Le système endomembranaire Flashcards
Comment fut créer la mitochondrie ?
Une cellule eucaryote ancestrale (anaérobie) absorbe une bactérie procaryote aérobie. Ils font depuis symbiose.
Où commence la synthèse d’une protéine ?
Dans le cytosol
Comment commence la synthèse d’une protéine ?
Le ribosome crée une vingtaine d’acide aminés hydrophobes en position N-terminale qu’on appelle peptide signal.
Quelle est l’utilité du PRS ?
Il transporte les protéines nouvellement synthétisé et le ribosome vers la membrane du RE.
Quand la PRS se lie au complexe ribosome-peptide signal qu’est-ce que cela provoque ?
Cela met en pause la synthèse de la protéine. (aussi appelée traduction)
De quel façon le complexe ribosome-peptide-PRS se lie à la membrane plasmique ?
1) Le PRS se fixe sur un récepteur PRS
2) La partie 60S du ribosome se fixe sur le translocon
Une fois que le ribosome est fixé au translocon, qu’est-ce qu’il ce passe concernant la PRS ?
Elle s’enfuit pour chercher du nouveau travail. Cela permet au ribosome de reprendre la synthèse de la protéine.
Quand la synthèse de la protéine se termine. Qu’elle est la différence entre si elle est destinée à être transmembranaire et si elle est destinée à être soluble ?
Transmembranaire : Elle va s’insérer dans la membrane lipidique durant la synthèse
Soluble : Elles se retrouvent dans la lumière du RE.
Qu’est-ce qui clive le peptide signal ?
La peptidase signal
Le peptide signal est-il toujours clivé ?
Pour le cours OUI
De quoi est fait le réticulum endoplasmique ?
De saccule
A cause de quoi le réticulum est-il rugueux ? L’est-il également à l’intérieur ?
A cause de ribosome qui ne se trouvent que sur sa face externe.
Comment s’appelle la zone dépourvue de ribosome sur la face externe du RER ? A quoi sert-elle ?
C’est la zone de transition qui est l’endroit à partir duquel les vésicules vont se former pour quitter le RER.
Quelle est la fonction principale du RE ?
Synthèse et translocation des protéines.
Qu’est-ce qui permet à une protéine de rester dans le RE où d’y revenir si elle en sort ?
Le signal de rétention.
Si un protéine qui vient de finir d’être synthétisé ne possède pas de signal de rétention que va-t-elle faire ? (2)
- Elle pourra être transmembranaire
- Elle pourra aller dans le flux vectoriel
Qu’est un “signal de rétention” ?
Une séquence spécifique d’acide aminé qui les retiendra dans un compartiment en particulier.
Qu’est-ce qu’une protéine résidente ?
Une protéine qui doit rester dans la lumière du RE.
Où se positionne le signal de rétention au RE sur une protéine et comment on peut l’appeler ?
Il y a le KDEL et le HDEL qui se positionnent en extrémité C-terminale des protéines solubles.
Quel marquage possèdent les protéines devant aller dans le lysosome ?
Un marquage au M6P.
En laboratoire lorsqu’un RER est fractionné qu’est-ce que cela donne ?
Des petites vésicules de RER appelées microsomes. Ils conservent les ribosomes sur la face extracellulaire.
Quelle est la taille d’un microsome ?
100 nanomètre
Il y a deux types de microsome. Lesquels ?
Lisse et rugueux
Où est stocké le plus gros du calcium dans la cellule ?
Dans le réticulum endoplasmique (ou sarcoplasmique).
Sous quelle forme est le REL ?
Canalicules
Vers quoi sont orientés les réseaux cis et trans golgiens ?
Le réseau cis fait face au RE tandis que le réseau trans fait face à le membrane plasmique.
Homogénéiser une cellule c’est quoi ?
Cela revient à la fragmenter.
Les canalicules sont faites de quoi ?
D’une bicouche lipidique.
De quoi peut être résidente une protéine ?
Du RER, du Golgi ou du lysosome.
Qu’est le “peptide signal” d’une protéine transmembranaire ?
Il y a deux possibilité.
1) Le premier domaine hydrophobe servira de peptide signal ici, le PRS s’accrochera dessus.
2) Un peptide signal classique en avec un signal N-terminal
Une séquence transmembranaire peut-elle être clivée ?
Non
Quand la protéine est dans la membrane plasmique et que ses cotés N et C terminal dépassent de part et d’autre de la membrane. De quel coté seront-ils ?
N-terminal : Lumière
C-terminal : Cytosol (extérieur)
Quand une protéine n’a pas de domaine hydrophobe mais qu’elle doit s’insérer dans la membrane plasmique. Qu’est-ce qui va faire qu’elle se mettra d’un coté où de l’autre ?
La répartition des charges de part et d’autre de la membrane et de la protéine. Les charges de la protéine devront aller à l’inverse des charges de la membrane.
Des ribosomes qui ne sont pas en cours de synthèse peuvent-ils être accroché à la membrane du RE ?
Non
Sur la membrane plasmique, une fois la protéine clivée, que fait-on du peptide signal ? (2)
1) Dégradé par des peptidases
2) Envoyé dans le CMH1
Dans la membrane plasmique quel côté est chargé + et quel côté est chargé - ?
+ à l’intérieur et - à l’extérieur
A quelle famille appartient la protéine BiP ?
Hsp70
Citer deux protéines solubles résidentes du RE.
BiP et calréticuline
Citer une protéine transmembranaire résidente du RE ?
Calnexine.
Quel est le site consensus de la N-glycosylation et qu’est “X” ?
Asparagine-X-Sérine ou Asparagine-X-Thréonine
X correspond à n’importe quel acide aminé autre que la Proline.
Combien de résidus osidiques sont nécessaires à la N-glycosylation ?
