identification et validation de la cible (3) Flashcards
AA synthétisés par l’organisme (11)
- alanine
- arginine
- asparagine
- acide aspartique
- acide glutamique
- glutamine
- glycine
- cystéine
- proline
- Serine
- tyrosine
AA essentiels (9)
- histidine
- leucine
- isoleucine
- lysine
- méthionine
- phénylalanine
- thréonine
- tryptophane
- valine
les macromolécules protéiques résultent
d’un enchainement d’AA reliés entre eux par une liaison peptique covalente
le carbone est
asymétrique et possède 4 fonctions
les AA de l’alimentation sont appelés
essentiels
la structure de base des AA est caractérisée par
une fonction carboxyle -COOH, une fonction amine primaire-NH2 et une chaine latérale R
la liaison peptidique s’établit entre
-COOH et -NH2
l’enchainement d’AA par les liaisons peptiques constituent
la structure primaire des protéines
liaison peptidique=
liaison amide
la liaison hydrogène est une liaison
faible
les liaisons faibles sont des liaisons hydrogène entre les fonctions peptiques
-CONH-
la structure secondaire est composée
- hélice alpha
- feuillet beta
dans l’hélice alpha, les liaisons hydrogènes sont orientées
selon l’axe de l’hélice
dans l’hélice alpha, les chaines latérales des aa pointent
en dehors et perpendiculairement à l’axe de l’hélice
le feuillet beta est
une superposition de 2 fragments antiparallèles de la chaine protéique
dans le feuillet beta, les chaines latérales sont
perpendiculaires au feuillet
la fonction carboxyle C=O de la fonction peptidique est
accepteur de liaison hydrogène
la fonction amine NH de la fonction peptidique est
donneur d’une autre fonction peptidique
la structure tertiaire résulte
de l’interaction par des liaisons électrostatiques entre les chaines latérales des aa en différents points de la structure secondaire
la structure quaternaire est
l’association de 2 ou plusieurs structures tertiaires
l’hémoglobine est constituée de
4 structures tertiaires associées
les différents types d’interactions ligand-cible protéique dépendent
- de liaisons faibles
- de la nature des fonctions chimiques du ligand et de la cible
- de leur conformation spatiale
- de la complémentarité des 2 partenaires
l’interaction ligand cible est un processus irréversible
FAUX, réversible
les liaisons ioniques sont des liaisons
faibles électrostatique
les liaisons ioniques dépendent du pH
VRAI
Parmi les liaisons faibles, la liaison ionique est la +
forte
les liaisons ioniques se forment
entre les groupements ionisants du ligand et de la cible
les groupements ionisantes de la cible sont
les fonctions chimiques des chaines latérales des a.a
les fonctions chimiques ionisantes des a.a sont les fonctions
-carboxyliques de l’acide aspartique et de l’acide glutamique
-amines de la lysine, arginine et histidine
plus le pKa est élevé, + le doublet non liant est
accessible
