Repetidos comunes Flashcards
¿Qué son los repetidos comunes?
- regiones de ADN que tienen secuencias repetidas
- están en diferentes regiones
¿En qué regiones pueden estar los repetidos comunes?
- transposones (45%)
- regiones intergénicas
- pseudogenes
- replicaciones cortas y largas
- repeticiones en tandem
Transposones
¿Qué son los transposones?
- elementos móviles del genoma “genes saltarines”
- se insertan en diferentes localizaciones
Transposones
Tipos
- clase I
- clase II
Clase I de transposones y características
retrotransposones
* de ARN a cADN (transcriptasa reversa) → transposon se inserta en el cADN
* provienen del ARN
* se clasifican en LTR y no LTR
Retrotransposones
Características de los LTR
repeticiones terminales largas
100pb a 5kb en el extremo de cromosomas
Retrotransposones
Tipos de no TLR
- LINE → elementos intercalados largos (20% genoma)
- SINE → elementos intercalados cortos (13% genoma)
Retrotransposones
Características de los LINE
- 📍en bandas G
- autónomos: producen su propia transcriptasa reversa
- su transcripción es bidireccional en 5’UTR
- 6500 pb con terminación poliA
Retrotransposones
3 familias de LINE
- LINE 1
- LINE 2
- LINE 3
Retrotransposones
¿Qué hay dentro del LINE 1?
el + estudiado
ORF 1: transcribe a p40 (chaperona de ac. nucleicos)
ORF 2: produce endonucleasa (✂️ donde se une el transposon) y transcriptasa reversa
Retrotransposones
Características de los SINES
- 100-400pb
- no autónomos (no codifican prote)
- comparte secuencias con LINES
Retrotransposones
¿Cuál es la forma + común de SINES?
elementos ALU
Retrotransposones
La maquinaria de ____ es responsable de la retrotranscripción de ____
LINES - SINES
Retrotransposones
Características de los elementos ALU (3)
- 280pb
- compuesto por 2 repetidos en tandem 120pb c/u seguido de una secuencia de An/Tn
- están en bandas R (Q negativas)
Clase II transposones
- de ADN a ADN
- 🚫 retrotranscripcion
- 🚫 ARN
