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{P2} UE6.1 > Biochimie : Transcription > Flashcards

Biochimie : Transcription Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la transcription ?

A

Production d’un ARN à partir d’un gène présent sur l’ADN

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Q

Qu’est-ce que la reverse transcription ?

A

A partir d’un ARN refaire un ADN double brin

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Q

Principale différence pour la transcription entre les procaryote et les eucaryotes ?

A
  • Eucaryote : à lieu dans le noyau
  • Procaryote : à lieu dans le cytoplasme
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Q

Qu’implique la production de l’ARN dans le noyau pour les eucaryote ?

A

Nécessité de protéger l’ARN par modification d’une possible dégradation

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5
Q

Différences entre L’ADN et l’ARN ?

A
  • ADN : Désoxyribo
  • ARN : Ribo
  • T → U
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6
Q

Quels sont les ARNs existants ?

A
  • ARNt
  • ARNr
  • ARNm
  • s/ncARN
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7
Q

Rôles des ARNr ?

A

→ ARN ribosomique
* Structure des ribosomes
* Formation des ribosomes

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8
Q

Rôles des ARNt ?

A

→ ARN de transfert
* Aide à la traduction des messager en protéines

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9
Q

Rôle des ARNm ?

A

→ARN messager
* Messager codant des protéines

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10
Q

Rôles de s/ncARN ?

A

→ Small ARN/ ARN non codant
* Petite tailles ( ≈ 500 nucléotides)
* Fonction de régulation

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11
Q

Quel est l’ARN le plus produit ?

A

ARNr → 90% des ARN transcrit

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12
Q

Quelles est la différence entre l’ARNm et tous les autres ARN ?

A
  • ARNm = seul à être traduit (intermédiaire)
  • Les autre = produits finis
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13
Q

Qu’est-ce que le TSS ?

A

1er nucléotide transcrit = +1
→ Extrémité 5’P de l’ARN

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14
Q

Qu’est-ce que l’unité de transcription ?

A

Limite du fragment d’ADN qui sera transcrit en ARN par l’ARN polymérase

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15
Q

Rôle du brin codant ?

A

Modèle de transcription (formation d’un brin quasi identique)

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16
Q

Autres noms du brin codant ?

A
  • Brin sens
  • Brin du haut
  • Brin +
  • Brin 5’→3’
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17
Q

Rôle du brin matrice ?

A

Base pour la traduction (formation d’un brin complémentaire)

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18
Q

Autres noms du brin matrice ?

A
  • Brin transcrit
  • Brin antisens
  • Brin du bas
  • Brin -
  • Brin 3’→5’
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19
Q

Rôle de la région promotrice ?

A

Possède des signaux pour démarrer la transcription

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20
Q

Rôle de la région terminatrice ?

A

Possède des signaux pour arrêter la transcription

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21
Q

Qu’est-ce que le terminateur ?

A

Il situe le lieu où l’ARN polymérase va se dissocier de l’ADN
→ Extrémité 3’OH de l’ARN

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22
Q

Que sont les région 5’UTR et 3’UTR ?

A

Région promotrice et terminatrice des ARN
→ Ne sont pas traduite

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23
Q

Qu’est-ce qu’un opéron ?

A

Plusieurs protéine codées par un même fragment d’ADN (présente côte à côte dans le génome)
→ Procaryote

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24
Q

Quels sont les signaux que l’on retrouve chez les procaryotes ?

