transgene planten: agrobacterium tumefaciens Flashcards
voordelen planten
- totipotent = uit 1 cel kan volledige plant genereren
- goed gekende mutanten van soorten
- zichzelf bestuiven (backcross)
- polyploïde (somaclonale variatie mogelijk in cultuur)
methoden
- protoplasttransformatie/elektroporatie
- micro-injectie
- biolistics
- transfer Ti van A. tumefaciens
somaclonale variatie
natuurlijke herschikking in chromosomen
euploïdie
vermeerdering/vermindering volledige set chromosomen met 1 set chromosomen
aneuploïdie
vermeerdering/vermindering 1 chromosoom
protoplasttransformatie/elektroporatie
- celwand verwijderen > protoplast
- transformatie
> elektroporatie protoplast > kanalen > DNA binnen
> liposomale transfer - selectie transformanten
- regeneratie celwand
- eventueel cel uitgroeien > plant
micro-injectie
- protoplasten makkelijker in nucleus, injec in kern
- selectie regeneratie uitgroei
biolistics
- protoplasten of embryonale regeneragtiestadium plantencellen
> voordeel embr.: groeivoordeel nr regeneratie toe - particle gun (goud/wolfraam)
- selectie regeneratie uitgroei
x onzeker # kopijen plasmide in cel
x transiënt: pDNA verloren tijdens opgroei
transfer via Ti vanuit A. tumefaciens
= agrobacterium tumefaciens
- kroon-gal groei = fytohormonen onafhankelijke groei tumorvorming (uitschakelen bij gebruik)
- tumor inducerend (Ti) plasmide
> 200kb
> 23kb T-DNA > plant > integratie plantcel chromosoom
> T-DNA gebruiken gen X in plant Y in genoom via intermediaire vector
- hecht aan plantenwonde (katabolisatie als C-bron)
Ti plasmide
- ori
- virulentieregio (overdracht T-DNA)
- conjugatieve transfer regio (overdracht Ti plasmide A.)
- T-region tss borders
> fytohormonen: cytokinine (scheut) & auxine (wortel)
> opinine: plant maakt opsonine voor A. (metabolisatie C-bron)
hechting aan plant + overdracht
- verwonde plant > EW als wondherstel > A. herkent EW + hecht
- EW stimuleren expressie vir EW in genoom A.
- vir EW stimuleren virulentieregio Ti-plasmide > T-DNA genicked border regios
- ssDNA van Ti (virulentieproteïnen) ssT-DNA plantencel
=» random multiple integratie = meerdere kopijen T-DNA in genoom op 1 plaatst
techniek A. tumefaciens
- A. kweken in cultuur
- recombinant Ti plasmide aanmaken + in A. brengen
- T-regio met GOI in plantencel
- selectie regeneratie transgene plant
tumorvorming vermijden
Ti disarmed plasmide
- deletie cytokinine, auxine & opine > GOI
> fytohormonen in medium
- Ab res, reportergenen,… bij GOI
> P nos = nopaline synthese promotor = typisch promotor constitutieve expressie in planten