelle année s’est étendue l’époque pasteurienne en microbiologie?
1885-1935
De quelle année à quelle année s’est étendue la période thérapeutique classique des agents microbiens?
1935-1980
Quelle est la particularité du Penicillium rubens?
- Champignon anti-microbien qui mène à la découverte de la pénicilline
- Penicillium rubens inhibe le staphylocoque
- Moisissure
Quels sont les différents endroits où peuvent agir les antibiotiques?
- Becra Lactams
- Vanomycin Bacitracin
- Cell membrane
- 30S subunit
- 50S subunit
- Folate synthesis
- DNA gyrase
- RNA polymerase
Quelle période est nommée l’âge d’or de la découverte des antibiotiques?
Années 50-60’
Depuis ?, il n’y a pas eu de nouveaux antibiotiques développés.
40 ans
Quelques ?, après le développement d’antibiotiques on peut voir apparaître ?.
années
le développement d’une résistance à cet antibiotique
Nommez un effet à long terme de l’usage des antibiotiques.
Étant donnée que les antibiotiques visent les microbes, ils visent également le microbiome du système digestif. Il peut donc avoir des effets à long terme sur le microbiome.
Histoire du développement des antibiotiques et du développement d’une résistance à ces antibiotiques.
Les bactéries à ___________ sont plus résistantes étant donné ______.
gram négatif
leurs 2 couches de protection
Qui est la déesse de la Santé?
Hygie
Décrivez l’évolution des méthodes préventives développées au fil du temps pour empêcher la transmission des infections. (5)
- 375 av JC Hippocrate: hygiène correcte; gymnastique, saines habitudes de vie !!!!
- 1348 Quarantaine: bateaux qui arrivent au port ne sont pas visités pendant 40 jours (mais les rats…..)
- 1847 Semmelweiss : le lavage des mains sauvent des vies (fièvre puerpérale suite à l’accouchement)
- 1867 Lister: Désinfection des instruments chirurgicaux, port de vêtement propre, traitement des plaies avec le phénol
- 1870 Florence Nightingale: isolement des patients contagieux; prévention de contamination croisée,
Nommez des méthodes préventives pour empêcher la transmission d’infection (14)
- Hygiène des mains
- Stérilisation
- Désinfection (liquide, UV)
- Équipement de protection individuelle (EPI) :gants, blouses, écrans faciaux, masques, lunettes de protection, etc….
- Surfaces antimicrobiennes
- Vaccination
- Diagnostic
- Surveillance des Infections
- Isolement et quarantaine
- Antibiogouvernance
- Prophylaxie
- Traitement de masse
- Contrôle des vecteurs
- Formation et standardisation
De quelle manière les vaccins peuvent-ils être pertinents dans la lutte à la résistance aux antibiotiques?
- Éviter des surinfections qui découlent de certaine pathologie et qui nécessiteraient l’utilisation d’antibiotiques
- Ex. Si vacciné pour l’influenza, diminuer le risque d’avoir l’influenza et d’avoir une pneumonie due à cette influenza, et donc de devoir utiliser des antibiotiques.
Nommez un exemple où l’usage de la prophylaxie a été grandement bénéfique. Qui sont les scientifiques impliqués?
- Onchocercose: cécité des rivières causée par un vers transmis par les mouches noires; 20 millions de personnes infectées
- Ivermectine : traitement de masse: élimination de la maladie
- utilisé dans le cadre de “repurposing”
- William Campbell et Satoshi Omura (Nobel 2015)
Identifiez des “nouveaux microbes” médiatisés
1. **Bactéries** Legionella pneumophila (1976) Borrelia burgdorferi (1982) Helicobacter pylori (1983) Tropheryma whipplei (1991)
-
Champignons
Candida auris
Cryptococcus gattii -
Protozoaire
Cryptosporidium parvum
Babesia microti -
Virus
Coronavirus- SARS, MERS, SARS-CoV-2
Zika, Chikungunya
Ebola
West-Nile - Prions
Qui est Barry Marshall?
- (1951-), Nobel 2005 pour avoir prouvé que H. pylori est la cause des ulcères d’estomac
- H. pylori: nouveau microbe médiatisé
Qui est Stanley Prusiner?
- Stanley Prusiner (1942-), Nobel 1997 pour un nouvel agent infectieux- une protéine- le prion
Qu’est-ce que la maladie de Lyme?
