Bioch : Enzymologie p1 Flashcards
Définition d’un catalyseur
Molécule qui modifie la vitesse de réaction sans :
* Entrée dans le bilan final
* Être modifié en fin de réaction (intact)
* Modifier l’équilibre
* Modifier le sens de réaction
Qui sont les biocatalyseurs dans l’organisme ?
- ARN (ribosomes)
- Protéines (enzymes)
Principe de fonctionnement d’une enzyme ?
=> Accélérer la vitesse de réaction par abaissement de l’NRJ d’activation de la réaction
=> Le chemin pour réaliser la réaction sera moins couteux en NRJ
Quel est le “problème” de l’énergie d’activation ?
+ le niveau à atteindre est grand, - la réaction se fera spontanément
Comment un catalyseur augmente la vitesse de réaction ?
- Induis de nouveaux chemins
- Abaisse l’NRJ d’activation
/!\ Il peut aussi diminuer la T° de réaction /!\
Quelles différences portent les biocatalyseurs par rapport aux catalyseurs chimiques ?
1) + Puissant qu’un catalyseur chimique
2) Condition de réaction + douces
3) Porte une spécificité de réaction par rapport à leur substrat +++
4) Activité enzymatique PEUT être régulée
Efficacité des biocatalyseurs ?
Multiplient la vitesse de réaction par 10^6 à 10^12
Condition de “travail” des enzymes ?
T° : «< 100°C
P : 1 atm
pH ≈ 7
Comment est définie l’activité enzymatique ?
En terme de vitesse de réaction
Qu’est-ce que l’unité internationale ?
=> UI
Quantité d’enzyme qui catalyse la transformation d’1 µmol de substrat en 1 min
Quelle est l’unité officielle de l’enzymo ?
=> Le Katal
Quantité d’enzyme qui catalyse la transformation d’1 mol de substrat/sec
Qu’est-ce que l’activité spécifique d’une enzyme ?
=> UI/mg (ou UI/ml
Activité catalytique par unité de masse de protéine
Qu’est-ce que l’activité moléculaire spécifique ?
=> min^-1
Nb de moles de substrat transformées /min et par mole d’enzyme
Relations de Beer Lambert ?
- Absorbance = DO = εlC
- ΔC = ΔDO/(ε*l)
Quels sont les types d’enzyme qui existe ?
=> 2 types :
* Enzyme Michaelienne
* Enzyme allostérique
Quelles sont les paramètres qui définissent les réactions enzymatiques ?
=> 3
* Vitesse initiale
* Vitesse maximum
* Constante de Michaelis
Définition de la vitesse de réaction ?
- Quantité de substrat qui va être transformé par unité de temps
OU - Quantité de produit qui va être formée par unité de temps
De quoi dépend le devenir du complexe ES ?
Des constantes => Il s’agit d’une dynamique
A quoi correspondent les différents k ?
- k1 = cst d’association
- k2 = cst de dissociation
- Kcat/k3 = cst catalytique
- k1/k2 = cts d’affinité pour le substrat
Relation à l’état stationnaire ?
k1[E][S] = (k2+k3)*[ES]
Vitesse de catalyse enzymatique ?
V = k3*[ES]
Vitesse de formation ?
ES = k1[E][s]
Vitesse de destruction ?
ES = (k2+k3)*[ES]
Qu’est-ce que le Km ?
=> Inverse de l’affinité de l’enzyme pour le substrat
* Km = (k2+k3)/k1
MAIS svt :
* Km = k2/k1 = Ks
Equation de Michaelis Menten ?
V = (Vmax*[S])/Km+[S]
Quelles sont les condition d’expérience pour observé une équation de Michaelis Menten ?
1) Vitesse mesurée = vitesse initiale de la réaction
2) Concentration en substrat»_space;> enzyme
3) Hypothèse du pré équilibre ou de l’état stationnaire
Equation pour utilisation de Lineweaver et Burk
1/V = Km/(Vm*[S])+(1/Vm)
Point remarquables de linweaver et Burk ?
X = 0 → Y = 1/VM
Y = 0 → X = -1/Km
Quels sont les facteurs influençant la réaction enzymatique ?
=> Les effecteurs
* Activateurs
* Inhibiteur
- Réversibles
- Irréversibles
Exemple d’inhibiteur irréversible ?
La chaleur
Quelles sont les inhibitions induites par les inhibiteurs réversibles ?
Inhibition :
* Compétitive
* Non-compétitive
* Incompétitive
* Mixte
* Par excès de S ou P
Quels sont les complexe possible avec l’inhibition compétitive ?
ES ou EI
Conséquence d’une inhibition compétitive ?
- Km = modifié
- Vmax = pas modifiée
Quels sont les complexes possibles avec l’inhibition non compétitive ?
EI, ES et EIS
Conséquences entre S et I lors d’inhibition non compétitive ?
- Pas de compétition entre S et I
- Km = pas modifié
- Vm = modifié (svt + petite)
