IIIc control epigenético Flashcards

1
Q

mecanismos epigenéticos

A

-modificación de las histonas
-remodelación de la cromatina
-organización espacial de la cromatina
-metilación del ADN
-miRNAS

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2
Q

CÓDIGO DE HISTONAS

A

suma de las modificaciones de histonas
podrían extender la información potencial del material genético, almacenándola en la cromatina de forma epigenética
diferente en distintas partes del genoma

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3
Q

HAT

A

histona acetil transferasa

activación transcripcional

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4
Q

HDAC

A

histona desacetilasa

restaura carga positiva de lisinas, la cromatina se compacta y es menos accesibles a las proteínas reguladoras para transcripción (ej. HDAC1 y HDAC2 en humanos)

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5
Q

p300/CBP

A

acetila a H4

interactúa con factores de transcripción receptores hormonales, AP-1 y MyoD
algunas proteínas virales inhiben la transcripción uniéndose a p300/CBP generación de tumores

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6
Q

PCAF

A

P300/CBP associated factor

Acetila H3

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7
Q

ACTR

A

acetila H3 y H4

recluta a p300/CBP y PCAF

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8
Q

fosforilación de las histonas

A

promueve expresión génica abriendo la estructura de la cromatina al añadir carga negativa
en residuos de serina y treonina mediada por cinasas y eliminadas por fosfatasas

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9
Q

remodelación de la cromatina

A

proceso general de inducción de cambios en la estructura de la cromatina
-modelo de pre-vaciado
-modelo dinámico
-complejos remodeladores

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10
Q

modelo de pre-vaciado

A

histonas y factores de transcripción compiten por DNA y una vez que cualquiera de ellos toma posesión, no puede ser desplazado

promotores libres durante la replicación deben mantenerse ocupados por los factores de transcripción evitando la llegada de las histonas
importante para establecer in vitro que hay una competencia más que demostrar que efectivamente se utiliza in vivo

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11
Q

histonas VS TFIID o TFIIIA
(transcrpción de rRNA 5S)

A

modelo de pre-vaciado

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12
Q

modelo dinámico

A

existencia de factores de transcripción que utilizan energía proporcionada por ATP para desplazar a los nucleosomas

el gran número de contactos proteína-proteína y proteína-DNA que deben ser interrumpidos para liberar las histonas de la cromatina hace improbable que las histonas libres estén en equilibrio espontáneo con los octámeros

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13
Q

factor de transcripción GAGA en el promotor de hsp70 Drosophila puede <romper> el nucleosoma y relocalizarlo</romper>

A

modelo dinámico

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14
Q

tienen actividad ATPasa
permiten que activadores transcripcionales tengan acceso a sitios diana
algunos poseen TAFs

A

complejos remodeladores de la cromatina

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15
Q

q provocan los complejos remodeladores de la cromatina

A

-cambio conformacional del DNA en la superficie del octámero
-que los nucleosomas cambien su posición (deslizamiento)
-cambio en la composición de histonas del octámero
-pérdida parcial (H2A-H2B) o total del octámero

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16
Q

complejo SWI/SNF

A

complejo remodelador de la cromatina

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17
Q

a ph fisiologico los grupos aminos de la cadena lateral de la lisina están:

A

protonados

*histonas no acetiladas

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18
Q

la acetilación de las lisinas produce grupos:

A

amida, que no se protonan a ph fisiologico

*histonas acetiladas

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19
Q

residuos de aa de las histonas q se fosforilan para promover la expresión génica

A

serina y treonina

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20
Q

proceso general de induccion de cambios en la estructura de la cromatina

A

remodelación de la cromatina

-modelo prevaciado
-modelo dinámico
-complejos remodeladores

21
Q

las histonas y los factores transcripcionales compiten por el DNA y una vez que cualquiera de ellos toma posesión, no puede ser desplazado

A

modelo pre-vaciado

*Ej: histonas vs TFIID oTFIIIA (transcripcion de rRNA 5S)

