Bio cell : Oxydation irréversible ADN Flashcards
Sur quels composants de l’ADN les ERO et ERN peuve,t réagir ?
- Bases
- Désoxyribose
Quelles sont les effets des ERO et ERN sur les bases de l’ADN ?
- Formation d’adduits
- Nitration
- Nitrosation
- Désamination des bases
- Oxydation
Quels sont les produits à l’origine des adduits se formant sur les bases de l’ADN ?
- Radicaux peroxyde d’AG
- Aldéhyde : MDA, 4HNE, acroéline
Caractéristiques de la localisation des adduits sur les base de l’ADN ?
- Groupement aminé des bases
- Guanine +++
Quel est le composé qui réagit le plus avec la guanine ?
MDA → malondialdéhyde
Réaction de la guanine avec un dérivée oxydant ?
Fragmentation → Ouverture du cycle → intermédiaire réactif électrophile → Fixation sur nucléophiles → Liaison avec ADN → Pontages → Condensation chroma +++ → impact transcription/ réplication
Les formations d’adduits sur l’ADN sont ……. des oxydations
Non spécifiques
Quels sont les acteurs de la nitration, nitrosation et désamination des bases ?
- Dioxyde d’azotes → NO°2
- Anion peroxyde → ONOO-
Qu’est-ce que la nitration des bases ?
Formation de :
* Nitroguanine
* Bases xanthiques
Comment sont obtenues les bases xanthiques ?
Désamination de xanthine et hypoxantine
Rôle de la xanthine oxydase ?
→ Enzyme pro-oxydante
Conduit à la formation :
* Acide urique
* Anion superoxyde
Importance de la “dangerosité” de la nitration des bases de l’ADN ?
Peut entrainer une 2eme vague de production d’ERO
Quelles sont les espèces oxydantes intervenant dans l’oxydation des bases ?
- Oxygène singulet
- LOO°
- ONOO- (+ rare)
- Radical hydroxyle
Quelle fonction chimique peut être oxydée par les ions ?
Les grpt thiols des protéines
Rôle de O2°-, H2O2 et NO dans l’oxydation des base de l’ADN ?
Formation des espèces oxydées
Quels sont les mécanismes d’oxydation des bases principales ?
→ 2
* Addition : guanine et adénine
* Arrachement d’un atome d’H
Addition d’°OH sur Guanine ?
- C4, C5 ou C8 (+++)
Addition → intermédiaire R° 8-hydroxyguanine ou ouverture de cycle FAPyGuanine
Sur quelles base se déroule majoritairement l’arrachement des hydrogènes ?
- Cytosine
- Thymine
Qu’obtient on après arrachement d’un hydrogène ?
Radical de base
Comment réagit le radical de base ?
Oxydation → Radical peroxyde de base → arrache un atome H → Hydroperoxyde de base
Effet de °OH sur la thymine ?
Arrachement d’un H sur le cycle ou groupement méthyle
Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le cycle de la thymine ?
Thymine glycol
Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le méthyle d’une thymine ?
5-hydroxyméthyleuracile
Caractéristiques des réactions d’arrachement d’hydrogène sur les thymines ?
Catalysées par le Fe et autres métaux
Quels sont les produits que l’on peut obtenir avec la réaction d’un °OH sur une cytosine ?
→ Arrachement d’un atome H
* Cytosine glycol
* 5,6-dihydroxycytosine
Qu’implique une atteinte de la désoxyribose par l’oxydation ?
Déstructurations de l’ADN
Produit obtenu par l’oxydation de la désoxyribose ?
Radicaux peroxyles
Forme des radicaux peroxyles ?
Radical carbone centré
Qu’engendre l’oxydation de la désoxyribose ?
Fragmentation de l’ADN
→ Carbonyles et MDA
→ Déstructuration de l’ADN
→ Rupture de liaison avec la base
Quelles sont les produit obtenues après altération du désoxyribose ?
- Sites abasiques
- Simple brin d’ADN
Quels sont les principaux sites cellulaires d’oxydation de l’ADN ?
- Noyau
- Mitochondires
Quelle espèce dans le noyau peut réagir et oxyder l’ADN ?
Radical hydroxyle
Le radical hydroxyle est formé dans/a proximité/loin du noyau ?
A proximité
Quels facteurs augmentent le risque d’oxydation de l’ADN ?
Présence de Fe et Cu liés à l’ADN
Pourquoi le risque d’oxydation de l’ADN est + important dans la mitochondrie que dans le noyau ?
- Proximité avec la chaine respiratoire (fuite d’e-)
- Réparation moins efficace
- Augmente avec l’âge
Quelles sont les différentes sorte de toxicités cellulaires observée avec l’oxydation irréversible de l’ADN ?
- Arrêt de la réplication
- Effets mutagènes
Quelles sont les conditions d’arrêt de la réplication ?
- Certains types d’oxydation
- Base très modifiée
- Réparation plus suffisement rapide
Quels sont les différents effets mutagènes observables ?
- Protéine nucléaire
- Cancérogénèse
- Effets génotoxique
Qu’est-ce que que la modification des protéines nucléaires ?
- Pas d’arrêt de réplication
- Incorporation d’erreurs minimes
- incorporation d’un nucléotide incorrect face à la base oxydée
Quelle est la mutation protéique nucléaire la plus fréquente ?
Transversion GC en AT
Quels sont les effets génotoxiques directs qui ont un risque carcinogène ?
- Aberration Xsomique
- Coupure simple ou double brin
- Echange de chromatide
- Formation de µnoyaux
Que sont les µnoyaux ?
Partie des Xsomes part dans une des cellules et forme des petits amas
Principe de la réparation de l’oxydation des bases ?
- Elimination des bases oxydées
- Clivage du désoxyribose
- Remplacement de la base par une nouvelle synthèse
Nom de la réparation de l’oxydation des bases ?
BER : Base Excision Repair
Réparation par excision de base
Quelles sont les enzymes spécifiques à la réaction BER ?
- DNA glycosylase
- Endonucléase
- Desoxyribosephosphodiesterase
- Polymérase
- Ligase
Rôle de la DNA glycosylase ?
Permet d’éliminer la base oxydée → obtention d’un site AP → Clivage par endonucléase
Rôle de la desoxyriboephosphodiesterase ?
Permet d’éliminer la désoxyribophosphate
Rôle de la polymérase dans la réparation de l’ADN ?
Introduit le bon nucléotide
Rôle de la ligase dans la réparation de l’ADN ?
Réalise la suture entre les nucléotides
Caractéristiques des glycosylases ?
- Famille
- 11 chez l’Ho
- +/- spécifique de la base oxydée
