Cours 15 - Le virus Flashcards
Racontez la petite histoire des virus
- Les virus ont été décrits initialement comme des agents filtrables par Ivanovsky en 1892
- Ça fait longtemps que l’on utilise le terme “virus” mais avant sa signification n’était pas la même
- Avant, ce terme désignait des choses qui étaient plus petites qu’une grosse protéines mais plus petite que la plus petite bactérie
- Nos connaissances sur les virus ont bcp évolué durant le dernier siècle
Décrire ce qu’est un virus
- Agent qui peut être filtré*
- filtres conçus pour retenir les bactéries
- Un parasite intracellulaire obligatoire
- Dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication
- Agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la cellule hôte
- Fait d’un génome viral d’ADN ou d’ARN
- Enveloppé ou non
- Agent infectieux dont les composantes individuelles sont assemblées, donc qui ne se reproduit pas par division cellulaire
- contrairement à bactéries
Virus: faits (vivant, reproduction, fonctionnement composantes virales)
- Les virus ne sont pas vivants
- Les virus doivent infecter les cellules pour assurer leur survie
- Les virus doivent être capables d’utiliser la machinerie cellulaire de l’hôte pour produire leurs propres composantes
- Les virus doivent encoder tous les processus requis qui ne sont pas “fournis” par la cellule hôte
- Les composantes virales doivent s’assembler par elles-mêmes
Virus: conditions de base pour infecter les cellules hôtes
Tous les virus ne peuvent pas infecter toutes les cellules ou tous les hôtes
- Le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hôte
- Une fois le virus entré, la cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer
- Une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule pour transmettre l’infection (et pouvoir ainsi assurer sa survie)
Unité pour mesurer les virus? Bactéries?
- virus: nanomètres (nm)
- bactéries: microm
Plus petits et plus gros virus? Comment voir les virus en labo?
- Les plus petits: 18nm (parvovirus)
- Les plus gros: 300nm (poxvirus)
- Presque visibles en microscopie optique
- besoin microscopie électronique
Lien entre grosseur du virions et taille du génome? Conséquence?
En général, les plus gros virions ont un plus gros génome qui encode pour plus de protéines et sont généralement plus complexes que les petits virions.
Structure et composition de la particule virale (virion)
- Génome d’acide nucléique compris dans une couche protectrice de protéines: la capside
- Génome d’acide nucléique + capside = nucléocapside
- Icosahédrique (sur image en haut à gauche)
- Hélicoïdale (sur image en haut à droite)
- Complexe
- Tous les virions ont une nucléocapside
- Avec ou sans enveloppe
Définir: nucléocapside
- Capside: couche protectrice des virions faite de protéines
- Génome d’acide nucléique + capside = nucléocapside
- Icosahédrique (sur image en haut à gauche)
- Hélicoïdale (sur image en haut à droite)
- Complexe
Résumez les différentes composantes possibles d’un virion
- capside faite de protéines obligatoire
- enveloppe non-obligatoire
- capside + acide nucléique +/- enzymes et protéines liant les acides nucléiques = nucleocapside = virion nu
- nucleocaspide + enveloppe = virus enveloppé
Structure et composition du virion: génome d’acide nucléique
- ADN OU ARN
-
ADN
- simple ou double brin
-
ARN
- simple brin
- polarité positive (comme l’ARNm)
- ou négative
- double brin (reovirus)
- polarité +/- ou double sens
- segmenté ou non
- simple brin
La capside et l’enveloppe: fonctions
- La couche la plus externe d’un virus (l’un ou l’autre)
- Constituent la structure, la protection et le véhicule de transmission du virus
- véhicule de transmission: permet d’interagir avec les cellules environnantes (récepteurs)
- Les structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre structure
- Si on détruit la couche la plus externe d’un virus (la capside ou l’enveloppe), on inactive le virus
- Les anticorps développés contre les composantes de ces structures de surface peuvent prévenir l’infection
Où se trouvent la capside et l’enveloppe, l’un par rapport à l’autre?
enveloppe par-dessus capside
Décrire: PAV
Les structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre structure
Comment inactiver un virus?
détruire sa couche externe (peu importe si capside ou enveloppe)
Résistance aux substances environnementales: virus nus
- Les virus nus (non enveloppés) sont généralement résistants à la sécheresse, à l’acidité, aux détergents
- Incluant l’acide et la bile du tractus digestif
- Ceci détermine leur mode de transmission (transmission fécale-orale possible)
- plus résistante que l’enveloppe
- Incluant l’acide et la bile du tractus digestif
Structure et composition du virion: la capside
- La capside est faite de protéines
- Structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
- Plus résistante que l’enveloppe
- La capside est symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)
Décrire: La capside icosahédrique
- Pour former la capside icosahédrique, les sous-unités protéiques virales s’unissent en protomères. Cinq protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamères) qui s’assemblent en capside
- La capside icosahédrique simple est formée de 12 capsomères. Chacun des 12 capsomères (aux 12 sommets) interagit avec 5 autres capsomères
- On appelle ces capsomères des pentamères ou pentons
- La capside icosahédrique ressemble à une sphère et est constituée par l’assemblage de sous-unités protéiques
- forme de ballon de soccer
- Toutes les faces de l’icosahèdre simple sont identiques
- L’acide nucléique est compris au centre de la capside qui le protège de l’environnement
- Des virions à plus grosse capside sont fabriqués en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons
- Ex: la capside du virus Herpès a 12 pentons et 150 hexons, celle de l’adénovirus a 12 pentons et 240 hexons.
Décrire: La capside hélicoïdale
- Les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet
- Photo: microscope électronique
- pas présente dans les labos cliniques, juste dans labos de recherche
Décrire: l’enveloppe d’un virion
- L’enveloppe est une membrane composée de lipides, de protéines et de glycoprotéines
- L’enveloppe a une structure similaire aux membranes cellulaires
- Des glycoprotéines virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules « spikes »
- Certaines agissent comme protéines d’attachement virales (PAV), capables de se lier à des cellules cibles
- Sont des antigènes majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
- (on peut produire des anticorps contre ces antigènes)
- Autres fonctions possibles
Capacité d’adapation et de survie des virus enveloppés
- Contrairement aux virus non enveloppés, les virus enveloppés sont facilement inactivés par la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants
- La plupart de ces virus ne peuvent survivre dans le tractus digestif
- La structure de l’enveloppe peut être maintenue uniquement dans une solution aqueuse (doivent rester mouillés)
- Ces virus sont généralement transmis par les fluides tels que le sang, les gouttelettes respiratoires et les tissus
À quoi ressemble un virus enveloppé?
- note: spicules se projettent hors du virus
Expliquer et décrire: Classification internationale des virus
Les virus sont classifiés principalement selon
1) la nature de leur génome
- Acide nucléique: ADN ou ARN
- Simple brin ou double brin
- Pour les génomes d’ARN: polarité (+/-)
- Segmenté ou non segmenté
- Linéaire ou circulaire
- Simple brin ou double brin
2) leur structure (morphologie)
- Structure du virion
- Symétrie de la nucléocapside (icosahédrique, hélicoïdale, complexe)
- Enveloppé ou non enveloppé
- Nombre de capsomères
- autres
Terminaison des virus selon leur hiérarchie taxonomique
Classification des virus à ADN
Classification: virus à ARN