identification et validation de la cible (5) Flashcards
concernant un dipole permanent, la fonction chimique est représentée par
2 atomes polarisées
Lors d’une électronégativité, on a une répartition de charges
différentes
concernant un dipôle induit, la fonction chimique ne possède pas une répartition de charges
VRAI
pour un dipôle induit, la répartition électronique devient
dissymétrique
différents types d’a.a de la cible sont impliqués
- a.a à chaines latérales ionisables
- a.a à chaines latérales polaires
les interactions dipolaires peuvent se produire entre
ion-dipole
dipole permanent- dipole permanent
dipole induit-dipôle induit
l’énergie mise en jeu sera comprise entre
0,5 et 7 kcal.mol-1
les liaisons de Van der Waals se forment
entre les cycles aromatiques
les interactions entre un ligand et sa cible par liaison de Van der Waals se produisent entre 2 groupements fonctionnels aromatiques de densité électronique
différente
la densité électronique du cycle aromatique dépend de
la nature des atomes et du caractère électrodonneur ou électroattracteur des substituants du cycle aromatique
l’énergie mis en jeu pour les liaisons de Van der Waals sera comprise entre
1 et 10 kcal.mol-1
3 AA sur la cible protéique qui peuvent faire des liaisons de Van der Waals
- phénylalanine
- tyrosine
- tryptophane
la tyrosine est
accepteur et donneur de liaison hydrogène
la fonction tyrosine est capable de s’ioniser dans un environnement chimique favorable pour donner un
alcoolate
sous forme alcoolate la tyrosine peut également interagir par liaison
hydrogène ou dipolaire
le tryptophane peut interagir par liaison hydrogène ou par interaction dipolaire
VRAI
les liaisons hydrophobes se forment
entre les chaines aliphatiques alkylées
a.a qui peuvent former des liaisons hydrophobes
- glycine
- alanine
- valine
- leucine
- isoleucine
- proline
les liaisons hydrophobes peuvent se former entre tous les a.a à chaines
latérales hydrogénocarbonées
l’énergie de liaisons pour une liaison hydrophobe sera de l’ordre de
0,5 kcal.mol-1
l’anhydrase carbonique 2 est une
métallo-enzyme complexée par un métal ionisé: ions Zn2+
l’anhydrase carbonique 2 est impliquée dans
certains processus de sécrétion
l’anhydrase carbonique 2 transporte
le CO2 entre les tissus et les poumons
l’anhydrase carbonique 2 catalyse
la transformation du dioxyde de carbone en carbonate en présence d’eau
l’autoprotolyse de l’eau génère des espèces ioniques qui vont interagir avec les chaines latérales des a.a de l’enzyme qui elle même va faciliter leur réaction avec le dioxyde de carbone
VRAI
il faut que delta G soit
< 0
l’entropie joue un rôle essentiel dans l’autoprotolyse de l’eau, pour avoir une réaction efficace, il faut
la diminuer
l’étude des interactions ligand-cible permet de mettre en évidence
le réseau de liaisons électrostatiques le plus efficace
