Bio cell : Oxydation irréversible ADN Flashcards

1
Q

Sur quels composants de l’ADN les ERO et ERN peuve,t réagir ?

A
  • Bases
  • Désoxyribose
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelles sont les effets des ERO et ERN sur les bases de l’ADN ?

A
  • Formation d’adduits
  • Nitration
  • Nitrosation
  • Désamination des bases
  • Oxydation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quels sont les produits à l’origine des adduits se formant sur les bases de l’ADN ?

A
  • Radicaux peroxyde d’AG
  • Aldéhyde : MDA, 4HNE, acroéline
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Caractéristiques de la localisation des adduits sur les base de l’ADN ?

A
  • Groupement aminé des bases
  • Guanine +++
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Quel est le composé qui réagit le plus avec la guanine ?

A

MDA → malondialdéhyde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Réaction de la guanine avec un dérivée oxydant ?

A

Fragmentation → Ouverture du cycle → intermédiaire réactif électrophile → Fixation sur nucléophiles → Liaison avec ADN → Pontages → Condensation chroma +++ → impact transcription/ réplication

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Les formations d’adduits sur l’ADN sont ……. des oxydations

A

Non spécifiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quels sont les acteurs de la nitration, nitrosation et désamination des bases ?

A
  • Dioxyde d’azotes → NO°2
  • Anion peroxyde → ONOO-
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Qu’est-ce que la nitration des bases ?

A

Formation de :
* Nitroguanine
* Bases xanthiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Comment sont obtenues les bases xanthiques ?

A

Désamination de xanthine et hypoxantine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Rôle de la xanthine oxydase ?

A

→ Enzyme pro-oxydante
Conduit à la formation :
* Acide urique
* Anion superoxyde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Importance de la “dangerosité” de la nitration des bases de l’ADN ?

A

Peut entrainer une 2eme vague de production d’ERO

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quelles sont les espèces oxydantes intervenant dans l’oxydation des bases ?

A
  • Oxygène singulet
  • LOO°
  • ONOO- (+ rare)
  • Radical hydroxyle
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Quelle fonction chimique peut être oxydée par les ions ?

A

Les grpt thiols des protéines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Rôle de O2°-, H2O2 et NO dans l’oxydation des base de l’ADN ?

A

Formation des espèces oxydées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quels sont les mécanismes d’oxydation des bases principales ?

A

→ 2
* Addition : guanine et adénine
* Arrachement d’un atome d’H

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Addition d’°OH sur Guanine ?

A
  • C4, C5 ou C8 (+++)
    Addition → intermédiaire R° 8-hydroxyguanine ou ouverture de cycle FAPyGuanine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Sur quelles base se déroule majoritairement l’arrachement des hydrogènes ?

A
  • Cytosine
  • Thymine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Qu’obtient on après arrachement d’un hydrogène ?

A

Radical de base

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Comment réagit le radical de base ?

A

Oxydation → Radical peroxyde de base → arrache un atome H → Hydroperoxyde de base

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Effet de °OH sur la thymine ?

A

Arrachement d’un H sur le cycle ou groupement méthyle

22
Q

Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le cycle de la thymine ?

A

Thymine glycol

23
Q

Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le méthyle d’une thymine ?

A

5-hydroxyméthyleuracile

24
Q

Caractéristiques des réactions d’arrachement d’hydrogène sur les thymines ?

A

Catalysées par le Fe et autres métaux

25
Quels sont les produits que l'on peut obtenir avec la réaction d'un °OH sur une cytosine ?
→ Arrachement d'un atome H * Cytosine glycol * 5,6-dihydroxycytosine
26
Qu'implique une atteinte de la désoxyribose par l'oxydation ?
Déstructurations de l'ADN
27
Produit obtenu par l'oxydation de la désoxyribose ?
Radicaux peroxyles
28
Forme des radicaux peroxyles ?
Radical carbone centré
29
Qu'engendre l'oxydation de la désoxyribose ?
Fragmentation de l'ADN → Carbonyles et MDA → Déstructuration de l'ADN → Rupture de liaison avec la base
30
Quelles sont les produit obtenues après altération du désoxyribose ?
* Sites abasiques * Simple brin d'ADN
31
Quels sont les principaux sites cellulaires d'oxydation de l'ADN ?
* Noyau * Mitochondires
32
Quelle espèce dans le noyau peut réagir et oxyder l'ADN ?
Radical hydroxyle
33
Le radical hydroxyle est formé dans/a proximité/loin du noyau ?
A proximité
34
Quels facteurs augmentent le risque d'oxydation de l'ADN ?
Présence de Fe et Cu liés à l'ADN
35
Pourquoi le risque d'oxydation de l'ADN est + important dans la mitochondrie que dans le noyau ?
* Proximité avec la chaine respiratoire (fuite d'e-) * Réparation moins efficace * Augmente avec l'âge
36
Quelles sont les différentes sorte de toxicités cellulaires observée avec l'oxydation irréversible de l'ADN ?
* Arrêt de la réplication * Effets mutagènes
37
Quelles sont les conditions d'arrêt de la réplication ?
* Certains types d'oxydation * Base très modifiée * Réparation plus suffisement rapide
38
Quels sont les différents effets mutagènes observables ?
* Protéine nucléaire * Cancérogénèse * Effets génotoxique
39
Qu'est-ce que que la modification des protéines nucléaires ?
* Pas d'arrêt de réplication * Incorporation d'erreurs minimes * incorporation d'un nucléotide incorrect face à la base oxydée
40
Quelle est la mutation protéique nucléaire la plus fréquente ?
Transversion GC en AT
41
Quels sont les effets génotoxiques directs qui ont un risque carcinogène ?
* Aberration Xsomique * Coupure simple ou double brin * Echange de chromatide * Formation de µnoyaux
42
Que sont les µnoyaux ?
Partie des Xsomes part dans une des cellules et forme des petits amas
43
Principe de la réparation de l'oxydation des bases ?
* Elimination des bases oxydées * Clivage du désoxyribose * Remplacement de la base par une nouvelle synthèse
44
Nom de la réparation de l'oxydation des bases ?
BER : Base Excision Repair Réparation par excision de base
45
Quelles sont les enzymes spécifiques à la réaction BER ?
* DNA glycosylase * Endonucléase * Desoxyribosephosphodiesterase * Polymérase * Ligase
46
Rôle de la DNA glycosylase ?
Permet d'éliminer la base oxydée → obtention d'un site AP → Clivage par endonucléase
47
Rôle de la desoxyriboephosphodiesterase ?
Permet d'éliminer la désoxyribophosphate
48
Rôle de la polymérase dans la réparation de l'ADN ?
Introduit le bon nucléotide
49
Rôle de la ligase dans la réparation de l'ADN ?
Réalise la suture entre les nucléotides
50
Caractéristiques des glycosylases ?
* Famille * 11 chez l'Ho * +/- spécifique de la base oxydée