C7 - Sinteza ARN plecand de la o matrita ADN si procesarea ARN Flashcards
Ce virusuri au un ADN ds in cadrul ciclului lor reproductiv?
Retrovirus (ARNss+)
Parvovirus(ADNss+)
Hepatita B (ADNds incomplet)
Adenovirus
Herpes simplex virus
Polioma virus
Papilomavirus
Ce ADN e gata pentru transcriere?
ADNds
Ce genoame virale NU nu au nevoie de conversie in ADN ds?
exemple
ADN ds
*se pot transcrie
Adenovirus
Papilomavirus
Polioma virus(SV40)
Herpes simplex virus
Ce virusuri trebuie sa codifice pt o ARN polimeraza? de ce?
Numai virusurile ADN care se multiplica in citoplasmă codifica pentru o ARN polimeraza (poxvirus, virusurile gigante)
- De ce? Pentru ca ARN polimeraza celulara se găsește numai in nucleu
Ce face secventa TATA?
atașează TFIID(factor de initiere a transcriptiei) - Proteina necesara transcripției
Ce face secventa de initiere?
este specifica unei initieri precise
Ce sunt enhancerii si silencerii
Activatori(stimuleaza activarea initierii) si represori
promoter
independent de pozitie si orientare
Secvențe specifice de ADN la care se atașează proteine ce controlează transcripția
Promotorul este o secvență specifică de ADN situată în apropierea începutului unei gene și servește ca loc de ancorare pentru complexul de transcripție, facilitând astfel inițierea procesului de transcripție
exemple de promotori virali
promotor tarziu
promotor precoce
Alte proteine care controlează transcripția
- Proteine specifice de atașare la ADN (de origine celulara sau virala)
- Molecule de co-activare virale sau celulare (nu se atașează la ADN-ul, dar pot modula transcripția) ; sunt de asemenea necesare
- Mulți co-activatori virali modulează structura/activitatea matrițelor nucleozomale (de exemplu, metilarea sau acetilarea histonelor prin atașarea de grupuri de metale sau de acil )
la ce virusuri componentele transcriptionale provin de la gazda?
Retroviruses cu genoame simple,
Caulimoviruses (plante)
Circoviruses - recunoastere promotori virali de catre celula
la ce virusuri componentele transcriptionale provin numai de la virus? De ce?
De ce? Pentru ca totul se intampla in citoplasma
Mimiviruses, Poxviruses
la ce virusuri componentele transcriptionale provin de la gazda + mai mult decât o proteina virala ce stimulează transcripția
Adenoviruses, herpesviruses
la ce virusuri componentele transcriptionale provin de la gazda + o proteina virala
Proteina virala (una singura) transcrie genele târzii - Bacteriophages T3, T7
Proteina virala(una singură) controlează transcripția
-Hepadnaviruses, parvoviruses, papillomaviruses, polyomaviruses, retroviruses cu genoame complexe
Controlul transcripției de către proteinele virale
Controlul cascadei
* Gena Y nu este transcrisa de la început
* Proteina X este necesara pentru activarea procesului de transcriere ale genei Y
Bucla » de Autocontrol pozitiv (poate fi si negativa)
* Proteina X stimulează si mai mult transcripția
Care este funcția fazelor timpurii și târzii?
Pentru a întârzia sinteza proteinelor structurale până când ADN-ul a fost replicat!
Unde sunt prezente unitatile de transcriptie la Adenovirus?
- la ambele catene
program transcriptional la herpesvirus
- Inițiat de VP16, o proteină asociată virionului (diferă de Polyoma, Adenovirus); aceasta proteina este necesara pentru recunosterea de catre sistemul celular de transcriptie
- Activează transcripția IE – care un promotor nu prea bine recunoscut de sistemul de transcripție celulară (de aceea este nevoie de aceasta proteina virala VP16)
- Proteinele IE controlează transcripția de la toate genele virusului
- Expresia genelor E și sinteza ADN-ului
- Expresia genelor L, dependența de ADN; asigură producția coordonată de genoame de ADN și de proteine structurale
de catre ce structuri este sintetizat ARNm viral?
ARNm viral este sintetizat fie de enzime virale, fie celulare și pot fi produse în nucleul sau citoplasma unei celule infectate.
ce presupune procesarea ARN-ului ?
=o serie de modificări covalente făcute de enzime virale sau
celulare
facilitează recunoașterea ARNm de către sistemul celular de sinteză a proteinelor precum și traducerea de către ribozomi
- adăugarea m7 GpppN la capătul 5’ (capping)
- adăugarea de mai multe nucleotide A la capătul 3’ (poliadenilare)
- splicing („imbinare si eliminare diferita a intronilor); realizat de produse genetice celulare
- exportul nuclear de ARNm
Modificarile covalente din timpul procesarii pre-ARNm viral
- Sinteza structurilor virale 5’ de tip „CAP” de către enzime virale
- Achiziția de structuri virale 5’ CAP din ARN-urile celulare
- Acoperirea capătului terminal 5’ („Capping”) ale ARNm viral : atașarea structurii 5’CAP
- Sinteza segmentelor 3’ poly(a) ale ARNm viral
-Poliadenilarea pre-ARNm viral de către enzimele celulare
-Poliadenilarea pre-ARNm viral de către enzime virale - Fenomenul de „splicing” ( „imbinare si eliminare diferita a intronilor)
ce produc reactiile de procesare a ARN-ului ?
Reacțiile de procesare a ARN-ului produc ARNm funcționali și oferă numeroase oportunități pentru controlul post-transcripțional al expresiei genelor
controlul procesarii ARN
- poate crește capacitatea de codificare a genomului viral
- determina când sunt produse proteine virale specifice în timpul ciclului de infecție
- facilitează expresia selectivă a informațiilor genetice
co-transcriptie
- Fenomenul se numește Co-transcriptional pentru adăugarea structurii de tip CAP
- Este realizata după ce au fost incorporare 20-30 de nucleotide si câteva segmente de ARN au fost sintetizate
DECI transcripția si adăugarea structurii CAP este in acelasi timp (la inceput)
Clivajul pre-ARNm urmat de poliadenilare
-post-transcriptional
-enzima celulara
Adenovirus, HBV, HDV,
Herpesviruses,
Polyomavirus, Retrovirus
-pt aditia de polyA la ARN viral
Recopierea secventelor de U din matrita de ARN
-in timpul sintezei de ARN m
-enzima virala
-influenza virus, VSV
-pt aditia de polyA la ARN viral
Copierea secventelor lungi de U din matrita ARN-ului
- in tompul sintezei ARNm
-enzima virala
Poliovirus, Alphavirusuri
-pt aditia de polyA la ARN viral
Adăugarea de poli(A) la ARNm virale la virusurile ARNss+ si ARNss-
- Virusurile ARNss (+): o secvență poli (U) prezentă la capătul 5’ al matriței de ARN catenei (-) este copiată direct într-o secvență poli (A) de lungime echivalentă
- Virusurile ARNss (-) sunt poliadenilate prin recopierea secventelor scurte de reziduuri U din matrița ARN al catenei (-).
Cum este realizat exportul nuclear al ARNm retroviral?
fara eliminarea intronilor
