VIIc. bases moleculaes del cáncer pt1 DAÑO Y REPARACIÓN DEL DNA

Question 1

en general los mecanismos de reparación actúan sobre:

Answer 1

todo el genoma

Question 2

la supervivencia a largo plazo de una especie puede aumentar gracias a:

Answer 2

cambios genéticos pero la supervivencia de los individuos requiere estabilidad genética

Question 3

la estabilidad genética no solo depende de los mecanismos de replicación, sino tambn de:

Answer 3

los de reparación

Question 4

cada cadena en el DNA tiene la información para la construcción de su contraparte por lo q :

Answer 4

se puede restaurar la secuencia de la cadena dañada

Question 5

velocidad con q se producen cambios estables en las secuencias de DNA

Answer 5

frecuencia de mutación

Question 5

frecuencia mutación*
la frecuencia real se subestima ya q la mayoría de las mutaciones en las proteínas resultan:

Answer 5

perjudiciales y son eliminadas por selección natural

Question 6

frecuencia mutacion*
una mutación cada 1x10^6 generaciones celulares para un gen de tamaño medio q contega:

Answer 6

1000 pb

Question 6

frecuencia mutacion*
se ha determinado q:
-una proteína de tamaño medio de 400 aa puede verse alterada aleatoriamente por una variación en un aa cada:

Answer 6

200,000 años

*un cambio en un pb por cada 10^9 en cada generación celular

Question 7

se consideran cambios raros y discapacitantes en la secuencia de nucleotidos de un gen

Answer 7

mutaciones

Question 8

son variaciones genéticas frecuentes y <normales> que se presentan en al menor 1% de la poblacion de una especie</normales>

Answer 8

polimorfismos geneticos

Question 9

mutaciones*
sustitución de bases del mismo tipo. purina por otra purina. pirimidina por otra pirimidina

Answer 9

transición

Question 10

mutaciones*
sustitucion de purina por pirimidina o viceversa

Answer 10

transversión

*las mutaciones en las células somaticas no afectan a los descendientes del organismo

Question 11

mutaciones afectan secue cod*
silenciosa

Answer 11

cuando es el mismo aa pero dif nucleotido

AGG—–AGA

*ambos para Arg

Question 12

mutaciones afectan secue cod*
de cambio de sentido
-sinónima

Answer 12

no alteran la función de la proteína

AAA ———-AGA
Lys Arg
Básico básico

Question 12

mutaciones afectan secue cod*
de cambio de sentido
-No sinónima

Answer 12

pueden alterar la funcion de la proteína

UUU —————- UCU
Phe Ser
hidrofóbico polar

Question 13

mutaciones afectan secue cod*
sin sentido

Answer 13

alteración grave

CAG ————- UAG
Gln Stop

Question 14

mutaciones afectan secue cod*
de cambio de fase/marco de lectura (inserción/deleción)

Answer 14

aa dif dentro de la proteína

Question 15

mutaciones afectan secue cod*
tmbn pueden producir alteraciones importantes:
-en el sitio de ensamblaje de intrón-exón

Answer 15

-fenilcetonurias (fenilalanina hidroxilasa)
-beta-talasemias (cadenas beta de la globina)

Question 15

mutaciones afectan secue cod*
tmbn pueden producir alteraciones importantes:
-de elementos de control:

Answer 15

afectan a secuencias reguladoras

Question 16

daño al DNA*
alteraciones espontáneas

Answer 16

daño oxidativo
ataque hidrolítico
metilación

Question 17

la desaminación de la adenina da:

Answer 17

hipoxantina

Question 17

desaminación*
los productos son reconocidos como:

Answer 17

no naturales y reparados

Question 17

daño al DNA*
-pérdida de bases púricas (A, G)
-absorción de energía térmica
-10,000 eventos por cada célula al día en mamíferos de sangre caliente

Answer 17

despurinación

Question 17

daño al DNA*
-Cambio de adenina a hipoxantina, guanina a xantina o citosina a uracilo
-alteración estructural de las bases por reactivos químicos productos de metabolismo celular
-100 eventos por cada célula al día

Answer 17

desaminación

Question 17

daño al DNA* la timina tiene grupo amino v o f

Answer 17

falso la timina no tiene ningun grupo amino

Question 17

la desaminación de la guanina da:

Answer 17

xantina

Question 18

desaminación 3% de citosina en vertebrados estan metilados, su desaminación forma:

Answer 18

Timina natural pero apareado de forma incorrecta con la Guanina

Question 19

la desaminación de la citosina da:

Answer 19

uracilo

Question 19

dímeros de pirimidina* residuos adyacentes de Timina

Answer 19

Dímero timina ciclobutano y Fotoproducto 6-4

Question 20

daño al DNA* -enlace covalente entre dos bases de pirimidinas -Luz UV

Answer 20

dímero de pirimidinas (Timina)

