La transcription (Cornillot) Flashcards
Qu’est la transcription ?
Le processus permettant de produire l’ARN à partir d’un brin d’ADN.
Qu’est-ce qui catalyse (permet) la transcription ?
L’ARN polymérase
Quel est le pourcentage d’ADN codant dans le génome d’une bactérie ?
80%
Il y a plusieurs type d’ARN. Quel est le rôle des ARN messagers ?
Ils servent à coder pour les protéines.
Chez l’Homme quel est la part d’ADN codant dans son génome ?
1 à 2% de gène codant pour des protéines.
Quel pourcentage du génome est transcrit ?
(C’est à dire transformer en ARN)
75% mais tout n’est pas traduit en protéine.
Sur les 75% d’ADN transcrit en ARN. Que deviennent les 67% qui sont des ARN non codants ?
1) ARN ribosomique : Ils constituent les ribosomes
2) ARN de transfert : Transportent les acides aminés pour la traduction
3) ARN non codant : Impliqués dans la régulation des gènes
Quelle est l’utilité des 25% d’ADN non transcrit ?
20% sont des structures importantes comme les centromères et télomères.
5 % restants sont des séquences impliquées dans la régulation de l’expression des gènes (promoteurs, enhancers, etc.).
Chez les humaines combien de gènes codent pour des protéines et combien de protéines différentes peuvent-ils produire ?
20 000 gènes pour 100 000 protéines.
L’expression d’un gène peut être activée ou inhibée en réponse à un stimuli interne ou externe. A quelle allure ?
De façon lente, cela prendre entre plusieurs minutes et plusieurs heures.
Comment fonctionnent les gènes du parasite responsable de la malaria ?
Ce parasite change de forme, il en a trois au cours de son évolution et pour chaque forme, il active et désactive certains gènes.
On parle de vague d’expression génétique.
A quelle allure se réorganise le cytosquelette ?
En quelques secondes.
Dans quelle cellule de l’Homme se niche la malaria et comment est-ce qu’il évolue ?
Dans son premier stade, il est juste dans le globule rouge.
Dans son deuxième stade, il consomme l’hémoglobine.
Dans son troisième stage, il est toujours dans le globule rouge et il se multiplie.
Ensuite il éclate et ils vont parasiter d’autres érythrocytes.
Que sont les éléments cis-régulateurs et les facteurs trans ?
Cis-régulateurs : Séquence proche d’un gène qui contrôle directement son expression. (Promoteur ou enhancers) Ils sont génétiquement liés aux gènes de structure
Facteurs trans : Protéines ou ARN produits ailleurs dans la cellule, qui interagissent avec les éléments cis pour moduler l’expression. Ils sont produit par des gènes régulateurs.
Que sont les gènes de structures ?
Ils codent pour des ARN messagers qui produisent des protéines. 0
Les facteurs trans sont quel type de protéine et sont produites par quoi ?
Avec quoi est-ce qu’ils réagissent ?
Ce sont des protéines régulatrices diffusibles, elles sont produites par des gènes régulateurs. Egalement, elles interagissent avec des éléments cis-régulateurs dans le but de réguler l’expression des gènes de structure.
Quelle partie des éléments cis régulateurs peuvent activer ou inhiber l’expression d’un gène en fonction des signaux reçus ?
Les éléments de réponse
Les facteurs trans se lient aux éléments cis régulateurs (qui sont des promoteurs) pour :
Recruter l’ARN polymérase.
Faciliter ou bloquer la transcription en modulant les interactions ADN-protéines.
Chez quel type d’être vivant se retrouve l’opéron lactose ?
Chez les PROCARYOTE, il est absent chez les eucaryote.
Qu’est-ce qu’un opéron ?
Un opéron est un ensemble de gènes régulés par un unique promoteur, permettant une transcription commune.
Les eucaryotes ont des gènes monocistroniques. Qu’est-ce que cela signifie ?
Chaque gène possède son propre élément cis régulateur (comme un promoteur)
L’opéron lactose possède trois gènes principaux. Lesquels ?
LacZ : Code pour la beta-galactosidase qui est une enzyme qui dégrade le lactose en galactose et en glucose.
LacY : Code pour la perméase qui facilite l’entrée du lactose dans la cellule.
LacA : Code pour la transacétylase, dont le rôle est moins essentiel pour le catabolisme du lactose.
Quelle est l’utilité de l’opéron lactose ?
L’opéron lactose intervient dans le catabolisme des sucres.
(Catabolise : Transformer molécules complexes en molécule simple)
Le lactose est un disaccharide de quoi ?
De galactose et de glucose
Chez les procaryotes la traduction et la transcription se font à quel moment ?
En même temps
Une certaine protéine régulatrice est appelée Lacl. Son utilité ?
Elle se pose sur l’opéron lactose bloquant ainsi l’accès à l’ARN polymérase sur les gènes lacZ, lacY, et lacA
De quelle façon est produite la protéine lacl ?
Constamment
Comment fonctionne l’allolactose ?
1) Une petite quantité de lactose rentre dans la cellule grâce à perméase
2) Lactose converti en allolactose grâce à une enzyme dans la cellule
3) Allolactose se fixe sur lacl et provoque un changement de conformation
4) Ce changement de structure diminue l’affinité de LacI pour l’opérateur, le libérant de l’ADN.
Avec LacI détaché, le répresseur n’est plus actif, et l’ARN polymérase peut désormais accéder au promoteur. Cela entraîne une transcription des gènes lacZ, lacY et lacA
Quand il n’y a pas de glucose dans la bactérie quelque chose est renforcé. Quoi ?
L’expression des gènes de l’opéron lactose est renforcé. (La protéine CRP le permet)
Quelle est la source d’énergie privilégiée pour les procaryotes et eucaryote ?
Le glucose
Lorsqu’il n’y a plus de glucose comment la procaryote trouve de l’énergie ?
1) Enzyme appelée adenylate cyclase est activée en cas de stresse métabolique. Elle synthétise l’AMPc, molécule de signalisation intracellulaire.
2) AMPc se fixe sur la protéine CAP, un activateur transcriptionnel, cela active CAP
3) Une fois activée, CAP se lie à une séquence en amont du promoteur de l’opéron lactose, aidant l’ARN polymérase à se fixer et à stabiliser sa position. Cela entraîne une transcription accrue des gènes lacZ, lacY et lacA.
Que dire sur l’AMPc et l’opéron lactose en présence de glucose ?
L’opéron lactose s’exprime faiblement
L’AMPc n’est pas présent même si du lactose est présent
Que dire sur l’AMPc et l’opéron lactose en présence de lactose ?
L’absence de glucose stimule la production d’AMPc, qui active CAP. Avec le répresseur LacI inhibé par l’allolactose, l’opéron est fortement exprimé, permettant à la bactérie de consommer efficacement le lactose.
Qu’est la croissance en diauxie ?
La croissance en diauxie est un phénomène où une bactérie utilise deux sources de carbone successivement. Elle consomme d’abord la source préférée (ex. glucose), fait une pause (phase de latence), puis utilise la seconde source (ex. lactose) après adaptation.
