IIId factores de transcripción Flashcards
nivel más frecuente de regulación
iniciación de la transcripción
el control de la degradación del mRNA está determinado por:
longitud del poliA
sitio de unión de proteínas reguladoras q pueden modificar la capacidad de expresión de un gen
región control/reguladora
secuencia de nucleotidos que se corresponde con la secuencia de aa de la proteína
región codificante
mutación en la región codificante de dicho alelo
mutación en cis de la región control de dicho alelo
inhibicion de la expresión genica de un solo alelo
mutación en trans del gen de la proteína reguladora
inhibición de la expresión genica de ambos alelos
el exterior de la hélice del DNA puede ser leído por:
proteínas
proteínas como los ________________ pueden unirse a secuencias específicas
factores de trascripción
el borde de cada par de bases en la superficie presenta un:
patrón específico de aceptores y dadores de enlaces de hidrogeno y parches hidrofobicos, tanto en el surco mayor como en menor
hendidura q contiene más información
hendidura mayor
TFBS
transcripcion factor binding
sitio vinculado al factor de transcripcion
reguladores en cis localizados en un promotor o enhacer q permite q un gen responda a un factor de transcripcion necesario para la iniciación de la RNA pol
elementos de respuesta
el factor de transcripción (proteina) esta activo solamente bajo condiciones en las cuales:
el gen regulado va a ser expresado
cada evento regulador depende de la union de:
su propia proteína a un elemento de respuesta en particular
tfbs
protege a la célula humana de metales pesados uniendose a ellos y extrayéndolos de la célula
metalotioneina
metalotioneina
se expresa a nivel basal pero se induce su expresión cuando:
aumenta la concentración de los iones de metales pesados
modifican la producción del mRNA
tfbs
enhancers (potenciadores)
dos elementos constitutivos del promotor
caja TATA Box y las CG Box
pueden estar hacia el 5´, 3´o dentro de los intrones
hasta 50kb de distancia de los genes q regulan
responsables de parte del patron de expresion global de un gen
la ausencia de un elemneto necesario para un modo de activacion no afecta la activacion de otros modos
TFBS
***elementos de respuesta
determinan interacciones proteinas-proteina q promueven la formacion del complejo de iniciación
factores de transcripcion
algunas proteinas pueden participar en más de un modulo regulador, incluso activador e inhibidor
factores de trasncripcion
algunas interacciones proteina-proteina son demasiado debiles para ensamblar complejos en solución, sin embargo son suficientes para producir el ensamble sobre el DNA (centro de nucleacion)
factores de transcripcion
numero limitado de diferentes maneras de combinar helices a con láminas B para formar una estructura tridimensional
motivo proteico
*varios motivos forman el dominio
unidad estructural básica de una proteína. conjunto interconectado de láminas B, hélices a o ambas que estable independientemente del resto de la cadena polipeptidica
dominio proteico
unidad biologica funcional**
reconocen secuencias palindrómicas en el adn
incorporan un átomo de zinc en su estructura
frecuentemente agrupados con otros dedos de zinc
dimerización
dedos de zinc
**dedo q justo entra en el surco mayor
elementos reguladores en trans que poseen estructuras de naturaleza básica cuyos motivos respondables de la union al DNA pueden ser dedos de zinc, helice vuelta helice, helice bucle helice, cremalleras de leucina, laminas B
factores de transcripcion
ej TFIIIA, receptor de glucocorticoides y estrogenos
dedos de zinc
ligandos que requieren del receptor con dominio de union al DNA. activan transcripción de genes y no son proteinas unidas a membrana
receptores a hormonas esteroideas
superfamilia de factores de transcripcion con respuesta a ligandos
receptores a hormonas esteroideas
el domino de union a esteroides C-t de glucocorticoides:
evita q el N-t del receptor promueva el reconocimiento del elemento de respuesta de forma constitutiva
en el receptor a estrogeno el C-t
activa la función del N-t
receptores esteroideos
los dedos de zinc controlan la especifidad de
union al DNA y de dimerización
*no actuan directamente sobre el aparato basal
q hace CBP/p300
promueve la acetilación de las histonas
homodimeros
glucocorticoide
mineralocorticoide
progesterona
andrógeno
estrógeno
heterodímeros
triyodotironina
vitamina D
retinoico
dos helices casi perpendiculares una a la otra por una vuelta corta
una helice a se situa en el surco mayor y la otra por fuera de la doble helice haciendo contactos adicionales con el surco menor
hélice-vuelta-hélice
ej represor Trp, CAP, homeodominio
helice-vuelta-helice
hélices anfipaticas de 40 a 50 aa conectadas por un bucle de 12 a 28 aa q permite q ambas hélices queden alineadas
helice-bucle-helice
pueden formar homodimeros o heterodimeros con diferente fuerza de union entre los monómeros y reconocimiento de sitios diana en el DNA
helice-bucle-helice
h-b-h
clase A se expresa de forma
ubicua (todos los tejidos)
h-b-h
clase B es:
tejido especifica
ej. MyoD, miogenina y Myf5. implicados en miogenesis
secuencia de aa ricos en residuos de leucina (hidrofobicos) que proporciona un motivo de dimerización
región adyacente altamente básica
cremallera de lucina
pueden formar homodimeros o heterodimeros entre ciertos tipos, lo que incrementa significativamente el repertorio con dif especifidades de union al DNA
3 especifidades a partir de dos monomeros. 6 especifidades a partir de 3 mononeros
cremallera de leucina
ej AP1 (c-Jun, c-fos). reguladores del desarrollo y procesos celulares como diferenciación, proliferación y apoptosis
cremallera de leucina
reconocen info sobre la superficie del surco mayor
dos láminas ________ dirigidas hacia el DNA
láminas B
ej proteína dimerica represora met del operon metionina
laminas B