Question 21

daño al DNA* ruptura de la cadena

Answer 21

radiación ionizante

Question 22

mecanismos de reparación del DNA

Answer 22

-reparación de la escisión nucleotrídica (NER) -reparación por escisión de las bases (BER) -reparación de la unión deficiente (MMR) -reparación de la ruptura de doble cadena (DSBR)------ unión de extremos no homólogos (NHRJ), SDSA (single, double), DSBR

Question 23

elimina diversas lesiones voluminosas -vía acoplada a la transcripción: se repara preferentemente el DNA q se transcribe activamente -vía genómica global: corrige el ADN en el resto del genoma

Answer 23

reparación de la escisión nucleotídica (NER)

Question 24

ej. dímero de pirimidina TFIIH

Answer 24

NER

Question 25

pasos para la reparación de la escisión nucleotídica (NER)

Answer 25

1. reconocimiento del daño por la RNApol/CSB o XPC 2. helicasas XPB y XPD 3. endonucleasas XPG corta en el 3´y XPF-ERCC1 en el 5´del segmento dañado 4. se elimina el segmento dañado 5. síntesis. Polimerasa S o E^ 6. ligación

Question 26

proteina de reparación por escisión del grupo 1 de complementación cruzada (excision-repair cross-complementing group 1)

Answer 26

ERCC1

Question 27

ej nucleotidos alterados por reactivos químicos de la dieta o del metabolismo (desaminación)

Answer 27

reparación por escisión de bases (BER)

Question 27

paso 1 de BER

Answer 27

1. DNA GLUCOSILASA reconoce la alteración. existen varias glucosilasas con dif especificidades

Question 27

Se inserta el nucleotido correcto (DNA pol B)

Answer 27

paso 5 BER

Question 27

DNA GLUCOSILASA hidroliza el enlace B-glucosídico q une la base dañada al azúcar generando un sitio sin base: apurínico o apirimidínico. Sitio AP

Answer 27

paso 2 de BER

Question 28

se liga (DNA ligasa III)

Answer 28

paso 6 BER

Question 29

se elimina el azúcar-fosfato q estaba unido a la base eliminada (DNA pol B)

Answer 29

paso cuatro BER

Question 29

la ENDONUCLEASA AP rompe el enlace fosfodiéster del sitio AP

Answer 29

paso 3 de BER

Question 30

deteccion daños durante BER* ej. 8-oxoguanina (oxoG) la enzima hOGG1 se inserta en el duplex y:

Answer 30

rota el nucleotido fuera de la hélice hacia el cuerpo de la enzima

Question 30

reparación de hetedúplex (mismatch repair) ej. eliminación de bases mal apareadas incorporadas por la polimerasa durante la replicación y q se escaparon a la actividad exonucleasa y/o cromosomas recombinantes

Answer 30

reparacion de la union deficiente (MMR)

Question 30

proceso en el q una doble cadena de DNA se junta con otra. en contexto de la meiosis, proceso en el q dos cromosomas homólogos intercambian largas posiciones de su DNA (crossing over- entrecruzamiento)

Answer 30

recombinación

Question 31

NHEJ* ___ fosforila algunas otras proteínas poco conocidas

Answer 31

DNA-PKcs (cinasa dependiente de DNA) *finalmente se lleva a cabo la ligación

Question 31

reparación de la ruptura de doble cadena (DSBR) en una persona de 70 años cada celula tiene en promedio 2000 de este tipo

Answer 31

unión de extremos no homólogos (NHEJ)

Question 32

lugares en el cromosoma en donde el entrecruzamiento es más probable de ocurrir

Answer 32

Recombination Hotspots (puntos calientes de recombinación)

Question 32

NHEJ* ____ detecta la lesión y se une a los extremos

Answer 32

Ku

Question 33

sitios en los q se produce el entrecruzamiento. contiene la maquinaria enzimática q facilita la recombinación

Answer 33

nódulos de recombinación

Question 34

puntos en forma de X en los q anteriormente ocurrió el entrecruzamiento

Answer 34

quiasmas

Question 35

intermediario de Holliday* solamente una de las dos formas de resolver los intermediarios de Holliday provenientes de la ruptura de cadena sencilla (nicks) de cromosomas homologos, resulta en:

Answer 35

recombinación genética de cromátides no hermanas

Question 36

DNA bicatenario originado de un evento de recombinación homologa de cadenas complementarias únicas derivadas de cromosomas homólogos

Answer 36

heterodúplex

Question 36

intermediario de Holliday* heterodúplex* comunmente posee nucleotidos no complementarios ("mismatches") debido a:

Answer 36

las diferencias de cromosomas parentales; por ej, secuencias pertenecientes a alelos distintos d un gen

Question 37

los eventos de recombinación genética tmbn pueden provenir de la reparación por:

Answer 37

recombinación homologa de rupturas de la doble cadena

Question 38

ruptura doble cadena dna* dos mecanismos:

Answer 38

-SDSA (synthesis-dependent strand annealing). invasión y síntesis *sencilla *doble -DSBR (Double strand break repair)