A
  • Promoteur
  • Opérateur
  • Séquence RBS
  • Codon d’initiation
  • Cadre ouvert de lecture
  • Codon stop
  • Terminateur
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25
Caractéristiques du promoteur ? (procaryote)
Contient : * Nucléotide +1 (TSS) * TATA box (-10) * Boite pribnow (TTGACA, -35)
26
Rôle du promoteur ? (procaryote)
Permet à l'ARN polymérase de débuter la transcription
27
Qu'est-ce que l'opérateur ? (procaryote)
Séquence reconnue par d'éventuels régulateurs
28
Rôle de l'opérateur ?
En se fixant sur l'opérateur, les régulateurs peuvent empêcher la polymérase d'avancer
29
Où se situe l'opérateur ?(procaryote)
En général : entre TATA box et TSS
30
Caractéristique du terminateur ?
Peut être : → Rho dépendante → Rho indépendante
31
Caractéristique d'un terminateur rho dépendante ?
Constitué d'une séquence consensus reconnue par prot Rho → Provoque détachement
32
Caractéristique d'un terminateur Rho indépendante ?
* Séquence répétée inversée → formation d'une structure en tige de boucle → met fin à la transcription
33
Quels sont les signaux que l'on retrouve dans les gènes eucaryotes ?
* Les ≠ types de gène/promoteurs * Séquence de fixat° des facteurs de transcription * Boite TATA * Coiffe 5' * Jonctions introns/exons * Terminateur
34
Quels sont les ≠ types de gènes eucaryote et les ARN polymérases associées ?
* Gènes ARNr 18s et 28s → ARN polymérase I * Gènes ARNm et ARNnc → ARN polymérase II * Gènes ARNt et ARNr 5S → ARN polymérase III
35
Où se situent les séquences de fixation des transcription (chez eucaryotes) ?
* Dans la région promotrice * A cheval sur TSS
36
Rôle des séquences de fixation des facteurs de transcription ?
Facilitent ou empêchent la fixation de l'ARN polymérase
37
Localisation de la TATA box chez les eucaryotes ?
A - 25/30 du TSS
38
Chez les eucaryotes, avec quel action est couplée la terminaison de la transcription ?
La poly adénylation en 3' des ARNm
39
Caractéristique de la polyadénylation ?
* Modification post transcriptionnelle * Au niveau d'une séquence AAUAA * Fait intervenir le complexe CPSF * Ajout ≈ 200 A
40
Quels sont les principes de la transcription ?
* Unidirectionnel * Action d'une ARN polymérase ADN dépendante * 3 étape * Plusieurs étape post transcriptionnelles chez les eucaryotes * Régulation
41
Quelles sont les 3 étapes de la transcription ?
* Initiation * Elongation * Terminaison
42
Sens de synthèse de la transcription ?
Sens 5'-3'
43
Caractéristique de l'ARN polymérase chez les procaryotes ?
* Unique * 6 sous unités * PM ≈ 480 kDa
44
Caractéristiques de l'ARN polymérase chez les eucaryotes ?
* 3 ARN polymérase ≠ * 5 à 12 sous unités
45
Comment se fait l'adaptation des procaryote pour leur transcription ?
1 seul ARN polymérase mais plusieurs facteur sigma
46
Problème de l'ARN polymérase II ?
Incapable de lier ADN assez fortement et d'initier la transcription
47
Comment chez les eucaryotes est permis la liaison de l'ARN pol II à l'ADN ?
* Intervention des facteurs généraux de transcription (TFII) * Formation du CIT
48
Quelles sont les les TFII existantes ?
=> 5 * B * D * E * F *H
49
Comment est initiée la transcription ?
Fixat° du complexe ARN poly → Ouverture double hélice
50
Quelles sont les régions du promoteur chez les eucaryotes ?
=> 3 * TATA box : -25 * GC box : -50 * CAAT box : -90
51
Comment peut se faire la reconnaissance du promoteur chez les eucaryotes ?
→ Formation d'un complexe d'initiation
52
Par quel mécanisme se fait l'élongation lors de la transcritpion ?
Formation de liaison phosphodiester (sens 5'-3')
53
Comment expliquer que la transcription prenne plus de temps chez les eucaryote que chez les procaryotes ?
Remodelage des histones et nucléosome (eucaryotes)
54
Que se passe-t-il chez les procaryotes et le eucaryotes lorsque l'élongation à commencé ?
* Pro → relargage facteur σ * Eu → phosphorylation queue CTD par TFIIH
55
Terminaison procaryote ?
* Rho dépendante ou indépendante * Séquence terminateur + facteur de terminaison
56
Terminaison de la transcription avec ARN poly II chez eucaryotes ?
Couplée à la maturation des ARNm → Polyadénylation
57
Quelles sont les modification post transcriptionnelle chez les eucaryotes ?
* La coiffe 5' * La queue poly A * L'épissage
58
Caractéristique de la coiffe 5' ?
* Co-transcriptionnelle * Dès le début de la transcription dans le noyau * En 5'
59
Rôle de la coiffe ?
* Stabilisation * Export nucléaire * Traduction
60
Rôle de la polyadénylation ?
Stabilisation et protection de l'ARNm
61
Tailles des introns ?
500 à 500k nucléotides
62
Taille des exons ?
100 à 500 nucléotides
63

{P2} UE6.1 (33 decks)

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