22
Q

los promotores libres durante la replicacion deben de mantenerse ocupados por los factores de transcripcion evitando la llegada de histonas

A

modelo pre-vaciado

23
Q

importante para establecer in vitro que hay una competencia más que demostrar que efectivamente se utiliza in vivo

A

modelo pre-vaciado

*in vitro se ve q hay esa competencia

24
Q

se basa en la existencia de factores de transcripción que utilizan la energía proporcionada por el ATP para desplazar los nucleosomas

A

modelo dinámico

24
el gran numero de contactos proteína-proteína y proteína-DNA q deben ser interrumpidos para liberar las histonas de la cromatina hace improbable q las histonas libres esten en equilibrio espontaneo con los octámeros
modelo dinámico
25
ej, factor de transcripcion GAGA en el promotor de hsp70 de Drosophila puede romper el nucleosoma y relocalizarlo
modelo dinámico
26
algunos factores de transcripcion no pueden unirse al dna lineal pero sí sobre el nucleosoma verdadero o falso
verdadero ej. receptores de hormonas esteroideas
27
tiene actividad ATPasa permiten que activadores transcripcionales tengan acceso a sitios diana algunos poseen TAFs
complejos remodeladores de la cromatina
28
la organización de los 46 cromosomas interfásicos humanos en el núcleo no es al azar sino que ocupan zonas específicas conocidas como territorios cromosómicos verdadero o falso
verdadero
28
verdadero o falso en general los cromosomas homólogos colocalizan
falso NO colocalizan
29
provocan: -cambio comformacional del DNA en la superficie del octámero -que los nucleosomas cambien su posición (desplazamiento) -cambio en la composición de histonas del octámero -pérdida parcial (H2A-H2B) o total del octámero
complejos remodeladores de la cromatina
30
ej complejo SWI/SNF
complejos remodeladores de la cromatina
31
regiones ricas en genes estan hacia:
centro del nucleo
32
la _________ esta estrechamente asociada a la lamina nuclear
heterocromatina
33
DNMT
DNA metiltransferasa *ausencia de transcripción
34
posición donde ocurre la metilacion
posición 5 de la citosina (4% genoma)
35
necesaria pero no suficiente para transcripción activa
hipometilación
36
recluta represores transcripcionales (MeCP1, MeCP2, histona desacetilasa)
hipermetilacion
37
ej en adenocarcinoma pulmonar asociado al tabaco existen diferencias significativas en la metilación de islas CpG
metilación del DNA
38
secuencias dinucleótidas CG especialmente abundantes en regiones promotoras
islotes CpG *posiciones metilables
39
cuantas pb y porcentaje de GC hay en los islotes CpG
500pb con un porcentaje GC de 60% 20000 en el genoma humano
40
cómo son los nucleosomas en islotes CpG hipometilados?
tienen un contenido reducido de histona H1 (empaquetamiento ligero), e histonas acetiladas
41
conformación del dna q parece estar favorecida en secuencias ricas en CG
conformación Z
42
el DNA metilado es reconocido por proteinas como:
MeCP1 y MeCP2 q ompiden la union de factores de transcripcion o bien bloquean el avance de RNA polimerasa el gen no se transcribe
43
cada tejido presenta un patron caracteristico de
metilacion en sus células
44
en una fase muy precoz de la embrigenesis, cuando las celulas no estan diferenciadas, se elimina completamente del DNA el :
patron de metilacion heredado de los gametos progenitores
44
coincidiendo con la formación de los distintos tipos celulares, se incorpora al DNA:
un patron espeifico de sitios metilados, propio ya del embrión pero diferente en cada tejido
45
tras cada ronda de replicación, se reproduce fielmente en las hebras nuevas de DNA el :
esquema de metilación presentes en las hebras progenitoras, q actuan de molde el patron se conserva en todas las celulas hijas de un tipo determinado