14
Quel lipide hydrophobe est nécessaire à la N-glycosylation ?
Le dolichol
Quel type de protéine doit obligatoirement être repliée dans le RE ?
Transmembranaire et soluble
Quel est l’utilité des protéines chaperonnes ?
Elles aident les protéines à se replier et si ça ne fonctionne pas elles les envoient se faire dégrader.
Que dire sur la vitesse du flip flop et sur les protéines aidantes ?
Le flip flop quand il se fait seul est très lent, il y a donc des protéines qui aident à ça, appelées des flippases.
Peut-il y avoir plusieurs appareil de golgi dans une cellule ou est-il unique ?
Peut y en avoir plusieurs.
Comment s’appelle l’empilement de saccule qu’on trouve chez le golgi ?
Le dictyosome.
Qu’est l’ERGIC ?
Des vésicules provenant du RE allant vers le Golgi qui fusionnent entre elles.
Où est-ce qu’on retrouve COP I et COP II ?
Autour des vésicules qui se trouvent entre le RE et le Golgi. Ce sont des manteaux.
Le COP II va dans le sens du flux vectoriel et le COP I sur les vésicules se déplacent dans le sens rétrograde antérograde.
Le signal KDEL c’est quoi ?
Un signal de retour vers le RE. Sert pour les vésicules qui se sont “perdues”.
Qu’est-ce qu’un tri itératif ?
Le tri itératif est un tri progressif et répétitif des protéines pour corriger les erreurs et les acheminer vers leur destination finale.
Quand une protéine qui porte un signal KDEL est reconnu par un récepteur KDEL, qu’est-ce qu’il ce passe ?
Active un signal via une séquence KKXX (du récepteur). Cela entraîne le bourgeonnement de vésicules recouvertes de COP I, ramenant les protéines au RE.
Les fonctions de l’appareil de Golgi :
- Maturation des protéines
- Transfert des protéines
- Synthèse des sphingolipides
- Tri des molécules
A partir de quel acide aminé se fait la O glycosylation ?
La sérine ou la thréonine
La glycosylation est-elle toujours faites au maximum ? Quel est le mot utilisé ?
Non, parfois l’enzyme n’a pas le temps où la place de terminer la glycosylation. La glycosylation est donc hétérogène.
Dans quelle partie du Golgi est mis en place le M6P ?
Dans le réseau cis-golgien.
Où se fait la O-glycosylation ?
Golgi médian ou trans.
Où se fait l’addition d’acide sialique dans les N-glycosylation ?
Dans le réseau trans golgien, donc à la fin.
Quel type de charge donne un sulfate ?
Une charge négative
Sulfoconjugaison c’est quoi ?
Un groupe sulfate est ajouté à une molécule.
Où se fait la synthèse des sphingolipides ?
Dans le golgi cis et le golgi médian.
Où sont fabriqués les glycérophospholipides ?
Dans le RE.
Que sont les radeaux lipidiques ?
Des parties de la membrane plasmique plus épaisse. Elles sont riche en sphingolipide et cholestérol.
Qu’est-ce qui dénote sur les radeaux lipidique hormis leur épaisseur et leur composition ?
Ils sont moins fluide que le reste de la membrane.
Quelles protéines ont tendances à s’ancrer sur les radeaux lipidiques ?
Les ancres GPI, les protéines palmitoylée et les lipides.
Qu’est-ce qu’on ne trouve généralement pas sur les radeaux lipidiques ?
Les lipides insaturés.
Que forme la protéine FAPP ?
C’est un manteau qui forme des tubules.
Qu’est-ce qui aura tendance à voyager grâce aux tubes et grâce aux sphères ?
Dans les sphères, ce qui est soluble et dans les tubes, ce qui est membranaire.
(On parle juste de majorité)
Comment évolue l’insuline dans l’appareil de Golgi ?
Au début, il est très dispersé puis un manteau de clathrine va arrivé, petit à petit, il éliminera de la membrane et du contenu de la lumière qui est vide, cela se finira en vésicule très concentré avec beaucoup de molécule d’insuline.
Où est-ce que l’insuline mature ?
Dans le Golgi.
Une sécrétion sensible à un stimuli est une sécrétion :
Régulée
Les utilités de Rab et SNARE :
Elles aident les vésicules à arriver à destination.
Rab les guides et se lie aux bons effecteurs.
SNARE facilite la fusion entre la membrane et la vésicule.
Il y a deux types de SNARE. Développer.
V-SNARE se trouve sur la vésicule
T-SNARE se trouve sur le compartiment receveur
Rab et Snare se trouvent sur toutes les vésicules ?
Oui
Sur une protéine transmembranaire où se trouve le signal d’adressage ? (2)
- Dans le domaine cytosolique
- Entre les deux bicouches
Grâce à quoi est-ce qu’on peut détoxifier dans le RE ?
Le cytochrome P450
Que peut-on dire sur la clathrine et la cavéoline ?
Elles sont toutes les deux autours des vésicules mais la cavéoline ne part jamais tandis que la clathrine se déshabille avant de fusionner avec le compartiment cible.
Un segment hydrophobe peut-il être un signal d’arrêt de la translocation ?
Oui
Qu’elle est l’utilité de l’osmium ?
Le marquage des citernes cis-golgiennes.
RCPG c’est quoi ?
Un récepteur couplé à une protéine G
Combien de domaine transmembranaire possède RCPG ?
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Qu’est Bcl2 ?
La famille de molécule dont dépend l’apoptose
Quel type de chose sont activées par les RCPG ?
Les protéines globulaires
Donner la structure des protéines transmembranaire avec l’utilité de chacune des structures : (3)
Domaine extracellulaire : Site de fixation au ligand
Transmembranaire : Ancrage
Intracellulaire : Permet la transduction du signal
