IIIe genómica funcional y RNAs no codificantes Flashcards
genoma
La información genética común a todas las células del organismo
transcriptoma
la parte del genoma que se transcribe en una célula en un momento en específico
proteoma
las proteínas en la célula que le dan su carácter individual
metaboloma
suma total de los sustratos, metabolitos y moléculas pequeñas presentes en una población de células
planteamiento clásico
-dirigido por una hipótesis
-limitado numero de genes
planteamiento genómico
-no hay hipótesis
-Información sobre miles de genes contenidos en el genoma completo
determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación <descubrimiento></descubrimiento>
genómica funcional
identificación y estudio de la estructura de la secuencia en el genoma. Polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones. Localización y construcción de mapas.
genómica estructural
estudio comparativo de los genomas estructural y funcionalmente para explicar las relaciones funcionales y evolutivas
genómica comparativa
segmento de DNA con una ubicación física conocida en un cromosoma
ayudan a vincular una enfermedad hereditaria con el gen responsable
marcador genético
se utilizan para rastrear la herencia de un gen cercano q aun no ha sido identificado, pero cuya localizacion aproximada es conocida
marcador genetico
molecula biologica que se encuentra en la sangre, otros liquidos o tejidos del cuerpo y es UN SIGNO DE UN PROCESO normal o anormal, o de una afeccion o enfermedad
biomarcadores
se utiliza a veces para determinar la respuesta del cuerpo a un tratamiento para una enfermedad o afección. tmbn se llama marcador molecular y molecula distintiva
biomarcadores
posiblemente un tipo de “sistema inmunitario genetico” para proteger al organismo de la presencia de material genetico extraño
RNAi en eucariotas
tipos de RNA de interferencia
-dsRNA
-siRNA
-shRNA
-miRNA
dsRNA/siRNA
menos de 50 moleculas pueden silenciar un
mRNA blanco q este presente en miles de copias por célula
los mamiferos poseen la RdRp responsable de la amplificacion del RNA?
no
se introduce mediante técnicas de transfeccion un plasmido (o un vector viral) que transcriba una horquilla q semeje el pri-miRNA
son procesados por drosha y dicer para generar siRNAs funcionales
shRNA
pequeñas moleculas capaces de regular negativamente la expresión de un gen diana
patrones de expresión independientes tiempo-tejido específicos
miRNAs
cromosomicos, endogenos, no codificantes, diversos en secuencia, intergenicos, exonicos, intronicos, evolutivamente conservados
miRNA
transcritos por la ARN polimerasa II
miRNA
enzimas RNAsas III que procesan los pri-miRNA y preRNA, respectivamente
drosha y dicer
cuantos nt tiene pre-microRNA
70-100 nt
*cortados por drosha
endonucleasa especifica para RNA de doble hebra. deja 2-4 nt sobresaliendo (overhangs)
drosha
posee un amino terminal RNA helicasa, dos dominios RNAsa III y un carboxilo terminal de union a dsRNA
drosha
porcentaje de genes de miRNA son controlados directamente por la metilación del ADN
50%
porcentaje de la expresión de todos los genes que se cree que puede ser regulado mediante miRNAs
30%
se ha demostrado q varios miRNAs tienen como blanco a
DNMT
promoviendo la pérdida de metilacion del DNA