- pathogène émergent
- bactérie: Borrelia burgdorferi
- reconnue pour la 1ère fois à Lyme CT (d’où le nom)
- transmis par les tiques à pattes noires (Ixodes scapularis)
- grossissent bcp après repas sanguin
- pour l’instant, plus aux USA, mais sera endémique au Québec en 2060 si le réchauffement climatique continue d’évoluer à la même vitesse
Qu’est-ce que la Candida auris?
- décrit en 2009: dissémination planétaire rapide
- Infection nosocomiale (acquis à l’hôpital)
- mortalité élevée (fongémie)
- Généralement résistants aux azolés certains souches sont pan-résistantes:
Azolés: e.g. fluconazole
Polyènes: amphotéricine B
Echinocandines: Caspofungine
93% résistant au fluconazole
35% résistant à AmB
7% résistant à la Caspofungine
41% résistant à deux classes
4% résistant à trois classes
Qu’est-ce que Cryptosporidium parvum?
- pathogène émergent
- protozoaire
- drogue : nitazoxanide
- 3ème microbe causant de maladie diarrhéique (ordre: E. coli, Rotavirus, S. parvum, Shigella)
- rappel: maladie diarrhéique était la 2ème cause de mortalité dans les pays à faible revenu en 2016
- source possible: système de filtration d’eau
Qu’est-ce que Aedes aegypti et Aedes albopictus?
- ces mêmes vecteurs transmettent le virus de la dengue, du Zika, du Chikungunya, et fièvre jaune
- émergent
- A. aegypti: aime le chaud, ne sera jamais au Canada
- A. albopictus: s’adapte mieux au froid
- En 2050, avec les réchauffement climatique actuel, serait endémique au Canada
- Vecteur ayant le même potentiel de transmettre ces virus que A. aegypti…
NOTES
- Dengue: virus ARN, Flaviviridae
- Zika: virus ARN, Flaviviridae
- Chikungunya: virus ARN, Togaviridae
- Fièvre Jaune: virus ARN, Flaviviridae
Nommez 4 pathogènes émergents
- Maladie de Lyme
- Candida auris
- Cryptosporidium parvum
- Aedes aegypti et Aedes albopictus (vecteurs de: dengue, Zika, Chikungunya et fièvre jaune)
Recherche et innovation - vaccin (ordre)
- Killed / attenued microorganism
- Serum - toxoid vaccines
- Conjugate vaccine
- Cell culture
- Recombinant DNA
- Reverse technology
- Adjuvants
- Structural vaccinology
Comment fonctionne un vaccin à ARN messager?
- Mettre l’ARN dans une enveloppe de lipides (protection contre protéases)
- ARN entre dans la cellule
- ARN est traduit par le système immunitaire humain dans le cytosol, et donc production de protéines
- Les protéines sont exprimées par les cellules humaines, ce qui enclenche la production d’anticorps
- Les anticorps formés protègent contre l’infection
- NOTE: compagnies sont Moderna et BioNtech
Qu’est-ce que le diagnostic d’une infection? Combien de temps ça prend?
- identification du pathogène
- 2 jours à 1 semaine
Quelle est la vision de Michel G. Bergeron en lien avec le diagnostic des infections?
- le diagnostic microbiologique arrive en même temps que la radiologie, la biochimie et l’hématologie
- a mis sur pied 2 compagnies qui ont permis de faciliter le diagnostic au chevet du patient
Par quelles étapes passe le diagnostic des infections?
Qu’est-ce que le microbiote? (décrire)
- l’ensemble des microbes qui nous habitent
- >1500 espèces connues et cultivables
- 15 000 espèces non cultivables
- 100 milliards de bactéries par gramme de selles
- 1000 bactéries anaérobies pour 1 bactérie aérobie
- 10x plus de bactéries (10 exposant 14) que de cellules humaines (10 exposant 13)
- 150x plus de gènes bactériens que de gènes humains
Qu’est-ce que le microbiome? (définition)
l’ensemble des gènes du microbiote
Qu’est-ce que le résistome?
l’ensemble des gènes de résistance du microbiote
Quel sont les rôles du microbiote humain? (4)
- Digestion des aliments,
- production de nutriments et métabolites
- Éducation de notre système immunitaire,
- protection, etc.
Il existe une association entre dysbiose et: … (6)
- obésité,
- diabète;
- allergies;
- asthme;
- maladie inflammatoire intestinale;
- maladies mentales;
Quelle est une des solutions à la résistance aux antibiotiques dans des cas de C. difficile récurrent?
transplantation de selles
