Repetidos comunes Flashcards
¿Qué son los repetidos comunes?
- regiones de ADN que tienen secuencias repetidas
- están en diferentes regiones
¿En qué regiones pueden estar los repetidos comunes?
- transposones (45%)
- regiones intergénicas
- pseudogenes
- replicaciones cortas y largas
- repeticiones en tandem
Transposones
¿Qué son los transposones?
- elementos móviles del genoma “genes saltarines”
- se insertan en diferentes localizaciones
Transposones
Tipos
- clase I
- clase II
Clase I de transposones y características
retrotransposones
* de ARN a cADN (transcriptasa reversa) → transposon se inserta en el cADN
* provienen del ARN
Clasificación de la clase I de transposones (retrotransposones)
LTR y no LTR
Retrotransposones
Características de los LTR
repeticiones terminales largas
100pb a 5kb en el extremo de cromosomas
Retrotransposones
Tipos de no TLR y % en el genoma
- LINE → 20% genoma
- SINE → 13% genoma
SINE. elementos intercalados cortos/largos
Retrotransposones
Características de los LINE
- 📍en bandas G
- autónomos: producen su propia transcriptasa reversa
- su transcripción es bidireccional en 5’UTR
Retrotransposones
3 familias de LINE
- LINE 1
- LINE 2
- LINE 3
Retrotransposones
¿Qué hay dentro del LINE 1? (ORF 2)
el + estudiado
- Produce endonucleasa (✂️ donde se une el transposon)
- Produce transcriptasa reversa
Retrotransposones
¿Qué hay dentro del LINE 1? (ORF 1)
el + estudiado
Transcribe a p40 (chaperona de ac. nucleicos)
Retrotransposones
Características de los SINES
- no autónomos (no codifican prote)
- comparte secuencias con LINES
Retrotransposones
¿Cuál es la forma + común de SINES?
elementos ALU
Retrotransposones
La maquinaria de ____ es responsable de la retrotranscripción de ____
LINES - SINES
