Identificación Bacteriana Flashcards
Diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Diagnosticos clinico
- Anamnesis
- Signos
- Sintomas
- Exploración
Diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Diagnosticos de laboratorio:
Los Diagnosticos de laboratorio pueden ser:
- Inespecifico Bioquímico
- Específico o microbiologico (Directo e Indirecto)
Diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Diagnosticos de laboratorio: Bioquímico
Los Diagnosticos de laboratorio: Bioquímico pueden ser
- Hemograma
- Coagulación
- Velocidad de sedimentación globular
- Bioquiímica elemental
- Proteína C reactiva
Diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Diagnosticos de laboratorio: Especifico
Diagnosticos de laboratorio:
Especifico pueden ser directos y indirectos
Directo
- Frotis: en fresco
- Tinciones
- Cultivo
- Busqueda del antígeno
- Detección de productos del metabolismo
- Detección de ácidos nucleicos
- PCR
Indirectos (recuerde los indirectos)
Diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Diagnosticos de laboratorio: Especifico Indirecto
Diagnosticos de laboratorio: Especifico pueden ser Directos e Indirecto:
Los Indirectos son:
- Serlogía
- Pruebas cutáneas
Los Directos (recuerde!)
Diagnóstico de la enfermedad infecciosa.
Flugrama de tipos de diagnostico
Coloración de gram
- Gram directo de la muestra que permite informar presuntivamente agentes etiológicos con alto impacto clínico
- Es el caso de los gram directos de esputo, de flujo vaginal, de LCR, de cualquier material de cavidad estéril Deben ser examinados por personal altamente entrenado
- Permiten evaluar concordancia entre lo observado en la muestra original y lo rescatado en el cultivo de la misma
- Gram de las colonias aisladas de los medios de cultivo sólidos como punto inicial de la identificación bacteriana
- Gram de hemocultivos proporciona información presuntiva del agente involucrado en la bacteriemia
- Permite conocer las bacterias en el desarrollo de los medios líquidos para seleccionar los medios sólidos para el reaislamiento de las bacterias
Identificación microbiana
Métodos fenotípicos tradicionales
a) Características microscópicas
b) Morfología colonial (forma, tamaño, hemólisis, pigmentación, textura)
c) Medios selectivos y /o cromogénicos (nutrientes, ATB, sustratos)
c) Pruebas bioquímicas ( Características metabólicas )
d) Sensibilidad o resistencia a algún antimicrobiano
Identificación microbiana
Sistemas fenotípicos semiautomatizados
- ▪ Permiten probar gran cantidad de sustratos (10-50) simultáneamente
- ▪ Permite en general interpretar con sistema de códigos numéricos
- ▪ Algunos pueden ser de lectura rápida (4 horas)
Identificación microbiana
Sistemas fenotípicos totalmente automatizados
- Utilizan también sustratos liofilizados en diferentes soportes
- En general realizan también la prueba de sensibilidad a los ATB
- La resolución del código es automática e informatizada
Identificación microbiana
Métodos genotípicos
- El mas difundido es la secuenciación de ARNr 16S (Housekeeping)
- En la actualidad la base de secuencias alcanza 10000 bacterias
- Permite además establecer relaciones filogenéticas entre las bacterias
- Se han utilizado también las secuencias de ARNr 23S
- Otra secuencia utilizada es la de la subunidad β del gen ropB
Identificación microbiana
Sistemas proteómicos
- Permiten identificar bacterias basado en el perfil proteico determinado por espectroscopia de masa
- Los sistemas existentes en la actualidad se basan en la detección de proteínas ribosómicas
- A medida que se incrementa su utilización mundial también lo hace la base de datos
Diagnóstico molecular
RT PCR (GeneXpert)
RT PCR (GeneXpert)
Detecta un microorganismo por vez directamente de la muestra biológica
Paneles para SAMR, micobacterias, Clostridium difficile, Chlamydia, Enterovirus, Flu virus
Diagnóstico molecular
MULTIPLEX ( Film.Array)
MULTIPLEX ( Film.Array)
- Detecta simultáneamente varios gérmenes en el mismo ensayo
- Hay paneles para : infecciones respiratorias, gastrointestinales y sepsis.
