kloneren Flashcards
toepassingen kloneren
- sequeneren
- expressiescreening
- grote hoeveelheiden eiwitproduct bekomen
- mutaties gen
voorbereiding recombinante vector (hogen org. transgeen)
hybridisatie
2 strengen samenvoegen, basenparen, via label opsporen
expressieklonen
klonering zodat insert/vector tot expressie komt in doelwitcel
genetische variantie
screenen verschillende basenvolgorde binnen 1 soort organisme
post-genomisch
RNA,eiwitten, eiwit-eiwit interactie
transgenese
gen uit organisme X in organisme Y brengen, transgeen organisme
intermoleculaire ligatie
2 DNA moleculen; genfragment van interesse en vector
optimale ratio sticky en blunt ends
st= 3:1 of 1:3
bl= 1:5
controle resultaat
- antibioticum resistentie
- sequentie vector gekend: PCR primers
- restriction mapping: pDNA opnieuw verknipt, AGEF
- sequenering na PCR
voorkomen ongewenste ligatie
- defosforylatie insert/vector
- dubbele restrictiedigest
fosfatase enzym voorbeeld en hoe opzuiveren
bacterieel alkalisch fosfatase en kalf intestinaal fosfatase
anionachromatografie en fenolextractie + ethanolprecipitatie
conversie 3’ uiteinden
bacteriofaag T4 polymerase
5’-3’ polymerase
3’-5’ exonuclease
conversie 5’ uiteinden
T4 polymerase of klenow
5’-3’ polymerase
linkers
korte synthetische stukken DNA met gekende sequentie, RE herkenningsplaats
adapters
2 korte ss oligonucleotiden gedeeltelijk complementair aan elkaar (vaak 5’ gedefosforyleerd)