Question 38

ruptura d la doble cadena *cromosoma homologo* degradación de los extremos 5´ invasión y síntesis

Answer 38

SDSA sencilla (synthesis dependent strand annealing)

Question 39

intermediario de Holliday* si hay un corte vertical habra:

Answer 39

heteroduplex entrecruzamiento (CO)

Question 40

intermediario de Holliday* si hay corte horizontal habra:

Answer 40

heteroduplex no entrecruzamiento (NCO)

Question 41

COs vs NCOs* no todos los DSBs originan:

Answer 41

COs

Question 41

DSBR* -no hay cortes adicionales d la doble cadena -los dos intermediarios de holliday migran uno hacia el otro y los cromosomas homologos se separan -no entrecruzamientos (NCO)

Answer 41

disolución

Question 41

DSBR* dHJ

Answer 41

intermediarios de Holliday dobles

Question 42

DSBR* resolución* -dos cortes en las mismas cadenas de los dos intermediarios de Holliday para:

Answer 42

separar cromosomas homologos origina NCO

Question 43

DSBR* resolución* dos cortes, cada uno de ellos en distintas cadenas de los dos intermediarios de holliday origina:

Answer 43

CO

Question 44

reparacion heteroduplex* independientemente de q se haya producido entrecruzamiento o no entre cromosomas homologos, la genracion de heteroduplex tiene la capacidad de:

Answer 44

incorporar variabilidad genética al ser separado posteriormente

Question 44

reparacion heteroduplex* la maquinaria de reparación no tiene forma de saber cúal era la base originada en el dúplex v o f

Answer 44

verdadero *corregirá alguna de las bases en los mismatches (malos apareamientos) para lograr la complementariedad adecuada

Question 45

entrecru des= sec repe minisa* el estado inicial mostrado tiene:

Answer 45

dos regiones minidatelite (1 y 2)

Question 46

entrecru des= sec repe minisa* en un individuo diploide, la región 1 sobre un homologo se puede alinear con la región 2 del otro homologo durante la meiosis. si el entrecruzamiento ocurre durante esa mala alineación, la mitad de los gametos:

Answer 46

pierde una región 2 y la otra adquieren una región 2 adicional

Question 47

fracciones de renaturalización* secuencias cortas (de cinco a pocos cientos pb de longitud) q forman segmentos muy largos, cada uno con varios millones de pb

Answer 47

satélite

Question 47

entrecru des= sec repe minisa* conforme el entrecruzamiento desigual continua durante las divisiones meioticas en generaciones subsecuentes, evoluciona de modo:

Answer 47

gradual una secuencia de ordenamientos de DNA repetidos en tándem

Question 48

fracciones de renaturalización* -representa hasta el 10% del DNA total -centrómero, heterocromatina -se repite una y otra vez sin interrupción (repetidos en tándem) *satélite, *minisatélite, *microsatelite

Answer 48

muy repetidas

Question 49

fracciones de renaturalización* 10 a 100 pb de longitud en segmentos de una 3,000 repeticiones. la longitud de un locus especifico es muy variable en la población, incluso entre miembros de la misma familia; el numero de repetidos aumenta o disminuye d generación a la sig como resultado de ENTRECRUZAMIENTO DESIGUAL DURANTE MEIOSIS (dna fingerprinting - huella genetican de dna)

Answer 49

minisatélite

Question 50

secuencias muy cortas (uno a cinco pb de longitud) casi siempre en pequeños segmentos de 10 a 40 pb de longitud (ej. CACACACACACA). uniformes en todo el DNA. más de 100,000 dif loci en genoma humano (dna profiling - huella genetica)

Answer 50

microsatelite

Question 51

fracciones de renaturalización* -con funciones codificantes (histonas) -sin funciones codificantes (rRNAs, tRNAs)

Answer 51

moderadamente repetida

Question 51

recombinación, fuente variab en sist inmunitario* complejo proteico en la superficie de linfocitos T responsable del reconocimiento de antígenos presentados por las células presentadoras de antígenos

Answer 51

TCR. T-cell receptor

Question 51

fracciones de renaturalización* -representa solamente el 1.5% del genoma humano -todas las proteínas dif a las histonas

Answer 51

no repetida

Question 52

recombinación genera:

Answer 52

reordenamiento génico

Question 53

reordenamietos genic son unic* el TCR en cada célula T es único y puede emplearse para:

Answer 53

identificar cáncer/tumores de células T

Question 53

reordenamietos genic son unic* los tumores son proliferación de:

Answer 53

una única célula transformada

Question 54

reordenamietos genic son unic* en personas sanas no se observan bandas adicionales ya q:

Answer 54

ningun reordenamiento está presente en concentración suficiente para ser detectado, ya q una única celula T lo porta

Question 54

reordenamietos genic son unic* el patrón de reordenamiento de los genes de TCR será:

Answer 54

identico en cada célula del tumor