- Investiga bacterias y virus en el mismo ensayo
Diagnóstico molecular
LUMINEX x TAG
- Detecta varios gérmenes en el mismo ensayo
- Hay paneles para infecciones respiratorias y gastrointestinales
- Investiga bacterias y/o virus en cada panel
GeneXpert
Principales características
- Fácil realización
- Rápido: 2 hs
- Utiliza un cartucho cerrado
- Utilizado más ampliamente para diagnóstico de micobacterias
- Permite detectar resistencia a rifampicina
- Interesante para la detección de Clostridium difficile Detección de colonizados con EVR y SAMR
- Costo elevado
Pruebas bioquímicas, diferenciando…
- 1) Pruebas que se utilizan en la identificación preliminar y con lectura inmediata como la catalasa y oxidasa;
- 2) otras pruebas rápidas, con lectura en menos de 6 h tal y como la hidrólisis del hipurato, la -galactosidasa (ONPG), las aminopeptidasas, la uresa y el indol;
- 3) pruebas lentas, con lectura de 18 a 48 h que incluirían la óxido-fermentación, reducción de nitratos, rojo de metilo, Voges-Proskauer, Agar hierro de Kligler, fermentación de azúcares, hidrólisis de la esculina, coagulasa, fenilalanina-desaminasa, DNasa, hidrólisis de la gelatina, decarboxilasas, lipasa, lecitinasa, utilización de citratos, utilización de malonato, y prueba de CAMP entre las más frecuentes,
- 4) pruebas basadas en caracteres de resistencia a ciertas sustancias tal y como optoquina, bacitracina, solubilidad en bilis, y crecimiento en caldo hipersalino
Sistemas comerciales manuales o galerías multipruebas
Se trata de celdillas aisladas con sustrato liofilizado que se inoculan individualmente y que permiten realizar simultáneamente entre 10 y 50 pruebas bioquímicas
Los resultados de las pruebas se expresan de forma numérica
16S-23S ARNr
Espacio intergénico del 16S-23S ARNr (ITS)4 . Estas ITS se presentan en un número variable en función del número de operones ARNr o alelos rrs. Este elevado grado de diversidad observado en las ITS en diferentes géneros, diferentes especies, diferentes cepas, y en una misma cepa producido por variaciones en el número, tamano˜ y composición de las ITS del 16S-23S ARNr, constituye la base para su utilización en identificación, filogenia y/o tipificación.
ARNr 23S
Puede ser una buena alternativa en los casos en los que la fracción 16 s no proporciona resultados concluyentes. Un aumento en el coste y alguna dificultad técnica en la amplificación de fragmentos más grandes pueden limitar su uso, aunque ser utilizado en la actualidad como un método auxiliar útil con fines taxonómicos y filogenéticos
El ARNr 16S (rrs)
- Es un polirribonucleótido codificado por el gen rrs o ADN ribosomal ARNr 16S (ADN 16S) incluido en la subunidad 30S del ribosoma bacteriano.
- De distribución universal, componente crítico en la función celular, el ARNr 16S actúa como un cronómetro molecular al presentar un alto grado de conservación
- ARNr 16S constituye la diana de acción para algunos antimicrobianos, produciéndose mutaciones que conducen a la resistencia fenotípica, no se invalida la utilización del ARNr 16S para la identificación bacteriana o la asignación de género y especie.
- La secuencia del gen ARNr 16S presenta de forma aproximada 1.500 pb. Este tamano pro- ˜ porciona suficiente polimorfismo interespecífico para diferenciar y establecer medidas estadísticas válidas
Proteómica por espectrometría de masas (MALDI-TOF)
El espectrómetro de masas produce, separa y detecta iones en fase gaseosa.
Identifica moléculas y sus fragmentos mediante la medición de su masa en relación a su carga (masa/carga)