Biochimie : Transcription Flashcards
Qu’est-ce que la transcription ?
Production d’un ARN à partir d’un gène présent sur l’ADN
Qu’est-ce que la reverse transcription ?
A partir d’un ARN refaire un ADN double brin
Principale différence pour la transcription entre les procaryote et les eucaryotes ?
- Eucaryote : à lieu dans le noyau
- Procaryote : à lieu dans le cytoplasme
Qu’implique la production de l’ARN dans le noyau pour les eucaryote ?
Nécessité de protéger l’ARN par modification d’une possible dégradation
Différences entre L’ADN et l’ARN ?
- ADN : Désoxyribo
- ARN : Ribo
- T → U
Quels sont les ARNs existants ?
- ARNt
- ARNr
- ARNm
- s/ncARN
Rôles des ARNr ?
→ ARN ribosomique
* Structure des ribosomes
* Formation des ribosomes
Rôles des ARNt ?
→ ARN de transfert
* Aide à la traduction des messager en protéines
Rôle des ARNm ?
→ARN messager
* Messager codant des protéines
Rôles de s/ncARN ?
→ Small ARN/ ARN non codant
* Petite tailles ( ≈ 500 nucléotides)
* Fonction de régulation
Quel est l’ARN le plus produit ?
ARNr → 90% des ARN transcrit
Quelles est la différence entre l’ARNm et tous les autres ARN ?
- ARNm = seul à être traduit (intermédiaire)
- Les autre = produits finis
Qu’est-ce que le TSS ?
1er nucléotide transcrit = +1
→ Extrémité 5’P de l’ARN
Qu’est-ce que l’unité de transcription ?
Limite du fragment d’ADN qui sera transcrit en ARN par l’ARN polymérase
Rôle du brin codant ?
Modèle de transcription (formation d’un brin quasi identique)
Autres noms du brin codant ?
- Brin sens
- Brin du haut
- Brin +
- Brin 5’→3’
Rôle du brin matrice ?
Base pour la traduction (formation d’un brin complémentaire)
Autres noms du brin matrice ?
- Brin transcrit
- Brin antisens
- Brin du bas
- Brin -
- Brin 3’→5’
Rôle de la région promotrice ?
Possède des signaux pour démarrer la transcription
Rôle de la région terminatrice ?
Possède des signaux pour arrêter la transcription
Qu’est-ce que le terminateur ?
Il situe le lieu où l’ARN polymérase va se dissocier de l’ADN
→ Extrémité 3’OH de l’ARN
Que sont les région 5’UTR et 3’UTR ?
Région promotrice et terminatrice des ARN
→ Ne sont pas traduite
Qu’est-ce qu’un opéron ?
Plusieurs protéine codées par un même fragment d’ADN (présente côte à côte dans le génome)
→ Procaryote
Quels sont les signaux que l’on retrouve chez les procaryotes ?
- Promoteur
- Opérateur
- Séquence RBS
- Codon d’initiation
- Cadre ouvert de lecture
- Codon stop
- Terminateur
Caractéristiques du promoteur ? (procaryote)
Contient :
* Nucléotide +1 (TSS)
* TATA box (-10)
* Boite pribnow (TTGACA, -35)
Rôle du promoteur ? (procaryote)
Permet à l’ARN polymérase de débuter la transcription
Qu’est-ce que l’opérateur ? (procaryote)
Séquence reconnue par d’éventuels régulateurs
Rôle de l’opérateur ?
En se fixant sur l’opérateur, les régulateurs peuvent empêcher la polymérase d’avancer
Où se situe l’opérateur ?(procaryote)
En général : entre TATA box et TSS
Caractéristique du terminateur ?
Peut être :
→ Rho dépendante
→ Rho indépendante
Caractéristique d’un terminateur rho dépendante ?
Constitué d’une séquence consensus reconnue par prot Rho
→ Provoque détachement
Caractéristique d’un terminateur Rho indépendante ?
- Séquence répétée inversée
→ formation d’une structure en tige de boucle → met fin à la transcription
Quels sont les signaux que l’on retrouve dans les gènes eucaryotes ?
