Bioch : Régulation transcription Flashcards
Pourquoi réguler la transcription ?
Pour s’adaptera
Quels sont les niveau de régulation possible ?
- Régulation CIS
- Régulation Trans
- Régulation au niveau de la chromatine
- Régulation post transcriptionnelle
Autre non de la régulation cis ?
Régulateur de proximité
Comment fonctionne la régulation cis ?
→ Gène dans la région promotrice
* Eléments cis
* ARN cis régulateur
Quels sont les éléments cis ?
TATA Box, CRE, Seq MET…
Action des ARN cis régulateurs ?
Ligand qui se fixe sur le gène transcrit et qui empêche la transcription → Ribo-swich
Caractéristique de la régulation Trans ?
Fait intervenir des génomes à distance
Quels sont les facteurs recrutés par la régulation trans et quelles sont leur caractéristiques ?
→ Protéines :
* Se fixant sur l’ADN → motif doigt de zinc, leucine zipper
* Recrutant la machinerie de transcription → Glycine, proline, domaine hélice α acide…
Qu’est-ce qu’un facteur de transcription ?
Protéine nécessaire à l’initiation ou la régulation
Quels sont les différents facteurs de transcription existants ?
- Facteurs généraux
- Facteurs spécifiques
- Facteur inductibles
Comment le facteur trans peut piéger la machinerie de transcription et quelle en est la conséquence ?
Avec un petit ARN qui mime la structure d’un complexe d’initiation de la transcription → Diminution du pool endogène de protéines
Nature des trans régulateur ?
Facteurs de transcription
Comment sont régulés les facteurs de transcription ?
Régulés selon :
* Type cellulaire spécifique
* Signal interne ou externe
De quoi dépend l’accès de l’ARN polymérase à la chromatine ?
De son état → compacté ou non
Comment est régulée l’accès à la chromatine ?
- Méthylation des cytosines ou non
- Acétylation des histones ou non
Quels sont les enzymes intervenants dans l’acétylation des histones ?
- Acétylases
- Désacétylases
Où se déroule la méthylation des cytosines ?
→ Eucaryotes
→ Ilots GPC
Que sont les îlots CPG ?
- Zone riche en di-nucléotide CG
- Associés aux région 5’ (gènes vertébrés)
- S’étend sur le promoteur et l’exon 1 (et 2)
Que se passe-t-il en cas de méthylation de l’ADN ?
Etat de transcription éteint
Localisation des îlots CPG ?
- Gènes constitutifs/de ménage
- 40% gènes tissus spécifiques
Quelles sont les différentes formes de la chromatine et l’état de transcription qui y est associé ?
- Euchromatine : active transcriptionnellement
- Hétérochromatine : condensée → inactiv
Qu’est-ce que la régulation post-transcriptionnelle ?
Ensemble des modification sui convertissent ARN pré-messager → ARNm fonctionnel
Où ont lieu les régulation post transcriptionnelles ?
Eucaryotes
Sur quoi va influencer la maturation post transcriptionnelle ?
Quantité disponible de transcrit
Comment la maturation post transcriptionnelle va influencer la quantité disponible de transcrit ?
En jouant sur la :
* Localisation des ARNm
* Stabilité des ARNm
* Epissage (alternatif)
Comment est amélioré la stabilité des ARNm ?
- Coiffe et méthylation en 5’
- Poly-adénylation en 3’
- Edition des ARNm
Comment peut on jouer sur l’action des facteurs de transcription ?
Un facteur de transcription peut avoir un rôle ≠ en fonction de ses partenaires.
→ Possibilité des générer des types cellulaires ≠
Quels sont les rôles/fonctionnement d’un senseur ?
Si la l’organisme sent la présence d’un AA dans le milieu il va réprimer la synthèse de ces derniers
Pourquoi les ARN polymérases sont de bonnes cibles pour les ATB ?
- Essentiels à la bactérie
- Fortement conservée chez les procaryotes
- Suffisamment différent des ARN polymérase eucaryotes