- Les ≠ types de gène/promoteurs
- Séquence de fixat° des facteurs de transcription
- Boite TATA
- Coiffe 5’
- Jonctions introns/exons
- Terminateur
Quels sont les ≠ types de gènes eucaryote et les ARN polymérases associées ?
- Gènes ARNr 18s et 28s → ARN polymérase I
- Gènes ARNm et ARNnc → ARN polymérase II
- Gènes ARNt et ARNr 5S → ARN polymérase III
Où se situent les séquences de fixation des transcription (chez eucaryotes) ?
- Dans la région promotrice
- A cheval sur TSS
Rôle des séquences de fixation des facteurs de transcription ?
Facilitent ou empêchent la fixation de l’ARN polymérase
Localisation de la TATA box chez les eucaryotes ?
A - 25/30 du TSS
Chez les eucaryotes, avec quel action est couplée la terminaison de la transcription ?
La poly adénylation en 3’ des ARNm
Caractéristique de la polyadénylation ?
- Modification post transcriptionnelle
- Au niveau d’une séquence AAUAA
- Fait intervenir le complexe CPSF
- Ajout ≈ 200 A
Quels sont les principes de la transcription ?
- Unidirectionnel
- Action d’une ARN polymérase ADN dépendante
- 3 étape
- Plusieurs étape post transcriptionnelles chez les eucaryotes
- Régulation
Quelles sont les 3 étapes de la transcription ?
- Initiation
- Elongation
- Terminaison
Sens de synthèse de la transcription ?
Sens 5’-3’
Caractéristique de l’ARN polymérase chez les procaryotes ?
- Unique
- 6 sous unités
- PM ≈ 480 kDa
Caractéristiques de l’ARN polymérase chez les eucaryotes ?
- 3 ARN polymérase ≠
- 5 à 12 sous unités
Comment se fait l’adaptation des procaryote pour leur transcription ?
1 seul ARN polymérase mais plusieurs facteur sigma
Problème de l’ARN polymérase II ?
Incapable de lier ADN assez fortement et d’initier la transcription
Comment chez les eucaryotes est permis la liaison de l’ARN pol II à l’ADN ?
- Intervention des facteurs généraux de transcription (TFII)
- Formation du CIT
Quelles sont les les TFII existantes ?
=> 5
* B
* D
* E
* F
*H
Comment est initiée la transcription ?
Fixat° du complexe ARN poly → Ouverture double hélice
Quelles sont les régions du promoteur chez les eucaryotes ?
=> 3
* TATA box : -25
* GC box : -50
* CAAT box : -90
Comment peut se faire la reconnaissance du promoteur chez les eucaryotes ?
→ Formation d’un complexe d’initiation
Par quel mécanisme se fait l’élongation lors de la transcritpion ?
Formation de liaison phosphodiester (sens 5’-3’)
Comment expliquer que la transcription prenne plus de temps chez les eucaryote que chez les procaryotes ?
Remodelage des histones et nucléosome (eucaryotes)
Que se passe-t-il chez les procaryotes et le eucaryotes lorsque l’élongation à commencé ?
- Pro → relargage facteur σ
- Eu → phosphorylation queue CTD par TFIIH
Terminaison procaryote ?
- Rho dépendante ou indépendante
- Séquence terminateur + facteur de terminaison
Terminaison de la transcription avec ARN poly II chez eucaryotes ?
Couplée à la maturation des ARNm → Polyadénylation
Quelles sont les modification post transcriptionnelle chez les eucaryotes ?
- La coiffe 5’
- La queue poly A
- L’épissage
Caractéristique de la coiffe 5’ ?
- Co-transcriptionnelle
- Dès le début de la transcription dans le noyau
- En 5’
Rôle de la coiffe ?
- Stabilisation
- Export nucléaire
- Traduction
Rôle de la polyadénylation ?
Stabilisation et protection de l’ARNm
Tailles des introns ?
500 à 500k nucléotides
Taille des exons ?
100 à 500 nucléotides
